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Medicago truncatula (MtrunA17r5.0_ANR)
Description

putative senescence/spartin-associated

About this transcript

This transcript has 5 exons and is annotated with 9 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene gene29362 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-rna293622187460aa
 
Protein coding
G7JXI7 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
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Markup
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     1 GTCATCTCTTAATTCGTCCTTACCCTTCCCTCCCTCTTCGAAAAGAAAAATCAATTTTAC     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 ACTACACCATTTCGATTTCCATTCACCGTAACGTAACTGATACTTCCAATGGCTACTCAA    120
       ................................................ATGGCTACTCAA     12
       ................................................-M--A--T--Q-      4

                                                                          
   121 AACCCTAATCAACGAAATTCACTCTACCCTCAAGTAATCTCTTCCATCCCAACCGCTCCT    180
    13 AACCCTAATCAACGAAATTCACTCTACCCTCAAGTAATCTCTTCCATCCCAACCGCTCCT     72
     5 -N--P--N--Q--R--N--S--L--Y--P--Q--V--I--S--S--I--P--T--A--P-     24

                                                                          
   181 CCTTCTTCCCAATCAAATCTCTACCCTTCAATCGATCACGATTTCGACGACCTCGTTGAA    240
    73 CCTTCTTCCCAATCAAATCTCTACCCTTCAATCGATCACGATTTCGACGACCTCGTTGAA    132
    25 -P--S--S--Q--S--N--L--Y--P--S--I--D--H--D--F--D--D--L--V--E-     44

                                                                          
   241 AATCTCTTCCCTGACACCACCACCACCGCCGGCGTCAACACCACTTCGCCTTCTGCACCG    300
   133 AATCTCTTCCCTGACACCACCACCACCGCCGGCGTCAACACCACTTCGCCTTCTGCACCG    192
    45 -N--L--F--P--D--T--T--T--T--A--G--V--N--T--T--S--P--S--A--P-     64

                                                                          
   301 CCGGAAACTACCGAACAGATTCTTATCAAAATCCCCGGAGCCATTCTCAACCTCATCGAT    360
   193 CCGGAAACTACCGAACAGATTCTTATCAAAATCCCCGGAGCCATTCTCAACCTCATCGAT    252
    65 -P--E--T--T--E--Q--I--L--I--K--I--P--G--A--I--L--N--L--I--D-     84

                                                                          
   361 CAACAATACAGCGTTGAACTTGCTTCCGGTGACTTCACCGTCGTCCGTCTCCGCCAAGGT    420
   253 CAACAATACAGCGTTGAACTTGCTTCCGGTGACTTCACCGTCGTCCGTCTCCGCCAAGGT    312
    85 -Q--Q--Y--S--V--E--L--A--S--G--D--F--T--V--V--R--L--R--Q--G-    104

                                                                          
   421 GAAAATTCCATCGCCGTCTATGCTCGGATCGCCGATGAAATCCAATGGCCTCTTGCTAAA    480
   313 GAAAATTCCATCGCCGTCTATGCTCGGATCGCCGATGAAATCCAATGGCCTCTTGCTAAA    372
   105 -E--N--S--I--A--V--Y--A--R--I--A--D--E--I--Q--W--P--L--A--K-    124

                                                                          
   481 GACGAAACCGCTGTTAAAGTCGATGATTCTCACTACTTCTTCTCCTTCTCCGCTCCCAAG    540
   373 GACGAAACCGCTGTTAAAGTCGATGATTCTCACTACTTCTTCTCCTTCTCCGCTCCCAAG    432
   125 -D--E--T--A--V--K--V--D--D--S--H--Y--F--F--S--F--S--A--P--K-    144

                                                                          
   541 GGTTATGATTCCGACGAAGATGAAGCGGATCGGAGTAAAAACAGCAAAACCGAATCAGAT    600
   433 GGTTATGATTCCGACGAAGATGAAGCGGATCGGAGTAAAAACAGCAAAACCGAATCAGAT    492
   145 -G--Y--D--S--D--E--D--E--A--D--R--S--K--N--S--K--T--E--S--D-    164

