Transcript: LPERR06G04730.1
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- LPERR06G04730.1 690 229aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D9WMJ8 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GTT ATC ATG GCG GCG ATG CTC CCC GGC GTG GAG TGC GCC CGG CGG CGG CGA CTC CGG 60
1 ATGGTTATCATGGCGGCGATGCTCCCCGGCGTGGAGTGCGCCCGGCGGCGGCGACTCCGG 60
1 -M--V--I--M--A--A--M--L--P--G--V--E--C--A--R--R--R--R--L--R- 20
61 CAG GGA GGA GGA GCT GAG GCG GCG GAG GCC GGC GGT GGC GCG AGG CGG TCG TCG TTC TGC 120
61 CAGGGAGGAGGAGCTGAGGCGGCGGAGGCCGGCGGTGGCGCGAGGCGGTCGTCGTTCTGC 120
21 -Q--G--G--G--A--E--A--A--E--A--G--G--G--A--R--R--S--S--F--C- 40
121 GTG CAC GGT GGC GCC GCC ACC GTC GGG AAT AGC AAG AAT CTG ATG GTT GGT TTG TTG GGA 180
121 GTGCACGGTGGCGCCGCCACCGTCGGGAATAGCAAGAATCTGATGGTTGGTTTGTTGGGA 180
41 -V--H--G--G--A--A--T--V--G--N--S--K--N--L--M--V--G--L--L--G- 60
181 AAT AAT CAC CAG CAG AGG AGT GGT GTC ATG GAG CTC ATC CAT AGC TGG TCG CTG GAC AGC 240
181 AATAATCACCAGCAGAGGAGTGGTGTCATGGAGCTCATCCATAGCTGGTCGCTGGACAGC 240
61 -N--N--H--Q--Q--R--S--G--V--M--E--L--I--H--S--W--S--L--D--S- 80
241 AAT GCC CGT GAG GCG AAG GAG AGA CTC GAT CAG AAG CTG AGG AAT CAG AGA GAG GCC GTC 300
241 AATGCCCGTGAGGCGAAGGAGAGACTCGATCAGAAGCTGAGGAATCAGAGAGAGGCCGTC 300
81 -N--A--R--E--A--K--E--R--L--D--Q--K--L--R--N--Q--R--E--A--V- 100
301 ATC AAG AG G CAT CAC AGC ACG GGA AGC ATG AAG CTG AAC AGA GCA ACC GCC TCC GGC GGC 360
301 ATCAAGAGGCATCACAGCACGGGAAGCATGAAGCTGAACAGAGCAACCGCCTCCGGCGGC 360
101 -I--K--R--H--H--S--T--G--S--M--K--L--N--R--A--T--A--S--G--G- 120
361 GGC GGA GGC GAT AAG GGG AGC TCG ACG GCG GCG ACG GCG ACG GCG GCG GGG GTG CAG AGG 420
361 GGCGGAGGCGATAAGGGGAGCTCGACGGCGGCGACGGCGACGGCGGCGGGGGTGCAGAGG 420
121 -G--G--G--D--K--G--S--S--T--A--A--T--A--T--A--A--G--V--Q--R- 140
421 GAG GTG TAC TCG AGG AAG GGA GTG ATG AGG CGG CTG ATG AGG TGG AGC CGG CTG CGG TGG 480
421 GAGGTGTACTCGAGGAAGGGAGTGATGAGGCGGCTGATGAGGTGGAGCCGGCTGCGGTGG 480
141 -E--V--Y--S--R--K--G--V--M--R--R--L--M--R--W--S--R--L--R--W- 160
481 GAC GCG GCG GAG CAG GCG GAG TGC GCC GTC TGC CTC GAG GAG TTC GCC GCC GGC GAC GTG 540
481 GACGCGGCGGAGCAGGCGGAGTGCGCCGTCTGCCTCGAGGAGTTCGCCGCCGGCGACGTG 540
161 -D--A--A--E--Q--A--E--C--A--V--C--L--E--E--F--A--A--G--D--V- 180
541 CTC GCC CAC CTC CCC TGC GGC CAC CGC TTC CAC TGG GGC TGC GCC CTC CCC TGG CTC GAG 600
541 CTCGCCCACCTCCCCTGCGGCCACCGCTTCCACTGGGGCTGCGCCCTCCCCTGGCTCGAG 600
181 -L--A--H--L--P--C--G--H--R--F--H--W--G--C--A--L--P--W--L--E- 200
601 GCC GCC GCC TCC CGC TCC TCC TGC CCC TTC TGC CGC GCT GCC GTC GAC ACG CCG GCG ACG 660
601 GCCGCCGCCTCCCGCTCCTCCTGCCCCTTCTGCCGCGCTGCCGTCGACACGCCGGCGACG 660
201 -A--A--A--S--R--S--S--C--P--F--C--R--A--A--V--D--T--P--A--T- 220
661 CCG CCG GCG TGC TCC TCG ATT GGC GCG TGA 690
661 CCGCCGGCGTGCTCCTCGATTGGCGCGTGA 690
221 -P--P--A--C--S--S--I--G--A--*- 229
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