Transcript: OBART09G04500.1
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- OBART09G04500.1 1599 532aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3H4W6 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GCG GGG AGA TGC GCC GGC GGC GGC GAC GGC GGC GGC GAG GGC ATG CTG GCG CGG CTG 60
1 ATGGCGGGGAGATGCGCCGGCGGCGGCGACGGCGGCGGCGAGGGCATGCTGGCGCGGCTG 60
1 -M--A--G--R--C--A--G--G--G--D--G--G--G--E--G--M--L--A--R--L- 20
61 CGG AGG GCG GCA GCC AGG CGG ATC GGG CTC TCC TGC GCC TCC TTC TTC TCC CAC GCC GCC 120
61 CGGAGGGCGGCAGCCAGGCGGATCGGGCTCTCCTGCGCCTCCTTCTTCTCCCACGCCGCC 120
21 -R--R--A--A--A--R--R--I--G--L--S--C--A--S--F--F--S--H--A--A- 40
121 ACC TCC CCT TCC CCG CCT CCC AAG ACC ATC TCA TGC TCA GCA CTG AAT GCG CCT GCA GAC 180
121 ACCTCCCCTTCCCCGCCTCCCAAGACCATCTCATGCTCAGCACTGAATGCGCCTGCAGAC 180
41 -T--S--P--S--P--P--P--K--T--I--S--C--S--A--L--N--A--P--A--D- 60
181 AGC ACT GAT GAA GAC CAG GAA AAG CTG GAG GAG CCC ACT AGC ACA AGA ATG GCT GAC AAG 240
181 AGCACTGATGAAGACCAGGAAAAGCTGGAGGAGCCCACTAGCACAAGAATGGCTGACAAG 240
61 -S--T--D--E--D--Q--E--K--L--E--E--P--T--S--T--R--M--A--D--K- 80
241 A AT CTC TGT GCA ATA TGT CTG GAG CCC CTC AGC ACC GGC AGC GTT GAT ATT GAC AAT GGT 300
241 AATCTCTGTGCAATATGTCTGGAGCCCCTCAGCACCGGCAGCGTTGATATTGACAATGGT 300
81 -N--L--C--A--I--C--L--E--P--L--S--T--G--S--V--D--I--D--N--G- 100
301 GAC AGG CCA GCA ATC TTC ACA TCA CAA TGC TCC CAC TCC TTC CAC TTC CTA TGC ATC GCC 360
301 GACAGGCCAGCAATCTTCACATCACAATGCTCCCACTCCTTCCACTTCCTATGCATCGCC 360
101 -D--R--P--A--I--F--T--S--Q--C--S--H--S--F--H--F--L--C--I--A- 120
361 TCC AAC ATT CGG CAC GGC AAT GTT ACA TGT CCC ATC TGC CGT GCA CAG TGG TCT CAG CTG 420
361 TCCAACATTCGGCACGGCAATGTTACATGTCCCATCTGCCGTGCACAGTGGTCTCAGCTG 420
121 -S--N--I--R--H--G--N--V--T--C--P--I--C--R--A--Q--W--S--Q--L- 140
421 CCG CGT GAC TTG AAG GTG CCA CCA TTG CTG CAG AAC AAC CAG TCT GAC CCA ATC CTC CGC 480
421 CCGCGTGACTTGAAGGTGCCACCATTGCTGCAGAACAACCAGTCTGACCCAATCCTCCGC 480
141 -P--R--D--L--K--V--P--P--L--L--Q--N--N--Q--S--D--P--I--L--R- 160
481 ATC CTT GAT GAC AAC ATC GCG ACA TCT CGC TTC AAC AGA AGG TCA TCC ATC CGT GCT GCC 540
