Medicago truncatula (MtrunA17r5.0_ANR)
Description

putative F-box domain, galactose oxidase, beta-propeller

About this transcript

This transcript has 1 exon and is annotated with 11 domains and features.

Gene

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-rna490511846341aa
 
Protein coding
G7LHZ0 Ensembl Canonical
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     1 GATTAATTGGTTACGTTATCAAATCTTAATTTTTAACGGTTCGTATCGTTATAAATGCTC     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 CAAAAGCCACTCAATAACTTCACACTCTTCTTTCTTCTTCATCACACTCACTTGTAATCT    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 CACAAAACCAATTTCAATTTTCAAAACACACACAAAAATAAAACAATGGACGAGTTCATC    180
       .............................................ATGGACGAGTTCATC     15
       .............................................-M--D--E--F--I-      5

                                                                          
   181 GAGTTAATACCCGGTTTACCGAGCGAACTAGGACTCGAGTGTCTTACTCGTTTATCTAAT    240
    16 GAGTTAATACCCGGTTTACCGAGCGAACTAGGACTCGAGTGTCTTACTCGTTTATCTAAT     75
     6 -E--L--I--P--G--L--P--S--E--L--G--L--E--C--L--T--R--L--S--N-     25

                                                                          
   241 TCATCTCACAGAGTTGCACTCCGAGTCTGTAACCAGTGGCGACGCTTATTCCTAAGCGAC    300
    76 TCATCTCACAGAGTTGCACTCCGAGTCTGTAACCAGTGGCGACGCTTATTCCTAAGCGAC    135
    26 -S--S--H--R--V--A--L--R--V--C--N--Q--W--R--R--L--F--L--S--D-     45

                                                                          
   301 GAGTTTTACTCTCACAGAAAAAATACCGGTCACACCAGAAAAGTTGCTTGTTTGGTTCAA    360
   136 GAGTTTTACTCTCACAGAAAAAATACCGGTCACACCAGAAAAGTTGCTTGTTTGGTTCAA    195
    46 -E--F--Y--S--H--R--K--N--T--G--H--T--R--K--V--A--C--L--V--Q-     65

                                                                          
   361 GCCCATGAACAACAACCCCACTCTGAATTCGATAAACAAACCGGTTCAACTCCACCGAGT    420
   196 GCCCATGAACAACAACCCCACTCTGAATTCGATAAACAAACCGGTTCAACTCCACCGAGT    255
    66 -A--H--E--Q--Q--P--H--S--E--F--D--K--Q--T--G--S--T--P--P--S-     85

                                                                          
   421 TACGATATCACTGTGTTTGACCCGGAGAGTATGTCATGGGACCGGGTTGATCCGGTTCCT    480
   256 TACGATATCACTGTGTTTGACCCGGAGAGTATGTCATGGGACCGGGTTGATCCGGTTCCT    315
    86 -Y--D--I--T--V--F--D--P--E--S--M--S--W--D--R--V--D--P--V--P-    105

                                                                          
   481 GAGTATCCATCCGGGTTACCGTTGTTCTGTCAATTAACCAGCTGCGAAGGAAAGCTCGTG    540
   316 GAGTATCCATCCGGGTTACCGTTGTTCTGTCAATTAACCAGCTGCGAAGGAAAGCTCGTG    375
   106 -E--Y--P--S--G--L--P--L--F--C--Q--L--T--S--C--E--G--K--L--V-    125

                                                                          
   541 GTAATGGGTGGGTGGGACCCGGCGAGTTACGAACCACTTACGGCGGTGTTCGTTTACGAT    600
   376 GTAATGGGTGGGTGGGACCCGGCGAGTTACGAACCACTTACGGCGGTGTTCGTTTACGAT    435
   126 -V--M--G--G--W--D--P--A--S--Y--E--P--L--T--A--V--F--V--Y--D-    145

                                                                          
   601 TTCCGAATGAATATATGGTGGAGAGGGAAGGATATGCCGGAGAAACGTTCGTTCTTTGCT    660
   436 TTCCGAATGAATATATGGTGGAGAGGGAAGGATATGCCGGAGAAACGTTCGTTCTTTGCT    495
   146 -F--R--M--N--I--W--W--R--G--K--D--M--P--E--K--R--S--F--F--A-    165

                                                                          
   661 ACCGGGTCGGGTTACGATCGTGTTTTTGTTGCTGGTGGACATGATGAGAATAAGAACGCG    720
   496 ACCGGGTCGGGTTACGATCGTGTTTTTGTTGCTGGTGGACATGATGAGAATAAGAACGCG    555
   166 -T--G--S--G--Y--D--R--V--F--V--A--G--G--H--D--E--N--K--N--A-    185

                                                                          
   721 TTGAAGACTGCTTGGGCTTATGACCCGAAAATTGATGAATGGACGATGCTGGCTCCGATG    780
   556 TTGAAGACTGCTTGGGCTTATGACCCGAAAATTGATGAATGGACGATGCTGGCTCCGATG    615
   186 -L--K--T--A--W--A--Y--D--P--K--I--D--E--W--T--M--L--A--P--M-    205

