Oryza brachyantha (Oryza_brachyantha.v1.4b)
Description

RING-type E3 ubiquitin transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:J3L6T8]

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This transcript has 7 exons and is annotated with 21 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene OB01G49440 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OB01G49440.13138796aa
 
Protein coding
J3L6T8 Ensembl Canonical
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     1 ATGTTGGAGCTCTGGTGGTAGTTTAATAATGGATGCAATGGAGGCTGATGAAGGTCCTTT     60
       ............................ATGGATGCAATGGAGGCTGATGAAGGTCCTTT     32
       ............................-M--D--A--M--E--A--D--E--G--P--L     11

                                                                          
    61 ACTGGCTATCGATGCCAAGTTGCATGCCGGAATGTGCAGAGCATTTCAGCCTGCAGTGTC    120
    33 ACTGGCTATCGATGCCAAGTTGCATGCCGGAATGTGCAGAGCATTTCAGCCTGCAGTGTC     92
    11 --L--A--I--D--A--K--L--H--A--G--M--C--R--A--F--Q--P--A--V--S     31

                                                                          
   121 AAAACTTTTAGTGATTTTCCCTGACATTGAAGCATCAAGGCCCAGAAGCAAATCTGGCAT    180
    93 AAAACTTTTAGTGATTTTCCCTGACATTGAAGCATCAAGGCCCAGAAGCAAATCTGGCAT    152
    31 --K--L--L--V--I--F--P--D--I--E--A--S--R--P--R--S--K--S--G--I     51

                                                                          
   181 ACAGGCACTATGTTCTCTGCATGTAGCTCTAGATAAAGCTAAAGGTCTTCTTCAACATTG    240
   153 ACAGGCACTATGTTCTCTGCATGTAGCTCTAGATAAAGCTAAAGGTCTTCTTCAACATTG    212
    51 --Q--A--L--C--S--L--H--V--A--L--D--K--A--K--G--L--L--Q--H--C     71

                                                                          
   241 TGCAGATTGCAGCAGGCTATACTTGGCCATCACTGCAGAAACCGTGCTTTTGAAGTTTGA    300
   213 TGCAGATTGCAGCAGGCTATACTTGGCCATCACTGCAGAAACCGTGCTTTTGAAGTTTGA    272
    71 --A--D--C--S--R--L--Y--L--A--I--T--A--E--T--V--L--L--K--F--E     91

                                                                          
   301 GAAAGCAAGAAGCCAACTTCAGGAGAGTCTTAGACGTGTTGAGGGCATAGTAACAGAAGA    360
   273 GAAAGCAAGAAGCCAACTTCAGGAGAGTCTTAGACGTGTTGAGGGCATAGTAACAGAAGA    332
    91 --K--A--R--S--Q--L--Q--E--S--L--R--R--V--E--G--I--V--T--E--E    111

                                                                          
   361 AATTGGTTGCAAGATTGTTGAGATTGTTGCCGAGCTGGAGGAAGTTGTATTTACATTGGA    420
   333 AATTGGTTGCAAGATTGTTGAGATTGTTGCCGAGCTGGAGGAAGTTGTATTTACATTGGA    392
   111 --I--G--C--K--I--V--E--I--V--A--E--L--E--E--V--V--F--T--L--D    131

                                                                          
   421 TCAATCAGAGAAGGAAGCTGGTGATGAGGTGGTCAATTTACTCCAGAGAAACAGGAAAGT    480
   393 TCAATCAGAGAAGGAAGCTGGTGATGAGGTGGTCAATTTACTCCAGAGAAACAGGAAAGT    452
   131 --Q--S--E--K--E--A--G--D--E--V--V--N--L--L--Q--R--N--R--K--V    151

                                                                          
   481 GAATAGTTCCAGCGATAGCGGAGAGCTTGAGGTCTTTCATATGGCTGCATTGAAGCTAGG    540
   453 GAATAGTTCCAGCGATAGCGGAGAGCTTGAGGTCTTTCATATGGCTGCATTGAAGCTAGG    512
   151 --N--S--S--S--D--S--G--E--L--E--V--F--H--M--A--A--L--K--L--G    171

