Leersia perrieri (Lperr_V1.4)
Location
About this transcript

This transcript has 3 exons and is annotated with 39 domains and features.

Gene
Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-LPERR06G08490.131471048aa
 
Protein coding
A0A0D9WNW8 Ensembl Canonical
Variants
  • loading
Markup
  • loaded
                                                                          
     1 ATGCAGTCCTCCTCCGATCGGCGCCGCGGCGGCGGCGGTAACGGCGGCGGAGGAGGCCCC     60
     1 ATGCAGTCCTCCTCCGATCGGCGCCGCGGCGGCGGCGGTAACGGCGGCGGAGGAGGCCCC     60
     1 -M--Q--S--S--S--D--R--R--R--G--G--G--G--N--G--G--G--G--G--P-     20

                                                                          
    61 GTCGCGGTGCCTTCTTCCCGCACCGTATGGCGCCCCCCCGCAACCGCCCCGATCTTACCC    120
    61 GTCGCGGTGCCTTCTTCCCGCACCGTATGGCGCCCCCCCGCAACCGCCCCGATCTTACCC    120
    21 -V--A--V--P--S--S--R--T--V--W--R--P--P--A--T--A--P--I--L--P-     40

                                                                          
   121 TTCCCCAATCCGGCCTCGGAGGATCGGCCGCCCCAGCGCCGCCCGCGCCACAGGAATCGC    180
   121 TTCCCCAATCCGGCCTCGGAGGATCGGCCGCCCCAGCGCCGCCCGCGCCACAGGAATCGC    180
    41 -F--P--N--P--A--S--E--D--R--P--P--Q--R--R--P--R--H--R--N--R-     60

                                                                          
   181 GGGAATAGCGGCGGCCAGCGCCGCGCCCCGCCACCGCAGGAGAGGCCTTCCCCAGCGCCG    240
   181 GGGAATAGCGGCGGCCAGCGCCGCGCCCCGCCACCGCAGGAGAGGCCTTCCCCAGCGCCG    240
    61 -G--N--S--G--G--Q--R--R--A--P--P--P--Q--E--R--P--S--P--A--P-     80

                                                                          
   241 CCGCCGCCGCGGCAGCAGCAGGAGAGGCCTTCCGCCGCGGCGCCATCGCCCGCTCCGACC    300
   241 CCGCCGCCGCGGCAGCAGCAGGAGAGGCCTTCCGCCGCGGCGCCATCGCCCGCTCCGACC    300
    81 -P--P--P--R--Q--Q--Q--E--R--P--S--A--A--A--P--S--P--A--P--T-    100

                                                                          
   301 CGTTCCGCGCGTGGGCGTGTGGCGGCGGCGGTGGCGGGGGCGGGGATGAGCGATGGGTCG    360
   301 CGTTCCGCGCGTGGGCGTGTGGCGGCGGCGGTGGCGGGGGCGGGGATGAGCGATGGGTCG    360
   101 -R--S--A--R--G--R--V--A--A--A--V--A--G--A--G--M--S--D--G--S-    120

                                                                          
   361 GTGCCGCAGCTGGTGCAGGAGATCCAGGACAAGCTGGCGCGAGGGGCGGTGGAGTGCATG    420
   361 GTGCCGCAGCTGGTGCAGGAGATCCAGGACAAGCTGGCGCGAGGGGCGGTGGAGTGCATG    420
   121 -V--P--Q--L--V--Q--E--I--Q--D--K--L--A--R--G--A--V--E--C--M-    140

                                                                          
   421 ATCTGCTACGACATGGTGAGGCGGTCGGCGCCGGTATGGTCCTGCGGCAGCTGCTTCTCC    480
   421 ATCTGCTACGACATGGTGAGGCGGTCGGCGCCGGTATGGTCCTGCGGCAGCTGCTTCTCC    480
   141 -I--C--Y--D--M--V--R--R--S--A--P--V--W--S--C--G--S--C--F--S-    160

