Description
putative senescence/spartin-associated
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- rna29362 2187 460aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
G7JXI7 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 G TCATCTCTTAATTCGTCCTTACCCTTCCCTCCCTCTTCGAAAAGAAAAATCAATTTTAC 60
............................................................
............................................................
61 ACTACACCATTTCGATTTCCATTCACCGTAACGTAACTGATACTTCCA ATG GCT ACT CAA 120
................................................ATGGCTACTCAA 12
................................................-M--A--T--Q- 4
121 AAC CCT AAT CAA CGA AAT TCA CTC TAC CCT CAA GTA ATC TCT TCC ATC CCA ACC GCT CCT 180
13 AACCCTAATCAACGAAATTCACTCTACCCTCAAGTAATCTCTTCCATCCCAACCGCTCCT 72
5 -N--P--N--Q--R--N--S--L--Y--P--Q--V--I--S--S--I--P--T--A--P- 24
181 CCT TCT TCC CAA TCA AAT CTC TAC CCT TCA ATC GAT CAC GAT TTC GAC GAC CTC GTT GAA 240
73 CCTTCTTCCCAATCAAATCTCTACCCTTCAATCGATCACGATTTCGACGACCTCGTTGAA 132
25 -P--S--S--Q--S--N--L--Y--P--S--I--D--H--D--F--D--D--L--V--E- 44
241 AAT CTC TTC CCT GAC ACC ACC ACC ACC GCC GGC GTC AAC ACC ACT TCG CCT TCT GCA CCG 300
133 AATCTCTTCCCTGACACCACCACCACCGCCGGCGTCAACACCACTTCGCCTTCTGCACCG 192
45 -N--L--F--P--D--T--T--T--T--A--G--V--N--T--T--S--P--S--A--P- 64
301 CCG GAA ACT ACC GAA CAG ATT CTT ATC AAA ATC CCC GGA GCC ATT CTC AAC CTC ATC GAT 360
193 CCGGAAACTACCGAACAGATTCTTATCAAAATCCCCGGAGCCATTCTCAACCTCATCGAT 252
65 -P--E--T--T--E--Q--I--L--I--K--I--P--G--A--I--L--N--L--I--D- 84
361 CAA CAA TAC AGC GTT GAA CTT GCT TCC GGT GAC TTC ACC GTC GTC CGT CTC CGC CAA GGT 420
253 CAACAATACAGCGTTGAACTTGCTTCCGGTGACTTCACCGTCGTCCGTCTCCGCCAAGGT 312
85 -Q--Q--Y--S--V--E--L--A--S--G--D--F--T--V--V--R--L--R--Q--G- 104
421 GAA AAT TCC ATC GCC GTC TAT GCT CGG ATC GCC GAT GAA ATC CAA TGG CCT CTT GCT AAA 480
313 GAAAATTCCATCGCCGTCTATGCTCGGATCGCCGATGAAATCCAATGGCCTCTTGCTAAA 372
105 -E--N--S--I--A--V--Y--A--R--I--A--D--E--I--Q--W--P--L--A--K- 124
481 GAC GAA ACC GCT GTT AAA GTC GAT GAT TCT CAC TAC TTC TTC TCC TTC TCC GCT CCC AAG 540
373 GACGAAACCGCTGTTAAAGTCGATGATTCTCACTACTTCTTCTCCTTCTCCGCTCCCAAG 432
125 -D--E--T--A--V--K--V--D--D--S--H--Y--F--F--S--F--S--A--P--K- 144
541 G GT TAT GAT TCC GAC GAA GAT GAA GCG GAT CGG AGT AAA AAC AGC AAA ACC GAA TCA GAT 600
433 GGTTATGATTCCGACGAAGATGAAGCGGATCGGAGTAAAAACAGCAAAACCGAATCAGAT 492
145 -G--Y--D--S--D--E--D--E--A--D--R--S--K--N--S--K--T--E--S--D- 164
601 TTG TTG AGT TAT GGA TTG ACT ATT GCG TCG AAA GGA CAA GAA CAT TTA TTG AAG GAG TTG 660