                                                                          
   541 CATTACATCTTCTAGGGCAGCACTCACTGAAAGAAGGGCCCTGAAGAAGCTAATTGAGAA    600
   513 CATTACATCTTCTAGGGCAGCACTCACTGAAAGAAGGGCCCTGAAGAAGCTAATTGAGAA    572
   171 --I--T--S--S--R--A--A--L--T--E--R--R--A--L--K--K--L--I--E--K    191

                                                                          
   601 GTCTCGTTCTGATGAAGATAAGCGGAAAGAGTATGTTGTGTCATACCTGTACAATCTAAT    660
   573 GTCTCGTTCTGATGAAGATAAGCGGAAAGAGTATGTTGTGTCATACCTGTACAATCTAAT    632
   191 --S--R--S--D--E--D--K--R--K--E--Y--V--V--S--Y--L--Y--N--L--M    211

                                                                          
   661 GAGGAAATACTCGAAATTTTTCAGAAGTGAGACCGGTGATGATACCGATTCTCAAGGATC    720
   633 GAGGAAATACTCGAAATTTTTCAGAAGTGAGACCGGTGATGATACCGATTCTCAAGGATC    692
   211 --R--K--Y--S--K--F--F--R--S--E--T--G--D--D--T--D--S--Q--G--S    231

                                                                          
   721 GTCTCCATGCTCGCCGACAGTGTTAGGCATGGATGACATGTATGGACCCTATGGAAATGG    780
   693 GTCTCCATGCTCGCCGACAGTGTTAGGCATGGATGACATGTATGGACCCTATGGAAATGG    752
   231 --S--P--C--S--P--T--V--L--G--M--D--D--M--Y--G--P--Y--G--N--G    251

                                                                          
   781 CCGAGCATTCAGCAGACAGCTTTCGAGCATTCAATCATTCAATTCAAGATTTGGATCTTT    840
   753 CCGAGCATTCAGCAGACAGCTTTCGAGCATTCAATCATTCAATTCAAGATTTGGATCTTT    812
   251 --R--A--F--S--R--Q--L--S--S--I--Q--S--F--N--S--R--F--G--S--F    271

                                                                          
   841 CAATTCTAGGCTTGGATCGTTCAATTGTCGGCGTAGTGGTCCAAGGTCTGAAAACATGTC    900
   813 CAATTCTAGGCTTGGATCGTTCAATTGTCGGCGTAGTGGTCCAAGGTCTGAAAACATGTC    872
   271 --N--S--R--L--G--S--F--N--C--R--R--S--G--P--R--S--E--N--M--S    291

                                                                          
   901 AATCCCCCCTGAGGAGCTTAGGTGCCCTATTTCTCTACAACTGATGTATGACCCAGTTAT    960
   873 AATCCCCCCTGAGGAGCTTAGGTGCCCTATTTCTCTACAACTGATGTATGACCCAGTTAT    932
   291 --I--P--P--E--E--L--R--C--P--I--S--L--Q--L--M--Y--D--P--V--I    311

                                                                          
   961 CATCTCATCAGGGCAGACTTATGAGCGTGTTTGCATCGAGAAATGGTTTAACGATGGTCA   1020
   933 CATCTCATCAGGGCAGACTTATGAGCGTGTTTGCATCGAGAAATGGTTTAACGATGGTCA    992
   311 --I--S--S--G--Q--T--Y--E--R--V--C--I--E--K--W--F--N--D--G--H    331

                                                                          
  1021 CAGCACCTGTCCAAAGACTCAGCAGCAACTAGCTCACCTGTCTTTGACTCCAAACTACTG   1080
   993 CAGCACCTGTCCAAAGACTCAGCAGCAACTAGCTCACCTGTCTTTGACTCCAAACTACTG   1052
   331 --S--T--C--P--K--T--Q--Q--Q--L--A--H--L--S--L--T--P--N--Y--C    351

