Leersia perrieri (Lperr_V1.4) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 5: 19,225,750-19,231,169 forward strand.
This transcript has 8 exons and is annotated with 7 domains and features.
This transcript is a product of gene LPERR05G21500 Show transcript tableHide transcript table
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1 ATGGGGAGGGCGATGGGCAGTCTAGCTGGGTGTTCGCTCACTGGATTGGATTATCATTCG 60 1 ATGGGGAGGGCGATGGGCAGTCTAGCTGGGTGTTCGCTCACTGGATTGGATTATCATTCG 60 1 -M--G--R--A--M--G--S--L--A--G--C--S--L--T--G--L--D--Y--H--S- 20 61 AGCAATCTGGTCAGCGCCCGTGTTGCCAGTCTTGAAAACCAAGTTCAACCTGAAAGTCTC 120 61 AGCAATCTGGTCAGCGCCCGTGTTGCCAGTCTTGAAAACCAAGTTCAACCTGAAAGTCTC 120 21 -S--N--L--V--S--A--R--V--A--S--L--E--N--Q--V--Q--P--E--S--L- 40 121 TATTATGGAGGTGCTGGGAGCAACTTATCTAACCCGGGTGTGCAAGTTGCTGTTGGAATT 180 121 TATTATGGAGGTGCTGGGAGCAACTTATCTAACCCGGGTGTGCAAGTTGCTGTTGGAATT 180 41 -Y--Y--G--G--A--G--S--N--L--S--N--P--G--V--Q--V--A--V--G--I- 60 181 CCGGGGAATACTGATTTCCGTGGTCACTATGAGAACATTAGTCTTCAGCACCAGCATGTT 240 181 CCGGGGAATACTGATTTCCGTGGTCACTATGAGAACATTAGTCTTCAGCACCAGCATGTT 240 61 -P--G--N--T--D--F--R--G--H--Y--E--N--I--S--L--Q--H--Q--H--V- 80 241 CAAAATTCATACCCACATGTAGGTGTTGCATCAAGTTCTGTGTTCCCATCTACCATGTAC 300 241 CAAAATTCATACCCACATGTAGGTGTTGCATCAAGTTCTGTGTTCCCATCTACCATGTAC 300 81 -Q--N--S--Y--P--H--V--G--V--A--S--S--S--V--F--P--S--T--M--Y- 100 301 AATCCCTGCATATCAACAACAGCTGTGAACAGATATGTTCCTCCTATTCAAAGTTTTGGA 360 301 AATCCCTGCATATCAACAACAGCTGTGAACAGATATGTTCCTCCTATTCAAAGTTTTGGA 360 101 -N--P--C--I--S--T--T--A--V--N--R--Y--V--P--P--I--Q--S--F--G- 120 361 TTGGGCAATCCACAATTGCTCAAGGATCCATGGATGAGAGTGGCAGCAGTGGCAATTTTG 420 361 TTGGGCAATCCACAATTGCTCAAGGATCCATGGATGAGAGTGGCAGCAGTGGCAATTTTG 420 121 -L--G--N--P--Q--L--L--K--D--P--W--M--R--V--A--A--V--A--I--L- 140 421 CTGACAGTGCCAGAGAATTCATCAAGAGGAAAAATGCATTACATGTCATGGAATGCTTCA 480 421 CTGACAGTGCCAGAGAATTCATCAAGAGGAAAAATGCATTACATGTCATGGAATGCTTCA 480 141 -L--T--V--P--E--N--S--S--R--G--K--M--H--Y--M--S--W--N--A--S- 160 481 TTTGAATCAAATATTCTACCCAGCACTGGTGTTTCCAATCCACCAGACTACCTTTCTGCT 540 481 TTTGAATCAAATATTCTACCCAGCACTGGTGTTTCCAATCCACCAGACTACCTTTCTGCT 540 161 -F--E--S--N--I--L--P--S--T--G--V--S--N--P--P--D--Y--L--S--A- 180 541 GATGGACCAAACAGGTCTACTTTAATGGCTGCTCATCCAGAGTTGGTGCATCATGGCAAC 600 541 GATGGACCAAACAGGTCTACTTTAATGGCTGCTCATCCAGAGTTGGTGCATCATGGCAAC 600 181 -D--G--P--N--R--S--T--L--M--A--A--H--P--E--L--V--H--H--G--N- 200 601 TATGTGATTCCAGCTGGTCACATGAACCAATACAATACATGGATTCCACAGGCTGCAAAC 660 601 TATGTGATTCCAGCTGGTCACATGAACCAATACAATACATGGATTCCACAGGCTGCAAAC 660 201 -Y--V--I--P--A--G--H--M--N--Q--Y--N--T--W--I--P--Q--A--A--N- 220 661 AGAACTGGTGGATTGCCACAGTGGGAACATGGCAATGCAGCAGCTAATCCTCCAGGTGGA 720 661 AGAACTGGTGGATTGCCACAGTGGGAACATGGCAATGCAGCAGCTAATCCTCCAGGTGGA 720 221 -R--T--G--G--L--P--Q--W--E--H--G--N--A--A--A--N--P--P--G--G- 240 721 TTTGTCCATCCAGGAAACCTAGACATGTCAAATGGAGGTTTTCAGGGTTACCAAGCTGGT 780 721 TTTGTCCATCCAGGAAACCTAGACATGTCAAATGGAGGTTTTCAGGGTTACCAAGCTGGT 780 241 -F--V--H--P--G--N--L--D--M--S--N--G--G--F--Q--G--Y--Q--A--G- 260 781 CCTTCTGCCTTTTTTTATGGGCCTCTGCCTTATTTCCACCAAAACACTATGCATAGCCTG 840 781 CCTTCTGCCTTTTTTTATGGGCCTCTGCCTTATTTCCACCAAAACACTATGCATAGCCTG 840 261 -P--S--A--F--F--Y--G--P--L--P--Y--F--H--Q--N--T--M--H--S--L- 280 841 CAAGATCCTGGTTTATTTAATCATATCCAAATGCAAGTACCTCCTCAACATCGCCTCAGT 900 841 CAAGATCCTGGTTTATTTAATCATATCCAAATGCAAGTACCTCCTCAACATCGCCTCAGT 900 281 -Q--D--P--G--L--F--N--H--I--Q--M--Q--V--P--P--Q--H--R--L--S- 300 901 AATCATTTATTGCATTGTATAAACCCCTCTGGCAATGGCCTCCCCTTGGATCCAAGAACT 960 901 AATCATTTATTGCATTGTATAAACCCCTCTGGCAATGGCCTCCCCTTGGATCCAAGAACT 960 301 -N--H--L--L--H--C--I--N--P--S--G--N--G--L--P--L--D--P--R--T- 320 961 CTGGTGATATCATCCAATTCTGGGCATACCTTTGGACCAACAGCTCAGCCATCTGTAGCA 1020 961 CTGGTGATATCATCCAATTCTGGGCATACCTTTGGACCAACAGCTCAGCCATCTGTAGCA 1020 321 -L--V--I--S--S--N--S--G--H--T--F--G--P--T--A--Q--P--S--V--A- 340 1021 CACCAGGTTAACGCTGGAAGTTTGAGAATTCAGCCACATGAGAATGCTCCATTTGTGAAT 1080 1021 CACCAGGTTAACGCTGGAAGTTTGAGAATTCAGCCACATGAGAATGCTCCATTTGTGAAT 1080 341 -H--Q--V--N--A--G--S--L--R--I--Q--P--H--E--N--A--P--F--V--N- 360 1081 CTTTCGAGATTGTATGAAGCAGGAGTTATTGATGAACATAGAGATATGCGGCTAGACGTA 1140 1081 CTTTCGAGATTGTATGAAGCAGGAGTTATTGATGAACATAGAGATATGCGGCTAGACGTA 1140 361 -L--S--R--L--Y--E--A--G--V--I--D--E--H--R--D--M--R--L--D--V- 380 1141 GACAGCATGACTTATGAGGAGCTTGTAGCGTTGGAAGAGCAGATTGGAAGTGTTAATACT 1200 1141 GACAGCATGACTTATGAGGAGCTTGTAGCGTTGGAAGAGCAGATTGGAAGTGTTAATACT 1200 381 -D--S--M--T--Y--E--E--L--V--A--L--E--E--Q--I--G--S--V--N--T- 400 1201 GGCTTTACAGAAAGCTACATTAAAGAAAACTTGAAGTTGACTTCTTATATCCCAGACGCT 1260 1201 GGCTTTACAGAAAGCTACATTAAAGAAAACTTGAAGTTGACTTCTTATATCCCAGACGCT 1260 401 -G--F--T--E--S--Y--I--K--E--N--L--K--L--T--S--Y--I--P--D--A- 420 1261 GTTTGCATGCCTGATCAGTCTTCTGTGGAGAATGATGCTTGCATAATATGCCAGGAGGAG 1320 1261 GTTTGCATGCCTGATCAGTCTTCTGTGGAGAATGATGCTTGCATAATATGCCAGGAGGAG 1320 421 -V--C--M--P--D--Q--S--S--V--E--N--D--A--C--I--I--C--Q--E--E- 440 1321 TACGAAGCTAAAGAACTTATTGGAACCCTGGGTTGTGGTCACAAGTACCATGCGATGTGC 1380 1321 TACGAAGCTAAAGAACTTATTGGAACCCTGGGTTGTGGTCACAAGTACCATGCGATGTGC 1380 441 -Y--E--A--K--E--L--I--G--T--L--G--C--G--H--K--Y--H--A--M--C- 460 1381 ATAAAGGAGTGGCTGATGGTGAAGAACCTGTGCCCCATCTGCAAAACAACAGCTTTGCCA 1440 1381 ATAAAGGAGTGGCTGATGGTGAAGAACCTGTGCCCCATCTGCAAAACAACAGCTTTGCCA 1440 461 -I--K--E--W--L--M--V--K--N--L--C--P--I--C--K--T--T--A--L--P- 480 1441 GCAGATAGAAGAAACGGATAATGGATGCCAGTAACATTATTGGCCATTTGCCTCAACAAA 1500 1441 GCAGATAGAAGAAACGGATAA....................................... 1461 481 -A--D--R--R--N--G--*-....................................... 486 1501 CATTCAGCTCAGTTTTGTACATAAGACATGCTGGATAATGGTTCTGCCTGTATTTGCTTT 1560 ............................................................ ............................................................ 1561 GTTGTGAGGACATAAGCTAAAACTGTACAGTGAGAATCGCTCATCTTGTAGATTGTTTTA 1620 ............................................................ ............................................................ 1621 GACATTAAATCTCCCATGGTGCGTGAACAGCTCTCATCATGGCATAGTTATTAGATCGCT 1680 ............................................................ ............................................................ 1681 CCCCCTTTTTTTTTCCTTGTACATGATATTTATCTTTATTCTTTGCCACCAAAAAAAAGA 1740 ............................................................ ............................................................ 1741 GAACTTGTAGTTCTTCTGTACATTTGTGAAATTAAAAGAACTAGAGGAGTTTCTCAACTC 1800 ............................................................ ............................................................ 1801 TGGAGTGGTAGCCCTTTAGCAGAGTAGCAGAAAAAATGGATAGCCCTTGTTTTGAATGTA 1860 ............................................................ ............................................................ 