Transcript: OB02G26430.1
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- OB02G26430.1 1158 385aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
J3LDC6 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GGC CCA AAG AGG AGA GAA AGT CCA ACC CAA CCT GCG GAG CCC GAG CCC ACG AAA CAG 60
1 ATGGGCCCAAAGAGGAGAGAAAGTCCAACCCAACCTGCGGAGCCCGAGCCCACGAAACAG 60
1 -M--G--P--K--R--R--E--S--P--T--Q--P--A--E--P--E--P--T--K--Q- 20
61 AAG CAG ATG GGC CCG GCC CAC CAG GCC AGC ACA GCA GCA GCA GAG ATG CAG ACA AGT CCA 120
61 AAGCAGATGGGCCCGGCCCACCAGGCCAGCACAGCAGCAGCAGAGATGCAGACAAGTCCA 120
21 -K--Q--M--G--P--A--H--Q--A--S--T--A--A--A--E--M--Q--T--S--P- 40
121 CAG CCC CCC ACC CGC GTG GAG GTG GTC CAG CTC GAC GAG TCC TCG GGC GAC ATC GCC CCC 180
121 CAGCCCCCCACCCGCGTGGAGGTGGTCCAGCTCGACGAGTCCTCGGGCGACATCGCCCCC 180
41 -Q--P--P--T--R--V--E--V--V--Q--L--D--E--S--S--G--D--I--A--P- 60
181 GTG CTC TCC TTC GAG CAC CCC TTC CCG CCC ACC AAG ACC ATG TTC GTC CCG GAC CCG CAC 240
181 GTGCTCTCCTTCGAGCACCCCTTCCCGCCCACCAAGACCATGTTCGTCCCGGACCCGCAC 240
61 -V--L--S--F--E--H--P--F--P--P--T--K--T--M--F--V--P--D--P--H- 80
241 TCG GTG CGC CCG GAC CTG CTC GCC ACC TCC GCC GAC CAC CTC CGC ATC TGG CGC ATC GTC 300
241 TCGGTGCGCCCGGACCTGCTCGCCACCTCCGCCGACCACCTCCGCATCTGGCGCATCGTC 300
81 -S--V--R--P--D--L--L--A--T--S--A--D--H--L--R--I--W--R--I--V- 100
301 TCG CCG GAC GAC GCC GCC GAC GCC GAC GCC AAC TCC AAC TCC AAC TCC GGC TCC GTC CGC 360
301 TCGCCGGACGACGCCGCCGACGCCGACGCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCCGTCCGC 360
101 -S--P--D--D--A--A--D--A--D--A--N--S--N--S--N--S--G--S--V--R- 120
361 TGC AAC GGC GCC TCC CAG CCT TCC GTC GAG CTG CGC TGC GAG CTC AAC GGC AAC CGC AAC 420
361 TGCAACGGCGCCTCCCAGCCTTCCGTCGAGCTGCGCTGCGAGCTCAACGGCAACCGCAAC 420
121 -C--N--G--A--S--Q--P--S--V--E--L--R--C--E--L--N--G--N--R--N- 140
421 AGC GAC TAC TGC GGC CCG CTC ACC TCC TTC GAC TGG AAC GAC GCT GAC CCC CGC CGC ATC 480
421 AGCGACTACTGCGGCCCGCTCACCTCCTTCGACTGGAACGACGCTGACCCCCGCCGCATC 480
141 -S--D--Y--C--G--P--L--T--S--F--D--W--N--D--A--D--P--R--R--I- 160
481 GGC ACC TCC TCC ATC GAC ACC ACC TGC ACC ATC TGG GAC ATC GAG CGC GAG GCC GTC GAC 540
481 GGCACCTCCTCCATCGACACCACCTGCACCATCTGGGACATCGAGCGCGAGGCCGTCGAC 540
161 -G--T--S--S--I--D--T--T--C--T--I--W--D--I--E--R--E--A--V--D- 180
541 ACC CAG CTC ATC GCC CAC GAC AAG GAT GTC TAC GAC ATC GCC TGG GGC GGT GCT GGC GTC 600