                                                                          
   601 TTGTTGAGTTATGGATTGACTATTGCGTCGAAAGGACAAGAACATTTATTGAAGGAGTTG    660
   493 TTGTTGAGTTATGGATTGACTATTGCGTCGAAAGGACAAGAACATTTATTGAAGGAGTTG    552
   165 -L--L--S--Y--G--L--T--I--A--S--K--G--Q--E--H--L--L--K--E--L-    184

                                                                          
   661 GATGTGATTTTGGAGAACTGTAGTAATTTTTCTGTGCAGAAGGTTTCGGAGAAGGCGAAG    720
   553 GATGTGATTTTGGAGAACTGTAGTAATTTTTCTGTGCAGAAGGTTTCGGAGAAGGCGAAG    612
   185 -D--V--I--L--E--N--C--S--N--F--S--V--Q--K--V--S--E--K--A--K-    204

                                                                          
   721 AAGGGAGAGGTTTTGGATGGAAATTTGGCGAAGGAGGTATCGCCGAAGGATTTGGAGTCA    780
   613 AAGGGAGAGGTTTTGGATGGAAATTTGGCGAAGGAGGTATCGCCGAAGGATTTGGAGTCA    672
   205 -K--G--E--V--L--D--G--N--L--A--K--E--V--S--P--K--D--L--E--S-    224

                                                                          
   781 TCGAAGAAGAAGAAGGAGATGATGGAGGGGCAATGTGCGGCGTATTGGACTACATTGGCA    840
   673 TCGAAGAAGAAGAAGGAGATGATGGAGGGGCAATGTGCGGCGTATTGGACTACATTGGCA    732
   225 -S--K--K--K--K--E--M--M--E--G--Q--C--A--A--Y--W--T--T--L--A-    244

                                                                          
   841 CCGAATGTGGAGGAGTATAGTGGGACTGCTGCGAGGATGATAGCTTCGGGGTCTGGACAT    900
   733 CCGAATGTGGAGGAGTATAGTGGGACTGCTGCGAGGATGATAGCTTCGGGGTCTGGACAT    792
   245 -P--N--V--E--E--Y--S--G--T--A--A--R--M--I--A--S--G--S--G--H-    264

                                                                          
   901 GTGATCAAGGGGATTTTGTGGTGTGGTGATGTTACTATGGATAGGTTGCAATGGGGGAAT    960
   793 GTGATCAAGGGGATTTTGTGGTGTGGTGATGTTACTATGGATAGGTTGCAATGGGGGAAT    852
   265 -V--I--K--G--I--L--W--C--G--D--V--T--M--D--R--L--Q--W--G--N-    284

                                                                          
   961 CAGGTTATGAAGAAAAGGATGGCAGCTGGTGAACGTGATGCTCAGATTAGTCCTGAAACT   1020
   853 CAGGTTATGAAGAAAAGGATGGCAGCTGGTGAACGTGATGCTCAGATTAGTCCTGAAACT    912
   285 -Q--V--M--K--K--R--M--A--A--G--E--R--D--A--Q--I--S--P--E--T-    304

                                                                          
  1021 TTGAAGCGGATCAGAAGGGTCAAGAGAGTGACTAAAATGACACAGAAAGTTGCAAATGGA   1080
   913 TTGAAGCGGATCAGAAGGGTCAAGAGAGTGACTAAAATGACACAGAAAGTTGCAAATGGA    972
   305 -L--K--R--I--R--R--V--K--R--V--T--K--M--T--Q--K--V--A--N--G-    324

                                                                          
  1081 TTGCTCTCTGGGGTTGTGAAAGTGTCCGGATTTTTTACCAGTTCAGTGGTAAACTCGAAG   1140
   973 TTGCTCTCTGGGGTTGTGAAAGTGTCCGGATTTTTTACCAGTTCAGTGGTAAACTCGAAG   1032
   325 -L--L--S--G--V--V--K--V--S--G--F--F--T--S--S--V--V--N--S--K-    344

                                                                          
  1141 GCTGGAAAGAAATTTTTCAGCCTTTTACCGGGGGAAATTGTGCTTGCATCGTTGGATGGA   1200
  1033 GCTGGAAAGAAATTTTTCAGCCTTTTACCGGGGGAAATTGTGCTTGCATCGTTGGATGGA   1092
   345 -A--G--K--K--F--F--S--L--L--P--G--E--I--V--L--A--S--L--D--G-    364

