Transcript: OBART03G17590.1
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- OBART03G17590.1 1631 521aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3FIK2 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GAG AAC CCC AGG CCA CAG GCC CCT GCG GGG ACC CCT CCC ATG GCT CCC CTC CCT GTG 60
1 ATGGAGAACCCCAGGCCACAGGCCCCTGCGGGGACCCCTCCCATGGCTCCCCTCCCTGTG 60
1 -M--E--N--P--R--P--Q--A--P--A--G--T--P--P--M--A--P--L--P--V- 20
61 CCC CTT ACC ATC GCC CCA TCC CAG CCC CGC CTC CGC GAG CCC CCG CGC CCG CCC CGG CCG 120
61 CCCCTTACCATCGCCCCATCCCAGCCCCGCCTCCGCGAGCCCCCGCGCCCGCCCCGGCCG 120
21 -P--L--T--I--A--P--S--Q--P--R--L--R--E--P--P--R--P--P--R--P- 40
121 CCG CCG CTG CCG TCG CCT CCA CCT CCG CGG CAG GAG GAG GAG GGG GCG GCG GCT GAG TAC 180
121 CCGCCGCTGCCGTCGCCTCCACCTCCGCGGCAGGAGGAGGAGGGGGCGGCGGCTGAGTAC 180
41 -P--P--L--P--S--P--P--P--P--R--Q--E--E--E--G--A--A--A--E--Y- 60
181 GAG GTC TCC GAT GAC CAC CGC GCA GCG CGG GAG CGC CAC GAG CGC GCG GTG CAG GAG CTG 240
181 GAGGTCTCCGATGACCACCGCGCAGCGCGGGAGCGCCACGAGCGCGCGGTGCAGGAGCTG 240
61 -E--V--S--D--D--H--R--A--A--R--E--R--H--E--R--A--V--Q--E--L- 80
241 CTC CAG CGC CGC CGC GCC TTC GCC ATG GCC GTG CCC ACC AAC GAC TCC GCC GTG CGG GCG 300
241 CTCCAGCGCCGCCGCGCCTTCGCCATGGCCGTGCCCACCAACGACTCCGCCGTGCGGGCG 300
81 -L--Q--R--R--R--A--F--A--M--A--V--P--T--N--D--S--A--V--R--A- 100
301 CGC CTC CGC CGC CTC GGC GAG CCC GTC ACG CTC TTC GGC GAG CGC GAG ATG GAG CGC CGG 360
301 CGCCTCCGCCGCCTCGGCGAGCCCGTCACGCTCTTCGGCGAGCGCGAGATGGAGCGCCGG 360
101 -R--L--R--R--L--G--E--P--V--T--L--F--G--E--R--E--M--E--R--R- 120
361 GAC CGC CTC CGC GCC CTC ATG GTC CGC CTC GAG GCC GAC GGC CAC CTC GAC CGC CTC CTC 420
361 GACCGCCTCCGCGCCCTCATGGTCCGCCTCGAGGCCGACGGCCACCTCGACCGCCTCCTC 420
121 -D--R--L--R--A--L--M--V--R--L--E--A--D--G--H--L--D--R--L--L- 140
421 CGC GCG CAG GAG GAG GAG CAG GGC GCC GCT GGC GCC GAG GAG GAG GAG GAG CAG ATC CAG 480
421 CGCGCGCAGGAGGAGGAGCAGGGCGCCGCTGGCGCCGAGGAGGAGGAGGAGCAGATCCAG 480
141 -R--A--Q--E--E--E--Q--G--A--A--G--A--E--E--E--E--E--Q--I--Q- 160
481 TAC CCC TTC TTC ACC GAG GGC ACG CAG GAG CTT CTC AAG GCG CGC GTC GAC ATC GCG CAG 540
481 TACCCCTTCTTCACCGAGGGCACGCAGGAGCTTCTCAAGGCGCGCGTCGACATCGCGCAG 540