                                                                          
   481 ATCTTCCACCTCCCCTGCATCCGCAAGTGGGCGCGATCCCCGGCGTCCGCCGCCGAAGCC    540
   481 ATCTTCCACCTCCCCTGCATCCGCAAGTGGGCGCGATCCCCGGCGTCCGCCGCCGAAGCC    540
   161 -I--F--H--L--P--C--I--R--K--W--A--R--S--P--A--S--A--A--E--A-    180

                                                                          
   541 TCCGATCCTGACTCCTCCTGGCGATGCCCCGGGTGCCAGTCCGTGCACGCCGTACCCGCC    600
   541 TCCGATCCTGACTCCTCCTGGCGATGCCCCGGGTGCCAGTCCGTGCACGCCGTACCCGCC    600
   181 -S--D--P--D--S--S--W--R--C--P--G--C--Q--S--V--H--A--V--P--A-    200

                                                                          
   601 CGCGAGCTCTCCTACACCTGCTTCTGTGGCCGCCGCCGCGAGCCCCCCAATGACCTCTTC    660
   601 CGCGAGCTCTCCTACACCTGCTTCTGTGGCCGCCGCCGCGAGCCCCCCAATGACCTCTTC    660
   201 -R--E--L--S--Y--T--C--F--C--G--R--R--R--E--P--P--N--D--L--F-    220

                                                                          
   661 CTCACGCCCCACTCCTGCGGCGAGCCCTGCTCCAAGCCCCTCGAGAGGGCGGACACCGCC    720
   661 CTCACGCCCCACTCCTGCGGCGAGCCCTGCTCCAAGCCCCTCGAGAGGGCGGACACCGCC    720
   221 -L--T--P--H--S--C--G--E--P--C--S--K--P--L--E--R--A--D--T--A-    240

                                                                          
   721 ACGAAGGGCGAAGATGCTGGGGCTACCAGGTGCCCGCATGTATGTGTCCTCCAGTGCCAC    780
   721 ACGAAGGGCGAAGATGCTGGGGCTACCAGGTGCCCGCATGTATGTGTCCTCCAGTGCCAC    780
   241 -T--K--G--E--D--A--G--A--T--R--C--P--H--V--C--V--L--Q--C--H-    260

                                                                          
   781 CCAGGGCCATGCCCTCCCTGCAAGGCGTTTGCGCCCGACCGGCTGTGCCCCTGCGGCAAG    840
   781 CCAGGGCCATGCCCTCCCTGCAAGGCGTTTGCGCCCGACCGGCTGTGCCCCTGCGGCAAG    840
   261 -P--G--P--C--P--P--C--K--A--F--A--P--D--R--L--C--P--C--G--K-    280

                                                                          
   841 CAGACCATTGTGCGGCGGTGTGCGGATCGGACCACGCCTGTGACTGTGATCGGCTGCTCC    900
   841 CAGACCATTGTGCGGCGGTGTGCGGATCGGACCACGCCTGTGACTGTGATCGGCTGCTCC    900
   281 -Q--T--I--V--R--R--C--A--D--R--T--T--P--V--T--V--I--G--C--S-    300

                                                                          
   901 CTTGCCGGAGGCACCGTTGTGAGAAGTGAAGCCTGCGGCCACTTGCTGTCTTGTGGAAAT    960
   901 CTTGCCGGAGGCACCGTTGTGAGAAGTGAAGCCTGCGGCCACTTGCTGTCTTGTGGAAAT    960
   301 -L--A--G--G--T--V--V--R--S--E--A--C--G--H--L--L--S--C--G--N-    320

                                                                          
   961 CATGCCTGCCAAGACATTTGCCACCCAGGGCCGTGTGGGGAGTGCGAACTTATGCCAGGG   1020
   961 CATGCCTGCCAAGACATTTGCCACCCAGGGCCGTGTGGGGAGTGCGAACTTATGCCAGGG   1020
   321 -H--A--C--Q--D--I--C--H--P--G--P--C--G--E--C--E--L--M--P--G-    340

