Medicago truncatula (MtrunA17r5.0_ANR)
Description

putative transcription factor WD40-like family

About this transcript

This transcript has 2 exons and is annotated with 40 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene gene4079 Show transcript tableHide transcript table

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-rna40791415316aa
 
Protein coding
G7IEB8 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 TTAATTGAAAACACCAGAGAAAGAGAGTGGGGGAGACGAACATAGCGGCAAAGGAATCAA     60
       ...........................................................A      1
       ...........................................................-       

                                                                          
    61 TGGCGACGAGTACGACGAGCAGTAACAGCACGCCACCATACAAACCTTACCGTCACCACA    120
     2 TGGCGACGAGTACGACGAGCAGTAACAGCACGCCACCATACAAACCTTACCGTCACCACA     61
     1 M--A--T--S--T--T--S--S--N--S--T--P--P--Y--K--P--Y--R--H--H--     20

                                                                          
   121 AAACCCTAACAACCCACACACGCGCCGTTTCTTGCGTCAAATTCTCCAACGACGGAAACC    180
    62 AAACCCTAACAACCCACACACGCGCCGTTTCTTGCGTCAAATTCTCCAACGACGGAAACC    121
    21 K--T--L--T--T--H--T--R--A--V--S--C--V--K--F--S--N--D--G--N--     40

                                                                          
   181 TCCTCGCTTCCGCTTCCCTCGACAAAACCCTTATCATCTACTCCTCCACCACTCTCTCCC    240
   122 TCCTCGCTTCCGCTTCCCTCGACAAAACCCTTATCATCTACTCCTCCACCACTCTCTCCC    181
    41 L--L--A--S--A--S--L--D--K--T--L--I--I--Y--S--S--T--T--L--S--     60

                                                                          
   241 TCCTCCACCGCCTCACCGGCCACTCTGAAGGCATTAACGACATCGCCTGGTCCTCCGATT    300
   182 TCCTCCACCGCCTCACCGGCCACTCTGAAGGCATTAACGACATCGCCTGGTCCTCCGATT    241
    61 L--L--H--R--L--T--G--H--S--E--G--I--N--D--I--A--W--S--S--D--     80

                                                                          
   301 CCCACTACATCTGCTCCGCCTCCGACGACAAAACCCTCCGTATCTGGGACGCTAACACCG    360
   242 CCCACTACATCTGCTCCGCCTCCGACGACAAAACCCTCCGTATCTGGGACGCTAACACCG    301
    81 S--H--Y--I--C--S--A--S--D--D--K--T--L--R--I--W--D--A--N--T--    100

                                                                          
   361 GCGACTGCGTCAAAACGCTTCGTGGCCACGGCCACAATGTTTTCTGTGTCAATTTTAATC    420
   302 GCGACTGCGTCAAAACGCTTCGTGGCCACGGCCACAATGTTTTCTGTGTCAATTTTAATC    361
   101 G--D--C--V--K--T--L--R--G--H--G--H--N--V--F--C--V--N--F--N--    120

                                                                          
   421 CACAATCCAATTACATCGTTTCGGGTTCGTTTGATGAGACGGTTAGGGTTTGGGAAGTGA    480
   362 CACAATCCAATTACATCGTTTCGGGTTCGTTTGATGAGACGGTTAGGGTTTGGGAAGTGA    421
   121 P--Q--S--N--Y--I--V--S--G--S--F--D--E--T--V--R--V--W--E--V--    140

                                                                          
   481 AGACTGGGAAATCTGTTCATGTTATTAAGGCTCATGCTATGCCTGTTACTTCTGTTGATT    540
   422 AGACTGGGAAATCTGTTCATGTTATTAAGGCTCATGCTATGCCTGTTACTTCTGTTGATT    481
   141 K--T--G--K--S--V--H--V--I--K--A--H--A--M--P--V--T--S--V--D--    160

                                                                          
   541 TTAATCGCGACGGTTCGCTTATTGTTTCTGGGAGTCATGATGGGTCTTGTAAGATTTGGG    600
   482 TTAATCGCGACGGTTCGCTTATTGTTTCTGGGAGTCATGATGGGTCTTGTAAGATTTGGG    541
   161 F--N--R--D--G--S--L--I--V--S--G--S--H--D--G--S--C--K--I--W--    180

