Transcript: OBART08G22120.2
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Description
RBR-type E3 ubiquitin transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A0D3H2Q2 ]
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- OBART08G22120.1 2472 603aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3H2Q2 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - OBART08G22120.2 2364 567aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3H2Q3 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 CACTGGTATATAAAAAACACCCCATCCTGTGTGCCTGCCGACTCGCCCACGCAACTCCGA 60
............................................................
............................................................
61 CTCTTTCCTTCCCCAATTCCCCCGTCCACCGGCCGCGGGCCTCGCCGGAACCCTAGCCCC 120
............................................................
............................................................
121 GCCGCCCCCCTCCCCT CTCCGATCGCCCGATTCGGTGGTCGGGGTG ATG GAC TCC GAC GC 180
..............................................ATGGACTCCGACGC 14
..............................................-M--D--S--D--A 5
181 C GAG ATG CCC ATG TCC AGC GAC GAG GAG ATG CTG GAT GAC GAG GAC TAT TAC GAC TAC AG 240
15 CGAGATGCCCATGTCCAGCGACGAGGAGATGCTGGATGACGAGGACTATTACGACTACAG 74
5 --E--M--P--M--S--S--D--E--E--M--L--D--D--E--D--Y--Y--D--Y--S 25
241 T GAT GAC ATG GGT GAG GAC GAT GAT GGG AGC GGC GGC GGG GGC GGG GAG GGG GAG ATA GC 300
75 TGATGACATGGGTGAGGACGATGATGGGAGCGGCGGCGGGGGCGGGGAGGGGGAGATAGC 134
25 --D--D--M--G--E--D--D--D--G--S--G--G--G--G--G--E--G--E--I--A 45
301 G ATG AGG AGG AGG AGG GGG AGG AGG AGG AGC TGG TGG GCG GCG ACT ACG AGG GCC GCG AG 360
135 GATGAGGAGGAGGAGGGGGAGGAGGAGGAGCTGGTGGGCGGCGACTACGAGGGCCGCGAG 194
45 --M--R--R--R--R--G--R--R--R--S--W--W--A--A--T--T--R--A--A--R 65
361 G CGG AGG GGA GCG ACG AGG TGG TGT CCC GCC GCG AGC AG G AAC ATC AGC AAG CTA AGC GA 420
195 GCGGAGGGGAGCGACGAGGTGGTGTCCCGCCGCGAGCAGGAACATCAGCAAGCTAAGCGA 254
65 --R--R--G--A--T--R--W--C--P--A--A--S--R--N--I--S--K--L--S--D 85
421 T GAA TGG TTT GCG GAT GAA GAA AAA GTT CGT GAT ATT GTT GGA TTA CTT TTA AAT GGA AT 480
255 TGAATGGTTTGCGGATGAAGAAAAAGTTCGTGATATTGTTGGATTACTTTTAAATGGAAT 314
85 --E--W--F--A--D--E--E--K--V--R--D--I--V--G--L--L--L--N--G--I 105
481 T GAT CTT CCT AAC TCT AGA AAG CTA ACT TGT GGA ATA TGT TTT GAA GGG TAT TCT TCT GA 540
315 TGATCTTCCTAACTCTAGAAAGCTAACTTGTGGAATATGTTTTGAAGGGTATTCTTCTGA 374
105 --D--L--P--N--S--R--K--L--T--C--G--I--C--F--E--G--Y--S--S--D 125
541 T GCA ATG AGT TCT GCT GGT TGT GAT CAT TTT TAT TGC CAT GAA TGC TGG GAA G G T TAT AT 600
375 TGCAATGAGTTCTGCTGGTTGTGATCATTTTTATTGCCATGAATGCTGGGAAGGTTATAT 434
125 --A--M--S--S--A--G--C--D--H--F--Y--C--H--E--C--W--E--G--Y--I 145
601 T AGT GCT GCA ATA AGT GAT GGT CCA GGA TGT TTG TCA TTG CGA TGC CCT GAT CCA TCT TG 660
435 TAGTGCTGCAATAAGTGATGGTCCAGGATGTTTGTCATTGCGATGCCCTGATCCATCTTG 494
145 --S--A--A--I--S--D--G--P--G--C--L--S--L--R--C--P--D--P--S--C 165
661 T GGT GCT ATG GTT CTT CAG AAC ATG ATT AAT AAG TTA GCT AAA GAT GAT GAT AAA GTG AG 720
495 TGGTGCTATGGTTCTTCAGAACATGATTAATAAGTTAGCTAAAGATGATGATAAAGTGAG 554
