Leersia perrieri (Lperr_V1.4) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 7: 8,965,717-8,970,706 forward strand.
This transcript has 9 exons and is annotated with 23 domains and features.
This transcript is a product of gene LPERR07G09460 Show transcript tableHide transcript table
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1 AGGCCCACTAGAAATTGACTGGCCTGAGGCCCGTTAGAAACTAACCCTAGCCCCCTCTCC 60 ............................................................ ............................................................ 61 TCTGCTTGGCTAGTTGGCTGCTTCGCCCTTGAGCCTTGCGCTCCCCACGCAGCCGCTCCA 120 ............................................................ ............................................................ 121 CCACCGTCCGCCGTCGACCCCGCCGACCCCTGTCTCCCATGGCACCCCAGCAGCAGCAGC 180 ......................................ATGGCACCCCAGCAGCAGCAGC 22 ......................................-M--A--P--Q--Q--Q--Q-- 7 181 TGGTGCTCGCTGCCTCCTCCGCCGACGCCGGCGTGGCAGCGTGGGACCTCCGCACGGGCG 240 23 TGGTGCTCGCTGCCTCCTCCGCCGACGCCGGCGTGGCAGCGTGGGACCTCCGCACGGGCG 82 8 L--V--L--A--A--S--S--A--D--A--G--V--A--A--W--D--L--R--T--G-- 27 241 CCGAGGCCATCCGCCACCGCTCCTGTGCCTCTCGCCCGCGTGCCCTCGCCGTCGTCGCCG 300 83 CCGAGGCCATCCGCCACCGCTCCTGTGCCTCTCGCCCGCGTGCCCTCGCCGTCGTCGCCG 142 28 A--E--A--I--R--H--R--S--C--A--S--R--P--R--A--L--A--V--V--A-- 47 301 ACCGCTTCCTCGCCGCCGCCCAGGCCCCCGCCGGAAACTCCGCCCCCATCCATTACTACC 360 143 ACCGCTTCCTCGCCGCCGCCCAGGCCCCCGCCGGAAACTCCGCCCCCATCCATTACTACC 202 48 D--R--F--L--A--A--A--Q--A--P--A--G--N--S--A--P--I--H--Y--Y-- 67 361 ACTGGGACAAGCCCCAGGTAGCCGTCAAGAGCTTCCCTGTCGAACCCATACGCGCCCTCA 420 203 ACTGGGACAAGCCCCAGGTAGCCGTCAAGAGCTTCCCTGTCGAACCCATACGCGCCCTCA 262 68 H--W--D--K--P--Q--V--A--V--K--S--F--P--V--E--P--I--R--A--L-- 87 421 TCGCTGATCCGGAGGGGAGCTACCTCATCGGCGGTGGGGTGTCCGGCGACATTTTCTTTT 480 263 TCGCTGATCCGGAGGGGAGCTACCTCATCGGCGGTGGGGTGTCCGGCGACATTTTCTTTT 322 88 I--A--D--P--E--G--S--Y--L--I--G--G--G--V--S--G--D--I--F--F-- 107 481 GGGAGGTGGCTAGTGGGGAGTTGCTTGTCCAGTGGCATGCACATTATCGTGCTGTTAGGT 540 323 GGGAGGTGGCTAGTGGGGAGTTGCTTGTCCAGTGGCATGCACATTATCGTGCTGTTAGGT 382 108 W--E--V--A--S--G--E--L--L--V--Q--W--H--A--H--Y--R--A--V--R-- 127 541 GCCTTGCGCTCTATGACTTTTTGCTTGTCTCGGGGTCTGAAGACGGTAGCATCAAAGTTT 600 383 GCCTTGCGCTCTATGACTTTTTGCTTGTCTCGGGGTCTGAAGACGGTAGCATCAAAGTTT 442 128 C--L--A--L--Y--D--F--L--L--V--S--G--S--E--D--G--S--I--K--V-- 147 601 GGGATCTCCTCACGATGCTTGACGAGCAATCAAGATTGGAGGCAAAGACACAATACATAT 660 443 GGGATCTCCTCACGATGCTTGACGAGCAATCAAGATTGGAGGCAAAGACACAATACATAT 502 148 W--D--L--L--T--M--L--D--E--Q--S--R--L--E--A--K--T--Q--Y--I-- 167 661 ATAGCTTTAATCAGCATGCACTGCCTGTAACCGATGTTGCTTGCTTTCATGGAGCAATTG 720 503 ATAGCTTTAATCAGCATGCACTGCCTGTAACCGATGTTGCTTGCTTTCATGGAGCAATTG 562 168 Y--S--F--N--Q--H--A--L--P--V--T--D--V--A--C--F--H--G--A--I-- 187 721 CTGTGTCATCTTCAGAGGATCGCACCTGTAAAATTTGGAGTCTATCTGAGGGTAGGATGC 780 563 CTGTGTCATCTTCAGAGGATCGCACCTGTAAAATTTGGAGTCTATCTGAGGGTAGGATGC 622 188 A--V--S--S--S--E--D--R--T--C--K--I--W--S--L--S--E--G--R--M-- 207 781 TAAGAAGCATTTCATTTCCTGCTATCGTTGATTCTGTCGCTTTAGACCCAAGGAGTCATA 840 623 TAAGAAGCATTTCATTTCCTGCTATCGTTGATTCTGTCGCTTTAGACCCAAGGAGTCATA 682 208 L--R--S--I--S--F--P--A--I--V--D--S--V--A--L--D--P--R--S--H-- 227 841 TTTTCTATGCTGGTGGCAGAGATGGAAAGATATACGTTACTGCTATGGGAGTTGATGTCA 900 683 TTTTCTATGCTGGTGGCAGAGATGGAAAGATATACGTTACTGCTATGGGAGTTGATGTCA 742 228 I--F--Y--A--G--G--R--D--G--K--I--Y--V--T--A--M--G--V--D--V-- 247 901 CTTCTCCTAGTAGTGATGATTCATCTATTATTGGAGCTTTGGATGACCACAGCAAGGCAG 960 743 CTTCTCCTAGTAGTGATGATTCATCTATTATTGGAGCTTTGGATGACCACAGCAAGGCAG 802 248 T--S--P--S--S--D--D--S--S--I--I--G--A--L--D--D--H--S--K--A-- 267 961 TAACCAGCTTAGCATCGAGCACTGATGGACTTATATTGATCTCTGGATCTGAGGATGGTC 