Transcript: OBART07G01670.1
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Description
transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT3G18860) TAIR;Acc:AT3G18860]
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- OBART07G01670.1 2115 704aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3GLU1 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GCG CAG TAC CAC CTC AGC GCG CAG CTA CGC GGC CAC GAG GAT GAC G TT CGT GGC ATT 60
1 ATGGCGCAGTACCACCTCAGCGCGCAGCTACGCGGCCACGAGGATGACGTTCGTGGCATT 60
1 -M--A--Q--Y--H--L--S--A--Q--L--R--G--H--E--D--D--V--R--G--I- 20
61 TGT ATC TGT GGG GAT GCT GGG ATT GCA ACA TCC TCA AGA GAC CGG ACA GTG AGA TTC TGG 120
61 TGTATCTGTGGGGATGCTGGGATTGCAACATCCTCAAGAGACCGGACAGTGAGATTCTGG 120
21 -C--I--C--G--D--A--G--I--A--T--S--S--R--D--R--T--V--R--F--W- 40
121 ACA CAG CAC CCA GAA AAG AAG CAT GAA TAC GTT CTC TCG AAG ACT CTT GTT GGA CAT TCC 180
121 ACACAGCACCCAGAAAAGAAGCATGAATACGTTCTCTCGAAGACTCTTGTTGGACATTCC 180
41 -T--Q--H--P--E--K--K--H--E--Y--V--L--S--K--T--L--V--G--H--S- 60
181 AGT TTT GTG GGA CCA TTG GCT TGG ATC CCT CCT TCA GAC CGC TTT CCT GAA GGA GGA CTT 240
181 AGTTTTGTGGGACCATTGGCTTGGATCCCTCCTTCAGACCGCTTTCCTGAAGGAGGACTT 240
61 -S--F--V--G--P--L--A--W--I--P--P--S--D--R--F--P--E--G--G--L- 80
241 GTT TCT GGT GGA ATG GAT ACT CTT GTT TTG CTC TGG GAT TTG CAT AAA GGA GAA GTT GTT 300
241 GTTTCTGGTGGAATGGATACTCTTGTTTTGCTCTGGGATTTGCATAAAGGAGAAGTTGTT 300
81 -V--S--G--G--M--D--T--L--V--L--L--W--D--L--H--K--G--E--V--V- 100
301 GAG ACT ATG AAG GGT CAC ACT TCA CAA GTT ACT GGA CTT GCT GTA GAC AAC AAT GGC GAC 360
301 GAGACTATGAAGGGTCACACTTCACAAGTTACTGGACTTGCTGTAGACAACAATGGCGAC 360
101 -E--T--M--K--G--H--T--S--Q--V--T--G--L--A--V--D--N--N--G--D- 120
361 ATC ATC TCT TCA TCC ATG GAT TG C ACT GTA AGA CGG TGG AGA AAT GGC AGT GCA GTA GAG 420
361 ATCATCTCTTCATCCATGGATTGCACTGTAAGACGGTGGAGAAATGGCAGTGCAGTAGAG 420
121 -I--I--S--S--S--M--D--C--T--V--R--R--W--R--N--G--S--A--V--E- 140
421 G CT CAA GTG ATT CGA CAA TTA AGT TTT GGA AAG GAA GGA CAT GTC TAC ATA CAT TCA CAG 480
421 GCTCAAGTGATTCGACAATTAAGTTTTGGAAAGGAAGGACATGTCTACATACATTCACAG 480
141 -A--Q--V--I--R--Q--L--S--F--G--K--E--G--H--V--Y--I--H--S--Q- 160
481 GAC ATG CAG G TG TGG GCA TTA ACT GGC CAG CCC CTG TTG GAG ATG ATT GGA CAC ACT TCT 540
481 GACATGCAGGTGTGGGCATTAACTGGCCAGCCCCTGTTGGAGATGATTGGACACACTTCT 540
161 -D--M--Q--V--W--A--L--T--G--Q--P--L--L--E--M--I--G--H--T--S- 180
541 CTT GTG TAT TCT GTG GAT GCA CAT TCA TCT GGG GTA ATT GTT AGT GGC AGT GAA GAT CGA 600
541 CTTGTGTATTCTGTGGATGCACATTCATCTGGGGTAATTGTTAGTGGCAGTGAAGATCGA 600
181 -L--V--Y--S--V--D--A--H--S--S--G--V--I--V--S--G--S--E--D--R- 200
601 TCT GCC AAG ATA TGG AAA G A T GGG ATC TGT GTT CAA AGC ATT GAA CAC CCA GGT TGC ATA 660
601 TCTGCCAAGATATGGAAAGATGGGATCTGTGTTCAAAGCATTGAACACCCAGGTTGCATA 660
201 -S--A--K--I--W--K--D--G--I--C--V--Q--S--I--E--H--P--G--C--I- 220