                                                                          
  1081 TGTTAAGGCCCTAATTGCCAGCTGGTGTGAGCAGAATGATTTTCCTGTTCCGGATGGTCC   1140
  1053 TGTTAAGGCCCTAATTGCCAGCTGGTGTGAGCAGAATGATTTTCCTGTTCCGGATGGTCC   1112
   351 --V--K--A--L--I--A--S--W--C--E--Q--N--D--F--P--V--P--D--G--P    371

                                                                          
  1141 ACCAGGATCCTTTGATGTAAACTGGAGACTAGCTTTCTCTGACTCTGAAGCAACTGGCTG   1200
  1113 ACCAGGATCCTTTGATGTAAACTGGAGACTAGCTTTCTCTGACTCTGAAGCAACTGGCTG   1172
   371 --P--G--S--F--D--V--N--W--R--L--A--F--S--D--S--E--A--T--G--C    391

                                                                          
  1201 CGTGTCTCTTGAAAGTTTTGACTCTACCAACGTGAAGAGTGTCAAGGTAGTTCCAGTGGA   1260
  1173 CGTGTCTCTTGAAAGTTTTGACTCTACCAACGTGAAGAGTGTCAAGGTAGTTCCAGTGGA   1232
   391 --V--S--L--E--S--F--D--S--T--N--V--K--S--V--K--V--V--P--V--D    411

                                                                          
  1261 CAATGTGAGAAAAGAAGAGCCAGCAAACAGTGAATCAGGAACATTGGATGACAGCTCTTG   1320
  1233 CAATGTGAGAAAAGAAGAGCCAGCAAACAGTGAATCAGGAACATTGGATGACAGCTCTTG   1292
   411 --N--V--R--K--E--E--P--A--N--S--E--S--G--T--L--D--D--S--S--C    431

                                                                          
  1321 TTATGATTTTGATATGAATGAGGGGTACCGGAACTTACTTCTAATGCTTCATGAAAGAAC   1380
  1293 TTATGATTTTGATATGAATGAGGGGTACCGGAACTTACTTCTAATGCTTCATGAAAGAAC   1352
   431 --Y--D--F--D--M--N--E--G--Y--R--N--L--L--L--M--L--H--E--R--T    451

                                                                          
  1381 CAACCCACACATCCAGTGTAGGTTGGTTGAGCAGATAAGATATCTCCTGAAAGATGATGA   1440
  1353 CAACCCACACATCCAGTGTAGGTTGGTTGAGCAGATAAGATATCTCCTGAAAGATGATGA   1412
   451 --N--P--H--I--Q--C--R--L--V--E--Q--I--R--Y--L--L--K--D--D--E    471

                                                                          
  1441 GGAAGCAAGAATCCAGATGGGCTCAAATGGATTTGCTGAGGCACTAGTTCAGTTCTTGAG   1500
  1413 GGAAGCAAGAATCCAGATGGGCTCAAATGGATTTGCTGAGGCACTAGTTCAGTTCTTGAG   1472
   471 --E--A--R--I--Q--M--G--S--N--G--F--A--E--A--L--V--Q--F--L--R    491

                                                                          
  1501 GAATGCTATACAAGATGGAAATGAGAAGGCACAGGAAATTGGTGCCATGGCTCTTTTCAA   1560
  1473 GAATGCTATACAAGATGGAAATGAGAAGGCACAGGAAATTGGTGCCATGGCTCTTTTCAA   1532
   491 --N--A--I--Q--D--G--N--E--K--A--Q--E--I--G--A--M--A--L--F--N    511

                                                                          
  1561 CCTTGCAGTCAATAACAACAGGAACAAGGGACTTCTACTGTCTGCTGGAGTGGTCGATCT   1620
  1533 CCTTGCAGTCAATAACAACAGGAACAAGGGACTTCTACTGTCTGCTGGAGTGGTCGATCT   1592
   511 --L--A--V--N--N--N--R--N--K--G--L--L--L--S--A--G--V--V--D--L    531

