Transcript: OBART01G05870.1
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- OBART01G05870.1 879 292aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3EKK0 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GCG ATC GCC ACC GAG TCG CGC TGC GAG GAG GAG AAG GCT TCG CCG CAT TCG CAG GAG 60
1 ATGGCGATCGCCACCGAGTCGCGCTGCGAGGAGGAGAAGGCTTCGCCGCATTCGCAGGAG 60
1 -M--A--I--A--T--E--S--R--C--E--E--E--K--A--S--P--H--S--Q--E- 20
61 GTG AAG CGG TGG GTG TTG TCT GAT TTT GAC ATC GGG AAG CCC CTC GGG AGG GGC AAG TTC 120
61 GTGAAGCGGTGGGTGTTGTCTGATTTTGACATCGGGAAGCCCCTCGGGAGGGGCAAGTTC 120
21 -V--K--R--W--V--L--S--D--F--D--I--G--K--P--L--G--R--G--K--F- 40
121 GGC CAT GTT TAC TTA GCA AGA GAA AAG AGA A GT AAC CAT ATT NTG GCT TTG AAA GTA CTT 180
121 GGCCATGTTTACTTAGCAAGAGAAAAGAGAAGTAACCATATTNTGGCTTTGAAAGTACTT 180
41 -G--H--V--Y--L--A--R--E--K--R--S--N--H--I--X--A--L--K--V--L- 60
181 TTC AAG AGC CAA CTA AAG CAG TCC CAG GTG GAG CAT CAG CTA CGT CGG GAA GTT GAG ATT 240
181 TTCAAGAGCCAACTAAAGCAGTCCCAGGTGGAGCATCAGCTACGTCGGGAAGTTGAGATT 240
61 -F--K--S--Q--L--K--Q--S--Q--V--E--H--Q--L--R--R--E--V--E--I- 80
241 CAG AGT CAT CTT CGT CAT CCC AAC ATT CTA CGG CTG TAT GGG TAT TTC TAT GAT CAG ACC 300
241 CAGAGTCATCTTCGTCATCCCAACATTCTACGGCTGTATGGGTATTTCTATGATCAGACC 300
81 -Q--S--H--L--R--H--P--N--I--L--R--L--Y--G--Y--F--Y--D--Q--T- 100
301 CGT GTG TAC TTG ATC TTG GAG TAT GCC TTA AAA GGT GAA CTT TAT AAG GAG TTG CAG AGG 360
301 CGTGTGTACTTGATCTTGGAGTATGCCTTAAAAGGTGAACTTTATAAGGAGTTGCAGAGG 360
101 -R--V--Y--L--I--L--E--Y--A--L--K--G--E--L--Y--K--E--L--Q--R- 120
361 TGC AAG CAT TTC TCT GAA AGA CGT TCA GCG ACT TAC ATT GCA TCA CTG GCG CGT GCG CTC 420
361 TGCAAGCATTTCTCTGAAAGACGTTCAGCGACTTACATTGCATCACTGGCGCGTGCGCTC 420
121 -C--K--H--F--S--E--R--R--S--A--T--Y--I--A--S--L--A--R--A--L- 140
421 ATC TAC CTT CAC GGA AAG CAT GTG ATC CAT AGA GAC ATT AAA CCT GAA AAT CTT TTA ATT 480
421 ATCTACCTTCACGGAAAGCATGTGATCCATAGAGACATTAAACCTGAAAATCTTTTAATT 480
141 -I--Y--L--H--G--K--H--V--I--H--R--D--I--K--P--E--N--L--L--I- 160
481 GGG TCC CAG G GC GAA CTG AAA ATT GCA GAC TTT GGT TGG TCT GTG CAC ACC TTC AAC AGA 540
481 GGGTCCCAGGGCGAACTGAAAATTGCAGACTTTGGTTGGTCTGTGCACACCTTCAACAGA 540
161 -G--S--Q--G--E--L--K--I--A--D--F--G--W--S--V--H--T--F--N--R- 180
541 AGA AGG ACA ATG TGT GGA ACA TTA GAT TAC CTG CCC CCT GAA ATG G T G GAG AAG ACT GAA 600
541 AGAAGGACAATGTGTGGAACATTAGATTACCTGCCCCCTGAAATGGTGGAGAAGACTGAA 600
181 -R--R--T--M--C--G--T--L--D--Y--L--P--P--E--M--V--E--K--T--E- 200
601 CAT GAC TAC CAT GTT GAC ATT TGG AGC TTG GGG ATC CTG TGC TAT GAG TTC CTT TAT GGA 660
601 CATGACTACCATGTTGACATTTGGAGCTTGGGGATCCTGTGCTATGAGTTCCTTTATGGA 660
201 -H--D--Y--H--V--D--I--W--S--L--G--I--L--C--Y--E--F--L--Y--G- 220
661 GTC CCA CCT TTC GAA GCA AAA GAA CAC TCC GAA ACA TAT CGC AG G ATT GTG AAA GTT GAC 720
661 GTCCCACCTTTCGAAGCAAAAGAACACTCCGAAACATATCGCAGGATTGTGAAAGTTGAC 720
221 -V--P--P--F--E--A--K--E--H--S--E--T--Y--R--R--I--V--K--V--D- 240
721 TTG AAG TTT CCA CTG AAA CCA TTC GTG TCC CCG GCT GCG AAA GAC CTA ATT TCA CAG A TG 780
721 TTGAAGTTTCCACTGAAACCATTCGTGTCCCCGGCTGCGAAAGACCTAATTTCACAGATG 780
241 -L--K--F--P--L--K--P--F--V--S--P--A--A--K--D--L--I--S--Q--M- 260
781 CTC GTG AAG AAT TCG GCG CAT CGT CTG CCC CTC CAC AAG CTC CTC GAG CAC CCT TGG ATA 840
781 CTCGTGAAGAATTCGGCGCATCGTCTGCCCCTCCACAAGCTCCTCGAGCACCCTTGGATA 840
261 -L--V--K--N--S--A--H--R--L--P--L--H--K--L--L--E--H--P--W--I- 280
841 GTT CAA AAC GCT GAT CCC TCC GGC GTG TAC AGA GGC TAG 879
841 GTTCAAAACGCTGATCCCTCCGGCGTGTACAGAGGCTAG 879
281 -V--Q--N--A--D--P--S--G--V--Y--R--G--*- 292
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