                                                                          
   601 ATACCAATTCTGGTGCGCTGTTGAAGACTTTGATTGATGATAAGGTTCCTGCTGTTTCGT    660
   542 ATACCAATTCTGGTGCGCTGTTGAAGACTTTGATTGATGATAAGGTTCCTGCTGTTTCGT    601
   181 D--T--N--S--G--A--L--L--K--T--L--I--D--D--K--V--P--A--V--S--    200

                                                                          
   661 TCGCCAAATTTTCGCCTAATGGGAAATTTATACTTGTTGCTACTCTTAATGATACACTTA    720
   602 TCGCCAAATTTTCGCCTAATGGGAAATTTATACTTGTTGCTACTCTTAATGATACACTTA    661
   201 F--A--K--F--S--P--N--G--K--F--I--L--V--A--T--L--N--D--T--L--    220

                                                                          
   721 AACTATGGAACTATGCAGCTGGGAGGTCTTTGAAAATGTATTCAGGCCATGTGAATAGAG    780
   662 AACTATGGAACTATGCAGCTGGGAGGTCTTTGAAAATGTATTCAGGCCATGTGAATAGAG    721
   221 K--L--W--N--Y--A--A--G--R--S--L--K--M--Y--S--G--H--V--N--R--    240

                                                                          
   781 TGTACTGCTTAACTTCCACATTCTCCGTGACAAATGGGAGATATATCGTTAGTGGTTCAG    840
   722 TGTACTGCTTAACTTCCACATTCTCCGTGACAAATGGGAGATATATCGTTAGTGGTTCAG    781
   241 V--Y--C--L--T--S--T--F--S--V--T--N--G--R--Y--I--V--S--G--S--    260

                                                                          
   841 AAGATCGGTGCCTTTATTTGTGGGATCTTCAGCAGAAAAACATGATTCAGAAACTTGAAG    900
   782 AAGATCGGTGCCTTTATTTGTGGGATCTTCAGCAGAAAAACATGATTCAGAAACTTGAAG    841
   261 E--D--R--C--L--Y--L--W--D--L--Q--Q--K--N--M--I--Q--K--L--E--    280

                                                                          
   901 GCCATACAGATACTGTAATATCAGTTACCTGCCACCCAAAAGAGAATAAAATTGCTTCTG    960
   842 GCCATACAGATACTGTAATATCAGTTACCTGCCACCCAAAAGAGAATAAAATTGCTTCTG    901
   281 G--H--T--D--T--V--I--S--V--T--C--H--P--K--E--N--K--I--A--S--    300

                                                                          
   961 CTGGCCTTGATGGTGATAGAACTGTGAGGATTTGGGTACAGGATTCTTGAATGATTGCAA   1020
   902 CTGGCCTTGATGGTGATAGAACTGTGAGGATTTGGGTACAGGATTCTTGA..........    951
   301 A--G--L--D--G--D--R--T--V--R--I--W--V--Q--D--S--*-..........    316

                                                                          
  1021 AACTTTGGGGGGATATTGGCATACACATCTGAGGTTGTCCCCAATTAATATGCTTCTTTT   1080
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1081 TTGAGTCTGAGTTTGTCCCCAGTTATTAAGCTTCTTTTTTGAGAGTTGATGCTTTATAGG   1140
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1141 GGTGCGATTGTTAGAACACTATACGAGTATACATTAATAATTAGAAGAACTTACATTATT   1200
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1201 TGCATTTTAGGGTCTATAATTATTGCTTTAGAAAATAACACTGCACCAAAATGAATATGA   1260
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1261 CATTGATGCAATGCAAGTAGTTATGAGACTTAAGACAGGTATCGTCTATTTCAGACCCAA   1320
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1321 AAGTTCTGATCTGCAGAAAACAGAGAAGGTTAGAAATAAATTTATTTTCATCCATTGAGA   1380
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1381 TCTGATGCACTGAAAAATGAATTCATTTTCATCAA                            1415
       ...................................                                
       ...................................