Transcript: OBART07G12280.1
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Description
Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G40360) TAIR;Acc:AT2G40360]
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- OBART07G12280.1 1947 648aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3GQA2 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GGG CAC AGC GAC GGC GAC CAC GGT AGC GAC CTC TCC GCC GAC GAT TCC CCG TGG AGC 60
1 ATGGGGCACAGCGACGGCGACCACGGTAGCGACCTCTCCGCCGACGATTCCCCGTGGAGC 60
1 -M--G--H--S--D--G--D--H--G--S--D--L--S--A--D--D--S--P--W--S- 20
61 GAG GGG AGC TGG TCC GAC GAC GAT GAC GAG G GA TCG CTA TCC TTC GAG GAC AGC GGC GAA 120
61 GAGGGGAGCTGGTCCGACGACGATGACGAGGGATCGCTATCCTTCGAGGACAGCGGCGAA 120
21 -E--G--S--W--S--D--D--D--D--E--G--S--L--S--F--E--D--S--G--E- 40
121 GGC TCC GAC GCC GAG TCC GAC GAA CCG GAT GCC CCG GCG GTG GAG GAG AGC GAC TCT TCT 180
121 GGCTCCGACGCCGAGTCCGACGAACCGGATGCCCCGGCGGTGGAGGAGAGCGACTCTTCT 180
41 -G--S--D--A--E--S--D--E--P--D--A--P--A--V--E--E--S--D--S--S- 60
181 GAG GAC GAG GTG GCG CCA CGG AAT ACG GTA GGA GAT GTG CCG TTG GAA TGG TAC AAG AAC 240
181 GAGGACGAGGTGGCGCCACGGAATACGGTAGGAGATGTGCCGTTGGAATGGTACAAGAAC 240
61 -E--D--E--V--A--P--R--N--T--V--G--D--V--P--L--E--W--Y--K--N- 80
241 GAG GAG CAC ATC GGC TAT GAC ATC ACT GGT AGT AAG ATC AAG AAG CGG GAT AGG GAG GGC 300
241 GAGGAGCACATCGGCTATGACATCACTGGTAGTAAGATCAAGAAGCGGGATAGGGAGGGC 300
81 -E--E--H--I--G--Y--D--I--T--G--S--K--I--K--K--R--D--R--E--G- 100
301 CGA ATT GAG GCC TAC CTC AGG AAT GCT GAT GAT GCT AAG AAT TG G AGA AAG ATC TAT GAC 360
301 CGAATTGAGGCCTACCTCAGGAATGCTGATGATGCTAAGAATTGGAGAAAGATCTATGAC 360
101 -R--I--E--A--Y--L--R--N--A--D--D--A--K--N--W--R--K--I--Y--D- 120
361 GAG TAT AAT GAT GAA GAG GTG CAG ATT ACC AAG GAA GAG GCT AAG ATA ATT AGT AGA TTG 420
361 GAGTATAATGATGAAGAGGTGCAGATTACCAAGGAAGAGGCTAAGATAATTAGTAGATTG 420
121 -E--Y--N--D--E--E--V--Q--I--T--K--E--E--A--K--I--I--S--R--L- 140
421 CTG AAG GGA AAG ACT CCA CAC ACA AAT GTG GAT CCA TAT CCA GAT TAT GTT GAT TGG TTT 480
421 CTGAAGGGAAAGACTCCACACACAAATGTGGATCCATATCCAGATTATGTTGATTGGTTT 480
141 -L--K--G--K--T--P--H--T--N--V--D--P--Y--P--D--Y--V--D--W--F- 160
481 GAA TAT GAT GGT AAA GGC CAT CCA CTT TCT AGT GCT CCG GAG CCA AAG AGG CGA TTT GTA 540
481 GAATATGATGGTAAAGGCCATCCACTTTCTAGTGCTCCGGAGCCAAAGAGGCGATTTGTA 540
161 -E--Y--D--G--K--G--H--P--L--S--S--A--P--E--P--K--R--R--F--V- 180
541 CCC TCG AAG TGG GAA CAG AAG AAG GTT GTT AAA CTT GTT AGA GCC ATT CGT AAA GGA TGG 600
541 CCCTCGAAGTGGGAACAGAAGAAGGTTGTTAAACTTGTTAGAGCCATTCGTAAAGGATGG 600
181 -P--S--K--W--E--Q--K--K--V--V--K--L--V--R--A--I--R--K--G--W- 200