493 TTGTTGAGTTATGGATTGACTATTGCGTCGAAAGGACAAGAACATTTATTGAAGGAGTTG 552
165 -L--L--S--Y--G--L--T--I--A--S--K--G--Q--E--H--L--L--K--E--L- 184
661 GAT GTG ATT TTG GAG AAC TGT AGT AAT TTT TCT GTG CAG AAG GTT TCG GAG AAG GCG AAG 720
553 GATGTGATTTTGGAGAACTGTAGTAATTTTTCTGTGCAGAAGGTTTCGGAGAAGGCGAAG 612
185 -D--V--I--L--E--N--C--S--N--F--S--V--Q--K--V--S--E--K--A--K- 204
721 AAG GGA GAG GTT TTG GAT GGA AAT TTG GCG AAG GAG GTA TCG CCG AAG GAT TTG GAG TCA 780
613 AAGGGAGAGGTTTTGGATGGAAATTTGGCGAAGGAGGTATCGCCGAAGGATTTGGAGTCA 672
205 -K--G--E--V--L--D--G--N--L--A--K--E--V--S--P--K--D--L--E--S- 224
781 TCG AAG AAG AAG AAG GAG ATG ATG GAG GGG CAA TGT GCG GCG TAT TGG ACT ACA TTG GCA 840
673 TCGAAGAAGAAGAAGGAGATGATGGAGGGGCAATGTGCGGCGTATTGGACTACATTGGCA 732
225 -S--K--K--K--K--E--M--M--E--G--Q--C--A--A--Y--W--T--T--L--A- 244
841 CCG AAT GTG GAG GAG TAT AGT GGG ACT GCT GCG AGG ATG ATA GCT TCG GGG TCT GGA CAT 900
733 CCGAATGTGGAGGAGTATAGTGGGACTGCTGCGAGGATGATAGCTTCGGGGTCTGGACAT 792
245 -P--N--V--E--E--Y--S--G--T--A--A--R--M--I--A--S--G--S--G--H- 264
901 GTG ATC AAG GGG ATT TTG TGG TGT GGT GAT GTT ACT ATG GAT AGG TTG CAA TGG GGG AAT 960
793 GTGATCAAGGGGATTTTGTGGTGTGGTGATGTTACTATGGATAGGTTGCAATGGGGGAAT 852
265 -V--I--K--G--I--L--W--C--G--D--V--T--M--D--R--L--Q--W--G--N- 284
961 CAG GTT ATG AAG AAA AGG ATG GCA GCT GGT GAA CGT GAT GCT CAG ATT AGT CCT GAA ACT 1020
853 CAGGTTATGAAGAAAAGGATGGCAGCTGGTGAACGTGATGCTCAGATTAGTCCTGAAACT 912
285 -Q--V--M--K--K--R--M--A--A--G--E--R--D--A--Q--I--S--P--E--T- 304
1021 TTG AAG CGG ATC AGA AG G GTC AAG AGA GTG ACT AAA ATG ACA CAG AAA GTT GCA AAT GGA 1080
913 TTGAAGCGGATCAGAAGGGTCAAGAGAGTGACTAAAATGACACAGAAAGTTGCAAATGGA 972
305 -L--K--R--I--R--R--V--K--R--V--T--K--M--T--Q--K--V--A--N--G- 324
1081 TTG CTC TCT GGG GTT GTG AAA GTG TCC GGA TTT TTT ACC AGT TCA GTG GTA AAC TCG AAG 1140
973 TTGCTCTCTGGGGTTGTGAAAGTGTCCGGATTTTTTACCAGTTCAGTGGTAAACTCGAAG 1032
325 -L--L--S--G--V--V--K--V--S--G--F--F--T--S--S--V--V--N--S--K- 344
1141 GCT GGA AAG AAA TTT TTC AGC CTT TTA CCG GGG GAA ATT GTG CTT GCA TCG TTG GAT GGA 1200
1033 GCTGGAAAGAAATTTTTCAGCCTTTTACCGGGGGAAATTGTGCTTGCATCGTTGGATGGA 1092
345 -A--G--K--K--F--F--S--L--L--P--G--E--I--V--L--A--S--L--D--G- 364
1201 TTC A G T AAA GTG TTT GAT GCA GTT GAA ATA GCT GGA AAA AAT GTC ATG TCA ACG TCA TCC 1260
1093 TTCAGTAAAGTGTTTGATGCAGTTGAAATAGCTGGAAAAAATGTCATGTCAACGTCATCC 1152
365 -F--S--K--V--F--D--A--V--E--I--A--G--K--N--V--M--S--T--S--S- 384
1261 ACC GTG ACA ACT GAA CTT GTC GAC CAC AG A TAC GGA GAA GAA GCT GCT CAC GCA ACA AAT 1320