481 ATCCTTGATGACAACATCGCGACATCTCGCTTCAACAGAAGGTCATCCATCCGTGCTGCC 540
161 -I--L--D--D--N--I--A--T--S--R--F--N--R--R--S--S--I--R--A--A- 180
541 CGG TAC AAC GAC GAT GAT CCG GTT GAG CCT TAC ACC TTG ACC GAG CAT GTG GAT CCA TGC 600
541 CGGTACAACGACGATGATCCGGTTGAGCCTTACACCTTGACCGAGCATGTGGATCCATGC 600
181 -R--Y--N--D--D--D--P--V--E--P--Y--T--L--T--E--H--V--D--P--C- 200
601 CTT CGC TTC GCT CTG ATC CCA TCC CCA GTG GCG GCT CAC CAT CAT GCT CTC GGA CAT TAC 660
601 CTTCGCTTCGCTCTGATCCCATCCCCAGTGGCGGCTCACCATCATGCTCTCGGACATTAC 660
201 -L--R--F--A--L--I--P--S--P--V--A--A--H--H--H--A--L--G--H--Y- 220
661 CCT TGT GGC CGT GTG ATG CCA CTG CAG CAG CAT TGC CAG TAC AGC AGC TCC TCC ATG CTC 720
661 CCTTGTGGCCGTGTGATGCCACTGCAGCAGCATTGCCAGTACAGCAGCTCCTCCATGCTC 720
221 -P--C--G--R--V--M--P--L--Q--Q--H--C--Q--Y--S--S--S--S--M--L- 240
721 TCA CCG CCA CAG ATT GCT TCA CCA AGT GGG CAG AGG CGC GCT TAC CTC TCC GTC AGT CTC 780
721 TCACCGCCACAGATTGCTTCACCAAGTGGGCAGAGGCGCGCTTACCTCTCCGTCAGTCTC 780
241 -S--P--P--Q--I--A--S--P--S--G--Q--R--R--A--Y--L--S--V--S--L- 260
781 GCG CCA CAG CCA GCC ATG GAC CTA GTT CTG GTT GCC AGC CCT AAT GGG CCA CAT CTC AGG 840
781 GCGCCACAGCCAGCCATGGACCTAGTTCTGGTTGCCAGCCCTAATGGGCCACATCTCAGG 840
261 -A--P--Q--P--A--M--D--L--V--L--V--A--S--P--N--G--P--H--L--R- 280
841 CTC CTG AAG CAG GCA ATG GCG CTG GCT GTC TTC TCC ATG CGC GCA ATT GAC CGG TTA GCC 900
841 CTCCTGAAGCAGGCAATGGCGCTGGCTGTCTTCTCCATGCGCGCAATTGACCGGTTAGCC 900
281 -L--L--K--Q--A--M--A--L--A--V--F--S--M--R--A--I--D--R--L--A- 300
901 ATT GTC ACA AAT GCC ACC ACT GCA ACC CGC GCC TTC CCC TTG CGC CGA ATG TCA TCC CAT 960
901 ATTGTCACAAATGCCACCACTGCAACCCGCGCCTTCCCCTTGCGCCGAATGTCATCCCAT 960
301 -I--V--T--N--A--T--T--A--T--R--A--F--P--L--R--R--M--S--S--H- 320
961 GGA AAG CGA ATG GCA TTG CAG GTC ATT GAA CAC CTC TGC TGT GTT GGT GGT ACT GAT CCT 1020
961 GGAAAGCGAATGGCATTGCAGGTCATTGAACACCTCTGCTGTGTTGGTGGTACTGATCCT 1020
321 -G--K--R--M--A--L--Q--V--I--E--H--L--C--C--V--G--G--T--D--P- 340
1021 GTA GGG GCA TTG CAG AAG GGC CTG AAG ATA CTA GAG GAC CGG GCG CAC CAG AAC CCA AGC 1080
1021 GTAGGGGCATTGCAGAAGGGCCTGAAGATACTAGAGGACCGGGCGCACCAGAACCCAAGC 1080