601 ATA AAG TTT GAT AAG CGA AAG GAG GAA CCT AAC TTT TAT CTC TTG TGG GGA GAT GAA ACT 660
601 ATAAAGTTTGATAAGCGAAAGGAGGAACCTAACTTTTATCTCTTGTGGGGAGATGAAACT 660
201 -I--K--F--D--K--R--K--E--E--P--N--F--Y--L--L--W--G--D--E--T- 220
661 GAT ACA GCA GAC AAT AAG CGG CAA GGC CTG AGC TAC ATT CCT GCA CCC AAA CCA AAT TTG 720
661 GATACAGCAGACAATAAGCGGCAAGGCCTGAGCTACATTCCTGCACCCAAACCAAATTTG 720
221 -D--T--A--D--N--K--R--Q--G--L--S--Y--I--P--A--P--K--P--N--L- 240
721 CCA G GT CAT GAA GAG TCA TAT AAT CCT TCT GTT GAA TAC ATT CCA ACA CAA GAG GAG ATA 780
721 CCAGGTCATGAAGAGTCATATAATCCTTCTGTTGAATACATTCCAACACAAGAGGAGATA 780
241 -P--G--H--E--E--S--Y--N--P--S--V--E--Y--I--P--T--Q--E--E--I- 260
781 GAT TCA TAT CAG CTT ATG TAT GAG GAG GAC AGG CCA AAG TTT ATT CCA CGA AA A TTT GAT 840
781 GATTCATATCAGCTTATGTATGAGGAGGACAGGCCAAAGTTTATTCCACGAAAATTTGAT 840
261 -D--S--Y--Q--L--M--Y--E--E--D--R--P--K--F--I--P--R--K--F--D- 280
841 TGT CTT AGA AGT GTA CCT GCA TAT GAG AAG GCA CTT AGG GAA GGC TTT GAT CGG TGT CTA 900
841 TGTCTTAGAAGTGTACCTGCATATGAGAAGGCACTTAGGGAAGGCTTTGATCGGTGTCTA 900
281 -C--L--R--S--V--P--A--Y--E--K--A--L--R--E--G--F--D--R--C--L- 300
901 GAT CTT TAT CTC TGC CCT AGA ACA CGC AAG AAG CGT ATA AAC ATT GAT CCT GAG TCA CTC 960
901 GATCTTTATCTCTGCCCTAGAACACGCAAGAAGCGTATAAACATTGATCCTGAGTCACTC 960
301 -D--L--Y--L--C--P--R--T--R--K--K--R--I--N--I--D--P--E--S--L- 320
961 AAG CCA AAG TTA CCC AGT AAA AAG GAT TTG AGG CCA TAC CCA AGA ACA TGT TAC CTT GAG 1020
961 AAGCCAAAGTTACCCAGTAAAAAGGATTTGAGGCCATACCCAAGAACATGTTACCTTGAG 1020
321 -K--P--K--L--P--S--K--K--D--L--R--P--Y--P--R--T--C--Y--L--E- 340
1021 TTC AAG GGG CAT AAT GGT CCA GTG AAG TCT CTT TCA GTT GAA GCA ACT GGG CAA TGG ATA 1080
1021 TTCAAGGGGCATAATGGTCCAGTGAAGTCTCTTTCAGTTGAAGCAACTGGGCAATGGATA 1080
341 -F--K--G--H--N--G--P--V--K--S--L--S--V--E--A--T--G--Q--W--I- 360
1081 GCA TCT G G T TCA TCT GAT GGA ACA ATT CGT GTT TGG GAG GTT GAA ACT GGT CGC TGC ATT 1140
1081 GCATCTGGTTCATCTGATGGAACAATTCGTGTTTGGGAGGTTGAAACTGGTCGCTGCATT 1140
361 -A--S--G--S--S--D--G--T--I--R--V--W--E--V--E--T--G--R--C--I- 380
1141 AAG GTT TGG AAT GTT GGT GGT GTT GTT CAC CGT ATT GCC TGG AAT CCT TCA CCT GAT AGA 1200
1141 AAGGTTTGGAATGTTGGTGGTGTTGTTCACCGTATTGCCTGGAATCCTTCACCTGATAGA 1200
381 -K--V--W--N--V--G--G--V--V--H--R--I--A--W--N--P--S--P--D--R- 400
1201 CAC ATT CTT GCT GCT GTT GT A GAC CAT GAT CTG CTG CTT CTT AAT GCT GAG GTT GGG GAT 1260
1201 CACATTCTTGCTGCTGTTGTAGACCATGATCTGCTGCTTCTTAATGCTGAGGTTGGGGAT 1260
401 -H--I--L--A--A--V--V--D--H--D--L--L--L--L--N--A--E--V--G--D- 420
1261 GAA GAC GCT CAA ACG AAG ACA AAA GGG CTC CTC CAA ATC GAG GAA CTG GCT CAG GAA GAG 1320
