Description
putative transcription factor WD40-like family
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- rna4079 1415 316aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
G7IEB8 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 T TAATTGAAAACACCAGAGAAAGAGAGTGGGGGAGACGAACATAGCGGCAAAGGAATCA A 60
...........................................................A 1
...........................................................-
61 TG GCG ACG AGT ACG ACG AGC AGT AAC AGC ACG CCA CCA TAC AAA CCT TAC CGT CAC CAC A 120
2 TGGCGACGAGTACGACGAGCAGTAACAGCACGCCACCATACAAACCTTACCGTCACCACA 61
1 M--A--T--S--T--T--S--S--N--S--T--P--P--Y--K--P--Y--R--H--H-- 20
121 AA ACC CTA ACA ACC CAC ACA CGC GCC GTT TCT TGC GTC AAA TTC TCC AAC GAC GGA AAC C 180
62 AAACCCTAACAACCCACACACGCGCCGTTTCTTGCGTCAAATTCTCCAACGACGGAAACC 121
21 K--T--L--T--T--H--T--R--A--V--S--C--V--K--F--S--N--D--G--N-- 40
181 TC CTC GCT TCC GCT TCC CTC GAC AAA ACC CTT ATC ATC TAC TCC TCC ACC ACT CTC TCC C 240
122 TCCTCGCTTCCGCTTCCCTCGACAAAACCCTTATCATCTACTCCTCCACCACTCTCTCCC 181
41 L--L--A--S--A--S--L--D--K--T--L--I--I--Y--S--S--T--T--L--S-- 60
241 TC CTC CAC CGC CTC ACC GGC CAC TCT GAA GGC ATT AAC GAC ATC GCC TGG TCC TCC GAT T 300
182 TCCTCCACCGCCTCACCGGCCACTCTGAAGGCATTAACGACATCGCCTGGTCCTCCGATT 241
61 L--L--H--R--L--T--G--H--S--E--G--I--N--D--I--A--W--S--S--D-- 80
301 CC CAC TAC ATC TGC TCC GCC TCC GAC GAC AAA ACC CTC CGT ATC TGG GAC GCT AAC ACC G 360
242 CCCACTACATCTGCTCCGCCTCCGACGACAAAACCCTCCGTATCTGGGACGCTAACACCG 301
81 S--H--Y--I--C--S--A--S--D--D--K--T--L--R--I--W--D--A--N--T-- 100
361 GC GAC TGC GTC AAA ACG CTT CGT GGC CAC GGC CAC AAT GTT TTC TGT GTC AAT TTT AAT C 420
302 GCGACTGCGTCAAAACGCTTCGTGGCCACGGCCACAATGTTTTCTGTGTCAATTTTAATC 361
101 G--D--C--V--K--T--L--R--G--H--G--H--N--V--F--C--V--N--F--N-- 120
421 CA CAA TCC AAT TAC ATC GTT TCG GGT TCG TTT GAT GAG ACG GTT AGG GTT TGG GAA GTG A 480
362 CACAATCCAATTACATCGTTTCGGGTTCGTTTGATGAGACGGTTAGGGTTTGGGAAGTGA 421
121 P--Q--S--N--Y--I--V--S--G--S--F--D--E--T--V--R--V--W--E--V-- 140
481 AG ACT GGG AAA TCT GTT CAT GTT ATT AAG GCT CAT GCT ATG CCT GTT ACT TCT GTT GAT T 540
422 AGACTGGGAAATCTGTTCATGTTATTAAGGCTCATGCTATGCCTGTTACTTCTGTTGATT 481
141 K--T--G--K--S--V--H--V--I--K--A--H--A--M--P--V--T--S--V--D-- 160
541 TT AAT CGC GAC GGT TCG CTT ATT GTT TCT GGG AGT CAT GAT GGG TCT TGT AAG ATT TGG G 600
482 TTAATCGCGACGGTTCGCTTATTGTTTCTGGGAGTCATGATGGGTCTTGTAAGATTTGGG 541
161 F--N--R--D--G--S--L--I--V--S--G--S--H--D--G--S--C--K--I--W-- 180
601 AT ACC AAT TCT GGT GCG CTG TTG AAG ACT TTG ATT GAT GAT AAG GTT CCT GCT GTT TCG T 660
