Transcript: OBART01G01660.1
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Description
Actin-interacting, WD40-repeat protein, Actin turnove [Source: Projected from Oryza sativa (Os01g0125800)]
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- OBART01G01660.1 2603 610aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3EJ46 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 G TTATTAACCACCACCTCCTCCACCACTCGCGACCCCACCCCAGATCAAGCGGAGGAGGA 60
............................................................
............................................................
61 GGAAGAGGAGAGGGCAAAA ATG GCG CAG CTG CAG GAG ACG TAC GCG TGC TCG CCG GCG AC 120
...................ATGGCGCAGCTGCAGGAGACGTACGCGTGCTCGCCGGCGAC 41
...................-M--A--Q--L--Q--E--T--Y--A--C--S--P--A--T 14
121 G GAG CGC GGC CGC GGG ATC CTC CTC GCG GGG GAC CCC AAG ACG GAG ACG ATC GCC TAC TG 180
42 GGAGCGCGGCCGCGGGATCCTCCTCGCGGGGGACCCCAAGACGGAGACGATCGCCTACTG 101
14 --E--R--G--R--G--I--L--L--A--G--D--P--K--T--E--T--I--A--Y--C 34
181 C ACG GGC CGC AGC GTC ATC ATC CGC CGC CTC GAC GCG CCG CTC GAC TGC TGG GCC TAC CC 240
102 CACGGGCCGCAGCGTCATCATCCGCCGCCTCGACGCGCCGCTCGACTGCTGGGCCTACCC 161
34 --T--G--R--S--V--I--I--R--R--L--D--A--P--L--D--C--W--A--Y--P 54
241 G GAC CAC GCC TAC CCG ACC ACC GTC GCC CGC TTC TCC CCC AAC GGC GAG TGG GTC GCC TC 300
162 GGACCACGCCTACCCGACCACCGTCGCCCGCTTCTCCCCCAACGGCGAGTGGGTCGCCTC 221
54 --D--H--A--Y--P--T--T--V--A--R--F--S--P--N--G--E--W--V--A--S 74
301 C GCC GAC GCC TCC GGC TGC GTC CGC GTC TGG GGG CGC TAC GGC GAC CGC GCC CTC AAG GC 360
222 CGCCGACGCCTCCGGCTGCGTCCGCGTCTGGGGGCGCTACGGCGACCGCGCCCTCAAGGC 281
74 --A--D--A--S--G--C--V--R--V--W--G--R--Y--G--D--R--A--L--K--A 94
361 C GAG TTC CGC CCC CTC TCC GGC CGC GTC GAC GAC CTC CGC TGG TCC CCC GAT GGC CTC CG 420
282 CGAGTTCCGCCCCCTCTCCGGCCGCGTCGACGACCTCCGCTGGTCCCCCGATGGCCTCCG 341
94 --E--F--R--P--L--S--G--R--V--D--D--L--R--W--S--P--D--G--L--R 114
421 C ATC GTC GTG TCC GGG GAC GGC AAG GGG AAG TCC TTC GTC CGC GCT TTC GT G TGG GAC TC 480
342 CATCGTCGTGTCCGGGGACGGCAAGGGGAAGTCCTTCGTCCGCGCTTTCGTGTGGGACTC 401
114 --I--V--V--S--G--D--G--K--G--K--S--F--V--R--A--F--V--W--D--S 134
481 T GGC AGC ACT GTT GGT GAG TTT GAC GGG CAC TCA AAG AGA GTT CTG AGC TGT GAC TTT AA 540
402 TGGCAGCACTGTTGGTGAGTTTGACGGGCACTCAAAGAGAGTTCTGAGCTGTGACTTTAA 461
134 --G--S--T--V--G--E--F--D--G--H--S--K--R--V--L--S--C--D--F--K 154