                                                                          
   781 AGTCAAGACCGAGACGAGTGTGAAGGAACGGTTGTCGGCGGCGAGTTTTGGGTGGTTAGC    840
   616 AGTCAAGACCGAGACGAGTGTGAAGGAACGGTTGTCGGCGGCGAGTTTTGGGTGGTTAGC    675
   206 -S--Q--D--R--D--E--C--E--G--T--V--V--G--G--E--F--W--V--V--S-    225

                                                                          
   841 GGTTATGCGACGGAGAGTCAAGGGATGTTTGATGATTCTGCGGAGGTGCTGGATATTGGG    900
   676 GGTTATGCGACGGAGAGTCAAGGGATGTTTGATGATTCTGCGGAGGTGCTGGATATTGGG    735
   226 -G--Y--A--T--E--S--Q--G--M--F--D--D--S--A--E--V--L--D--I--G-    245

                                                                          
   901 TCGGGCCAGTGGAGGAGAGTTGAAGGAGTTTGGGAAGCGGGTCGGTGTCCCAGATCATGT    960
   736 TCGGGCCAGTGGAGGAGAGTTGAAGGAGTTTGGGAAGCGGGTCGGTGTCCCAGATCATGT    795
   246 -S--G--Q--W--R--R--V--E--G--V--W--E--A--G--R--C--P--R--S--C-    265

                                                                          
   961 GTTGATATTAGGGAGAATGGGAAAGTGGTGGATCCGGGGCTCCGAATCGGGGTTTGCAGT   1020
   796 GTTGATATTAGGGAGAATGGGAAAGTGGTGGATCCGGGGCTCCGAATCGGGGTTTGCAGT    855
   266 -V--D--I--R--E--N--G--K--V--V--D--P--G--L--R--I--G--V--C--S-    285

                                                                          
  1021 GTTAGGGTCGGGTCGAGGAAATGGGTTACTGGATCTGAATATGAAGGAGCACCGTATGGG   1080
   856 GTTAGGGTCGGGTCGAGGAAATGGGTTACTGGATCTGAATATGAAGGAGCACCGTATGGG    915
   286 -V--R--V--G--S--R--K--W--V--T--G--S--E--Y--E--G--A--P--Y--G-    305

                                                                          
  1081 TTCTATTTGGTGGAGAATGATGAAGGACAAAACCGTAAATTGAATAAGATAAGTAGTGTT   1140
   916 TTCTATTTGGTGGAGAATGATGAAGGACAAAACCGTAAATTGAATAAGATAAGTAGTGTT    975
   306 -F--Y--L--V--E--N--D--E--G--Q--N--R--K--L--N--K--I--S--S--V-    325

                                                                          
  1141 CCTGATGGGTTTGCTGGGTTTGTTCAATCAGGGTGCTGTGTTGAAATCTAGTGAGTGTAC   1200
   976 CCTGATGGGTTTGCTGGGTTTGTTCAATCAGGGTGCTGTGTTGAAATCTAG.........   1026
   326 -P--D--G--F--A--G--F--V--Q--S--G--C--C--V--E--I--*-.........    341

                                                                          
  1201 ACAGATAGATATATGCAGCCAATTTTATTGTAGATATTATATTGTATATAGTTTGATTAA   1260
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1261 GGAAGAAAAAATTAACTTCACTTAATCTAACAGCTAAGTGATGCGTAAGTAAATAATTTT   1320
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1321 TGCTACTCACACCTTCTGTATCATACTTCCTATATTTAAGGTGCAACAATTAGCACAAAT   1380
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1381 ATTCTGCTTTGGGAAAAAAAAATACAAAAGTCACGATCTGTGAGTGAAATATGTGTTACT   1440
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1441 ATACATAAATTTGTTTTCATCTTTATTAGTTCTAGACAGTAAAATATGGTAAGACTTGTT   1500
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1501 GATTTAATTTAATAGTAGAAAAAAAAATGTGCGTAGTTTACTTGTTGACCATATAACTAG   1560
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1561 CATGCAATTTGTAGTTTTGAGTTGAAGATTGGTATTGTAATTTGAGCTTTCGAAGCTTCG   1620
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1621 ATCCATCATTCACTTGCAATGTTGCAATGTAGTATGCCGCCCTATCTCTGAATTATTACA   1680
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1681 TGATGAGTTTTTATTTATTTTTTATTATATGATGATATTATGATAATGATAGCATCTTTT   1740
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1741 ACCTTAATAATGATAGTCATAGTAGCATATTTGGTAGTAATATTTTGTTTGTTATCCATA   1800
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1801 AAAACAAAAAATATAAATAGTAAATGTTTTGATTGTTGCACATATT                 1846
       ..............................................                     
       ..............................................