Oryza barthii (O.barthii_v1)
Description

Ankyrin repeat family protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT3G04470) TAIR;Acc:AT3G04470]

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About this transcript

This transcript has 2 exons, is annotated with 13 domains and features and maps to 40 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OBART02G36760.11803547aa
 
Protein coding
A0A0D3FBW2 Ensembl Canonical
Codons
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       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACAGCCCGGCCCA     14
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    15 CCTCGCCGTGGTGCGGCGGGACCACGCCTCGCTCCGCCGCCTGGTCGCGGGGCTCCCGCG     74
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    75 CCTCCCGCGCGCCGGGGAGGTCGCCGCCGACATCCTCATGTCCGCCGGCGCTGACTGGTC    134
       .....................................ATGTCCGCCGGCGCTGACTGGTC     23
       .....................................-M--S--A--G--A--D--W--S      8

                                                                          
   135 GCTCCAGAACGCCGACGGGTGGTCCGCGCTCCAGGAGGCCGTCTGCACGCGGGAGGACGC    194
    24 GCTCCAGAACGCCGACGGGTGGTCCGCGCTCCAGGAGGCCGTCTGCACGCGGGAGGACGC     83
     8 --L--Q--N--A--D--G--W--S--A--L--Q--E--A--V--C--T--R--E--D--A     28

                                                                          
   195 CATCGCCACCATCATCGCGCGCCACTACCAGCCCCTCGCCTGGGCCAAGTGGTGCCGCCG    254
    84 CATCGCCACCATCATCGCGCGCCACTACCAGCCCCTCGCCTGGGCCAAGTGGTGCCGCCG    143
    28 --I--A--T--I--I--A--R--H--Y--Q--P--L--A--W--A--K--W--C--R--R     48

                                                                          
   255 CCTCCCGCGCGTCCTCGCCTCCATCAACCGCATCCGAGACTTCTACATGGAGATCTCCTT    314
   144 CCTCCCGCGCGTCCTCGCCTCCATCAACCGCATCCGAGACTTCTACATGGAGATCTCCTT    203
    48 --L--P--R--V--L--A--S--I--N--R--I--R--D--F--Y--M--E--I--S--F     68

                                                                          
   315 CCACTTCGAGTCCTCCGTCATACCCTTCATCGGCCGCATCGCCCCCTCCGACACTTACCG    374
   204 CCACTTCGAGTCCTCCGTCATACCCTTCATCGGCCGCATCGCCCCCTCCGACACTTACCG    263
    68 --H--F--E--S--S--V--I--P--F--I--G--R--I--A--P--S--D--T--Y--R     88

                                                                          
   375 CATTTGGAAGCGAGGAGCTGCGCTGCGTGCCGACATGACGCTTGCCGGCTTCGACGGCTT    434
   264 CATTTGGAAGCGAGGAGCTGCGCTGCGTGCCGACATGACGCTTGCCGGCTTCGACGGCTT    323
    88 --I--W--K--R--G--A--A--L--R--A--D--M--T--L--A--G--F--D--G--F    108

                                                                          
   435 CCGCATCCAGCGTTCGGACCAGACCTTCTTGTTTCTCGGGGATGGTGCTCGTCCTGAGGA    494
   324 CCGCATCCAGCGTTCGGACCAGACCTTCTTGTTTCTCGGGGATGGTGCTCGTCCTGAGGA    383
   108 --R--I--Q--R--S--D--Q--T--F--L--F--L--G--D--G--A--R--P--E--D    128

                                                                          
   495 TGCTGGGGGCAAAGAGTTGCACCCAGGTTCTCTCATAGTGCTGGCTCATAAGGACAAGGA    554
   384 TGCTGGGGGCAAAGAGTTGCACCCAGGTTCTCTCATAGTGCTGGCTCATAAGGACAAGGA    443
   128 --A--G--G--K--E--L--H--P--G--S--L--I--V--L--A--H--K--D--K--E    148

                                                                          
   555 GATCACAGATGCATTGGAGGGAGCAGGGGTGCAACCAACGGAGGCCGAGGTCGCACATGA    614
   444 GATCACAGATGCATTGGAGGGAGCAGGGGTGCAACCAACGGAGGCCGAGGTCGCACATGA    503
   148 --I--T--D--A--L--E--G--A--G--V--Q--P--T--E--A--E--V--A--H--E    168