541 G CCA ACC CGG CCG TTC CGC ATT GTG ACA TGT GGT GAA GAT TTT CTG GCA AAC TAC TAT GA 600
462 GCCAACCCGGCCGTTCCGCATTGTGACATGTGGTGAAGATTTTCTGGCAAACTACTATGA 521
154 --P--T--R--P--F--R--I--V--T--C--G--E--D--F--L--A--N--Y--Y--E 174
601 A GGA CCA CCA TTT AAA TTC AAG CAT TCC ATA AG G GAT CAC TCA AAC TTT GTT AAC TGT AT 660
522 AGGACCACCATTTAAATTCAAGCATTCCATAAGGGATCACTCAAACTTTGTTAACTGTAT 581
174 --G--P--P--F--K--F--K--H--S--I--R--D--H--S--N--F--V--N--C--I 194
661 C CGA TAT GCT CCT GAT GGG AGT AAG TTT ATC AGC GTG AGT TCA GAT AAG AAG GGT TTG AT 720
582 CCGATATGCTCCTGATGGGAGTAAGTTTATCAGCGTGAGTTCAGATAAGAAGGGTTTGAT 641
194 --R--Y--A--P--D--G--S--K--F--I--S--V--S--S--D--K--K--G--L--I 214
721 A TAT GAT GGC AAA ACT GGA GAC AAG ATT GGA GAA CTT TCC AGC GAA GGC AGT CAC ACA GG 780
642 ATATGATGGCAAAACTGGAGACAAGATTGGAGAACTTTCCAGCGAAGGCAGTCACACAGG 701
214 --Y--D--G--K--T--G--D--K--I--G--E--L--S--S--E--G--S--H--T--G 234
781 G AGT ATA TAT GCT GTT AGC TGG AGT CCT GAC AGC AAA CAA G TT CTG ACA GTT TCT GCT GA 840
702 GAGTATATATGCTGTTAGCTGGAGTCCTGACAGCAAACAAGTTCTGACAGTTTCTGCTGA 761
234 --S--I--Y--A--V--S--W--S--P--D--S--K--Q--V--L--T--V--S--A--D 254
841 T AAA ACT GCC AAA GTC TGG GAC ATA CTA GAA GAC GCT AGT GGG AAA TTG AAC AGA ACT TT 900
762 TAAAACTGCCAAAGTCTGGGACATACTAGAAGACGCTAGTGGGAAATTGAACAGAACTTT 821
254 --K--T--A--K--V--W--D--I--L--E--D--A--S--G--K--L--N--R--T--L 274
901 G GCT TGT CCT GGT ACA GGT GGA GTA GAT GAC ATG CTT GTG GGT TGC CTC TGG CAG AAT GA 960
822 GGCTTGTCCTGGTACAGGTGGAGTAGATGACATGCTTGTGGGTTGCCTCTGGCAGAATGA 881
274 --A--C--P--G--T--G--G--V--D--D--M--L--V--G--C--L--W--Q--N--D 294
961 T TAT CTT GTG ACA GTC TCT CTT GGT GGG ACA TTT AAT GTG TTC TCT GCA AGT AAT CCA GA 1020
882 TTATCTTGTGACAGTCTCTCTTGGTGGGACATTTAATGTGTTCTCTGCAAGTAATCCAGA 941
294 --Y--L--V--T--V--S--L--G--G--T--F--N--V--F--S--A--S--N--P--D 314
1021 C AAA GAG CCA GTA ACC TTT GCA GGA CAT TTG AAG ACT GTT AGT TCT TTG GCC TTT TTC CC 1080
942 CAAAGAGCCAGTAACCTTTGCAGGACATTTGAAGACTGTTAGTTCTTTGGCCTTTTTCCC 1001
314 --K--E--P--V--T--F--A--G--H--L--K--T--V--S--S--L--A--F--F--P 334
1081 A CAA AGT AAC CCC AAA ACT ATA CTG TCC ACA AGT TAC GAT GGC GTT ATC ATG AGA TGG AT 1140
1002 ACAAAGTAACCCCAAAACTATACTGTCCACAAGTTACGATGGCGTTATCATGAGATGGAT 1061
334 --Q--S--N--P--K--T--I--L--S--T--S--Y--D--G--V--I--M--R--W--I 354
1141 A AAG GGT GTT GGA TAT GGT GGC AGA TTG ATG CGA AAG AAC AAC ACC CAG ATT AAA TGC TT 1200