                                                                          
  1621 ACTTGAGCAGATGATATCAAATCCACGTCTATCTGCTCCAGCCACGGCACTATACCTTAA   1680
  1593 ACTTGAGCAGATGATATCAAATCCACGTCTATCTGCTCCAGCCACGGCACTATACCTTAA   1652
   531 --L--E--Q--M--I--S--N--P--R--L--S--A--P--A--T--A--L--Y--L--N    551

                                                                          
  1681 TCTTTCATGTCTACCTGATGCAAAGAACATCATTGGTTCAAGCCAGGCTGTGTCGTTCCT   1740
  1653 TCTTTCATGTCTACCTGATGCAAAGAACATCATTGGTTCAAGCCAGGCTGTGTCGTTCCT   1712
   551 --L--S--C--L--P--D--A--K--N--I--I--G--S--S--Q--A--V--S--F--L    571

                                                                          
  1741 AGTAGACCGTCTGTTCAGCCATGAGGCCCGTGACACGAAAGGCGGCTCCTGCAAGCATGA   1800
  1713 AGTAGACCGTCTGTTCAGCCATGAGGCCCGTGACACGAAAGGCGGCTCCTGCAAGCATGA   1772
   571 --V--D--R--L--F--S--H--E--A--R--D--T--K--G--G--S--C--K--H--D    591

                                                                          
  1801 TGCCCTATACACACTATACAATCTCTCTAATCACCAGGCCAGTGTACCATCACTTCTGTC   1860
  1773 TGCCCTATACACACTATACAATCTCTCTAATCACCAGGCCAGTGTACCATCACTTCTGTC   1832
   591 --A--L--Y--T--L--Y--N--L--S--N--H--Q--A--S--V--P--S--L--L--S    611

                                                                          
  1861 TGCGGGCATTGTGGAAGCTCTGCACTCTCTCCTTACAGAGTCCCCAGAGTCTGAGGGCCT   1920
  1833 TGCGGGCATTGTGGAAGCTCTGCACTCTCTCCTTACAGAGTCCCCAGAGTCTGAGGGCCT   1892
   611 --A--G--I--V--E--A--L--H--S--L--L--T--E--S--P--E--S--E--G--L    631

                                                                          
  1921 GGGTTGGACAGAGAAGGCCCTTGCAGTGCTCATCAGCCTCGCCGCAACCCAGCCTGGCAG   1980
  1893 GGGTTGGACAGAGAAGGCCCTTGCAGTGCTCATCAGCCTCGCCGCAACCCAGCCTGGCAG   1952
   631 --G--W--T--E--K--A--L--A--V--L--I--S--L--A--A--T--Q--P--G--R    651

                                                                          
  1981 AAAAGAGATCATGTCCACCCCAGGTTTGATCAGCACCTTGGCAATGCTGCTGGACACCGG   2040
  1953 AAAAGAGATCATGTCCACCCCAGGTTTGATCAGCACCTTGGCAATGCTGCTGGACACCGG   2012
   651 --K--E--I--M--S--T--P--G--L--I--S--T--L--A--M--L--L--D--T--G    671

                                                                          
  2041 TGAGCCAACGGAGCAGGAGCAGTCCGTGTCCTGCCTTCTAGTAATGTGCTCAGCCGACGA   2100
  2013 TGAGCCAACGGAGCAGGAGCAGTCCGTGTCCTGCCTTCTAGTAATGTGCTCAGCCGACGA   2072
   671 --E--P--T--E--Q--E--Q--S--V--S--C--L--L--V--M--C--S--A--D--D    691

                                                                          
  2101 CAAGTGCATCGCACCGGTGCTGCAGGAGGGAGTTGTGCCTTCCTTGGTTTCCATCTCGGC   2160
  2073 CAAGTGCATCGCACCGGTGCTGCAGGAGGGAGTTGTGCCTTCCTTGGTTTCCATCTCGGC   2132
   691 --K--C--I--A--P--V--L--Q--E--G--V--V--P--S--L--V--S--I--S--A    711