                                                                          
   615 GGTGGCGTTGATGTCAAAGACGAACATGTATCGTCCCGGGATCGACGTGACGCAGGCAGA    674
   504 GGTGGCGTTGATGTCAAAGACGAACATGTATCGTCCCGGGATCGACGTGACGCAGGCAGA    563
   168 --V--A--L--M--S--K--T--N--M--Y--R--P--G--I--D--V--T--Q--A--E    188

                                                                          
   675 GCTTGTGCCGCATTTGAATTGGCGCCGGCAGGAGAGGACGGAAGCCGTTGGACATTGGAA    734
   564 GCTTGTGCCGCATTTGAATTGGCGCCGGCAGGAGAGGACGGAAGCCGTTGGACATTGGAA    623
   188 --L--V--P--H--L--N--W--R--R--Q--E--R--T--E--A--V--G--H--W--K    208

                                                                          
   735 AGCTAAGGTTTATGATATGTTAAACGTTCTGGTGACTGTGAAGTCAAGGCGTGTGCCGGG    794
   624 AGCTAAGGTTTATGATATGTTAAACGTTCTGGTGACTGTGAAGTCAAGGCGTGTGCCGGG    683
   208 --A--K--V--Y--D--M--L--N--V--L--V--T--V--K--S--R--R--V--P--G    228

                                                                          
   795 GGCGATGACAGATGAGGAGCTGTTTGCGATGGAGGGGGAGGAGAAGAATGGGAGGGGCAC    854
   684 GGCGATGACAGATGAGGAGCTGTTTGCGATGGAGGGGGAGGAGAAGAATGGGAGGGGCAC    743
   228 --A--M--T--D--E--E--L--F--A--M--E--G--E--E--K--N--G--R--G--T    248

                                                                          
   855 TGAACTTGACGCGGAGCTGGATGAAGTGTTGACAGCCGAAGAGAGGAAACAGCTTGATTC    914
   744 TGAACTTGACGCGGAGCTGGATGAAGTGTTGACAGCCGAAGAGAGGAAACAGCTTGATTC    803
   248 --E--L--D--A--E--L--D--E--V--L--T--A--E--E--R--K--Q--L--D--S    268

                                                                          
   915 TGCGTTGAGAATGGGGAACCAGGAAGAAGAATTTGAGGAGAGGTGCGAGGAAGGTGATGG    974
   804 TGCGTTGAGAATGGGGAACCAGGAAGAAGAATTTGAGGAGAGGTGCGAGGAAGGTGATGG    863
   268 --A--L--R--M--G--N--Q--E--E--E--F--E--E--R--C--E--E--G--D--G    288

                                                                          
   975 CGGGGCTGATCATTTGGATGCAAATGGCGTGGCAAAAGATAAGAAGGGATGGTTTGGTTG   1034
   864 CGGGGCTGATCATTTGGATGCAAATGGCGTGGCAAAAGATAAGAAGGGATGGTTTGGTTG    923
   288 --G--A--D--H--L--D--A--N--G--V--A--K--D--K--K--G--W--F--G--W    308

                                                                          
  1035 GGGTGGCAAGAAAGGCACCAAGAATGACGAGAAACCATCCAAGGCGAATCAAGGGAGTAA   1094
   924 GGGTGGCAAGAAAGGCACCAAGAATGACGAGAAACCATCCAAGGCGAATCAAGGGAGTAA    983
   308 --G--G--K--K--G--T--K--N--D--E--K--P--S--K--A--N--Q--G--S--K    328

                                                                          
  1095 GGATGAATCAGGTGACCTAGGAAAGGGAAAGGAGAAGAACAGCAGCAAGAAGAAGAAGGG   1154
   984 GGATGAATCAGGTGACCTAGGAAAGGGAAAGGAGAAGAACAGCAGCAAGAAGAAGAAGGG   1043
   328 --D--E--S--G--D--L--G--K--G--K--E--K--N--S--S--K--K--K--K--G    348

                                                                          
  1155 TGCATCATCAGGGGATTCTACTAAACATGAAAGTGAATACAAGAAGGGGTTAAGACCAGT   1214
  1044 TGCATCATCAGGGGATTCTACTAAACATGAAAGTGAATACAAGAAGGGGTTAAGACCAGT   1103
   348 --A--S--S--G--D--S--T--K--H--E--S--E--Y--K--K--G--L--R--P--V    368

