Oryza barthii (O.barthii_v1)
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About this transcript

This transcript has 9 exons, is annotated with 10 domains and features and maps to 51 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OBART01G05870.1879292aa
 
Protein coding
A0A0D3EKK0 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
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Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGGCGATCGCCACCGAGTCGCGCTGCGAGGAGGAGAAGGCTTCGCCGCATTCGCAGGAG     60
     1 ATGGCGATCGCCACCGAGTCGCGCTGCGAGGAGGAGAAGGCTTCGCCGCATTCGCAGGAG     60
     1 -M--A--I--A--T--E--S--R--C--E--E--E--K--A--S--P--H--S--Q--E-     20

                                                                          
    61 GTGAAGCGGTGGGTGTTGTCTGATTTTGACATCGGGAAGCCCCTCGGGAGGGGCAAGTTC    120
    61 GTGAAGCGGTGGGTGTTGTCTGATTTTGACATCGGGAAGCCCCTCGGGAGGGGCAAGTTC    120
    21 -V--K--R--W--V--L--S--D--F--D--I--G--K--P--L--G--R--G--K--F-     40

                                                                          
   121 GGCCATGTTTACTTAGCAAGAGAAAAGAGAAGTAACCATATTNTGGCTTTGAAAGTACTT    180
   121 GGCCATGTTTACTTAGCAAGAGAAAAGAGAAGTAACCATATTNTGGCTTTGAAAGTACTT    180
    41 -G--H--V--Y--L--A--R--E--K--R--S--N--H--I--X--A--L--K--V--L-     60

                                                                          
   181 TTCAAGAGCCAACTAAAGCAGTCCCAGGTGGAGCATCAGCTACGTCGGGAAGTTGAGATT    240
   181 TTCAAGAGCCAACTAAAGCAGTCCCAGGTGGAGCATCAGCTACGTCGGGAAGTTGAGATT    240
    61 -F--K--S--Q--L--K--Q--S--Q--V--E--H--Q--L--R--R--E--V--E--I-     80

                                                                          
   241 CAGAGTCATCTTCGTCATCCCAACATTCTACGGCTGTATGGGTATTTCTATGATCAGACC    300
   241 CAGAGTCATCTTCGTCATCCCAACATTCTACGGCTGTATGGGTATTTCTATGATCAGACC    300
    81 -Q--S--H--L--R--H--P--N--I--L--R--L--Y--G--Y--F--Y--D--Q--T-    100

                                                                          
   301 CGTGTGTACTTGATCTTGGAGTATGCCTTAAAAGGTGAACTTTATAAGGAGTTGCAGAGG    360
   301 CGTGTGTACTTGATCTTGGAGTATGCCTTAAAAGGTGAACTTTATAAGGAGTTGCAGAGG    360
   101 -R--V--Y--L--I--L--E--Y--A--L--K--G--E--L--Y--K--E--L--Q--R-    120

                                                                          
   361 TGCAAGCATTTCTCTGAAAGACGTTCAGCGACTTACATTGCATCACTGGCGCGTGCGCTC    420
   361 TGCAAGCATTTCTCTGAAAGACGTTCAGCGACTTACATTGCATCACTGGCGCGTGCGCTC    420
   121 -C--K--H--F--S--E--R--R--S--A--T--Y--I--A--S--L--A--R--A--L-    140

                                                                          
   421 ATCTACCTTCACGGAAAGCATGTGATCCATAGAGACATTAAACCTGAAAATCTTTTAATT    480
   421 ATCTACCTTCACGGAAAGCATGTGATCCATAGAGACATTAAACCTGAAAATCTTTTAATT    480
   141 -I--Y--L--H--G--K--H--V--I--H--R--D--I--K--P--E--N--L--L--I-    160

                                                                          
   481 GGGTCCCAGGGCGAACTGAAAATTGCAGACTTTGGTTGGTCTGTGCACACCTTCAACAGA    540
   481 GGGTCCCAGGGCGAACTGAAAATTGCAGACTTTGGTTGGTCTGTGCACACCTTCAACAGA    540
   161 -G--S--Q--G--E--L--K--I--A--D--F--G--W--S--V--H--T--F--N--R-    180

                                                                          
   541 AGAAGGACAATGTGTGGAACATTAGATTACCTGCCCCCTGAAATGGTGGAGAAGACTGAA    600
   541 AGAAGGACAATGTGTGGAACATTAGATTACCTGCCCCCTGAAATGGTGGAGAAGACTGAA    600
   181 -R--R--T--M--C--G--T--L--D--Y--L--P--P--E--M--V--E--K--T--E-    200

                                                                          
   601 CATGACTACCATGTTGACATTTGGAGCTTGGGGATCCTGTGCTATGAGTTCCTTTATGGA    660
   601 CATGACTACCATGTTGACATTTGGAGCTTGGGGATCCTGTGCTATGAGTTCCTTTATGGA    660
   201 -H--D--Y--H--V--D--I--W--S--L--G--I--L--C--Y--E--F--L--Y--G-    220

                                                                          
   661 GTCCCACCTTTCGAAGCAAAAGAACACTCCGAAACATATCGCAGGATTGTGAAAGTTGAC    720
   661 GTCCCACCTTTCGAAGCAAAAGAACACTCCGAAACATATCGCAGGATTGTGAAAGTTGAC    720
   221 -V--P--P--F--E--A--K--E--H--S--E--T--Y--R--R--I--V--K--V--D-    240

                                                                          
   721 TTGAAGTTTCCACTGAAACCATTCGTGTCCCCGGCTGCGAAAGACCTAATTTCACAGATG    780
   721 TTGAAGTTTCCACTGAAACCATTCGTGTCCCCGGCTGCGAAAGACCTAATTTCACAGATG    780
   241 -L--K--F--P--L--K--P--F--V--S--P--A--A--K--D--L--I--S--Q--M-    260

                                                                          
   781 CTCGTGAAGAATTCGGCGCATCGTCTGCCCCTCCACAAGCTCCTCGAGCACCCTTGGATA    840
   781 CTCGTGAAGAATTCGGCGCATCGTCTGCCCCTCCACAAGCTCCTCGAGCACCCTTGGATA    840
   261 -L--V--K--N--S--A--H--R--L--P--L--H--K--L--L--E--H--P--W--I-    280

                                                                          
   841 GTTCAAAACGCTGATCCCTCCGGCGTGTACAGAGGCTAG                         879
   841 GTTCAAAACGCTGATCCCTCCGGCGTGTACAGAGGCTAG                         879
   281 -V--Q--N--A--D--P--S--G--V--Y--R--G--*-                         292