1020 803 TAACCAGCTTAGCATCGAGCACTGATGGACTTATATTGATCTCTGGATCTGAGGATGGTC 862 268 V--T--S--L--A--S--S--T--D--G--L--I--L--I--S--G--S--E--D--G-- 287 1021 CAGTGACAAATGTTCTCTTAGTAACGCCAAAACGAGTAAATCTCCCGCCACTACAATCAC 1080 863 CAGTGACAAATGTTCTCTTAGTAACGCCAAAACGAGTAAATCTCCCGCCACTACAATCAC 922 288 P--V--T--N--V--L--L--V--T--P--K--R--V--N--L--P--P--L--Q--S-- 307 1081 TACGTAAAGTTTGCTCAGCAAATGGAGAATCTGAATCACGGGCTGTAATTGTGCCCCAAC 1140 923 TACGTAAAGTTTGCTCAGCAAATGGAGAATCTGAATCACGGGCTGTAATTGTGCCCCAAC 982 308 L--R--K--V--C--S--A--N--G--E--S--E--S--R--A--V--I--V--P--Q-- 327 1141 CAGAAAATGATGTCCACATTGCTGGAAACTTCAGTTCCAACTTTCTGGAGCGCTGCCTGG 1200 983 CAGAAAATGATGTCCACATTGCTGGAAACTTCAGTTCCAACTTTCTGGAGCGCTGCCTGG 1042 328 P--E--N--D--V--H--I--A--G--N--F--S--S--N--F--L--E--R--C--L-- 347 1201 ATGCACTTCAGCCTGGCAGTTCGTCTAGATTGTTTGAATCTGGGGCTGGTACTATGTATG 1260 1043 ATGCACTTCAGCCTGGCAGTTCGTCTAGATTGTTTGAATCTGGGGCTGGTACTATGTATG 1102 348 D--A--L--Q--P--G--S--S--S--R--L--F--E--S--G--A--G--T--M--Y-- 367 1261 GTTCTGCAAACCAACAGGGTGTAGAATGGAGGAGTAAATACTTGGAGTTACAGGACCTCT 1320 1103 GTTCTGCAAACCAACAGGGTGTAGAATGGAGGAGTAAATACTTGGAGTTACAGGACCTCT 1162 368 G--S--A--N--Q--Q--G--V--E--W--R--S--K--Y--L--E--L--Q--D--L-- 387 1321 TTGTGCGTGAGGTTCTTGATCAGATGCCATCTTCAAAGAATACATGATATGCAACTGGTT 1380 1163 TTGTGCGTGAGGTTCTTGATCAGATGCCATCTTCAAAGAATACATGA............. 1209 388 F--V--R--E--V--L--D--Q--M--P--S--S--K--N--T--*-............. 402 1381 ATTTTGGTGATCATTACTGCCAAATCAGGAGATTGTGATCGGCTTTAGTCAACACATGAG 1440 ............................................................ ............................................................ 1441 CTGGTTGCTACCTCTGTCCTAAATAGTGGTCATTTTGAGTTTTTATTTTGTAGTGTTTGA 1500 ............................................................ ............................................................ 1501 CCATTCATCTTATTTAAAAAATTATGAAATTTTTATCTATTTTTGTTGTGATTTGTTTTG 1560 ............................................................ ............................................................ 1561 TTATCAAAAGTAATTTAGGTGTGACTTGTCCTTTTTAATATTTGCAATAATTTTTTTGAA 1620 ............................................................ ............................................................ 1621 TAAGACGAATGGTCAACGCTATAAAAGAAAAGCCCAAAACGATAAGTATTTTGGGATGGA 1680 ............................................................ ............................................................ 1681 GGGAGTATAAATTCTCGGGAAACCCTATTGGAACTTAAAATGAGTTCATCAGAGTAGTGT 1740 ............................................................ ............................................................ 1741 AACATCAATTTTTGCTATGGCGGAGGGGTGAGAAGGGCCTTTGCCTCCCTCAGTCTAAAG 1800 ............................................................ ............................................................ 1801 GAACTATTGTAGTATTGTGGCTTGAGCAAATTCTAAACGAACTAGCACTACCGGCCCCAG 1860 ............................................................ ............................................................ 1861 CTCAAAAAATAATTGTTTAGTCTCTCTGGCTCCATTACTGAATTTTTGCATGTGCTATGG 1920 ............................................................ ............................................................ 1921 CTTGTGTTTAACTTGTGGCCGAAAAATATCTGGCATACAAAGTTATTTAACTTCAAACCG 1980 ............................................................ ............................................................ 1981 AAAACGAGCGAGTGGTAAGTGAAATATGGAGTAATATCTTGTGTTGGCAGGA 2032 .................................................... 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Ensembl Plants release 61 - May 2025 © EMBL-EBI EMBL-EBI
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