Transcript: LPERR06G16270.1
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- LPERR06G16270.1 1161 386aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D9WRM1 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GAG CTT GAC AAT CTT AGA GAG GCT TTT GAC CGA GTT ATT GAA AAA CGT GCT TCA TCT 60
1 ATGGAGCTTGACAATCTTAGAGAGGCTTTTGACCGAGTTATTGAAAAACGTGCTTCATCT 60
1 -M--E--L--D--N--L--R--E--A--F--D--R--V--I--E--K--R--A--S--S- 20
61 TCT GCT AAA GCT CAG GAA GTT ATT GAT CAG ATA GTG AGA GAA GTC GAG CAG GCA ATT ACG 120
61 TCTGCTAAAGCTCAGGAAGTTATTGATCAGATAGTGAGAGAAGTCGAGCAGGCAATTACG 120
21 -S--A--K--A--Q--E--V--I--D--Q--I--V--R--E--V--E--Q--A--I--T- 40
121 AAG ATG CAG ATG ATT AAT ACA GAT TCC ATG GGC AGT GCT GAC CAT TCA TCC GTC CTG GCA 180
121 AAGATGCAGATGATTAATACAGATTCCATGGGCAGTGCTGACCATTCATCCGTCCTGGCA 180
41 -K--M--Q--M--I--N--T--D--S--M--G--S--A--D--H--S--S--V--L--A- 60
181 GAG TTG AAA GCC AAG CTG AAT GAA TTG GCG CCA TTA AAC CAA CTA GAA GGT TGT CAA AAG 240
181 GAGTTGAAAGCCAAGCTGAATGAATTGGCGCCATTAAACCAACTAGAAGGTTGTCAAAAG 240
61 -E--L--K--A--K--L--N--E--L--A--P--L--N--Q--L--E--G--C--Q--K- 80
241 GAA TTG AAT GTT GCA CTG AGC AAA TAT CTC AAG GTG CTT GAG AAA TCT TTC AAT CCA GAC 300
241 GAATTGAATGTTGCACTGAGCAAATATCTCAAGGTGCTTGAGAAATCTTTCAATCCAGAC 300
81 -E--L--N--V--A--L--S--K--Y--L--K--V--L--E--K--S--F--N--P--D- 100
301 ATA TCA AAG GCA TAC CGA AAT GTG GAT TTT GAA GCT AAT ACA ATA AAC AGT ATA ATA GCA 360
301 ATATCAAAGGCATACCGAAATGTGGATTTTGAAGCTAATACAATAAACAGTATAATAGCA 360
101 -I--S--K--A--Y--R--N--V--D--F--E--A--N--T--I--N--S--I--I--A- 120
361 AAT CAT TTC TAC CGC CAA GGC CTT TTT GAT CTT GGA GAC TCA TTT GTC CGT GAG TGT GGT 420
361 AATCATTTCTACCGCCAAGGCCTTTTTGATCTTGGAGACTCATTTGTCCGTGAGTGTGGT 420
121 -N--H--F--Y--R--Q--G--L--F--D--L--G--D--S--F--V--R--E--C--G- 140
421 GAA TCA GAT GGG GCA TAC TTG AAA CTA CCC TTC CAA GAG ATG TAT TCA ATA CTT GAA GCA 480
421 GAATCAGATGGGGCATACTTGAAACTACCCTTCCAAGAGATGTATTCAATACTTGAAGCA 480
141 -E--S--D--G--A--Y--L--K--L--P--F--Q--E--M--Y--S--I--L--E--A- 160
481 ATG CAA GCT AGA AAC CTC CAG CCT GCC CTC AGT TGG GCT GCC AAG AAC CAT GAT CAA CTT 540
481 ATGCAAGCTAGAAACCTCCAGCCTGCCCTCAGTTGGGCTGCCAAGAACCATGATCAACTT 540
161 -M--Q--A--R--N--L--Q--P--A--L--S--W--A--A--K--N--H--D--Q--L- 180
541 TTG CAG AAT GGC TCA ATG CTT GAG TTG AAG CTT CAT CAA CTT CAG TTT GTT GAG ATA CTC 600
