We need your help! Has Ensembl saved you time or effort? Please take 15 minutes to fill in a survey and help EMBL-EBI make the case for why open data resources are critical to life science research.
https://www.surveymonkey.com/r/QGFMBH8?channel=[webpage]

Medicago truncatula (MtrunA17r5.0_ANR)
Description

putative nuclear pore localization protein NPL4

About this transcript

This transcript has 2 exons and is annotated with 12 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene gene43643 Show transcript tableHide transcript table

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-rna436431970414aa
 
Protein coding
G8A181 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 TTGAGCCCATGATCATTAGACGGTTTTTCTGTGCTTCAGATTGAACTCTACACAGTATCA     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 GTATCAGTATCGCGTAATCGTAATAACTTAACTTTCCCTTTTCTTTTCAGTTTTCTCCCT    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 CGACGCGCGGTGAAGTAAGCAAGTTCTTTTCGTTCTCTGCATCTTTTCCACTCCACCAAG    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 CAATCCATAATCGATTATTCTCAACTCTTCTATATTCCATTCATAAAAACCCCAATTCTT    240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   241 TCTTCATCATTCTCAATCATCATCCACACAAAATAACCAAAACATAAACCATGATGCTCA    300
       ..................................................ATGATGCTCA     10
       ..................................................-M--M--L--      3

                                                                          
   301 GAATTCGAAGCCGAGATGGTCTAGAACGAGTAACACTCGATAATCCAAACAACAAAACCG    360
    11 GAATTCGAAGCCGAGATGGTCTAGAACGAGTAACACTCGATAATCCAAACAACAAAACCG     70
     4 R--I--R--S--R--D--G--L--E--R--V--T--L--D--N--P--N--N--K--T--     23

                                                                          
   361 TCTCAGACCTCAAAACAATCATCGAAAAACAACTACGTATCCCCACACACAACCAAACCC    420
    71 TCTCAGACCTCAAAACAATCATCGAAAAACAACTACGTATCCCCACACACAACCAAACCC    130
    24 V--S--D--L--K--T--I--I--E--K--Q--L--R--I--P--T--H--N--Q--T--     43

                                                                          
   421 TATCCACCAATCAAAACCTTCTCCTCGCTAAATCCCTTCAAGATCTTCTCCTATTCACCG    480
   131 TATCCACCAATCAAAACCTTCTCCTCGCTAAATCCCTTCAAGATCTTCTCCTATTCACCG    190
    44 L--S--T--N--Q--N--L--L--L--A--K--S--L--Q--D--L--L--L--F--T--     63

                                                                          
   481 ACATGTCAAACCCTAACACTCCCTTAACAGCTTTAAACCTCTCTCACGGTTCAATCATCT    540
   191 ACATGTCAAACCCTAACACTCCCTTAACAGCTTTAAACCTCTCTCACGGTTCAATCATCT    250
    64 D--M--S--N--P--N--T--P--L--T--A--L--N--L--S--H--G--S--I--I--     83

                                                                          
   541 TTTTAGCTTACGAAGGTGAACGTACTGTTCAAGGTCCCGCTGCTTTCTCACCCGCCGGTT    600
   251 TTTTAGCTTACGAAGGTGAACGTACTGTTCAAGGTCCCGCTGCTTTCTCACCCGCCGGTT    310
    84 F--L--A--Y--E--G--E--R--T--V--Q--G--P--A--A--F--S--P--A--G--    103

                                                                          
   601 CATTCGGTAAGAAAATGACTATGGATGATCTCATCGCGAAACAGATGCGTGTTTCGCGAC    660
   311 CATTCGGTAAGAAAATGACTATGGATGATCTCATCGCGAAACAGATGCGTGTTTCGCGAC    370
   104 S--F--G--K--K--M--T--M--D--D--L--I--A--K--Q--M--R--V--S--R--    123

                                                                          
   661 AAGAGAATCCACATTGTGAATTGGTTTCATTTGATCGCGATTGTGCAAATGCTTTTCAGC    720
   371 AAGAGAATCCACATTGTGAATTGGTTTCATTTGATCGCGATTGTGCAAATGCTTTTCAGC    430
   124 Q--E--N--P--H--C--E--L--V--S--F--D--R--D--C--A--N--A--F--Q--    143

                                                                          
   721 ATTATGTCAATGAGAATCTTGCTTTTGCTGTGAAAAGGGGTGGGTTTATGTATGGTACTG    780
   431 ATTATGTCAATGAGAATCTTGCTTTTGCTGTGAAAAGGGGTGGGTTTATGTATGGTACTG    490
   144 H--Y--V--N--E--N--L--A--F--A--V--K--R--G--G--F--M--Y--G--T--    163

                                                                          
   781 TTACTGAAGAAGGAAAGGTTGAGGTGAATTTTATATATGAACCTCCGCAACAAGGTTTGG    840
   491 TTACTGAAGAAGGAAAGGTTGAGGTGAATTTTATATATGAACCTCCGCAACAAGGTTTGG    550
   164 V--T--E--E--G--K--V--E--V--N--F--I--Y--E--P--P--Q--Q--G--L--    183

                                                                          
   841 AGGATAATTTATTGTTTTTTAGGGATCCTGAGGAAGAGAAATGTGTTGAAGCCATTGCGG    900
   551 AGGATAATTTATTGTTTTTTAGGGATCCTGAGGAAGAGAAATGTGTTGAAGCCATTGCGG    610
   184 E--D--N--L--L--F--F--R--D--P--E--E--E--K--C--V--E--A--I--A--    203