161 -Y--P--F--F--T--E--G--T--Q--E--L--L--K--A--R--V--D--I--A--Q- 180
541 TAC TCG CTG CCA CGA GCC AAG GCC AGG ATC GAG CGG GCC AAG CGC CGC CAT GAC GAC CCC 600
541 TACTCGCTGCCACGAGCCAAGGCCAGGATCGAGCGGGCCAAGCGCCGCCATGACGACCCC 600
181 -Y--S--L--P--R--A--K--A--R--I--E--R--A--K--R--R--H--D--D--P- 200
601 GAC GAG GAC CCT GAG GCA GAG GCC AAC CTT GTC GTG AAG CAG GCG GAG GAT TTC GTG CTT 660
601 GACGAGGACCCTGAGGCAGAGGCCAACCTTGTCGTGAAGCAGGCGGAGGATTTCGTGCTT 660
201 -D--E--D--P--E--A--E--A--N--L--V--V--K--Q--A--E--D--F--V--L- 220
661 GAG TGC AGC GAG ATT GGA GAT GAC CGC CCC CTC ACC GGC TGC TCC TTC TCT CGA GAT GCA 720
661 GAGTGCAGCGAGATTGGAGATGACCGCCCCCTCACCGGCTGCTCCTTCTCTCGAGATGCA 720
221 -E--C--S--E--I--G--D--D--R--P--L--T--G--C--S--F--S--R--D--A- 240
721 TCA ATG CTC GCT ACA AG T TCA TGG AGT GGG ATG ATC AAA GTG TGG AGT ATG CCA CAA GTA 780
721 TCAATGCTCGCTACAAGTTCATGGAGTGGGATGATCAAAGTGTGGAGTATGCCACAAGTA 780
241 -S--M--L--A--T--S--S--W--S--G--M--I--K--V--W--S--M--P--Q--V- 260
781 ACT AAA ATT GCA ACT CTG AAA GGT CAC ACA GAA CGT GCA ACT GAT GTT GCG TTT TCA CCA 840
781 ACTAAAATTGCAACTCTGAAAGGTCACACAGAACGTGCAACTGATGTTGCGTTTTCACCA 840
261 -T--K--I--A--T--L--K--G--H--T--E--R--A--T--D--V--A--F--S--P- 280
841 GTT GAC GAC TGC TTA GCA ACA GCT TCA GCT GAT AAA ACT GCC AAA CTA TGG AAG ATC GAT 900
841 GTTGACGACTGCTTAGCAACAGCTTCAGCTGATAAAACTGCCAAACTATGGAAGATCGAT 900
281 -V--D--D--C--L--A--T--A--S--A--D--K--T--A--K--L--W--K--I--D- 300
901 GGG TCA CTC TTA ATG TCC TTT GAT GGT CAC CTG GAT CGG CTT GCT CGC CTT GCT TTT CAT 960
901 GGGTCACTCTTAATGTCCTTTGATGGTCACCTGGATCGGCTTGCTCGCCTTGCTTTTCAT 960
301 -G--S--L--L--M--S--F--D--G--H--L--D--R--L--A--R--L--A--F--H- 320
961 CCA TCT GGA GGG TAC CTT GCT ACA GCT AGC TTT GAC AAG ACC TGG AGA TTG TGG GAC GTT 1020
961 CCATCTGGAGGGTACCTTGCTACAGCTAGCTTTGACAAGACCTGGAGATTGTGGGACGTT 1020
321 -P--S--G--G--Y--L--A--T--A--S--F--D--K--T--W--R--L--W--D--V- 340
1021 AGC ACT GGA AAG GAA CTT CTA CTC CAA GAA GGG CAC AGC AGA AGT GTC TAT GGA GTT AGC 1080
1021 AGCACTGGAAAGGAACTTCTACTCCAAGAAGGGCACAGCAGAAGTGTCTATGGAGTTAGC 1080
341 -S--T--G--K--E--L--L--L--Q--E--G--H--S--R--S--V--Y--G--V--S- 360