1261 GAAGACGCTCAAACGAAGACAAAAGGGCTCCTCCAAATCGAGGAACTGGCTCAGGAAGAG 1320
421 -E--D--A--Q--T--K--T--K--G--L--L--Q--I--E--E--L--A--Q--E--E- 440
1321 GAT AAT G G T GAT AAG AAA TCA GCT GTC AAG TGG GTC AAG CAT GAA AAA TTT GAT GGA ATC 1380
1321 GATAATGGTGATAAGAAATCAGCTGTCAAGTGGGTCAAGCATGAAAAATTTGATGGAATC 1380
441 -D--N--G--D--K--K--S--A--V--K--W--V--K--H--E--K--F--D--G--I- 460
1381 ATG TTG ATT CAT CAT AAG CTC TCT AAG AAG CAT TCG CAT CAT CCT TTC CGT AAA TTG CCA 1440
1381 ATGTTGATTCATCATAAGCTCTCTAAGAAGCATTCGCATCATCCTTTCCGTAAATTGCCA 1440
461 -M--L--I--H--H--K--L--S--K--K--H--S--H--H--P--F--R--K--L--P- 480
1441 GGC CTT CCT ATT GCA GCA GTG TTT CAT CCA AGT CAA AAG ATG TTC TTT GTG GCC ACT AAG 1500
1441 GGCCTTCCTATTGCAGCAGTGTTTCATCCAAGTCAAAAGATGTTCTTTGTGGCCACTAAG 1500
481 -G--L--P--I--A--A--V--F--H--P--S--Q--K--M--F--F--V--A--T--K- 500
1501 AAA TTT GTT CAG GTT TAT GAT CTC CAG AAG GCA CAG TTA GTC AAG AAG TTG GAG TCA GGT 1560
1501 AAATTTGTTCAGGTTTATGATCTCCAGAAGGCACAGTTAGTCAAGAAGTTGGAGTCAGGT 1560
501 -K--F--V--Q--V--Y--D--L--Q--K--A--Q--L--V--K--K--L--E--S--G- 520
1561 GTT CGT GAG ATT TCC TCC ATC TCG ATA CAT CCT GGT G GT GAT AAT GTT ATC GTG GGC AGC 1620
1561 GTTCGTGAGATTTCCTCCATCTCGATACATCCTGGTGGTGATAATGTTATCGTGGGCAGC 1620
521 -V--R--E--I--S--S--I--S--I--H--P--G--G--D--N--V--I--V--G--S- 540
1621 AAA GAT GGT AAA TTG TGT TGG TTC GAT ACT GAT CTA TCC ACG CGA CCA TAC AAG ACA TTA 1680
1621 AAAGATGGTAAATTGTGTTGGTTCGATACTGATCTATCCACGCGACCATACAAGACATTA 1680
541 -K--D--G--K--L--C--W--F--D--T--D--L--S--T--R--P--Y--K--T--L- 560
1681 AA G AAC CAC TCG AAG GAT ATC ACT AAT GTT ACT TTT CAC CGG AAA TAT CCT CTT TTT GCC 1740
1681 AAGAACCACTCGAAGGATATCACTAATGTTACTTTTCACCGGAAATATCCTCTTTTTGCC 1740
561 -K--N--H--S--K--D--I--T--N--V--T--F--H--R--K--Y--P--L--F--A- 580
1741 TCA TCC TCA GAG GAT TGT ACG GCC TAT GTA TTC CAT GGA ATG GTC TAT TCA GAT CTT AAC 1800
1741 TCATCCTCAGAGGATTGTACGGCCTATGTATTCCATGGAATGGTCTATTCAGATCTTAAC 1800
581 -S--S--S--E--D--C--T--A--Y--V--F--H--G--M--V--Y--S--D--L--N- 600
1801 CAA AAC CCA CTT ATT GTA CCA TTG GAA ATT CTT CGT GGT CAT TCA AGT TCA GAT GGA AGA 1860
1801 CAAAACCCACTTATTGTACCATTGGAAATTCTTCGTGGTCATTCAAGTTCAGATGGAAGA 1860
601 -Q--N--P--L--I--V--P--L--E--I--L--R--G--H--S--S--S--D--G--R- 620
1861 G GA GTT CTG GAT TGC AAA TTC CAC CCA AGA CAG CCT TGG TTG TTC ACT GCT GGT GCT GAC 1920
1861 GGAGTTCTGGATTGCAAATTCCACCCAAGACAGCCTTGGTTGTTCACTGCTGGTGCTGAC 1920
621 -G--V--L--D--C--K--F--H--P--R--Q--P--W--L--F--T--A--G--A--D- 640
1921 TCT GTC GTT AGG CTT TAT TGC GAC TAA 1947
1921 TCTGTCGTTAGGCTTTATTGCGACTAA 1947
641 -S--V--V--R--L--Y--C--D--*- 648
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