                                                                          
  1215 GTTGTGGCTGACACCAGATTTCCCTTTGAAGACGGATGAACTGATCCCTCTGCTTGATGT   1274
  1104 GTTGTGGCTGACACCAGATTTCCCTTTGAAGACGGATGAACTGATCCCTCTGCTTGATGT   1163
   368 --L--W--L--T--P--D--F--P--L--K--T--D--E--L--I--P--L--L--D--V    388

                                                                          
  1275 CTTAGCAAACAAAGTGAAAGCTGTCAGAAGGCTTAGGGAACTCTTGACTACTAAACTGCC   1334
  1164 CTTAGCAAACAAAGTGAAAGCTGTCAGAAGGCTTAGGGAACTCTTGACTACTAAACTGCC   1223
   388 --L--A--N--K--V--K--A--V--R--R--L--R--E--L--L--T--T--K--L--P    408

                                                                          
  1335 TCCAGGCACATTTCCGGTGAAGATTGCGATACCTATTGTTCCAACAATACGAGTCATCGT   1394
  1224 TCCAGGCACATTTCCGGTGAAGATTGCGATACCTATTGTTCCAACAATACGAGTCATCGT   1283
   408 --P--G--T--F--P--V--K--I--A--I--P--I--V--P--T--I--R--V--I--V    428

                                                                          
  1395 GACATTCACAAAGTTTGAGGAATTACAACCTTTGGATGAGTTTGCTACCCCACCCTCAAG   1454
  1284 GACATTCACAAAGTTTGAGGAATTACAACCTTTGGATGAGTTTGCTACCCCACCCTCAAG   1343
   428 --T--F--T--K--F--E--E--L--Q--P--L--D--E--F--A--T--P--P--S--S    448

                                                                          
  1455 CCCAACGCAATTCCAGGATGCCAAGGGCAAAGAATCAGAAGGATCAGGCTCATGGTATTC   1514
  1344 CCCAACGCAATTCCAGGATGCCAAGGGCAAAGAATCAGAAGGATCAGGCTCATGGTATTC   1403
   448 --P--T--Q--F--Q--D--A--K--G--K--E--S--E--G--S--G--S--W--Y--S    468

                                                                          
  1515 GTGGGTTAGAGGGGGGCGTGGTGCACAGTCCAGTGATAGTGGTGATAGCCGTAACTGGAA   1574
  1404 GTGGGTTAGAGGGGGGCGTGGTGCACAGTCCAGTGATAGTGGTGATAGCCGTAACTGGAA   1463
   468 --W--V--R--G--G--R--G--A--Q--S--S--D--S--G--D--S--R--N--W--K    488

                                                                          
  1575 AGATGAGGTTGATCCATTCCAAATACCTTCTGACTACACCTGGGTTGATGCCAACGAGAA   1634
  1464 AGATGAGGTTGATCCATTCCAAATACCTTCTGACTACACCTGGGTTGATGCCAACGAGAA   1523
   488 --D--E--V--D--P--F--Q--I--P--S--D--Y--T--W--V--D--A--N--E--K    508

                                                                          
  1635 GAAACGGAGGATGAAGGCAAAGAAAGCCAAGAACAGGCGGGGCTCAACTCGGAAACAATC   1694
  1524 GAAACGGAGGATGAAGGCAAAGAAAGCCAAGAACAGGCGGGGCTCAACTCGGAAACAATC   1583
   508 --K--R--R--M--K--A--K--K--A--K--N--R--R--G--S--T--R--K--Q--S    528

                                                                          
  1695 ATCGAAAAGCACCTCGTCGGAAGGAGGTCACCACCCGATGATGGATGGCTTTGAGGAGTA   1754
  1584 ATCGAAAAGCACCTCGTCGGAAGGAGGTCACCACCCGATGATGGATGGCTTTGAGGAGTA   1643
   528 --S--K--S--T--S--S--E--G--G--H--H--P--M--M--D--G--F--E--E--*    547

                                                                          
  1755 AAA                                                            1757
  1644 A..                                                            1644
       -..                                                             547