                                                                          
   901 CTGGATTAGGGATGAAGAGGGTTGGGTTTATTTTTACTCAAAGTGTGAGTCAGGATAAAA    960
   611 CTGGATTAGGGATGAAGAGGGTTGGGTTTATTTTTACTCAAAGTGTGAGTCAGGATAAAA    670
   204 A--G--L--G--M--K--R--V--G--F--I--F--T--Q--S--V--S--Q--D--K--    223

                                                                          
   961 AGGATTATACTTTATCTTATAGGGAAGTGCTGCAAGCTGCTGAGTATCATGCTGAGAGTG   1020
   671 AGGATTATACTTTATCTTATAGGGAAGTGCTGCAAGCTGCTGAGTATCATGCTGAGAGTG    730
   224 K--D--Y--T--L--S--Y--R--E--V--L--Q--A--A--E--Y--H--A--E--S--    243

                                                                          
  1021 GTTTGAAGGAATGGGTTACCGCGGTTGTGAAGCTCGAGGTGAATGAGGAAATGGGTGGTG   1080
   731 GTTTGAAGGAATGGGTTACCGCGGTTGTGAAGCTCGAGGTGAATGAGGAAATGGGTGGTG    790
   244 G--L--K--E--W--V--T--A--V--V--K--L--E--V--N--E--E--M--G--G--    263

                                                                          
  1081 CTGATGTTCATTTTGAAGCTTTTCAGATGAGTGATGTTTGTATTAGGTTGTTTAAGGAAG   1140
   791 CTGATGTTCATTTTGAAGCTTTTCAGATGAGTGATGTTTGTATTAGGTTGTTTAAGGAAG    850
   264 A--D--V--H--F--E--A--F--Q--M--S--D--V--C--I--R--L--F--K--E--    283

                                                                          
  1141 GGTGGTTTGATACTGAGGTTAAGGAGGATCATGATCCTAAGTTGTCCATCATGAAGAAGG   1200
   851 GGTGGTTTGATACTGAGGTTAAGGAGGATCATGATCCTAAGTTGTCCATCATGAAGAAGG    910
   284 G--W--F--D--T--E--V--K--E--D--H--D--P--K--L--S--I--M--K--K--    303

                                                                          
  1201 ATGTTGTTGTTGGTGTGAAGGATACTAAAGAGGTTGATAATGATTTTTTCTTGGTTGTTG   1260
   911 ATGTTGTTGTTGGTGTGAAGGATACTAAAGAGGTTGATAATGATTTTTTCTTGGTTGTTG    970
   304 D--V--V--V--G--V--K--D--T--K--E--V--D--N--D--F--F--L--V--V--    323

                                                                          
  1261 TTAAAATCTCTGATCATCAGGGTCCTCTTTCGTCAACATTTCCCGTTGAGAACCGGAATA   1320
   971 TTAAAATCTCTGATCATCAGGGTCCTCTTTCGTCAACATTTCCCGTTGAGAACCGGAATA   1030
   324 V--K--I--S--D--H--Q--G--P--L--S--S--T--F--P--V--E--N--R--N--    343

                                                                          
  1321 CTCAAGTGACTGCGATGGCACTGAAGAATCATCTTGAACGGACTAAAAATCTTCCATTTG   1380
  1031 CTCAAGTGACTGCGATGGCACTGAAGAATCATCTTGAACGGACTAAAAATCTTCCATTTG   1090
   344 T--Q--V--T--A--M--A--L--K--N--H--L--E--R--T--K--N--L--P--F--    363

                                                                          
  1381 TGAAGCGAATTTCAGATTTTCATCTTCTTCTTGTATTAGCGAGGGTTTTGGATGTGTCTG   1440
  1091 TGAAGCGAATTTCAGATTTTCATCTTCTTCTTGTATTAGCGAGGGTTTTGGATGTGTCTG   1150
   364 V--K--R--I--S--D--F--H--L--L--L--V--L--A--R--V--L--D--V--S--    383

                                                                          
  1441 CTGATGTTCCTGCATTGACCGAATGTGTGCAGACACAGAGTGCTGTACCTGAAGGTTACC   1500
  1151 CTGATGTTCCTGCATTGACCGAATGTGTGCAGACACAGAGTGCTGTACCTGAAGGTTACC   1210
   384 A--D--V--P--A--L--T--E--C--V--Q--T--Q--S--A--V--P--E--G--Y--    403

                                                                          
  1501 AGATCCTTATTGAGTCCATGGCTAGCGCTGCTTGATGCTGTGTCTAGGTGCTCGGGGCTC   1560
  1211 AGATCCTTATTGAGTCCATGGCTAGCGCTGCTTGA.........................   1245
   404 Q--I--L--I--E--S--M--A--S--A--A--*-.........................    414

                                                                          
  1561 ATACAGGACCATAGCAAATGAATCATGCACTATATGTAGGGGAAGATCCAGTGTACCATG   1620
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1621 AGGTGTGCAGAAATTGCACTGGTATCCTTATAATTTTGCATTCCGACCACCCTGAATTTT   1680
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1681 ATATGTTGCACCGTAGACTCAAATATTTGCATCTAAACCCAAAGTATTTCATTTACTTTT   1740
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1741 TCGCATTCTGACCAAAGTCCCGTCAACTTTATGTTTATGTATATTGTCTTAATATATTTA   1800
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1801 TTATAGTAATTATTATTCTATTTGATTATCATAAAAGCTAAAATGAAAATGCAAAATGCA   1860
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1861 AGGCATCAAACTCAAGAGTCAAAAGAACGGTGCTATATAGTATATGGTGCGAAGCTTTGT   1920
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1921 TCGCACAAAATGCACGACTGCATGTTTTCATGCTTTTTTGTACAATTTAC             1970
       ..................................................                 
       ..................................................