                                                                          
  1021 AAGGTCACCACATGCCATTGTGGGAAGACAGGGCTTCTGGAGAAGAGAGCAAGCTGCTTG   1080
  1021 AAGGTCACCACATGCCATTGTGGGAAGACAGGGCTTCTGGAGAAGAGAGCAAGCTGCTTG   1080
   341 -K--V--T--T--C--H--C--G--K--T--G--L--L--E--K--R--A--S--C--L-    360

                                                                          
  1081 GACCCTATCCCAACCTGTGACAAGGTGTGCGACAAGAAGCTGCCGTGTGGAGTGCATAGG   1140
  1081 GACCCTATCCCAACCTGTGACAAGGTGTGCGACAAGAAGCTGCCGTGTGGAGTGCATAGG   1140
   361 -D--P--I--P--T--C--D--K--V--C--D--K--K--L--P--C--G--V--H--R-    380

                                                                          
  1141 TGCAAGGTCACATGCCATGAGGGAGATTGCCCACCTTGTGTGGTGCGTGTGGAACAGAGG   1200
  1141 TGCAAGGTCACATGCCATGAGGGAGATTGCCCACCTTGTGTGGTGCGTGTGGAACAGAGG   1200
   381 -C--K--V--T--C--H--E--G--D--C--P--P--C--V--V--R--V--E--Q--R-    400

                                                                          
  1201 TGCCGCTGTGGTTCATCGGGCCAGATGGTGGAGTGCTACAAGGTCTTGGAGGAAGAATTC   1260
  1201 TGCCGCTGTGGTTCATCGGGCCAGATGGTGGAGTGCTACAAGGTCTTGGAGGAAGAATTC   1260
   401 -C--R--C--G--S--S--G--Q--M--V--E--C--Y--K--V--L--E--E--E--F-    420

                                                                          
  1261 CGTTGCAACAAGCCTTGTGGGCGAAAGAAAAATTGTGGGAGGCACAGGTGCAGTGAGTGC   1320
  1261 CGTTGCAACAAGCCTTGTGGGCGAAAGAAAAATTGTGGGAGGCACAGGTGCAGTGAGTGC   1320
   421 -R--C--N--K--P--C--G--R--K--K--N--C--G--R--H--R--C--S--E--C-    440

                                                                          
  1321 TGTTGCCCACTTTCAAAGCCGCTTGCTCAGCTTGAAGGAGGTAATTGGGATCCCCATCTC   1380
  1321 TGTTGCCCACTTTCAAAGCCGCTTGCTCAGCTTGAAGGAGGTAATTGGGATCCCCATCTC   1380
   441 -C--C--P--L--S--K--P--L--A--Q--L--E--G--G--N--W--D--P--H--L-    460

                                                                          
  1381 TGCCAGATACCTTGTGGCAAGAAGCTCCGGTGTGGACAGCATGGATGCCAGCTTCTCTGC   1440
  1381 TGCCAGATACCTTGTGGCAAGAAGCTCCGGTGTGGACAGCATGGATGCCAGCTTCTCTGC   1440
   461 -C--Q--I--P--C--G--K--K--L--R--C--G--Q--H--G--C--Q--L--L--C-    480

                                                                          
  1441 CATAGTGGTCACTGCCCGCCGTGCCTTGAGACCATATTTAATGATCTCACTTGTGCCTGT   1500
  1441 CATAGTGGTCACTGCCCGCCGTGCCTTGAGACCATATTTAATGATCTCACTTGTGCCTGT   1500
   481 -H--S--G--H--C--P--P--C--L--E--T--I--F--N--D--L--T--C--A--C-    500

                                                                          
  1501 GGTCGGACATCCATCCCGCCGCCACTTCCTTGTGGCACACCAACTCCATCGTGCACACAC   1560
  1501 GGTCGGACATCCATCCCGCCGCCACTTCCTTGTGGCACACCAACTCCATCGTGCACACAC   1560
   501 -G--R--T--S--I--P--P--P--L--P--C--G--T--P--T--P--S--C--T--H-    520