661 TGG GGT GCT AAA TTC TTG GAA AAC GGA GAT ATT GTA ACT GCA TGC TCT GAT GGA ATC GTG 720
661 TGGGGTGCTAAATTCTTGGAAAACGGAGATATTGTAACTGCATGCTCTGATGGAATCGTG 720
221 -W--G--A--K--F--L--E--N--G--D--I--V--T--A--C--S--D--G--I--V- 240
721 AGG ATA TGG ACA ACT GAC AAT AAT AGG TTT TGC AGT GAT GAG GAG CTT GCA GCT TTT ACA 780
721 AGGATATGGACAACTGACAATAATAGGTTTTGCAGTGATGAGGAGCTTGCAGCTTTTACA 780
241 -R--I--W--T--T--D--N--N--R--F--C--S--D--E--E--L--A--A--F--T- 260
781 GAT CTT ATT TCT CAG TAC ACA CTT AGT AG A AAG ACT GTC GGT GGA TTG AAG TTG TCG GAT 840
781 GATCTTATTTCTCAGTACACACTTAGTAGAAAGACTGTCGGTGGATTGAAGTTGTCGGAT 840
261 -D--L--I--S--Q--Y--T--L--S--R--K--T--V--G--G--L--K--L--S--D- 280
841 CTA CCA GGA ATT GAG GCA CTG CAA GTT CCA G G A AAC TCT GAT GGT CAG ACA CTG ATT GTT 900
841 CTACCAGGAATTGAGGCACTGCAAGTTCCAGGAAACTCTGATGGTCAGACACTGATTGTT 900
281 -L--P--G--I--E--A--L--Q--V--P--G--N--S--D--G--Q--T--L--I--V- 300
901 AGA GAA GGG GAC AAT GGT GTT GCT TAT TCT TGG AAT TCA AAA GAG CTA AAA TGG GAC AAA 960
901 AGAGAAGGGGACAATGGTGTTGCTTATTCTTGGAATTCAAAAGAGCTAAAATGGGACAAA 960
301 -R--E--G--D--N--G--V--A--Y--S--W--N--S--K--E--L--K--W--D--K- 320
961 A TT GGT GAA GTA GTG GAT GGA CCT GGG GAT GCT GCA GCT GCA CCA GGC CAG TTT CAT GAT 1020
961 ATTGGTGAAGTAGTGGATGGACCTGGGGATGCTGCAGCTGCACCAGGCCAGTTTCATGAT 1020
321 -I--G--E--V--V--D--G--P--G--D--A--A--A--A--P--G--Q--F--H--D- 340
1021 GGT GTT CGT TAT GAT TTT G T T TTT AAT GTT GAC ATT GGA GAT GGA GAG CCT ATG CGA AAG 1080
1021 GGTGTTCGTTATGATTTTGTTTTTAATGTTGACATTGGAGATGGAGAGCCTATGCGAAAG 1080
341 -G--V--R--Y--D--F--V--F--N--V--D--I--G--D--G--E--P--M--R--K- 360
1081 CTA CCC TAT AAT CGA TCA G A T GAT CCG TAT GCA GTT GCG GAC AAA TGG CTC CTG AAG GAG 1140
1081 CTACCCTATAATCGATCAGATGATCCGTATGCAGTTGCGGACAAATGGCTCCTGAAGGAG 1140
361 -L--P--Y--N--R--S--D--D--P--Y--A--V--A--D--K--W--L--L--K--E- 380
1141 AAT CTC CCT TTG ACA TAT CGC CAA CAA GTG GTA GAA TTT ATA CTA CAG AAT TCT GGC CAG 1200
1141 AATCTCCCTTTGACATATCGCCAACAAGTGGTAGAATTTATACTACAGAATTCTGGCCAG 1200
381 -N--L--P--L--T--Y--R--Q--Q--V--V--E--F--I--L--Q--N--S--G--Q- 400
1201 AAT AAT TTT GTT CCA GAT CCA TCT TTT CGG GAC CCC TAC ACT GGA G C T AAT GCA TAT GTA 1260
1201 AATAATTTTGTTCCAGATCCATCTTTTCGGGACCCCTACACTGGAGCTAATGCATATGTA 1260
401 -N--N--F--V--P--D--P--S--F--R--D--P--Y--T--G--A--N--A--Y--V- 420
1261 CCT GGG CAA TCA GCG TCT TCA ACT G TT AGT GCT CCT AAA CCA ACT TTC AAG CAC ATA CCA 1320
1261 CCTGGGCAATCAGCGTCTTCAACTGTTAGTGCTCCTAAACCAACTTTCAAGCACATACCA 1320
421 -P--G--Q--S--A--S--S--T--V--S--A--P--K--P--T--F--K--H--I--P- 440
1321 AAG A AT GGA ATG CTG ACA TTT GAG ACG GCT CAG TTT GAG GGA ATT CTA AAG AAA CTC TCT 1380
1321 AAGAATGGAATGCTGACATTTGAGACGGCTCAGTTTGAGGGAATTCTAAAGAAACTCTCT 1380
441 -K--N--G--M--L--T--F--E--T--A--Q--F--E--G--I--L--K--K--L--S- 460
1381 GAA TTC AAT GCA ACA CTT TCA TCT AAT TTG GAA CAG AAG GAA CTA TCT TTG TCT GAG ATC 1440
