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Leersia perrieri (Lperr_V1.4)
Location
About this transcript

This transcript has 1 exon and is annotated with 13 domains and features.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-LPERR06G16270.11161386aa
 
Protein coding
A0A0D9WRM1 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGGAGCTTGACAATCTTAGAGAGGCTTTTGACCGAGTTATTGAAAAACGTGCTTCATCT     60
     1 ATGGAGCTTGACAATCTTAGAGAGGCTTTTGACCGAGTTATTGAAAAACGTGCTTCATCT     60
     1 -M--E--L--D--N--L--R--E--A--F--D--R--V--I--E--K--R--A--S--S-     20

                                                                          
    61 TCTGCTAAAGCTCAGGAAGTTATTGATCAGATAGTGAGAGAAGTCGAGCAGGCAATTACG    120
    61 TCTGCTAAAGCTCAGGAAGTTATTGATCAGATAGTGAGAGAAGTCGAGCAGGCAATTACG    120
    21 -S--A--K--A--Q--E--V--I--D--Q--I--V--R--E--V--E--Q--A--I--T-     40

                                                                          
   121 AAGATGCAGATGATTAATACAGATTCCATGGGCAGTGCTGACCATTCATCCGTCCTGGCA    180
   121 AAGATGCAGATGATTAATACAGATTCCATGGGCAGTGCTGACCATTCATCCGTCCTGGCA    180
    41 -K--M--Q--M--I--N--T--D--S--M--G--S--A--D--H--S--S--V--L--A-     60

                                                                          
   181 GAGTTGAAAGCCAAGCTGAATGAATTGGCGCCATTAAACCAACTAGAAGGTTGTCAAAAG    240
   181 GAGTTGAAAGCCAAGCTGAATGAATTGGCGCCATTAAACCAACTAGAAGGTTGTCAAAAG    240
    61 -E--L--K--A--K--L--N--E--L--A--P--L--N--Q--L--E--G--C--Q--K-     80

                                                                          
   241 GAATTGAATGTTGCACTGAGCAAATATCTCAAGGTGCTTGAGAAATCTTTCAATCCAGAC    300
   241 GAATTGAATGTTGCACTGAGCAAATATCTCAAGGTGCTTGAGAAATCTTTCAATCCAGAC    300
    81 -E--L--N--V--A--L--S--K--Y--L--K--V--L--E--K--S--F--N--P--D-    100

                                                                          
   301 ATATCAAAGGCATACCGAAATGTGGATTTTGAAGCTAATACAATAAACAGTATAATAGCA    360
   301 ATATCAAAGGCATACCGAAATGTGGATTTTGAAGCTAATACAATAAACAGTATAATAGCA    360
   101 -I--S--K--A--Y--R--N--V--D--F--E--A--N--T--I--N--S--I--I--A-    120

                                                                          
   361 AATCATTTCTACCGCCAAGGCCTTTTTGATCTTGGAGACTCATTTGTCCGTGAGTGTGGT    420
   361 AATCATTTCTACCGCCAAGGCCTTTTTGATCTTGGAGACTCATTTGTCCGTGAGTGTGGT    420
   121 -N--H--F--Y--R--Q--G--L--F--D--L--G--D--S--F--V--R--E--C--G-    140

                                                                          
   421 GAATCAGATGGGGCATACTTGAAACTACCCTTCCAAGAGATGTATTCAATACTTGAAGCA    480
   421 GAATCAGATGGGGCATACTTGAAACTACCCTTCCAAGAGATGTATTCAATACTTGAAGCA    480
   141 -E--S--D--G--A--Y--L--K--L--P--F--Q--E--M--Y--S--I--L--E--A-    160

                                                                          
   481 ATGCAAGCTAGAAACCTCCAGCCTGCCCTCAGTTGGGCTGCCAAGAACCATGATCAACTT    540
   481 ATGCAAGCTAGAAACCTCCAGCCTGCCCTCAGTTGGGCTGCCAAGAACCATGATCAACTT    540
   161 -M--Q--A--R--N--L--Q--P--A--L--S--W--A--A--K--N--H--D--Q--L-    180

                                                                          
   541 TTGCAGAATGGCTCAATGCTTGAGTTGAAGCTTCATCAACTTCAGTTTGTTGAGATACTC    600
   541 TTGCAGAATGGCTCAATGCTTGAGTTGAAGCTTCATCAACTTCAGTTTGTTGAGATACTC    600
   181 -L--Q--N--G--S--M--L--E--L--K--L--H--Q--L--Q--F--V--E--I--L-    200

