Oryza brachyantha (Oryza_brachyantha.v1.4b)
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About this transcript

This transcript has 2 exons and is annotated with 18 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene OB02G26430 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OB02G26430.11158385aa
 
Protein coding
J3LDC6 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
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Markup
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     1 ATGGGCCCAAAGAGGAGAGAAAGTCCAACCCAACCTGCGGAGCCCGAGCCCACGAAACAG     60
     1 ATGGGCCCAAAGAGGAGAGAAAGTCCAACCCAACCTGCGGAGCCCGAGCCCACGAAACAG     60
     1 -M--G--P--K--R--R--E--S--P--T--Q--P--A--E--P--E--P--T--K--Q-     20

                                                                          
    61 AAGCAGATGGGCCCGGCCCACCAGGCCAGCACAGCAGCAGCAGAGATGCAGACAAGTCCA    120
    61 AAGCAGATGGGCCCGGCCCACCAGGCCAGCACAGCAGCAGCAGAGATGCAGACAAGTCCA    120
    21 -K--Q--M--G--P--A--H--Q--A--S--T--A--A--A--E--M--Q--T--S--P-     40

                                                                          
   121 CAGCCCCCCACCCGCGTGGAGGTGGTCCAGCTCGACGAGTCCTCGGGCGACATCGCCCCC    180
   121 CAGCCCCCCACCCGCGTGGAGGTGGTCCAGCTCGACGAGTCCTCGGGCGACATCGCCCCC    180
    41 -Q--P--P--T--R--V--E--V--V--Q--L--D--E--S--S--G--D--I--A--P-     60

                                                                          
   181 GTGCTCTCCTTCGAGCACCCCTTCCCGCCCACCAAGACCATGTTCGTCCCGGACCCGCAC    240
   181 GTGCTCTCCTTCGAGCACCCCTTCCCGCCCACCAAGACCATGTTCGTCCCGGACCCGCAC    240
    61 -V--L--S--F--E--H--P--F--P--P--T--K--T--M--F--V--P--D--P--H-     80

                                                                          
   241 TCGGTGCGCCCGGACCTGCTCGCCACCTCCGCCGACCACCTCCGCATCTGGCGCATCGTC    300
   241 TCGGTGCGCCCGGACCTGCTCGCCACCTCCGCCGACCACCTCCGCATCTGGCGCATCGTC    300
    81 -S--V--R--P--D--L--L--A--T--S--A--D--H--L--R--I--W--R--I--V-    100

                                                                          
   301 TCGCCGGACGACGCCGCCGACGCCGACGCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCCGTCCGC    360
   301 TCGCCGGACGACGCCGCCGACGCCGACGCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCCGTCCGC    360
   101 -S--P--D--D--A--A--D--A--D--A--N--S--N--S--N--S--G--S--V--R-    120

                                                                          
   361 TGCAACGGCGCCTCCCAGCCTTCCGTCGAGCTGCGCTGCGAGCTCAACGGCAACCGCAAC    420
   361 TGCAACGGCGCCTCCCAGCCTTCCGTCGAGCTGCGCTGCGAGCTCAACGGCAACCGCAAC    420
   121 -C--N--G--A--S--Q--P--S--V--E--L--R--C--E--L--N--G--N--R--N-    140

                                                                          
   421 AGCGACTACTGCGGCCCGCTCACCTCCTTCGACTGGAACGACGCTGACCCCCGCCGCATC    480
   421 AGCGACTACTGCGGCCCGCTCACCTCCTTCGACTGGAACGACGCTGACCCCCGCCGCATC    480
   141 -S--D--Y--C--G--P--L--T--S--F--D--W--N--D--A--D--P--R--R--I-    160

                                                                          
   481 GGCACCTCCTCCATCGACACCACCTGCACCATCTGGGACATCGAGCGCGAGGCCGTCGAC    540
   481 GGCACCTCCTCCATCGACACCACCTGCACCATCTGGGACATCGAGCGCGAGGCCGTCGAC    540
   161 -G--T--S--S--I--D--T--T--C--T--I--W--D--I--E--R--E--A--V--D-    180

                                                                          
   541 ACCCAGCTCATCGCCCACGACAAGGATGTCTACGACATCGCCTGGGGCGGTGCTGGCGTC    600
   541 ACCCAGCTCATCGCCCACGACAAGGATGTCTACGACATCGCCTGGGGCGGTGCTGGCGTC    600
   181 -T--Q--L--I--A--H--D--K--D--V--Y--D--I--A--W--G--G--A--G--V-    200