165 --G--A--M--V--L--Q--N--M--I--N--K--L--A--K--D--D--D--K--V--R 185
721 A TAT GCA CGA TTT ATC TTA CGT GCA TAT GTT GAA GAT AGC AAG AAG A CT AAA TGG TGT CC 780
555 ATATGCACGATTTATCTTACGTGCATATGTTGAAGATAGCAAGAAGACTAAATGGTGTCC 614
185 --Y--A--R--F--I--L--R--A--Y--V--E--D--S--K--K--T--K--W--C--P 205
781 A GCT CCT GAC TGT ACA TGT GCA GTG GAA TTT GTC AGC GAT GGG AAC TAT GAT GTC TCA TG 840
615 AGCTCCTGACTGTACATGTGCAGTGGAATTTGTCAGCGATGGGAACTATGATGTCTCATG 674
205 --A--P--D--C--T--C--A--V--E--F--V--S--D--G--N--Y--D--V--S--C 225
841 C AAT TGC AAA TTC AGT TTT TGT TGG AAC TGC ACG GAG GAA GCT CAT CGA CCA GTG AAC TG 900
675 CAATTGCAAATTCAGTTTTTGTTGGAACTGCACGGAGGAAGCTCATCGACCAGTGAACTG 734
225 --N--C--K--F--S--F--C--W--N--C--T--E--E--A--H--R--P--V--N--C 245
901 T GAG ACT GTT TCT AGG TGG ATA TTA AAG AAT AGC GCA GAA TCT GAA AAT ATG AAC TG G AT 960
735 TGAGACTGTTTCTAGGTGGATATTAAAGAATAGCGCAGAATCTGAAAATATGAACTGGAT 794
245 --E--T--V--S--R--W--I--L--K--N--S--A--E--S--E--N--M--N--W--I 265
961 A CTG GCT AAT TCT AAG CCG TGC CCG AAA TGC AAA CGA CCA ATA GAG AAA AAC CAG GGA TG 1020
795 ACTGGCTAATTCTAAGCCGTGCCCGAAATGCAAACGACCAATAGAGAAAAACCAGGGATG 854
265 --L--A--N--S--K--P--C--P--K--C--K--R--P--I--E--K--N--Q--G--C 285
1021 C ATG CAT ATG ACT TGC ACT CCA CCT TGC AAA TTT GAG TTC TGC TG G TTA TGT CTG GGT TC 1080
855 CATGCATATGACTTGCACTCCACCTTGCAAATTTGAGTTCTGCTGGTTATGTCTGGGTTC 914
285 --M--H--M--T--C--T--P--P--C--K--F--E--F--C--W--L--C--L--G--S 305
1081 A TGG GCT GAA CAT GGG GAG AGA ACT GGT GGA TTT TAC GCT TGT AAT CGC TAT GAA TCA GC 1140
915 ATGGGCTGAACATGGGGAGAGAACTGGTGGATTTTACGCTTGTAATCGCTATGAATCAGC 974
305 --W--A--E--H--G--E--R--T--G--G--F--Y--A--C--N--R--Y--E--S--A 325
1141 A AAG AAG GAG GGA GTT TAT GAT GAG ACT GAA GCA AGG AGG GAA AGA GCC AAA AAT TCA CT 1200
975 AAAGAAGGAGGGAGTTTATGATGAGACTGAAGCAAGGAGGGAAAGAGCCAAAAATTCACT 1034
325 --K--K--E--G--V--Y--D--E--T--E--A--R--R--E--R--A--K--N--S--L 345
1201 T GAG AGA TAC ATG CAT TAC TAT GAG CGC TGG GCA TCT AAT CAG ACG T CG AGG CAG AAG GC 1260
1035 TGAGAGATACATGCATTACTATGAGCGCTGGGCATCTAATCAGACGTCGAGGCAGAAGGC 1094
345 --E--R--Y--M--H--Y--Y--E--R--W--A--S--N--Q--T--S--R--Q--K--A 365
1261 A CAA GCA GAT CTG CAA AAG GCA GAA AAG GAA CAA C TT GCA AAA TTA ACA GAT GTT TTT GG 1320
1095 ACAAGCAGATCTGCAAAAGGCAGAAAAGGAACAACTTGCAAAATTAACAGATGTTTTTGG 1154
365 --Q--A--D--L--Q--K--A--E--K--E--Q--L--A--K--L--T--D--V--F--G 385
1321 A ATA CCG GAG ACC CAA CTG AAG TTC ATA ATT GAA GCT TGG TCA CAG ATT ATT GAA TGC AG 1380
1155 AATACCGGAGACCCAACTGAAGTTCATAATTGAAGCTTGGTCACAGATTATTGAATGCAG 1214
385 --I--P--E--T--Q--L--K--F--I--I--E--A--W--S--Q--I--I--E--C--R 405
1381 G CGG GTG CTC AAA TGG ACA TAT GCT TAT GGC TAT TAT CTG GAC GAC AAG GTC AAG AGC GA 1440
1215 GCGGGTGCTCAAATGGACATATGCTTATGGCTATTATCTGGACGACAAGGTCAAGAGCGA 1274
405 --R--V--L--K--W--T--Y--A--Y--G--Y--Y--L--D--D--K--V--K--S--E 425
1441 A TTT TTC GAG TAC CTG CAA G GT GAA GCT GAG TCT GGT CTG GAG CGT CTT CAC CAA TGT GC 1500
1275 ATTTTTCGAGTACCTGCAAGGTGAAGCTGAGTCTGGTCTGGAGCGTCTTCACCAATGTGC 1334
425 --F--F--E--Y--L--Q--G--E--A--E--S--G--L--E--R--L--H--Q--C--A 445