                                                                          
  1561 CAATGCATGGTCCCTCAACCATGTGGGCATCCGGCCTCACATCAATGTCATTTCGGGGAC   1620
  1561 CAATGCATGGTCCCTCAACCATGTGGGCATCCGGCCTCACATCAATGTCATTTCGGGGAC   1620
   521 -Q--C--M--V--P--Q--P--C--G--H--P--A--S--H--Q--C--H--F--G--D-    540

                                                                          
  1621 TGCCCGCCTTGTGTTGTTCCAGTGATGAGAGAATGCATCGGTGGACATGTCATGTTGAGG   1680
  1621 TGCCCGCCTTGTGTTGTTCCAGTGATGAGAGAATGCATCGGTGGACATGTCATGTTGAGG   1680
   541 -C--P--P--C--V--V--P--V--M--R--E--C--I--G--G--H--V--M--L--R-    560

                                                                          
  1681 AACATCCCTTGTGGTTCTAAGGATATCAGATGCAACCAACCATGCGGAAAGAACCGGCAA   1740
  1681 AACATCCCTTGTGGTTCTAAGGATATCAGATGCAACCAACCATGCGGAAAGAACCGGCAA   1740
   561 -N--I--P--C--G--S--K--D--I--R--C--N--Q--P--C--G--K--N--R--Q-    580

                                                                          
  1741 TGCGGAATACATGCTTGCACTAGGACTTGCCACCCTTCTCCTTGTGATCCACCAACTGCA   1800
  1741 TGCGGAATACATGCTTGCACTAGGACTTGCCACCCTTCTCCTTGTGATCCACCAACTGCA   1800
   581 -C--G--I--H--A--C--T--R--T--C--H--P--S--P--C--D--P--P--T--A-    600

                                                                          
  1801 AATGGAGATGCTAGCTCAGGCACTGGTGGAAGAGCTTCGTGTGGACAGGTATGTGGTGCT   1860
  1801 AATGGAGATGCTAGCTCAGGCACTGGTGGAAGAGCTTCGTGTGGACAGGTATGTGGTGCT   1860
   601 -N--G--D--A--S--S--G--T--G--G--R--A--S--C--G--Q--V--C--G--A-    620

                                                                          
  1861 CCAAGGAGGGAATGTAAGCACACTTGCACAGCTCCATGCCACCCATCATCACCTTGCCCA   1920
  1861 CCAAGGAGGGAATGTAAGCACACTTGCACAGCTCCATGCCACCCATCATCACCTTGCCCA   1920
   621 -P--R--R--E--C--K--H--T--C--T--A--P--C--H--P--S--S--P--C--P-    640

                                                                          
  1921 GATTCGAGATGTGAATTTCCTATGACCATTACCTGCTCTTGTGGCCGAATCACTGCAACT   1980
  1921 GATTCGAGATGTGAATTTCCTATGACCATTACCTGCTCTTGTGGCCGAATCACTGCAACT   1980
   641 -D--S--R--C--E--F--P--M--T--I--T--C--S--C--G--R--I--T--A--T-    660

                                                                          
  1981 GTGCCATGCGGTGCTGGGGGAACCTCCAGTGGTGATAATATGTTTGAAGTATCCATCATA   2040
  1981 GTGCCATGCGGTGCTGGGGGAACCTCCAGTGGTGATAATATGTTTGAAGTATCCATCATA   2040
   661 -V--P--C--G--A--G--G--T--S--S--G--D--N--M--F--E--V--S--I--I-    680

                                                                          
  2041 CAGAAGCTGCCAATGCCACTCCAGCCAGTGGAATCGGATGGGAGGAGGGTTCCACTTGGG   2100
  2041 CAGAAGCTGCCAATGCCACTCCAGCCAGTGGAATCGGATGGGAGGAGGGTTCCACTTGGG   2100
   681 -Q--K--L--P--M--P--L--Q--P--V--E--S--D--G--R--R--V--P--L--G-    700

