Manihot esculenta (M.esculenta_v8)
About this transcript

This transcript has 6 exons and is annotated with 11 domains and features.

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-Manes.06G000800.1.v8.12244499aa
 
Protein coding
A0A2C9VLJ3 Ensembl Canonical
Variants
  • loading
Markup
  • loaded
                                                                          
     1 CAGCATCCACCTATGTGCTCTGTACAGCACACTGCCACTACTCTCTGCCACCGCGCTATC     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 ATTGCCGGTTGCTTCTTCTTTATATATATTGCCTTCTTGGCTGTACTTGTGCACAATTCA    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 TCTCTCCCTCTCTTAAGAATAACTTAACAAGGATGGTCATCACTACCACCATTGCTGCAG    180
       ................................ATGGTCATCACTACCACCATTGCTGCAG     28
       ................................-M--V--I--T--T--T--I--A--A--      9

                                                                          
   181 ACTCCGATGAGTTTCTGTACTGCACTTTTGCTTCCAGATATGTTCGCAGTCCTGTTCCAA    240
    29 ACTCCGATGAGTTTCTGTACTGCACTTTTGCTTCCAGATATGTTCGCAGTCCTGTTCCAA     88
    10 D--S--D--E--F--L--Y--C--T--F--A--S--R--Y--V--R--S--P--V--P--     29

                                                                          
   241 GGTTTAAGATGCCAGAGAAGTCGATGCCAAAGGAAGCGGCGTATCAGGTGATTAATGATG    300
    89 GGTTTAAGATGCCAGAGAAGTCGATGCCAAAGGAAGCGGCGTATCAGGTGATTAATGATG    148
    30 R--F--K--M--P--E--K--S--M--P--K--E--A--A--Y--Q--V--I--N--D--     49

                                                                          
   301 AACTGATGTTGGATGGGAATCCAAGGCTTAACTTGGCTTCTTTTGTCACCACTTGGATGG    360
   149 AACTGATGTTGGATGGGAATCCAAGGCTTAACTTGGCTTCTTTTGTCACCACTTGGATGG    208
    50 E--L--M--L--D--G--N--P--R--L--N--L--A--S--F--V--T--T--W--M--     69

                                                                          
   361 AGCCTGAGTGTAATGATCTCATCTTGGCTTCTATTAACAAGAACTATGTTGATATGGATG    420
   209 AGCCTGAGTGTAATGATCTCATCTTGGCTTCTATTAACAAGAACTATGTTGATATGGATG    268
    70 E--P--E--C--N--D--L--I--L--A--S--I--N--K--N--Y--V--D--M--D--     89

                                                                          
   421 AGTACCCTGTTACAACTGAGCTCCAGAATCGGTGTGTGAATATGATAGCCCACCTGTTCC    480
   269 AGTACCCTGTTACAACTGAGCTCCAGAATCGGTGTGTGAATATGATAGCCCACCTGTTCC    328
    90 E--Y--P--V--T--T--E--L--Q--N--R--C--V--N--M--I--A--H--L--F--    109

                                                                          
   481 ATGCTCCTGTTGGAGATGATGAAACTGCAGTTGGGGTGGGGACTGTGGGATCATCAGAGG    540
   329 ATGCTCCTGTTGGAGATGATGAAACTGCAGTTGGGGTGGGGACTGTGGGATCATCAGAGG    388
   110 H--A--P--V--G--D--D--E--T--A--V--G--V--G--T--V--G--S--S--E--    129

                                                                          
   541 CAATTATGCTGGCTGGATTAGCTTTTAAAAGGAAATGGCAGAACAAGAGAAAAGCAGAGG    600
   389 CAATTATGCTGGCTGGATTAGCTTTTAAAAGGAAATGGCAGAACAAGAGAAAAGCAGAGG    448
   130 A--I--M--L--A--G--L--A--F--K--R--K--W--Q--N--K--R--K--A--E--    149

                                                                          
   601 GCAAACCATATGATAAGCCCAACATTGTGACGGGAGCTAATGTGCAAGTCTGTTGGGAGA    660
   449 GCAAACCATATGATAAGCCCAACATTGTGACGGGAGCTAATGTGCAAGTCTGTTGGGAGA    508
   150 G--K--P--Y--D--K--P--N--I--V--T--G--A--N--V--Q--V--C--W--E--    169