1153 ACCGTGACAACTGAACTTGTCGACCACAGATACGGAGAAGAAGCTGCTCACGCAACAAAT 1212
385 -T--V--T--T--E--L--V--D--H--R--Y--G--E--E--A--A--H--A--T--N- 404
1321 GAA GGG CTT AAT GCT GCT GGT CAT GCT TTG GGC ACT GCA TGG GCT GCA TTT AAG ATT AGG 1380
1213 GAAGGGCTTAATGCTGCTGGTCATGCTTTGGGCACTGCATGGGCTGCATTTAAGATTAGG 1272
405 -E--G--L--N--A--A--G--H--A--L--G--T--A--W--A--A--F--K--I--R- 424
1381 AAG GCT ATT AAC CCT AAG AGT GTT TTT AAA CCT ACC ACC CTG GCC AAG TCT GCT GCT AAA 1440
1273 AAGGCTATTAACCCTAAGAGTGTTTTTAAACCTACCACCCTGGCCAAGTCTGCTGCTAAA 1332
425 -K--A--I--N--P--K--S--V--F--K--P--T--T--L--A--K--S--A--A--K- 444
1441 GCT GCA GCT TCT GAT TTG AAG TCT AGC AAG TCC AAG TCC AAG TCC AAG TAA TTTATGGCA 1500
1333 GCTGCAGCTTCTGATTTGAAGTCTAGCAAGTCCAAGTCCAAGTCCAAGTAA......... 1383
445 -A--A--A--S--D--L--K--S--S--K--S--K--S--K--S--K--*-......... 460
1501 GTTCTTGTAATTTAGTTTAGGTTTGGCCATCCTGCCATCAGAAGCTGTTGCTTTCAGCTT 1560
............................................................
............................................................
1561 TAAATTACCACTTTTTTCTTAGGAAAGAAGAGGAGGAGCATAGTAACATGATCTGTTGTT 1620
............................................................
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1621 TTTATGGTTTACTTTTCTGTGCATGTGTAATATTTGGACTTTCTTCTAATTTTTATAACA 1680
............................................................
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1681 GGATATAATCTTATATAATCTTTAAAAGAAGATCATATTTATCATGTAAAGATCAGCAAT 1740
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1741 GTCTGGTTGTAACTTGTACGTTGCACTCACTAAGTATGTATATCTTATATAATCATGCTC 1800
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1801 TGCATGCCCGTATGCCTTATCTGTTTGTGGCACCTTTATTTATTGCTTAGGTAGCAAGAA 1860
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1861 AATCACTATCACTACTAGTAATGTTTAGTGATGAATAATGGGAATTGATAAATTTCACTT 1920
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1921 GTGGTTTTGGTCTCTAATCCTCCACGATGTGGTTGTTCCTAAAGTGCGTTTATAATCACA 1980
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1981 TATCACTTTCTTACACTGTGGAACGAGGAAGTTTTAATTGCGCCAGTTTTAAGTTAGATA 2040
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2041 CATCCAAAATGATGTTATTTTCACCTTGCATCAATTCGATTCTTTTAACATTTTCTGGTC 2100
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2101 TGAAAGTAATAGGGAAATGTTTGATGGACACACAAATACTCCAATAACACCATGAGAAAA 2160
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2161 AATAAATAAAATATATGATATGTTAGT 2187
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