Medicago truncatula (MtrunA17r5.0_ANR) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
putative transcription factor WD40-like family
Primary_assembly CM010654.1: 5,616,247-5,621,095 reverse strand.
This transcript has 8 exons and is annotated with 20 domains and features.
This transcript is a product of gene gene38648 Show transcript tableHide transcript table
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1 GCCCAGTTTTAAGAGGCCCATGTACTAAACAGAATAAGCCCAATCTTTAATATCTTCCTT 60 ............................................................ ............................................................ 61 GAGCAGCGCCGCTTCTTCCTCTTCTTCTCTTTCTTCACGCCTTCGCACGCTGCGCCATCT 120 ............................................................ ............................................................ 121 TTTCCGATCTTCGAACCGCTCCAACTCGGCGGAGGCTTAGTGGCGCGCCGAGGAAGGATG 180 .........................................................ATG 3 .........................................................-M- 1 181 GTGGTTGTTTTGGCTTCATCCACGGATGCTAGTGGTGGGATTGGATGCTGGGACCTTAAC 240 4 GTGGTTGTTTTGGCTTCATCCACGGATGCTAGTGGTGGGATTGGATGCTGGGACCTTAAC 63 2 -V--V--V--L--A--S--S--T--D--A--S--G--G--I--G--C--W--D--L--N- 21 241 ACAGGTTCTGAGCAGATCCGCTACAAATCATTTTCTTCCCCTTCTCATGGACTTGTCTCT 300 64 ACAGGTTCTGAGCAGATCCGCTACAAATCATTTTCTTCCCCTTCTCATGGACTTGTCTCT 123 22 -T--G--S--E--Q--I--R--Y--K--S--F--S--S--P--S--H--G--L--V--S- 41 301 GTTGGTGATCGTTTCCTTGCATCTTCTCAGCTTCGAGATGCATCAACTTCCTCTGCTTCC 360 124 GTTGGTGATCGTTTCCTTGCATCTTCTCAGCTTCGAGATGCATCAACTTCCTCTGCTTCC 183 42 -V--G--D--R--F--L--A--S--S--Q--L--R--D--A--S--T--S--S--A--S- 61 361 GTTTTCTTCTGGTCCTGGTCCAAGCCTCAAGTTGAAGTTAAGAGCTTTCCTTCTGAACCT 420 184 GTTTTCTTCTGGTCCTGGTCCAAGCCTCAAGTTGAAGTTAAGAGCTTTCCTTCTGAACCT 243 62 -V--F--F--W--S--W--S--K--P--Q--V--E--V--K--S--F--P--S--E--P- 81 421 ATCACGCCTCTTGCTTCTAATCACAGTGGCACTTATCTAGTTGGTGGAGGTTTGTCTGGT 480 244 ATCACGCCTCTTGCTTCTAATCACAGTGGCACTTATCTAGTTGGTGGAGGTTTGTCTGGT 303 82 -I--T--P--L--A--S--N--H--S--G--T--Y--L--V--G--G--G--L--S--G- 101 481 GAAATATACTTGTGGGAGGTTGAAACCGGCAGATTGCTTAAGAAGTGGCATGGTCATAAT 540 304 GAAATATACTTGTGGGAGGTTGAAACCGGCAGATTGCTTAAGAAGTGGCATGGTCATAAT 363 102 -E--I--Y--L--W--E--V--E--T--G--R--L--L--K--K--W--H--G--H--N- 121 541 ACGGCTGTTACTTGCCTGGTATTTTCTGAAGATGACTCACTTCTAATATCTGGTTTTAAA 600 364 ACGGCTGTTACTTGCCTGGTATTTTCTGAAGATGACTCACTTCTAATATCTGGTTTTAAA 423 122 -T--A--V--T--C--L--V--F--S--E--D--D--S--L--L--I--S--G--F--K- 141 601 AATGGAAGCGTACGAGTTTGGTCTCTCTTAATGATATTTGATGATGTGAGAAGACGGGAA 660 424 