1861 GGAAGTCCTTGTGTTGATCCTATGTGATTTTCCGATCAACTATGTTCAGATGTGATAATG 1920 ............................................................ ............................................................ 1921 TCGCATGAGAATAAGTGGATAATTGTGGCCCTCGTAAGACGGCAAAAATCATGGGTTGCA 1980 ............................................................ ............................................................ 1981 GCAGCTTTGCTAACAGGATAAAGAAACCGTAAGAACAATGAACTTTGCTAATGAAAAACA 2040 ............................................................ ............................................................ 2041 GATGGCAACATACAAATAAATCAAGCAGTAGAGCCTTTAATAGAAGGCAAACAAATGGCC 2100 ............................................................ ............................................................ 2101 TGTATGAAAATCTGATGGCCTCACACTTTCATATCCCTAAACTATACCAGCAAGATTATG 2160 ............................................................ ............................................................ 2161 TCCTGAATGAATTAATGTTATCAAATGGTAAAACGACGGAGACACTTCGTAACACATGAA 2220 ............................................................ ............................................................ 2221 TACAGACGAGGTCTATGATTGCAATAACATCCTGTGTCCTACTACTGCATAGTATCAACC 2280 ............................................................ ............................................................ 2281 ACCTCTCGTGTATCTCCATGTTTGTAAGTCATTTCGATCTAGGATGAACAGCAAGCAGAT 2340 ............................................................ ............................................................ 2341 TTTTTCACTGCAGAGACATCATCTTTGCCACCCATATTGATGGTCTGCCCCTTTGGAGGA 2400 ............................................................ ............................................................ 2401 GCAGCAGGATCGTCGCCGATGTCGAGAGCTTTCTTGCTCACTACATGATATATCTGGGTG 2460 ............................................................ ............................................................ 2461 AGCACTTCAGTGAAAGCATTCTCCACATTCATCGACTCAAGGGCAGACGTCTCCATAAAG 2520 ............................................................ ............................................................ 2521 TAAGTGTTTTCTTTCTCAGCAAATGCTTTCGCATCCTCGGTTGAGACAGCTCTAAGGTGG 2580 ............................................................ ............................................................ 2581 CGCAGATCCGCCTTGTTCCCCACAAGCATGATCACGATGTTAGCGTCCGTGTGATCCTTG 2640 ............................................................ ............................................................ 2641 AGCTCCCTCATCCACCTCTCCACATTCTCAAAGGTGACATGCCGCGTGACATCATAGACA 2700 ............................................................ ............................................................ 2701 ACGAGCGCTCCTACTGCTCCGCGATAGTAGGCACTTGTGATAGCTCGATATCTACAGAAG 2760 ............................................................ ............................................................ 2761 CAACACAAGATAACGATCATTTGCTATGCAGGAGCGAGACAGCTAGTTAATAAACAGCAA 2820 ............................................................ ............................................................ 2821 AAGCGCATGAGACATCATTCCATCAAACAGAGAATATAATAATGTACTGTAACTCCATCA 2880 ............................................................ ............................................................ 2881 AATTTAACTATTTCGCACATGGCATTAGCTATAACCTTTTTCCCCA 2926 .............................................. 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