                                                                          
   661 AATTCGCAAGGTACTTCGAAGTTGAACTAAAGGAAGTGAAGCTGAAAGAGGGCTATTATG    720
   509 AATTCGCAAGGTACTTCGAAGTTGAACTAAAGGAAGTGAAGCTGAAAGAGGGCTATTATG    568
   170 K--F--A--R--Y--F--E--V--E--L--K--E--V--K--L--K--E--G--Y--Y--    189

                                                                          
   721 TGATGGACCCTGTGAAAGCAGTTGAAATGGTGGATGAGAACACAATCTGTGTTGCAGCCA    780
   569 TGATGGACCCTGTGAAAGCAGTTGAAATGGTGGATGAGAACACAATCTGTGTTGCAGCCA    628
   190 V--M--D--P--V--K--A--V--E--M--V--D--E--N--T--I--C--V--A--A--    209

                                                                          
   781 TTTTAGGATCAACATTGACGGGAGAGTTTGAAGATGTGAAGCTTCTTAATGAACTACTCA    840
   629 TTTTAGGATCAACATTGACGGGAGAGTTTGAAGATGTGAAGCTTCTTAATGAACTACTCA    688
   210 I--L--G--S--T--L--T--G--E--F--E--D--V--K--L--L--N--E--L--L--    229

                                                                          
   841 CTAAAAAGAATGAGGAAACTGGATGGGACATCCCAATTCACGTCGATGCTGCCAGTGGAG    900
   689 CTAAAAAGAATGAGGAAACTGGATGGGACATCCCAATTCACGTCGATGCTGCCAGTGGAG    748
   230 T--K--K--N--E--E--T--G--W--D--I--P--I--H--V--D--A--A--S--G--    249

                                                                          
   901 GTTTTGTTGCTCCTTTTGTTTGCCCAGATCTTCCGTGGGATTTCCGTTTGCCATTGGTGA    960
   749 GTTTTGTTGCTCCTTTTGTTTGCCCAGATCTTCCGTGGGATTTCCGTTTGCCATTGGTGA    808
   250 G--F--V--A--P--F--V--C--P--D--L--P--W--D--F--R--L--P--L--V--    269

                                                                          
   961 AGAGTATTAATGTAAGTGGTCATAAGTATGGCCTTGTTTATCCTGGTGTTGGTTGGGTTG   1020
   809 AGAGTATTAATGTAAGTGGTCATAAGTATGGCCTTGTTTATCCTGGTGTTGGTTGGGTTG    868
   270 K--S--I--N--V--S--G--H--K--Y--G--L--V--Y--P--G--V--G--W--V--    289

                                                                          
  1021 TGTGGAGGGCTAAAGAAGACTTGCCGGAGGAGCTTATTTTTCACATTAACTACCTTGGAT   1080
   869 TGTGGAGGGCTAAAGAAGACTTGCCGGAGGAGCTTATTTTTCACATTAACTACCTTGGAT    928
   290 V--W--R--A--K--E--D--L--P--E--E--L--I--F--H--I--N--Y--L--G--    309

                                                                          
  1081 CTGATCAACCCACTTTCACTCTCAACTTCTCAAAAGGCTCTAGTCAAATAATTGCTCAAT   1140
   929 CTGATCAACCCACTTTCACTCTCAACTTCTCAAAAGGCTCTAGTCAAATAATTGCTCAAT    988
   310 S--D--Q--P--T--F--T--L--N--F--S--K--G--S--S--Q--I--I--A--Q--    329

                                                                          
  1141 ATTATCAGTTTATAAGGCTTGGTTTTGAGGGTTATAAGAAAGTTATTGAAAACTGTATGG   1200
   989 ATTATCAGTTTATAAGGCTTGGTTTTGAGGGTTATAAGAAAGTTATTGAAAACTGTATGG   1048
   330 Y--Y--Q--F--I--R--L--G--F--E--G--Y--K--K--V--I--E--N--C--M--    349

                                                                          
  1201 AAAATACAAGGGTGCTGAAAGGAGGACTTGAGAAAACAGGGAGGTTTGACATTGTCTCCA   1260
  1049 AAAATACAAGGGTGCTGAAAGGAGGACTTGAGAAAACAGGGAGGTTTGACATTGTCTCCA   1108
   350 E--N--T--R--V--L--K--G--G--L--E--K--T--G--R--F--D--I--V--S--    369