                                                                          
   601 ACCAAAGGAAGTAGAGACGAGGCTTTGCAGTATGCAAGGACTCACCTGGTTCCCTTTGCA    660
   601 ACCAAAGGAAGTAGAGACGAGGCTTTGCAGTATGCAAGGACTCACCTGGTTCCCTTTGCA    660
   201 -T--K--G--S--R--D--E--A--L--Q--Y--A--R--T--H--L--V--P--F--A-    220

                                                                          
   661 TCCTTGCACAAGTCAGAGATCCAAAGGCTAATGGCCTGCCTTCTCTGGGCTGACCGGCTT    720
   661 TCCTTGCACAAGTCAGAGATCCAAAGGCTAATGGCCTGCCTTCTCTGGGCTGACCGGCTT    720
   221 -S--L--H--K--S--E--I--Q--R--L--M--A--C--L--L--W--A--D--R--L-    240

                                                                          
   721 GATCAGTCTCCATATGCTGAATTCATGTCATCGACTCATTGGGAGAAGCTAGCTGAGGAG    780
   721 GATCAGTCTCCATATGCTGAATTCATGTCATCGACTCATTGGGAGAAGCTAGCTGAGGAG    780
   241 -D--Q--S--P--Y--A--E--F--M--S--S--T--H--W--E--K--L--A--E--E-    260

                                                                          
   781 CTTATCCACCAATTCTGCAGTCTGTTGGGGCAATCTAGTGAGAGCCCGCTTGGTATAGCA    840
   781 CTTATCCACCAATTCTGCAGTCTGTTGGGGCAATCTAGTGAGAGCCCGCTTGGTATAGCA    840
   261 -L--I--H--Q--F--C--S--L--L--G--Q--S--S--E--S--P--L--G--I--A-    280

                                                                          
   841 ATATCAGCTGGTTTTCAAGGACTACCAACCTTACTGAAGCTAACGACAGTAATGGCTGCC    900
   841 ATATCAGCTGGTTTTCAAGGACTACCAACCTTACTGAAGCTAACGACAGTAATGGCTGCC    900
   281 -I--S--A--G--F--Q--G--L--P--T--L--L--K--L--T--T--V--M--A--A-    300

                                                                          
   901 AAAAAGCAGGAGTGGCAGGCAATGAAACAACTTCCAGTACCCATAGATATTGGCCCAGAG    960
   901 AAAAAGCAGGAGTGGCAGGCAATGAAACAACTTCCAGTACCCATAGATATTGGCCCAGAG    960
   301 -K--K--Q--E--W--Q--A--M--K--Q--L--P--V--P--I--D--I--G--P--E-    320

                                                                          
   961 TTCCAGTACCACTCTGTGTTTGTATGTCCGGTACTCAGAGAGCAGTCAAGTGATGAAAAC   1020
   961 TTCCAGTACCACTCTGTGTTTGTATGTCCGGTACTCAGAGAGCAGTCAAGTGATGAAAAC   1020
   321 -F--Q--Y--H--S--V--F--V--C--P--V--L--R--E--Q--S--S--D--E--N-    340

                                                                          
  1021 CCTCCAATGCTGATGCCTTGTGGACACGTCGTGTCGAAACAATCGATAATGAAGCTATCT   1080
  1021 CCTCCAATGCTGATGCCTTGTGGACACGTCGTGTCGAAACAATCGATAATGAAGCTATCT   1080
   341 -P--P--M--L--M--P--C--G--H--V--V--S--K--Q--S--I--M--K--L--S-    360

                                                                          
  1081 AAGAGCAGCTCCAGACCATTCAAATGCCCATACTGTCCCTCAGAGGCTGTTGCTTCTCAG   1140
  1081 AAGAGCAGCTCCAGACCATTCAAATGCCCATACTGTCCCTCAGAGGCTGTTGCTTCTCAG   1140
   361 -K--S--S--S--R--P--F--K--C--P--Y--C--P--S--E--A--V--A--S--Q-    380

                                                                          
  1141 TGCAAGCAACTCCATTTCTGA                                          1161
  1141 TGCAAGCAACTCCATTTCTGA                                          1161
   381 -C--K--Q--L--H--F--*-                                           386