Description
putative nuclear pore localization protein NPL4
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- rna43643 1970 414aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
G8A181 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 T TGAGCCCATGATCATTAGACGGTTTTTCTGTGCTTCAGATTGAACTCTACACAGTATCA 60
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............................................................
61 GTATCAGTATCGCGTAATCGTAATAACTTAACTTTCCCTTTTCTTTTCAGTTTTCTCCCT 120
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............................................................
121 CGACGCGCGGTGAAGTAAGCAAGTTCTTTTCGTTCTCTGCATCTTTTCCACTCCACCAAG 180
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181 CAATCCATAATCGATTATTCTCAACTCTTCTATATTCCATTCATAAAAACCCCAATTCTT 240
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241 TCTTCATCATTCTCAATCATCATCCACACAAAATAACCAAAACATAAACC ATG ATG CTC A 300
..................................................ATGATGCTCA 10
..................................................-M--M--L-- 3
301 GA ATT CGA AGC CGA GAT GGT CTA GAA CGA GTA ACA CTC GAT AAT CCA AAC AAC AAA ACC G 360
11 GAATTCGAAGCCGAGATGGTCTAGAACGAGTAACACTCGATAATCCAAACAACAAAACCG 70
4 R--I--R--S--R--D--G--L--E--R--V--T--L--D--N--P--N--N--K--T-- 23
361 TC TCA GAC CTC AAA ACA ATC ATC GAA AAA CAA CTA CGT ATC CCC ACA CAC AAC CAA ACC C 420
71 TCTCAGACCTCAAAACAATCATCGAAAAACAACTACGTATCCCCACACACAACCAAACCC 130
24 V--S--D--L--K--T--I--I--E--K--Q--L--R--I--P--T--H--N--Q--T-- 43
421 TA TCC ACC AAT CAA AAC CTT CTC CTC GCT AAA TCC CTT CAA GAT CTT CTC CTA TTC ACC G 480
131 TATCCACCAATCAAAACCTTCTCCTCGCTAAATCCCTTCAAGATCTTCTCCTATTCACCG 190
44 L--S--T--N--Q--N--L--L--L--A--K--S--L--Q--D--L--L--L--F--T-- 63
481 AC ATG TCA AAC CCT AAC ACT CCC TTA ACA GCT TTA AAC CTC TCT CAC GGT TCA ATC ATC T 540
191 ACATGTCAAACCCTAACACTCCCTTAACAGCTTTAAACCTCTCTCACGGTTCAATCATCT 250
64 D--M--S--N--P--N--T--P--L--T--A--L--N--L--S--H--G--S--I--I-- 83
541 TT TTA GCT TAC GAA GGT GAA CGT ACT GTT CAA GGT CCC GCT GCT TTC TCA CCC GCC GGT T 600
251 TTTTAGCTTACGAAGGTGAACGTACTGTTCAAGGTCCCGCTGCTTTCTCACCCGCCGGTT 310
84 F--L--A--Y--E--G--E--R--T--V--Q--G--P--A--A--F--S--P--A--G-- 103
601 CA TTC GGT AAG AAA ATG ACT ATG GAT GAT CTC ATC GCG AAA CAG ATG CGT GTT TCG CGA C 660
311 CATTCGGTAAGAAAATGACTATGGATGATCTCATCGCGAAACAGATGCGTGTTTCGCGAC 370
104 S--F--G--K--K--M--T--M--D--D--L--I--A--K--Q--M--R--V--S--R-- 123
661 AA GAG AAT CCA CAT TGT GAA TTG GTT TCA TTT GAT CGC GAT TGT GCA AAT GCT TTT CAG C 720
371 AAGAGAATCCACATTGTGAATTGGTTTCATTTGATCGCGATTGTGCAAATGCTTTTCAGC 430
124 Q--E--N--P--H--C--E--L--V--S--F--D--R--D--C--A--N--A--F--Q-- 143
721 AT TAT GTC AAT GAG AAT CTT GCT TTT GCT GTG AAA AGG GGT GGG TTT ATG TAT GGT ACT G 780
431 ATTATGTCAATGAGAATCTTGCTTTTGCTGTGAAAAGGGGTGGGTTTATGTATGGTACTG 490
144 H--Y--V--N--E--N--L--A--F--A--V--K--R--G--G--F--M--Y--G--T-- 163
781 TT ACT GAA GAA GGA AAG GTT GAG GTG AAT TTT ATA TAT GAA CCT CCG CAA CAA GGT TTG G 840
491 TTACTGAAGAAGGAAAGGTTGAGGTGAATTTTATATATGAACCTCCGCAACAAGGTTTGG 550
164 V--T--E--E--G--K--V--E--V--N--F--I--Y--E--P--P--Q--Q--G--L-- 183
841 AG GAT AAT TTA TTG TTT TTT AGG GAT CCT GAG GAA GAG AAA TGT GTT GAA GCC ATT GCG G 900
551 AGGATAATTTATTGTTTTTTAGGGATCCTGAGGAAGAGAAATGTGTTGAAGCCATTGCGG 610
184 E--D--N--L--L--F--F--R--D--P--E--E--E--K--C--V--E--A--I--A-- 203