341 -V--G--A--L--Q--K--G--L--K--I--L--E--D--R--A--H--Q--N--P--S- 360
1081 AGT TGC ATT CTT CAC CTG TCA GAC CAT CCA ATC CGA AGC TGT TTC GGG GTC GAC ATG AAC 1140
1081 AGTTGCATTCTTCACCTGTCAGACCATCCAATCCGAAGCTGTTTCGGGGTCGACATGAAC 1140
361 -S--C--I--L--H--L--S--D--H--P--I--R--S--C--F--G--V--D--M--N- 380
1141 CGT TTC AAC ATC CCG GTT CAC CAG TTC CAT GTC GGC CTC GGT TTC GGG GTG CAG AAT GGC 1200
1141 CGTTTCAACATCCCGGTTCACCAGTTCCATGTCGGCCTCGGTTTCGGGGTGCAGAATGGC 1200
381 -R--F--N--I--P--V--H--Q--F--H--V--G--L--G--F--G--V--Q--N--G- 400
1201 TTT GTG ATG CAC GAG TTT GAG GAG CTC TTA GCG CGG TTG CTT GGC GGT GTC ATA AGC GAC 1260
1201 TTTGTGATGCACGAGTTTGAGGAGCTCTTAGCGCGGTTGCTTGGCGGTGTCATAAGCGAC 1260
401 -F--V--M--H--E--F--E--E--L--L--A--R--L--L--G--G--V--I--S--D- 420
1261 ACC CAG CTC AGG ATT GGC GAG CAC GGT GGA GTG GTG AGG CTA GGT GAG CTG AGG GGT GGC 1320
1261 ACCCAGCTCAGGATTGGCGAGCACGGTGGAGTGGTGAGGCTAGGTGAGCTGAGGGGTGGC 1320
421 -T--Q--L--R--I--G--E--H--G--G--V--V--R--L--G--E--L--R--G--G- 440
1321 GAA GAG AGG AGG ATC CCG CTT GAC CTG GTG TCG GAC TGC GGC TTC ATA CTT GTT GGC TAT 1380
1321 GAAGAGAGGAGGATCCCGCTTGACCTGGTGTCGGACTGCGGCTTCATACTTGTTGGCTAT 1380
441 -E--E--R--R--I--P--L--D--L--V--S--D--C--G--F--I--L--V--G--Y- 460
1381 AGC TAT CTG GAA GGT GGA AGG GAG GAT CAG TTC AGG ACA GGC GAA GTC GCT GTC GGT TTC 1440
1381 AGCTATCTGGAAGGTGGAAGGGAGGATCAGTTCAGGACAGGCGAAGTCGCTGTCGGTTTC 1440
461 -S--Y--L--E--G--G--R--E--D--Q--F--R--T--G--E--V--A--V--G--F- 480
1441 GAA GAG AAA GGC AAT AAC CGG TAC TGC GGG GTC AGG GAT GCC GGT GGT CTG AGT ATC GGC 1500
1441 GAAGAGAAAGGCAATAACCGGTACTGCGGGGTCAGGGATGCCGGTGGTCTGAGTATCGGC 1500
481 -E--E--K--G--N--N--R--Y--C--G--V--R--D--A--G--G--L--S--I--G- 500
1501 GGT GAG AGG AGG AGC AGC TGC TGC GCT GAG AGA TGG GAC TAC CTT GAT CCG TTC ATG GCG 1560
1501 GGTGAGAGGAGGAGCAGCTGCTGCGCTGAGAGATGGGACTACCTTGATCCGTTCATGGCG 1560
501 -G--E--R--R--S--S--C--C--A--E--R--W--D--Y--L--D--P--F--M--A- 520
1561 CGG CGA TGG GCG AAG CAT TTC AAT GTG TAT AGG GCC TGA 1599
1561 CGGCGATGGGCGAAGCATTTCAATGTGTATAGGGCCTGA 1599
521 -R--R--W--A--K--H--F--N--V--Y--R--A--*- 532
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