                                                                          
  2161 AACCGGCACAGGGAGGGGGAAGGAGAAGTCCCAGAAGCTGCTCAAGCTGTTCCGGGAGCA   2220
  2133 AACCGGCACAGGGAGGGGGAAGGAGAAGTCCCAGAAGCTGCTCAAGCTGTTCCGGGAGCA   2192
   711 --T--G--T--G--R--G--K--E--K--S--Q--K--L--L--K--L--F--R--E--Q    731

                                                                          
  2221 AAGGCAGCGAGACGGGGCACAGCCTGCACCACAGCAAGCTCAGCAGCAGCAGCACCAGCA   2280
  2193 AAGGCAGCGAGACGGGGCACAGCCTGCACCACAGCAAGCTCAGCAGCAGCAGCACCAGCA   2252
   731 --R--Q--R--D--G--A--Q--P--A--P--Q--Q--A--Q--Q--Q--Q--H--Q--Q    751

                                                                          
  2281 GCAGGTTGGAGAGACCGGTAACGGCACCATGGTCTGCCGCCGGGACTCGAAACAGCTGTG   2340
  2253 GCAGGTTGGAGAGACCGGTAACGGCACCATGGTCTGCCGCCGGGACTCGAAACAGCTGTG   2312
   751 --Q--V--G--E--T--G--N--G--T--M--V--C--R--R--D--S--K--Q--L--C    771

                                                                          
  2341 CAAGTCGAAATCGAGGAAGCTGGGAAGGACTCTGAGCTCTCTGTGGAAGAACAGGAGCTT   2400
  2313 CAAGTCGAAATCGAGGAAGCTGGGAAGGACTCTGAGCTCTCTGTGGAAGAACAGGAGCTT   2372
   771 --K--S--K--S--R--K--L--G--R--T--L--S--S--L--W--K--N--R--S--F    791

                                                                          
  2401 CTCCCTCTACCAATGCTAGTAGAGTTTTGAGCTGAGTTTGATCAGTGGATATGTACATCT   2460
  2373 CTCCCTCTACCAATGCTAG.........................................   2391
   791 --S--L--Y--Q--C--*-.........................................    796

                                                                          
  2461 TCTCTTGTTCCATGTTTCTCTTGATCTTTTTTTCTTTCTTTGCCTTTTTTTTTTTGCCTT   2520
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2521 TGTTGCTTCCTTGTGTAAAGTAAAACTATCTTCCCCCCCTTCTCGGTGGGGTGATGTAGG   2580
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2581 CCATTTCCTCCCCTTTCTTCCCCTTGCCAAGATATGTTCATAGCTCATGTTATCTCTGCT   2640
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2641 TCAGAAGTTCATATCAGATCATCAGATTGTCTCCCCCTGAATCCATCAGCTCACATGTTA   2700
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2701 TGTTACTGGAGTACATTTATGTCTATACTCAATACATCATCAGATGATCTCTCATGCAGA   2760
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2761 TTCTTGTCTTCAGGAGGCTCAGCTGCTGAAGCAATTCACATCAGACAAACTCACCAAGGT   2820
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2821 ACACATTTTAGTACAGTAATGAATTCAACATTGTCATATGCTACTACCTCATGGTATAGT   2880
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2881 ATTCAGCTTTGTCTCTAGATGCAACAGTGATGAGATGCAGGGCAATGTTGACATGACATG   2940
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2941 AGTCTTGTGAAGACGATGACATGAGATGAAAAGGAAGAACAAATTGCCACAGGGTAGCAG   3000
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3001 ACAATGACTGGAGGGCCGACATGAAATGAGCAGCTCATGGACTGGACTTCATCAAGTTTG   3060
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3061 GTGGTGACGTTTCAGCCTCGGGCCCAGTAGGCCAGCATTGTGCAAGAGAGACCTGTGCCG   3120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3121 TGTTTGTCTCACAGAGGG                                             3138
       ..................                                                 
       ..................