                                                                          
  2101 CAGAGGAAGCTATGTTGTGATGAGGACTGTGCAAAGCTGGAGAGGAAGAAGGCTCTTGCT   2160
  2101 CAGAGGAAGCTATGTTGTGATGAGGACTGTGCAAAGCTGGAGAGGAAGAAGGCTCTTGCT   2160
   701 -Q--R--K--L--C--C--D--E--D--C--A--K--L--E--R--K--K--A--L--A-    720

                                                                          
  2161 GAAGCATTTGACATCACCCCACCCAATTTGGATGCATTGCATTTTGGTGAGAACTCCAAT   2220
  2161 GAAGCATTTGACATCACCCCACCCAATTTGGATGCATTGCATTTTGGTGAGAACTCCAAT   2220
   721 -E--A--F--D--I--T--P--P--N--L--D--A--L--H--F--G--E--N--S--N-    740

                                                                          
  2221 GCATCTGATTTGCTTTCTGACCTTTTCCGCCGTGAGCCAAAATGGGTGATGGCTATTGAG   2280
  2221 GCATCTGATTTGCTTTCTGACCTTTTCCGCCGTGAGCCAAAATGGGTGATGGCTATTGAG   2280
   741 -A--S--D--L--L--S--D--L--F--R--R--E--P--K--W--V--M--A--I--E-    760

                                                                          
  2281 GAGAGGTGCAAGTTTCTTGTACTTGGGAAGACTAGAGGCAATTCTTCAGGCAGCCTCAAG   2340
  2281 GAGAGGTGCAAGTTTCTTGTACTTGGGAAGACTAGAGGCAATTCTTCAGGCAGCCTCAAG   2340
   761 -E--R--C--K--F--L--V--L--G--K--T--R--G--N--S--S--G--S--L--K-    780

                                                                          
  2341 GTCCATGTATTCTGTTACATGATGAAGGATAAACGAGATGCTATCAGGCTCATTGCGGAC   2400
  2341 GTCCATGTATTCTGTTACATGATGAAGGATAAACGAGATGCTATCAGGCTCATTGCGGAC   2400
   781 -V--H--V--F--C--Y--M--M--K--D--K--R--D--A--I--R--L--I--A--D-    800

                                                                          
  2401 AGGTGGAAGCTTGCTGTTCAGGGTATTGGTTGGGATCCCAAACGTTTCATTACTATCCAT   2460
  2401 AGGTGGAAGCTTGCTGTTCAGGGTATTGGTTGGGATCCCAAACGTTTCATTACTATCCAT   2460
   801 -R--W--K--L--A--V--Q--G--I--G--W--D--P--K--R--F--I--T--I--H-    820

                                                                          
  2461 GTTACACCTAAGTCAAAGCCGCCTGCTCGCATACTGGGTTCCAAGCCAGGCATATCTGTT   2520
  2461 GTTACACCTAAGTCAAAGCCGCCTGCTCGCATACTGGGTTCCAAGCCAGGCATATCTGTT   2520
   821 -V--T--P--K--S--K--P--P--A--R--I--L--G--S--K--P--G--I--S--V-    840

                                                                          
  2521 ACCGCTAACCATCATCCTTTCTTTGATCCCATGGTGGACATGGACCCAAGGCTTGTCGTT   2580
  2521 ACCGCTAACCATCATCCTTTCTTTGATCCCATGGTGGACATGGACCCAAGGCTTGTCGTT   2580
   841 -T--A--N--H--H--P--F--F--D--P--M--V--D--M--D--P--R--L--V--V-    860

                                                                          
  2581 GCAATGATGGACCTGCCCCGGGATGCTGATGTTAGTGCTCTGGTTTTAAGGTTTGGTGGG   2640
  2581 GCAATGATGGACCTGCCCCGGGATGCTGATGTTAGTGCTCTGGTTTTAAGGTTTGGTGGG   2640
   861 -A--M--M--D--L--P--R--D--A--D--V--S--A--L--V--L--R--F--G--G-    880