1062 AAAGGGTGTTGGATATGGTGGCAGATTGATGCGAAAGAACAACACCCAGATTAAATGCTT 1121
354 --K--G--V--G--Y--G--G--R--L--M--R--K--N--N--T--Q--I--K--C--F 374
1201 T ACT GCA GCA GAA GAG GAA CTC GTC ACC TCT GGA TAT GAT AAC AAG GTT TTC AGA ATT CC 1260
1122 TACTGCAGCAGAAGAGGAACTCGTCACCTCTGGATATGATAACAAGGTTTTCAGAATTCC 1181
374 --T--A--A--E--E--E--L--V--T--S--G--Y--D--N--K--V--F--R--I--P 394
1261 T CTT AAT GGA GAT CAG TGT GGA GAT GCT GAA TCA GTT GAT GTA GGA GGT CAG CCA AAT GC 1320
1182 TCTTAATGGAGATCAGTGTGGAGATGCTGAATCAGTTGATGTAGGAGGTCAGCCAAATGC 1241
394 --L--N--G--D--Q--C--G--D--A--E--S--V--D--V--G--G--Q--P--N--A 414
1321 T TTG AAC CTT GCA ATT CAA AAA CCT GAA TTT GCA CTG GTC ACA ACA GAT TCT GGG ATA GT 1380
1242 TTTGAACCTTGCAATTCAAAAACCTGAATTTGCACTGGTCACAACAGATTCTGGGATAGT 1301
414 --L--N--L--A--I--Q--K--P--E--F--A--L--V--T--T--D--S--G--I--V 434
1381 A TTG CTG CAC AAG TCA ACG GTC ATT TCT ACA ACC AAA GTT AAT TAT ACT ATC ACT TCA TC 1440
1302 ATTGCTGCACAAGTCAACGGTCATTTCTACAACCAAAGTTAATTATACTATCACTTCATC 1361
434 --L--L--H--K--S--T--V--I--S--T--T--K--V--N--Y--T--I--T--S--S 454
1441 T GCT GTT TCT CCT GAT GGC ACT GAA GCC ATC GTT GGT GCA CAA GAT GGG AAA CTG CGT AT 1500
1362 TGCTGTTTCTCCTGATGGCACTGAAGCCATCGTTGGTGCACAAGATGGGAAACTGCGTAT 1421
454 --A--V--S--P--D--G--T--E--A--I--V--G--A--Q--D--G--K--L--R--I 474
1501 C TAT TCC ATC AAT GGG GAT ACA GTT ACA GAA GAA GCA TTA ATT GAG AAG CAC CGG GGT GC 1560
1422 CTATTCCATCAATGGGGATACAGTTACAGAAGAAGCATTAATTGAGAAGCACCGGGGTGC 1481
474 --Y--S--I--N--G--D--T--V--T--E--E--A--L--I--E--K--H--R--G--A 494
1561 T ATT ACT TGC ATA CAT TAT TCG CCC GAT GTT TCC ATG TTT GCT TCT GCT GAT GCC AAC AG 1620
1482 TATTACTTGCATACATTATTCGCCCGATGTTTCCATGTTTGCTTCTGCTGATGCCAACAG 1541
494 --I--T--C--I--H--Y--S--P--D--V--S--M--F--A--S--A--D--A--N--R 514
1621 G GAA GCC GTT GTG TGG GAT CGG GCA ACG AGA GAG ATC AAG CTG AAG AAC ATG TTG TTC CA 1680
1542 GGAAGCCGTTGTGTGGGATCGGGCAACGAGAGAGATCAAGCTGAAGAACATGTTGTTCCA 1601
514 --E--A--V--V--W--D--R--A--T--R--E--I--K--L--K--N--M--L--F--H 534
1681 C TCA GCT CGG ATA AAC TGC CTG GCT TGG TCA CCT GAC AAT CGC CTG GTT GCC ACA GGC TC 1740
1602 CTCAGCTCGGATAAACTGCCTGGCTTGGTCACCTGACAATCGCCTGGTTGCCACAGGCTC 1661
534 --S--A--R--I--N--C--L--A--W--S--P--D--N--R--L--V--A--T--G--S 554
1741 A TTG GAC ACC TGT GCA ATT GTA TAT GAA ATA GAC AAG CCA GCA TCC AGC CGC ATC ACC GT 1800
1662 ATTGGACACCTGTGCAATTGTATATGAAATAGACAAGCCAGCATCCAGCCGCATCACCGT 1721