1081 TTT CAC CCA GAT GGT TCT TTA GCT GCA TCT TGT GGT CTT GAT GCA TAT GCT CGA GTT TGG 1140
1081 TTTCACCCAGATGGTTCTTTAGCTGCATCTTGTGGTCTTGATGCATATGCTCGAGTTTGG 1140
361 -F--H--P--D--G--S--L--A--A--S--C--G--L--D--A--Y--A--R--V--W- 380
1141 GAT TTA AGA TCA GGA AGA TTG TGG GGC ACA CTT ATG GGA CAT GTG AAG CCT GTC TTA GGA 1200
1141 GATTTAAGATCAGGAAGATTGTGGGGCACACTTATGGGACATGTGAAGCCTGTCTTAGGA 1200
381 -D--L--R--S--G--R--L--W--G--T--L--M--G--H--V--K--P--V--L--G- 400
1201 GTG AGC TTC TCC CCT AAT GGT TTT CTG GTT GCA ACT GGA AGT GAA GAC AAT TTC TGT CGA 1260
1201 GTGAGCTTCTCCCCTAATGGTTTTCTGGTTGCAACTGGAAGTGAAGACAATTTCTGTCGA 1260
401 -V--S--F--S--P--N--G--F--L--V--A--T--G--S--E--D--N--F--C--R- 420
1261 ATA TGG GAT TTG AGG ACT AAA AGA ATG TTA TAT TCT ATA CCA GCA CAT AAG AGT CTT ATC 1320
1261 ATATGGGATTTGAGGACTAAAAGAATGTTATATTCTATACCAGCACATAAGAGTCTTATC 1320
421 -I--W--D--L--R--T--K--R--M--L--Y--S--I--P--A--H--K--S--L--I- 440
1321 TCA CAT GTC AAG TTT GAA CCC CAG GAG GGC TAT TAT TTG GCA ACT TCA TCC TAT GAC ACC 1380
1321 TCACATGTCAAGTTTGAACCCCAGGAGGGCTATTATTTGGCAACTTCATCCTATGACACC 1380
441 -S--H--V--K--F--E--P--Q--E--G--Y--Y--L--A--T--S--S--Y--D--T- 460
1381 AAA GCA GCG C TG TGG TCA GCT CGT GAT TAC AAA CCA ATC AAG AGT TTG GTG GGC CAT GAG 1440
1381 AAAGCAGCGCTGTGGTCAGCTCGTGATTACAAACCAATCAAGAGTTTGGTGGGCCATGAG 1440
461 -K--A--A--L--W--S--A--R--D--Y--K--P--I--K--S--L--V--G--H--E- 480
1441 TCA AAG GTT ACT AGT TTG GAT ATT AGT GGA G A T GGG CAG CAG ATT GTG ACT GTG TCA CAT 1500
1441 TCAAAGGTTACTAGTTTGGATATTAGTGGAGATGGGCAGCAGATTGTGACTGTGTCACAT 1500
481 -S--K--V--T--S--L--D--I--S--G--D--G--Q--Q--I--V--T--V--S--H- 500
1501 GAT AGA ACG ATC AAG ATT TGG TCC TGC AGA AGC AGG GCA CAA GAT AAT GCC ATG GAG CTG 1560
1501 GATAGAACGATCAAGATTTGGTCCTGCAGAAGCAGGGCACAAGATAATGCCATGGAGCTG 1560
501 -D--R--T--I--K--I--W--S--C--R--S--R--A--Q--D--N--A--M--E--L- 520
1561 GAC TGA GGCACTGAATTAACCTGTTGTTAGCGCTCTTCTGCACTTCCTGGCCGAAACATG 1620
1561 GACTGA...................................................... 1566
521 -D--*-...................................................... 521
1621 CCGTCGCTCCC 1631
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