                                                                          
   601 TTTGCATCCGTCTCGGCTGACGGCTCGGTTCGCGTGTTTGATCTCCGGGACAAGGAGCAT    660
   601 TTTGCATCCGTCTCGGCTGACGGCTCGGTTCGCGTGTTTGATCTCCGGGACAAGGAGCAT    660
   201 -F--A--S--V--S--A--D--G--S--V--R--V--F--D--L--R--D--K--E--H-    220

                                                                          
   661 TCCACAATTATCTACGAGTCTGGTTCTGGCGGTGGCTCCAATTCGGCTGGTGCAGATGGC    720
   661 TCCACAATTATCTACGAGTCTGGTTCTGGCGGTGGCTCCAATTCGGCTGGTGCAGATGGC    720
   221 -S--T--I--I--Y--E--S--G--S--G--G--G--S--N--S--A--G--A--D--G-    240

                                                                          
   721 GGGGCTGTGTCGCCAACGCCGCTGGTTAGGTTAGGGTGGAACAAGCAGGATCCTAGGTAC    780
   721 GGGGCTGTGTCGCCAACGCCGCTGGTTAGGTTAGGGTGGAACAAGCAGGATCCTAGGTAC    780
   241 -G--A--V--S--P--T--P--L--V--R--L--G--W--N--K--Q--D--P--R--Y-    260

                                                                          
   781 ATGGCAACCATTATCATGGATAGCCCCAAGGTGGTTGTGCTTGATATCCGCTATCCAACA    840
   781 ATGGCAACCATTATCATGGATAGCCCCAAGGTGGTTGTGCTTGATATCCGCTATCCAACA    840
   261 -M--A--T--I--I--M--D--S--P--K--V--V--V--L--D--I--R--Y--P--T-    280

                                                                          
   841 CTACCGGTGGTCGAGCTCCCCCGCCACCATTCCCCTGTCAACGCCATAGCATGGGCACCA    900
   841 CTACCGGTGGTCGAGCTCCCCCGCCACCATTCCCCTGTCAACGCCATAGCATGGGCACCA    900
   281 -L--P--V--V--E--L--P--R--H--H--S--P--V--N--A--I--A--W--A--P-    300

                                                                          
   901 CACTCTTCTTGCCACATTTGCACAGCTGGGGATGACTCGCAGGCCCTTATATGGGACCTA    960
   901 CACTCTTCTTGCCACATTTGCACAGCTGGGGATGACTCGCAGGCCCTTATATGGGACCTA    960
   301 -H--S--S--C--H--I--C--T--A--G--D--D--S--Q--A--L--I--W--D--L-    320

                                                                          
   961 TCATCCATGGGCACTGGGAGTAACAATGGTGGCAATGGAAATGGCAATGCTGCAGCAGCT   1020
   961 TCATCCATGGGCACTGGGAGTAACAATGGTGGCAATGGAAATGGCAATGCTGCAGCAGCT   1020
   321 -S--S--M--G--T--G--S--N--N--G--G--N--G--N--G--N--A--A--A--A-    340

                                                                          
  1021 GCAGCTGCTGAGGGTGGTCTTGATCCCATATTGGCGTACACTGCTGGGGCAGAAATTGAG   1080
  1021 GCAGCTGCTGAGGGTGGTCTTGATCCCATATTGGCGTACACTGCTGGGGCAGAAATTGAG   1080
   341 -A--A--A--E--G--G--L--D--P--I--L--A--Y--T--A--G--A--E--I--E-    360

                                                                          
  1081 CAGCTGCAGTGGTCAGCCACCCAGCCTGACTGGGTCGCTATTGCATTCTCCAATAAACTG   1140
  1081 CAGCTGCAGTGGTCAGCCACCCAGCCTGACTGGGTCGCTATTGCATTCTCCAATAAACTG   1140
   361 -Q--L--Q--W--S--A--T--Q--P--D--W--V--A--I--A--F--S--N--K--L-    380

                                                                          
  1141 CAGATCCTCAGGGTCTGA                                             1158
  1141 CAGATCCTCAGGGTCTGA                                             1158
   381 -Q--I--L--R--V--*-                                              385