541 ACCCAGCTCATCGCCCACGACAAGGATGTCTACGACATCGCCTGGGGCGGTGCTGGCGTC 600
181 -T--Q--L--I--A--H--D--K--D--V--Y--D--I--A--W--G--G--A--G--V- 200
601 TTT GCA TCC GTC TCG GCT GAC GGC TCG GTT CGC GTG TTT GAT CTC CGG GAC AAG GAG CAT 660
601 TTTGCATCCGTCTCGGCTGACGGCTCGGTTCGCGTGTTTGATCTCCGGGACAAGGAGCAT 660
201 -F--A--S--V--S--A--D--G--S--V--R--V--F--D--L--R--D--K--E--H- 220
661 TCC ACA ATT ATC TAC GAG TCT GGT TCT GGC GGT GGC TCC AAT TCG GCT GGT GCA GAT GGC 720
661 TCCACAATTATCTACGAGTCTGGTTCTGGCGGTGGCTCCAATTCGGCTGGTGCAGATGGC 720
221 -S--T--I--I--Y--E--S--G--S--G--G--G--S--N--S--A--G--A--D--G- 240
721 GGG GCT GTG TCG CCA ACG CCG CTG GTT AGG TTA GGG TGG AAC AAG CAG GAT CCT AGG TAC 780
721 GGGGCTGTGTCGCCAACGCCGCTGGTTAGGTTAGGGTGGAACAAGCAGGATCCTAGGTAC 780
241 -G--A--V--S--P--T--P--L--V--R--L--G--W--N--K--Q--D--P--R--Y- 260
781 ATG GCA ACC ATT ATC ATG GAT AGC CCC AAG GTG GTT GTG CTT GAT ATC CGC TAT CCA ACA 840
781 ATGGCAACCATTATCATGGATAGCCCCAAGGTGGTTGTGCTTGATATCCGCTATCCAACA 840
261 -M--A--T--I--I--M--D--S--P--K--V--V--V--L--D--I--R--Y--P--T- 280
841 CTA CCG GTG GTC GAG CTC CCC CGC CAC CAT TCC CCT GTC AAC GCC ATA GCA TGG GCA CCA 900
841 CTACCGGTGGTCGAGCTCCCCCGCCACCATTCCCCTGTCAACGCCATAGCATGGGCACCA 900
281 -L--P--V--V--E--L--P--R--H--H--S--P--V--N--A--I--A--W--A--P- 300
901 CAC TCT TCT TGC CAC ATT TGC ACA GCT GGG GAT GAC TCG CAG GCC CTT ATA TGG GAC CTA 960
901 CACTCTTCTTGCCACATTTGCACAGCTGGGGATGACTCGCAGGCCCTTATATGGGACCTA 960
301 -H--S--S--C--H--I--C--T--A--G--D--D--S--Q--A--L--I--W--D--L- 320
961 TCA TCC ATG GGC ACT GGG AGT AAC AAT GGT GGC AAT GGA AAT GGC AAT GCT GCA GCA GCT 1020
961 TCATCCATGGGCACTGGGAGTAACAATGGTGGCAATGGAAATGGCAATGCTGCAGCAGCT 1020
321 -S--S--M--G--T--G--S--N--N--G--G--N--G--N--G--N--A--A--A--A- 340
1021 GCA GCT GCT GAG GGT GGT CTT GAT CCC ATA TTG GCG TAC ACT GCT GGG GCA GAA ATT GAG 1080
1021 GCAGCTGCTGAGGGTGGTCTTGATCCCATATTGGCGTACACTGCTGGGGCAGAAATTGAG 1080
341 -A--A--A--E--G--G--L--D--P--I--L--A--Y--T--A--G--A--E--I--E- 360
1081 CAG CTG CAG TGG TCA GCC ACC CAG CCT GAC TGG GTC GCT ATT GCA TTC TCC AAT AAA CTG 1140
1081 CAGCTGCAGTGGTCAGCCACCCAGCCTGACTGGGTCGCTATTGCATTCTCCAATAAACTG 1140
361 -Q--L--Q--W--S--A--T--Q--P--D--W--V--A--I--A--F--S--N--K--L- 380
1141 CAG ATC CTC AGG GTC TGA 1158
1141 CAGATCCTCAGGGTCTGA 1158
381 -Q--I--L--R--V--*- 385
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