1501 T GAG AAA GAC CTG CAA TCA TTT TTG ACT GTG AGA TCT GAT AAT ACT GAA CCT GCA CCA TC 1560
1335 TGAGAAAGACCTGCAATCATTTTTGACTGTGAGATCTGATAATACTGAACCTGCACCATC 1394
445 --E--K--D--L--Q--S--F--L--T--V--R--S--D--N--T--E--P--A--P--S 465
1561 A ATT GCT GAA TTC GGT GAC TTC CGG GTG AAG CTT GCG GGG CTG ACA AG T GTG ACT CGG AA 1620
1395 AATTGCTGAATTCGGTGACTTCCGGGTGAAGCTTGCGGGGCTGACAAGTGTGACTCGGAA 1454
465 --I--A--E--F--G--D--F--R--V--K--L--A--G--L--T--S--V--T--R--N 485
1621 T TAT TTT GAG AAC CTT GTT CAA GCA CTG GAG GCT GGC TTG GAG GAT GTA CAC TCT ACT GC 1680
1455 TTATTTTGAGAACCTTGTTCAAGCACTGGAGGCTGGCTTGGAGGATGTACACTCTACTGC 1514
485 --Y--F--E--N--L--V--Q--A--L--E--A--G--L--E--D--V--H--S--T--A 505
1681 C CAG GGT ACC ACA TCA AGC AAT GCC ACC AAC ATC CCC TCC AAG AAA GCA GTC ACT AAA GG 1740
1515 CCAGGGTACCACATCAAGCAATGCCACCAACATCCCCTCCAAGAAAGCAGTCACTAAAGG 1574
505 --Q--G--T--T--S--S--N--A--T--N--I--P--S--K--K--A--V--T--K--G 525
1741 C AAA ACA AAG AAG CAG CTT CCT AGA ACA TCT TCG GAC AAC TCA GAT GAA GGC TGG CCT TG 1800
1575 CAAAACAAAGAAGCAGCTTCCTAGAACATCTTCGGACAACTCAGATGAAGGCTGGCCTTG 1634
525 --K--T--K--K--Q--L--P--R--T--S--S--D--N--S--D--E--G--W--P--C 545
1801 T GAG CGC TGC ACG TTT ATT AAC CCT TCA TCG GTG GAT GCA TGC AGC GTT TGC GAT AAG CA 1860
1635 TGAGCGCTGCACGTTTATTAACCCTTCATCGGTGGATGCATGCAGCGTTTGCGATAAGCA 1694
545 --E--R--C--T--F--I--N--P--S--S--V--D--A--C--S--V--C--D--K--H 565
1861 T AGA TAC TAG ATGAAAAACTGGCTGAAAGCCAGTGCCCCCTATAAATCTCGAAGCTGTTG 1920
1695 TAGATACTAG.................................................. 1704
565 --R--Y--*-.................................................. 567
1921 AGAAGGTGGGTGCTTACTCAAAGCTCATGAGAAGATTGTTGATTGTAGTTCTGTTCCTAA 1980
............................................................
............................................................
1981 ATTATGTGGCGTTGAAGAAGAGCTTCCAATGGCAGCAATGGCGTACATGTGTGAGTGAAG 2040
............................................................
............................................................
2041 GTCCCTGGTATCTAGTTTGCAACAACAATGCAGGACCGACTATGGAGCGAAGGTGGATGG 2100
............................................................
............................................................
2101 GGTACAAACATGTGGTAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTCTAGCCTATATTATGTACA 2160
............................................................
............................................................
2161 TATTAGTTATGGTCTGTAGTTGTGTTAATGTGGTGGGCAATGTTCTGTTTTTGTTTAAAT 2220
............................................................
............................................................
2221 GGCATGAGATGATGTGGTGGGTAAAGTTCCACTCCTGTACTGACCAACCTGTGAAGCTGG 2280
............................................................
............................................................
2281 AGAATGGTAGATGTAGCTCTTATCTATTGAGCGGTCATGTAAATTACCAAAGCTCGTCAT 2340
............................................................
............................................................
2341 AATCTATGGTTGATATATCATGTG 2364
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