Medicago truncatula (MtrunA17r5.0_ANR)
Description

putative RNA polymerase II transcription factor SIII, subunit A

About this transcript

This transcript has 1 exon and is annotated with 6 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene gene32819 Show transcript tableHide transcript table

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-rna32819714237aa
 
Protein coding
G7KH78 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGATGAGAAGGGATGAAATATCTGCAAGAAAGAAGCCATCGTTGTTTCAAAGGAATCCT     60
     1 ATGATGAGAAGGGATGAAATATCTGCAAGAAAGAAGCCATCGTTGTTTCAAAGGAATCCT     60
     1 -M--M--R--R--D--E--I--S--A--R--K--K--P--S--L--F--Q--R--N--P-     20

                                                                          
    61 GTTATGATGAAGAGAAAGGATCAAACATCTTTGGTTGATCTTTGTGTTGAGAAAGCTATT    120
    61 GTTATGATGAAGAGAAAGGATCAAACATCTTTGGTTGATCTTTGTGTTGAGAAAGCTATT    120
    21 -V--M--M--K--R--K--D--Q--T--S--L--V--D--L--C--V--E--K--A--I-     40

                                                                          
   121 GATAATGTAAAATACCTTGGAGATGTTAGTCATGTTGATCATCATATGCTTGAGAGAATC    180
   121 GATAATGTAAAATACCTTGGAGATGTTAGTCATGTTGATCATCATATGCTTGAGAGAATC    180
    41 -D--N--V--K--Y--L--G--D--V--S--H--V--D--H--H--M--L--E--R--I-     60

                                                                          
   181 TTGCCTCACTGCACACTTGATCAGTTGATGCATATTGAGAAGGCAAGTGAAGGGATGGAT    240
   181 TTGCCTCACTGCACACTTGATCAGTTGATGCATATTGAGAAGGCAAGTGAAGGGATGGAT    240
    61 -L--P--H--C--T--L--D--Q--L--M--H--I--E--K--A--S--E--G--M--D-     80

                                                                          
   241 TTGAGCCCTATAACTGATAAATTGTGGAAAAAATTCTTTGAAAAGCAGTTTGGTATAAAT    300
   241 TTGAGCCCTATAACTGATAAATTGTGGAAAAAATTCTTTGAAAAGCAGTTTGGTATAAAT    300
    81 -L--S--P--I--T--D--K--L--W--K--K--F--F--E--K--Q--F--G--I--N-    100

                                                                          
   301 TGCACTAATGAAGTAGTTAAGAAGATGAAAGAAAAAAGAGTTTCATTCACTTGGTTGCAG    360
   301 TGCACTAATGAAGTAGTTAAGAAGATGAAAGAAAAAAGAGTTTCATTCACTTGGTTGCAG    360
   101 -C--T--N--E--V--V--K--K--M--K--E--K--R--V--S--F--T--W--L--Q-    120

                                                                          
   361 CTGTATGAGGCTAAGGTAAAAAAAATGGCTCAGGCTGAGAATGAAGCAGTTGATCGACTC    420
   361 CTGTATGAGGCTAAGGTAAAAAAAATGGCTCAGGCTGAGAATGAAGCAGTTGATCGACTC    420
   121 -L--Y--E--A--K--V--K--K--M--A--Q--A--E--N--E--A--V--D--R--L-    140

                                                                          
   421 GCGCAACGCTACAAGGAAGAAGATGCAAGAAAACAAAGCAGGAAAATAAAAACATGCACC    480
   421 GCGCAACGCTACAAGGAAGAAGATGCAAGAAAACAAAGCAGGAAAATAAAAACATGCACC    480
   141 -A--Q--R--Y--K--E--E--D--A--R--K--Q--S--R--K--I--K--T--C--T-    160

                                                                          
   481 ATAGTTCCACCTAATAAAAGAAGATTTTCTGGAGACAACGGACCTGGATCAAATGTGAAG    540
   481 ATAGTTCCACCTAATAAAAGAAGATTTTCTGGAGACAACGGACCTGGATCAAATGTGAAG    540
   161 -I--V--P--P--N--K--R--R--F--S--G--D--N--G--P--G--S--N--V--K-    180

                                                                          
   541 AGCAGCAACATAATGAAGAAGTCAAAGAAAGATTTTCTTAATAGTTTTGAGGTAAAAAAT    600
   541 AGCAGCAACATAATGAAGAAGTCAAAGAAAGATTTTCTTAATAGTTTTGAGGTAAAAAAT    600
   181 -S--S--N--I--M--K--K--S--K--K--D--F--L--N--S--F--E--V--K--N-    200

                                                                          
   601 ATCACAGCAATGAAGAATAATTGTAACCAGAAGAAGAGTAGTAATTCATCAGGCATCATC    660
   601 ATCACAGCAATGAAGAATAATTGTAACCAGAAGAAGAGTAGTAATTCATCAGGCATCATC    660
   201 -I--T--A--M--K--N--N--C--N--Q--K--K--S--S--N--S--S--G--I--I-    220

                                                                          
   661 AAAACTGGAAGCATGGGTGGAATTGGTTCAACTTCCAAATATCTCACTTTTTAA          714
   661 AAAACTGGAAGCATGGGTGGAATTGGTTCAACTTCCAAATATCTCACTTTTTAA          714
   221 -K--T--G--S--M--G--G--I--G--S--T--S--K--Y--L--T--F--*-          237