554 --L--D--T--C--A--I--V--Y--E--I--D--K--P--A--S--S--R--I--T--V 574
1801 A AAA GGA GCT CAT CTT GGT GGA GTC CAT GGT TTA ACC TTT GTC GAT AAT GAT AGT CTG GT 1860
1722 AAAAGGAGCTCATCTTGGTGGAGTCCATGGTTTAACCTTTGTCGATAATGATAGTCTGGT 1781
574 --K--G--A--H--L--G--G--V--H--G--L--T--F--V--D--N--D--S--L--V 594
1861 G ACT GCT GGG GAG GAT GCA TGC ATC CGA GTT TGG AAG CTG GTG CCA CAA TAG ATGTTCTC 1920
1782 GACTGCTGGGGAGGATGCATGCATCCGAGTTTGGAAGCTGGTGCCACAATAG........ 1833
594 --T--A--G--E--D--A--C--I--R--V--W--K--L--V--P--Q--*-........ 610
1921 CCTGATGTTGCCTGTTGGGCGTGTCTTCGTCACTTGATTGAAATAAACATTGTTTGCACT 1980
............................................................
............................................................
1981 TGTCCCTTAGGGTGTCTGCGATTGTTTTCCTATGTTGCGACGCAGTTGGCCTTGAGTTGC 2040
............................................................
............................................................
2041 ATTTTATTTTTGTTGCATTTCTGGAAGAACTTGTTGATTGTTGTTATTTTATCCCTGCGT 2100
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2101 CTGATTTTGTTAGGAACTGAGAATTCAGGGATGCTGTCTTTTTTTTTCCTTCCTCCGTTT 2160
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2161 GTAACCTGCACATGGCTGTATCTGTTTGTAATTTTGACCGATCAGCTGCATAATGCTTTC 2220
............................................................
............................................................
2221 CTCTGCTGCCTTTTACATGTAATTCTCCATTTGTTCCTTACCATCCTTTGAAGCAAGGTA 2280
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2281 TAGGTCCAGCTGATGAAGTAGAATACTACCATGCTTTTTTTGTTCTTCCTTGGAGTGGAT 2340
............................................................
............................................................
2341 GTAGAAATTTGCATCAGCATAATATTTGCAGGGCATACAATTCTCCCCATTGATGAGAGG 2400
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2401 GTAAAGGAAAGAACATATGATCTGGGATAATTGCTGGCTAACCTGAATATGTTCTGATGT 2460
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............................................................
2461 AGTGCGCTTGAAGGAAGGGGCATGTCTCTGGCATAGCAAAGTAGGCGTTCTGATATATCT 2520
............................................................
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2521 GAACTTGACTCCAATACAGCAGAGTTGTTATAATCGAGGAGTTCATGACGATATTGCAAG 2580
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2581 ACCAATTGCAGGCTAATTTTAGT 2603
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