901 CT GGA TTA GGG ATG AAG AGG GTT GGG TTT ATT TTT ACT CAA AGT GTG AGT CAG GAT AAA A 960
611 CTGGATTAGGGATGAAGAGGGTTGGGTTTATTTTTACTCAAAGTGTGAGTCAGGATAAAA 670
204 A--G--L--G--M--K--R--V--G--F--I--F--T--Q--S--V--S--Q--D--K-- 223
961 AG GAT TAT ACT TTA TCT TAT AGG GAA GTG CTG CAA GCT GCT GAG TAT CAT GCT GAG AGT G 1020
671 AGGATTATACTTTATCTTATAGGGAAGTGCTGCAAGCTGCTGAGTATCATGCTGAGAGTG 730
224 K--D--Y--T--L--S--Y--R--E--V--L--Q--A--A--E--Y--H--A--E--S-- 243
1021 GT TTG AAG GAA TGG GTT ACC GCG GTT GTG AAG CTC GAG GTG AAT GAG GAA ATG GGT GGT G 1080
731 GTTTGAAGGAATGGGTTACCGCGGTTGTGAAGCTCGAGGTGAATGAGGAAATGGGTGGTG 790
244 G--L--K--E--W--V--T--A--V--V--K--L--E--V--N--E--E--M--G--G-- 263
1081 CT GAT GTT CAT TTT GAA GCT TTT CAG ATG AGT GAT GTT TGT ATT AGG TTG TTT AAG GAA G 1140
791 CTGATGTTCATTTTGAAGCTTTTCAGATGAGTGATGTTTGTATTAGGTTGTTTAAGGAAG 850
264 A--D--V--H--F--E--A--F--Q--M--S--D--V--C--I--R--L--F--K--E-- 283
1141 GG TGG TTT GAT ACT GAG GTT AAG GAG GAT CAT GAT CCT AAG TTG TCC ATC ATG AAG AAG G 1200
851 GGTGGTTTGATACTGAGGTTAAGGAGGATCATGATCCTAAGTTGTCCATCATGAAGAAGG 910
284 G--W--F--D--T--E--V--K--E--D--H--D--P--K--L--S--I--M--K--K-- 303
1201 AT GTT GTT GTT GGT GTG AAG GAT ACT AAA GAG GTT GAT AAT GAT TTT TTC TTG GTT GTT G 1260
911 ATGTTGTTGTTGGTGTGAAGGATACTAAAGAGGTTGATAATGATTTTTTCTTGGTTGTTG 970
304 D--V--V--V--G--V--K--D--T--K--E--V--D--N--D--F--F--L--V--V-- 323
1261 TT AAA ATC TCT GAT CAT CAG G GT CCT CTT TCG TCA ACA TTT CCC GTT GAG AAC CGG AAT A 1320
971 TTAAAATCTCTGATCATCAGGGTCCTCTTTCGTCAACATTTCCCGTTGAGAACCGGAATA 1030
324 V--K--I--S--D--H--Q--G--P--L--S--S--T--F--P--V--E--N--R--N-- 343
1321 CT CAA GTG ACT GCG ATG GCA CTG AAG AAT CAT CTT GAA CGG ACT AAA AAT CTT CCA TTT G 1380
1031 CTCAAGTGACTGCGATGGCACTGAAGAATCATCTTGAACGGACTAAAAATCTTCCATTTG 1090
344 T--Q--V--T--A--M--A--L--K--N--H--L--E--R--T--K--N--L--P--F-- 363
1381 TG AAG CGA ATT TCA GAT TTT CAT CTT CTT CTT GTA TTA GCG AGG GTT TTG GAT GTG TCT G 1440
1091 TGAAGCGAATTTCAGATTTTCATCTTCTTCTTGTATTAGCGAGGGTTTTGGATGTGTCTG 1150
364 V--K--R--I--S--D--F--H--L--L--L--V--L--A--R--V--L--D--V--S-- 383
1441 CT GAT GTT CCT GCA TTG ACC GAA TGT GTG CAG ACA CAG AGT GCT GTA CCT GAA GGT TAC C 1500
1151 CTGATGTTCCTGCATTGACCGAATGTGTGCAGACACAGAGTGCTGTACCTGAAGGTTACC 1210
384 A--D--V--P--A--L--T--E--C--V--Q--T--Q--S--A--V--P--E--G--Y-- 403
1501 AG ATC CTT ATT GAG TCC ATG GCT AGC GCT GCT TGA TGCTGTGTCTAGGTGCTCGGGGCTC 1560
1211 AGATCCTTATTGAGTCCATGGCTAGCGCTGCTTGA......................... 1245
404 Q--I--L--I--E--S--M--A--S--A--A--*-......................... 414
1561 ATACAGGACCATAGCAAATGAATCATGCACTATATGTAGGGGAAGATCCAGTGTACCATG 1620
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1621 AGGTGTGCAGAAATTGCACTGGTATCCTTATAATTTTGCATTCCGACCACCCTGAATTTT 1680
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1681 ATATGTTGCACCGTAGACTCAAATATTTGCATCTAAACCCAAAGTATTTCATTTACTTTT 1740
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1741 TCGCATTCTGACCAAAGTCCCGTCAACTTTATGTTTATGTATATTGTCTTAATATATTTA 1800
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1801 TTATAGTAATTATTATTCTATTTGATTATCATAAAAGCTAAAATGAAAATGCAAAATGCA 1860
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1861 AGGCATCAAACTCAAGAGTCAAAAGAACGGTGCTATATAGTATATGGTGCGAAGCTTTGT 1920
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1921 TCGCACAAAATGCACGACTGCATGTTTTCATGCTTTTTTGTACAATTTAC 1970
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