AATGGAAGCGTACGAGTTTGGTCTCTCTTAATGATATTTGATGATGTGAGAAGACGGGAA 483 142 -N--G--S--V--R--V--W--S--L--L--M--I--F--D--D--V--R--R--R--E- 161 661 GCAAGCAAGATTTATGAGTATAGTTTTTCAGACCACACTTTGTGTGTAAATGATGTTGTG 720 484 GCAAGCAAGATTTATGAGTATAGTTTTTCAGACCACACTTTGTGTGTAAATGATGTTGTG 543 162 -A--S--K--I--Y--E--Y--S--F--S--D--H--T--L--C--V--N--D--V--V- 181 721 ATCGGTTATGGAGGATGCAATGCAATTATAGCTTCAGCGTCAGATGATCGGACGTGTAAG 780 544 ATCGGTTATGGAGGATGCAATGCAATTATAGCTTCAGCGTCAGATGATCGGACGTGTAAG 603 182 -I--G--Y--G--G--C--N--A--I--I--A--S--A--S--D--D--R--T--C--K- 201 781 GTATGGACCTTATCTAATGGAATGCTACAAAGAAATATAGTGTTCCCTTCAAAAATTAAA 840 604 GTATGGACCTTATCTAATGGAATGCTACAAAGAAATATAGTGTTCCCTTCAAAAATTAAA 663 202 -V--W--T--L--S--N--G--M--L--Q--R--N--I--V--F--P--S--K--I--K- 221 841 GCCATTGCATTGGATCCTGCTGAACATGTTCTCTATGCTGGCAGTGAAGATGGAAAAATA 900 664 GCCATTGCATTGGATCCTGCTGAACATGTTCTCTATGCTGGCAGTGAAGATGGAAAAATA 723 222 -A--I--A--L--D--P--A--E--H--V--L--Y--A--G--S--E--D--G--K--I- 241 901 TTTGTCGCTGCACTTAACACCACAAGAATCACTACTAATGATCAAGTTTCATATATCACT 960 724 TTTGTCGCTGCACTTAACACCACAAGAATCACTACTAATGATCAAGTTTCATATATCACT 783 242 -F--V--A--A--L--N--T--T--R--I--T--T--N--D--Q--V--S--Y--I--T- 261 961 GGTTCATTTTCTAACCACAGCAAGGCAGTTACTTGCTTAGCATATAGTGCCGCCGAGAAT 1020 784 GGTTCATTTTCTAACCACAGCAAGGCAGTTACTTGCTTAGCATATAGTGCCGCCGAGAAT 843 262 -G--S--F--S--N--H--S--K--A--V--T--C--L--A--Y--S--A--A--E--N- 281 1021 TTTTTAATATCTGGATCTGATGATGGAATTGTTCGAGTTTGGAATGCCAGTACTCATAAC 1080 844 TTTTTAATATCTGGATCTGATGATGGAATTGTTCGAGTTTGGAATGCCAGTACTCATAAC 903 282 -F--L--I--S--G--S--D--D--G--I--V--R--V--W--N--A--S--T--H--N- 301 1081 ATCATCCGTGTCTTTAAACATGCTAAAGGACCAATAACTAATATTCTTGTTCTTAGACAA 1140 904 ATCATCCGTGTCTTTAAACATGCTAAAGGACCAATAACTAATATTCTTGTTCTTAGACAA 963 302 -I--I--R--V--F--K--H--A--K--G--P--I--T--N--I--L--V--L--R--Q- 321 1141 GAAAATGACTTGAGTAATCCCATGTCCTCTAATTTACAAGGAACCTCAAAAAAGAAGGGA 1200 964 GAAAATGACTTGAGTAATCCCATGTCCTCTAATTTACAAGGAACCTCAAAAAAGAAGGGA 1023 322 -E--N--D--L--S--N--P--M--S--S--N--L--Q--G--T--S--K--K--K--G- 341 1201 GCTCAATTTCCTCCTCTGGAAAAGTATGCGAATTCAATGGATGAAGACTCAGATAAAACG 1260 1024 GCTCAATTTCCTCCTCTGGAAAAGTATGCGAATTCAATGGATGAAGACTCAGATAAAACG 1083 342 -A--Q--F--P--P--L--E--K--Y--A--N--S--M--D--E--D--S--D--K--T- 361 1261 ACTATTGTCAGTCTTGGTGGTGGCAATATATGCATGGATGTTTCATACCTTAGTTCTCAA 1320 1084 ACTATTGTCAGTCTTGGTGGTGGCAATATATGCATGGATGTTTCATACCTTAGTTCTCAA 1143 362 -T--I--V--S--L--G--G--G--N--I--C--M--D--V--S--Y--L--S--S--Q- 381 1321 GTGATTTCTAGTTACAGTAAAGAACTTCAGAGTCAAGGTTCAGCTGCTGCTTCTGAAATG 1380 1144 