1381 GAATTCAATGCAACACTTTCATCTAATTTGGAACAGAAGGAACTATCTTTGTCTGAGATC 1440
461 -E--F--N--A--T--L--S--S--N--L--E--Q--K--E--L--S--L--S--E--I- 480
1441 GAG TTG TCC AGA TTA GCT GCC ATA GCA AAA GTA TTG AAA GAA ACA TCA TTT TAT CAT ACA 1500
1441 GAGTTGTCCAGATTAGCTGCCATAGCAAAAGTATTGAAAGAAACATCATTTTATCATACA 1500
481 -E--L--S--R--L--A--A--I--A--K--V--L--K--E--T--S--F--Y--H--T- 500
1501 AGT AAG CTT GCA GAT GCT GAC ATG ACC TTG CTG CTG AAA ATG TTG AAG TCT TGG CCT ACA 1560
1501 AGTAAGCTTGCAGATGCTGACATGACCTTGCTGCTGAAAATGTTGAAGTCTTGGCCTACA 1560
501 -S--K--L--A--D--A--D--M--T--L--L--L--K--M--L--K--S--W--P--T- 520
1561 CAA ATG ATG TTT CCA G T T ATT GAT TTT CTG AGG ATG TTT GTG TTG CAT CCT GAT GGA GCC 1620
1561 CAAATGATGTTTCCAGTTATTGATTTTCTGAGGATGTTTGTGTTGCATCCTGATGGAGCC 1620
521 -Q--M--M--F--P--V--I--D--F--L--R--M--F--V--L--H--P--D--G--A- 540
1621 ACT CTA CTT CTC AAG GCT ATT GAA AGT GGA AAT G A T GTA CTT GCC GAG ACT TTC CAT AAG 1680
1621 ACTCTACTTCTCAAGGCTATTGAAAGTGGAAATGATGTACTTGCCGAGACTTTCCATAAG 1680
541 -T--L--L--L--K--A--I--E--S--G--N--D--V--L--A--E--T--F--H--K- 560
1681 GTT GTA ACG CCA CCT GTG CAG CCA CCA AAT GTG CTT ACA ACC CTT AAA GCA GTT ACT AAC 1740
1681 GTTGTAACGCCACCTGTGCAGCCACCAAATGTGCTTACAACCCTTAAAGCAGTTACTAAC 1740
561 -V--V--T--P--P--V--Q--P--P--N--V--L--T--T--L--K--A--V--T--N- 580
1741 TTA TTT GAC AAG CCA TGC TTG CAC CAA TGG TTG AGA ATC CAT GGC ATG GAG ATT ATT GAT 1800
1741 TTATTTGACAAGCCATGCTTGCACCAATGGTTGAGAATCCATGGCATGGAGATTATTGAT 1800
581 -L--F--D--K--P--C--L--H--Q--W--L--R--I--H--G--M--E--I--I--D- 600
1801 TCA GTA TCA AGC TGT AAG ACA ACT TTT AGC AAG AAT GCT CAC CTG GCA TAT TCC ACA CTT 1860
1801 TCAGTATCAAGCTGTAAGACAACTTTTAGCAAGAATGCTCACCTGGCATATTCCACACTT 1860
601 -S--V--S--S--C--K--T--T--F--S--K--N--A--H--L--A--Y--S--T--L- 620
1861 CTA CTC AA T TAT GCT GTT CTT TCA ATC GAA TCA AAG GAT GAA CAA AGT CAG GCA CAG ATA 1920
1861 CTACTCAATTATGCTGTTCTTTCAATCGAATCAAAGGATGAACAAAGTCAGGCACAGATA 1920
621 -L--L--N--Y--A--V--L--S--I--E--S--K--D--E--Q--S--Q--A--Q--I- 640
1921 CTT TCT GCT GCC CTT GAA ATC GCT GAA GAC GAC ACC CAA GAT GCT GAT TCG AAA TAC CGG 1980
1921 CTTTCTGCTGCCCTTGAAATCGCTGAAGACGACACCCAAGATGCTGATTCGAAATACCGG 1980
641 -L--S--A--A--L--E--I--A--E--D--D--T--Q--D--A--D--S--K--Y--R- 660
1981 GCC CTT ATG TTG AAT GGC CTT GTG AAG TCC ATT GCT CTT GAT CTT GAT GTT AAG AGT GTT 2040
1981 GCCCTTATGTTGAATGGCCTTGTGAAGTCCATTGCTCTTGATCTTGATGTTAAGAGTGTT 2040
661 -A--L--M--L--N--G--L--V--K--S--I--A--L--D--L--D--V--K--S--V- 680
2041 GCG AAC ACC GCA AGA GCT TCA AAG GAC TCG AAG ATC GCT GAA GTT GGA GCC GAC ATC GAG 2100
2041 GCGAACACCGCAAGAGCTTCAAAGGACTCGAAGATCGCTGAAGTTGGAGCCGACATCGAG 2100
681 -A--N--T--A--R--A--S--K--D--S--K--I--A--E--V--G--A--D--I--E- 700
2101 CTT CTG ACA AGA TGA 2115
2101 CTTCTGACAAGATGA 2115
701 -L--L--T--R--*- 704
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