541 TTGCAGAATGGCTCAATGCTTGAGTTGAAGCTTCATCAACTTCAGTTTGTTGAGATACTC 600
181 -L--Q--N--G--S--M--L--E--L--K--L--H--Q--L--Q--F--V--E--I--L- 200
601 ACC AAA GGA AGT AGA GAC GAG GCT TTG CAG TAT GCA AGG ACT CAC CTG GTT CCC TTT GCA 660
601 ACCAAAGGAAGTAGAGACGAGGCTTTGCAGTATGCAAGGACTCACCTGGTTCCCTTTGCA 660
201 -T--K--G--S--R--D--E--A--L--Q--Y--A--R--T--H--L--V--P--F--A- 220
661 TCC TTG CAC AAG TCA GAG ATC CAA AGG CTA ATG GCC TGC CTT CTC TGG GCT GAC CGG CTT 720
661 TCCTTGCACAAGTCAGAGATCCAAAGGCTAATGGCCTGCCTTCTCTGGGCTGACCGGCTT 720
221 -S--L--H--K--S--E--I--Q--R--L--M--A--C--L--L--W--A--D--R--L- 240
721 GAT CAG TCT CCA TAT GCT GAA TTC ATG TCA TCG ACT CAT TGG GAG AAG CTA GCT GAG GAG 780
721 GATCAGTCTCCATATGCTGAATTCATGTCATCGACTCATTGGGAGAAGCTAGCTGAGGAG 780
241 -D--Q--S--P--Y--A--E--F--M--S--S--T--H--W--E--K--L--A--E--E- 260
781 CTT ATC CAC CAA TTC TGC AGT CTG TTG GGG CAA TCT AGT GAG AGC CCG CTT GGT ATA GCA 840
781 CTTATCCACCAATTCTGCAGTCTGTTGGGGCAATCTAGTGAGAGCCCGCTTGGTATAGCA 840
261 -L--I--H--Q--F--C--S--L--L--G--Q--S--S--E--S--P--L--G--I--A- 280
841 ATA TCA GCT GGT TTT CAA GGA CTA CCA ACC TTA CTG AAG CTA ACG ACA GTA ATG GCT GCC 900
841 ATATCAGCTGGTTTTCAAGGACTACCAACCTTACTGAAGCTAACGACAGTAATGGCTGCC 900
281 -I--S--A--G--F--Q--G--L--P--T--L--L--K--L--T--T--V--M--A--A- 300
901 AAA AAG CAG GAG TGG CAG GCA ATG AAA CAA CTT CCA GTA CCC ATA GAT ATT GGC CCA GAG 960
901 AAAAAGCAGGAGTGGCAGGCAATGAAACAACTTCCAGTACCCATAGATATTGGCCCAGAG 960
301 -K--K--Q--E--W--Q--A--M--K--Q--L--P--V--P--I--D--I--G--P--E- 320
961 TTC CAG TAC CAC TCT GTG TTT GTA TGT CCG GTA CTC AGA GAG CAG TCA AGT GAT GAA AAC 1020
961 TTCCAGTACCACTCTGTGTTTGTATGTCCGGTACTCAGAGAGCAGTCAAGTGATGAAAAC 1020
321 -F--Q--Y--H--S--V--F--V--C--P--V--L--R--E--Q--S--S--D--E--N- 340
1021 CCT CCA ATG CTG ATG CCT TGT GGA CAC GTC GTG TCG AAA CAA TCG ATA ATG AAG CTA TCT 1080
1021 CCTCCAATGCTGATGCCTTGTGGACACGTCGTGTCGAAACAATCGATAATGAAGCTATCT 1080
341 -P--P--M--L--M--P--C--G--H--V--V--S--K--Q--S--I--M--K--L--S- 360
1081 AAG AGC AGC TCC AGA CCA TTC AAA TGC CCA TAC TGT CCC TCA GAG GCT GTT GCT TCT CAG 1140
1081 AAGAGCAGCTCCAGACCATTCAAATGCCCATACTGTCCCTCAGAGGCTGTTGCTTCTCAG 1140
361 -K--S--S--S--R--P--F--K--C--P--Y--C--P--S--E--A--V--A--S--Q- 380
1141 TGC AAG CAA CTC CAT TTC TGA 1161
1141 TGCAAGCAACTCCATTTCTGA 1161
381 -C--K--Q--L--H--F--*- 386
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