GTGATTTCTAGTTACAGTAAAGAACTTCAGAGTCAAGGTTCAGCTGCTGCTTCTGAAATG 1203 382 -V--I--S--S--Y--S--K--E--L--Q--S--Q--G--S--A--A--A--S--E--M- 401 1381 GAGATAGAGAAACTAAAGCGTGATTGCCAAAAGTCGGTACAAATGGTTAACAAATGGAAA 1440 1204 GAGATAGAGAAACTAAAGCGTGATTGCCAAAAGTCGGTACAAATGGTTAACAAATGGAAA 1263 402 -E--I--E--K--L--K--R--D--C--Q--K--S--V--Q--M--V--N--K--W--K- 421 1441 AAAATGTATGAAAACTTGCATCAATTTTGTGTAAAGGAGATGCTAGATGGAAATGAGAAA 1500 1264 AAAATGTATGAAAACTTGCATCAATTTTGTGTAAAGGAGATGCTAGATGGAAATGAGAAA 1323 422 -K--M--Y--E--N--L--H--Q--F--C--V--K--E--M--L--D--G--N--E--K- 441 1501 TAAGACATGTTCTAGTCAGGAACGTTTTTAAATCTTCCGGGGTACCCTAAGTGGGATTTC 1560 1324 TAA......................................................... 1326 -*-......................................................... 441 1561 AACCTACGACCAATTGGTTAACATCCGAGCTCCTTGATTATCTTGATACACTAGAAAGAG 1620 ............................................................ ............................................................ 1621 AATTACCAGATACGAATACAAATACAATTGGTGTATTTATCTCTAGCTCTAGCATCACAA 1680 ............................................................ ............................................................ 1681 GGTTCCCTTCTGCAGTTTGTTTTGCTTCCTCTTATTATCAGTAATTTTTTGGGTACCTAT 1740 ............................................................ ............................................................ 1741 ACTCTGCTACATTGTTTATTAGCCTCTCTGCCTTTGAGTCTTACTTTGAAAATCTTCATC 1800 ............................................................ ............................................................ 1801 CCTTTTGTTAGGAGTATTATGTAAACCACGTCTTCACATAAAATCTTAAGACATTGAATA 1860 ............................................................ ............................................................ 1861 TCTGAGCACATTTAGTTTATTCTTAGTCGACATTGGACTACCTACTCACTTGTATTTCAA 1920 ............................................................ ............................................................ 1921 ATCCTTACTCTTTTCTCTTCGCCAAAAGAGCAAGTTTGAGTAGCATTGTAATCTTTTCGG 1980 ............................................................ ............................................................ 1981 ATTTAAATTTGATACATTACTGTTGTATTTTTTTTTATAATTATTTATCATTATTCAATT 2040 ............................................................ ............................................................ 2041 ATGTATTATT 2050 .......... ..........
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Ensembl Plants release 61 - May 2025 © EMBL-EBI EMBL-EBI
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