                                                                          
  1201 TTCAGTAAAGTGTTTGATGCAGTTGAAATAGCTGGAAAAAATGTCATGTCAACGTCATCC   1260
  1093 TTCAGTAAAGTGTTTGATGCAGTTGAAATAGCTGGAAAAAATGTCATGTCAACGTCATCC   1152
   365 -F--S--K--V--F--D--A--V--E--I--A--G--K--N--V--M--S--T--S--S-    384

                                                                          
  1261 ACCGTGACAACTGAACTTGTCGACCACAGATACGGAGAAGAAGCTGCTCACGCAACAAAT   1320
  1153 ACCGTGACAACTGAACTTGTCGACCACAGATACGGAGAAGAAGCTGCTCACGCAACAAAT   1212
   385 -T--V--T--T--E--L--V--D--H--R--Y--G--E--E--A--A--H--A--T--N-    404

                                                                          
  1321 GAAGGGCTTAATGCTGCTGGTCATGCTTTGGGCACTGCATGGGCTGCATTTAAGATTAGG   1380
  1213 GAAGGGCTTAATGCTGCTGGTCATGCTTTGGGCACTGCATGGGCTGCATTTAAGATTAGG   1272
   405 -E--G--L--N--A--A--G--H--A--L--G--T--A--W--A--A--F--K--I--R-    424

                                                                          
  1381 AAGGCTATTAACCCTAAGAGTGTTTTTAAACCTACCACCCTGGCCAAGTCTGCTGCTAAA   1440
  1273 AAGGCTATTAACCCTAAGAGTGTTTTTAAACCTACCACCCTGGCCAAGTCTGCTGCTAAA   1332
   425 -K--A--I--N--P--K--S--V--F--K--P--T--T--L--A--K--S--A--A--K-    444

                                                                          
  1441 GCTGCAGCTTCTGATTTGAAGTCTAGCAAGTCCAAGTCCAAGTCCAAGTAATTTATGGCA   1500
  1333 GCTGCAGCTTCTGATTTGAAGTCTAGCAAGTCCAAGTCCAAGTCCAAGTAA.........   1383
   445 -A--A--A--S--D--L--K--S--S--K--S--K--S--K--S--K--*-.........    460

                                                                          
  1501 GTTCTTGTAATTTAGTTTAGGTTTGGCCATCCTGCCATCAGAAGCTGTTGCTTTCAGCTT   1560
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1561 TAAATTACCACTTTTTTCTTAGGAAAGAAGAGGAGGAGCATAGTAACATGATCTGTTGTT   1620
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1621 TTTATGGTTTACTTTTCTGTGCATGTGTAATATTTGGACTTTCTTCTAATTTTTATAACA   1680
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1681 GGATATAATCTTATATAATCTTTAAAAGAAGATCATATTTATCATGTAAAGATCAGCAAT   1740
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1741 GTCTGGTTGTAACTTGTACGTTGCACTCACTAAGTATGTATATCTTATATAATCATGCTC   1800
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1801 TGCATGCCCGTATGCCTTATCTGTTTGTGGCACCTTTATTTATTGCTTAGGTAGCAAGAA   1860
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1861 AATCACTATCACTACTAGTAATGTTTAGTGATGAATAATGGGAATTGATAAATTTCACTT   1920
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1921 GTGGTTTTGGTCTCTAATCCTCCACGATGTGGTTGTTCCTAAAGTGCGTTTATAATCACA   1980
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1981 TATCACTTTCTTACACTGTGGAACGAGGAAGTTTTAATTGCGCCAGTTTTAAGTTAGATA   2040
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2041 CATCCAAAATGATGTTATTTTCACCTTGCATCAATTCGATTCTTTTAACATTTTCTGGTC   2100
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2101 TGAAAGTAATAGGGAAATGTTTGATGGACACACAAATACTCCAATAACACCATGAGAAAA   2160
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2161 AATAAATAAAATATATGATATGTTAGT                                    2187
       ...........................                                        
       ...........................