                                                                          
  2641 GAGTGTGAATTGGTTTGGCTGAATGACAAGAATGCTGTGGCTGTCTTCCATGATCCAGCT   2700
  2641 GAGTGTGAATTGGTTTGGCTGAATGACAAGAATGCTGTGGCTGTCTTCCATGATCCAGCT   2700
   881 -E--C--E--L--V--W--L--N--D--K--N--A--V--A--V--F--H--D--P--A-    900

                                                                          
  2701 AGAGCAGCGACAGCTCTGAGGCGGCTGGATTATGGTTCTGCTTACCAGGGTGCTGCTGTG   2760
  2701 AGAGCAGCGACAGCTCTGAGGCGGCTGGATTATGGTTCTGCTTACCAGGGTGCTGCTGTG   2760
   901 -R--A--A--T--A--L--R--R--L--D--Y--G--S--A--Y--Q--G--A--A--V-    920

                                                                          
  2761 TTTTTGCCAAGCAGCAGCGCTCCCCCGGGCAATGTCTGGGTTGCAGGGCAGAAAGATGGA   2820
  2761 TTTTTGCCAAGCAGCAGCGCTCCCCCGGGCAATGTCTGGGTTGCAGGGCAGAAAGATGGA   2820
   921 -F--L--P--S--S--S--A--P--P--G--N--V--W--V--A--G--Q--K--D--G-    940

                                                                          
  2821 GTGGCGGCTACTAAGAACAGTGCCAATTCATGGAAGAAGGCAGCCGCCTGTGAGCTCGAA   2880
  2821 GTGGCGGCTACTAAGAACAGTGCCAATTCATGGAAGAAGGCAGCCGCCTGTGAGCTCGAA   2880
   941 -V--A--A--T--K--N--S--A--N--S--W--K--K--A--A--A--C--E--L--E-    960

                                                                          
  2881 CCATCCTCAGGAAACTGGACAGGTGTGGTTGGTCAAGCTCCACCATCAGTATGGAGACGT   2940
  2881 CCATCCTCAGGAAACTGGACAGGTGTGGTTGGTCAAGCTCCACCATCAGTATGGAGACGT   2940
   961 -P--S--S--G--N--W--T--G--V--V--G--Q--A--P--P--S--V--W--R--R-    980

                                                                          
  2941 GGTGGTGATACTGTTGCTCAAGTCATGGGAACAACAAACCGCTGGAACGCCCTAGAGTCT   3000
  2941 GGTGGTGATACTGTTGCTCAAGTCATGGGAACAACAAACCGCTGGAACGCCCTAGAGTCT   3000
   981 -G--G--D--T--V--A--Q--V--M--G--T--T--N--R--W--N--A--L--E--S-   1000

                                                                          
  3001 GATACCACCACAAGCTCCAGGCCAGTCGAGGAGAGTAAGCCTGCTCCTCGCACTCATGCT   3060
  3001 GATACCACCACAAGCTCCAGGCCAGTCGAGGAGAGTAAGCCTGCTCCTCGCACTCATGCT   3060
  1001 -D--T--T--T--S--S--R--P--V--E--E--S--K--P--A--P--R--T--H--A-   1020

                                                                          
  3061 GGATCCAGCTCCAGTGCAGGGCCGCCCCCAGTTAGTAAGATGCAGCCGGAAGTCGAAGTG   3120
  3061 GGATCCAGCTCCAGTGCAGGGCCGCCCCCAGTTAGTAAGATGCAGCCGGAAGTCGAAGTG   3120
  1021 -G--S--S--S--S--A--G--P--P--P--V--S--K--M--Q--P--E--V--E--V-   1040

                                                                          
  3121 GATGATTGGGAAGAAGCCTGTGAATGA                                    3147
  3121 GATGATTGGGAAGAAGCCTGTGAATGA                                    3147
  1041 -D--D--W--E--E--A--C--E--*-                                    1048