542 ATACCAATTCTGGTGCGCTGTTGAAGACTTTGATTGATGATAAGGTTCCTGCTGTTTCGT 601
181 D--T--N--S--G--A--L--L--K--T--L--I--D--D--K--V--P--A--V--S-- 200
661 TC GCC AAA TTT TCG CCT AAT GGG AAA TTT ATA CTT GTT GCT ACT CTT AAT GAT ACA CTT A 720
602 TCGCCAAATTTTCGCCTAATGGGAAATTTATACTTGTTGCTACTCTTAATGATACACTTA 661
201 F--A--K--F--S--P--N--G--K--F--I--L--V--A--T--L--N--D--T--L-- 220
721 AA CTA TGG AAC TAT GCA GCT GGG AGG TCT TTG AAA ATG TAT TCA GGC CAT GTG AAT AGA G 780
662 AACTATGGAACTATGCAGCTGGGAGGTCTTTGAAAATGTATTCAGGCCATGTGAATAGAG 721
221 K--L--W--N--Y--A--A--G--R--S--L--K--M--Y--S--G--H--V--N--R-- 240
781 TG TAC TGC TTA ACT TCC ACA TTC TCC GTG ACA AAT GGG AGA TAT ATC GTT AGT GGT TCA G 840
722 TGTACTGCTTAACTTCCACATTCTCCGTGACAAATGGGAGATATATCGTTAGTGGTTCAG 781
241 V--Y--C--L--T--S--T--F--S--V--T--N--G--R--Y--I--V--S--G--S-- 260
841 AA GAT CGG TGC CTT TAT TTG TGG GAT CTT CAG CAG AAA AAC ATG ATT CAG AAA CTT GAA G 900
782 AAGATCGGTGCCTTTATTTGTGGGATCTTCAGCAGAAAAACATGATTCAGAAACTTGAAG 841
261 E--D--R--C--L--Y--L--W--D--L--Q--Q--K--N--M--I--Q--K--L--E-- 280
901 GC CAT ACA GAT ACT GTA ATA TCA GTT ACC TGC CAC CCA AAA GAG AAT AAA ATT GCT TCT G 960
842 GCCATACAGATACTGTAATATCAGTTACCTGCCACCCAAAAGAGAATAAAATTGCTTCTG 901
281 G--H--T--D--T--V--I--S--V--T--C--H--P--K--E--N--K--I--A--S-- 300
961 CT GGC CTT GAT GGT GAT AGA ACT GTG AGG ATT TGG GTA CAG GAT TCT TGA ATGATTGCAA 1020
902 CTGGCCTTGATGGTGATAGAACTGTGAGGATTTGGGTACAGGATTCTTGA.......... 951
301 A--G--L--D--G--D--R--T--V--R--I--W--V--Q--D--S--*-.......... 316
1021 AACTTTGGGGGGATATTGGCATACACATCTGAGGTTGTCCCCAATTAATATGCTTCTTTT 1080
............................................................
............................................................
1081 TTGAGTCTGAGTTTGTCCCCAGTTATTAAGCTTCTTTTTTGAGAGTTGATGCTTTATAGG 1140
............................................................
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1141 GGTGCGATTGTTAGAACACTATACGAGTATACATTAATAATTAGAAGAACTTACATTATT 1200
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1201 TGCATTTTAGGGTCTATAATTATTGCTTTAGAAAATAACACTGCACCAAAATGAATATGA 1260
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1261 CATTGATGCAATGCAAGTAGTTATGAGACTTAAGACAGGTATCGTCTATTTCAGACCCAA 1320
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1321 AAGTTCTGATCTGCAGAAAACAGAGAAGGTTAGAAATAAATTTATTTTCATCCATTGAGA 1380
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1381 TCTGATGCACTGAAAAATGAATTCATTTTCATCAA 1415
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