                                                                          
  1261 AAGATGTTGGAGTGCCTCTTGTGGCCTTCTCTCTCAAAGACAGCAGTAAATACAGTGTGT   1320
  1109 AAGATGTTGGAGTGCCTCTTGTGGCCTTCTCTCTCAAAGACAGCAGTAAATACAGTGTGT   1168
   370 K--D--V--G--V--P--L--V--A--F--S--L--K--D--S--S--K--Y--S--V--    389

                                                                          
  1321 TTGATATGTCTGAGAACTTGAGAAGATTTGGCTGGATAATTCCGGCGTACACAATTCCAG   1380
  1169 TTGATATGTCTGAGAACTTGAGAAGATTTGGCTGGATAATTCCGGCGTACACAATTCCAG   1228
   390 F--D--M--S--E--N--L--R--R--F--G--W--I--I--P--A--Y--T--I--P--    409

                                                                          
  1381 CAGATGCCGAGCAAATTGCTGTTCTTCGAGTGGTGGTCAGGGAAGATTTCAGCCGGAGTC   1440
  1229 CAGATGCCGAGCAAATTGCTGTTCTTCGAGTGGTGGTCAGGGAAGATTTCAGCCGGAGTC   1288
   410 A--D--A--E--Q--I--A--V--L--R--V--V--V--R--E--D--F--S--R--S--    429

                                                                          
  1441 TGGCTGAAAGACTCATCTGGCACATTGAGCAAGTTTTGGAGGAAATGGACTCACTTCCTA   1500
  1289 TGGCTGAAAGACTCATCTGGCACATTGAGCAAGTTTTGGAGGAAATGGACTCACTTCCTA   1348
   430 L--A--E--R--L--I--W--H--I--E--Q--V--L--E--E--M--D--S--L--P--    449

                                                                          
  1501 TCCAGATGTCCACCAAAGCTGCCACTGTTAAGAAACAACTGGAGAGCACTGAAGGGCAGA   1560
  1349 TCCAGATGTCCACCAAAGCTGCCACTGTTAAGAAACAACTGGAGAGCACTGAAGGGCAGA   1408
   450 I--Q--M--S--T--K--A--A--T--V--K--K--Q--L--E--S--T--E--G--Q--    469

                                                                          
  1561 AGGTAGTTAAAAAGAGTGAGAAGGAGATGCAGGAAGAGATCACTCGGTATTGGAGGCGGC   1620
  1409 AGGTAGTTAAAAAGAGTGAGAAGGAGATGCAGGAAGAGATCACTCGGTATTGGAGGCGGC   1468
   470 K--V--V--K--K--S--E--K--E--M--Q--E--E--I--T--R--Y--W--R--R--    489

                                                                          
  1621 TTGTAGATGGCAAGAGAATTGGAGTGTGCTAGGCGTCTGCTATTGACTTACTGTTCTCTT   1680
  1469 TTGTAGATGGCAAGAGAATTGGAGTGTGCTAG............................   1500
   490 L--V--D--G--K--R--I--G--V--C--*-............................    499

                                                                          
  1681 TCTGTGAGCCTTCTTGTTGTTTGATAGTATCATAAATGTGAGAAAATAAAACATGTATTT   1740
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1741 TGGGAATTAGAAAAGAAGACGATGATTTAAAAGCAATAATGTCTAGTTTCTTGCATCTCT   1800
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1801 GGAACAGTAGGGTGTTCAATGGCTGCAAATGAATGATTTGAGAGTCGACTCGATTCAAAA   1860
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1861 CTAACAGCAAAACCAGCAACACTATTGTGACAAGAAAGAAGCTAATCAACGATAAAGAAA   1920
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1921 TTCATCGACTTTTAAATTGAAATAGTTGTGAACCATTTTCAGGAATAAAAACTTGTGTGT   1980
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1981 TCTAGTGAGTAGGAGTTGAAAAAGCCTTGTGTACCATTGAAGACGAATTCTGGGAAGCGT   2040
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2041 TAATTGCGCAGTATTCTCCTTCCAATGCATAAATAATTCAGAACAAACGGCAGCTGCAAT   2100
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2101 ATTGTGATGTTGTCCCGGTAACTAAAACATCACCTTCAACATGAACACAGAGCCCCAGTA   2160
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2161 GATATCAAACTAAAAGCTCAAGGTTGTACTTAAATTATGATTATGATGATCATACAAATT   2220
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2221 GACATGCTTCAAGCGTTTTGAGGA                                       2244
       ........................                                           
       ........................