Leersia perrieri (Lperr_V1.4) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 5: 16,884,244-16,890,960 forward strand.
This transcript has 10 exons and is annotated with 12 domains and features.
This transcript is a product of gene LPERR05G18200 Show transcript tableHide transcript table
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1 AACACAGGGAATGACATAACACAAAACAGCTAGTATGCTGTCCAGACGGGATGAGACGAC 60 ............................................................ ............................................................ 61 CGATTAGAAAAAACTTGACCAAACTGTACCGACTACCGACTCGCCGAACACAAACACAAC 120 ............................................................ ............................................................ 121 AGGGCACGCTACTAGCTAGCCGTCTGGCTCTCGAGCTTCCACTCCCAAAAGAAAAAATAA 180 ............................................................ ............................................................ 181 AAATCCACCTCGATATCAAACCCAATTCCATCTCTCTCGGCCCCCCTCGCCGCGCTCCCC 240 ............................................................ ............................................................ 241 GCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGTCCTCCTCGATTCGAGGTGCAGTGCCGCCGTCGCCGCA 300 ............................................................ ............................................................ 301 GCTCCGGCATCCGCGCGCCGTGCGCAGAAGGCCCCGTGGGGATCGCCAATTCCTCCACAC 360 ............................................................ ............................................................ 361 ACACACGGTGGCCAATCCTCCGCGGCGCGCGCTGGTGGGCGATGCGATCGGATGAGGTGT 420 ............................................................ ............................................................ 421 TGGCGACGGCGGCGGCGCAACGTGGAGAGGAGGAGGAGGAGCTACCCCGAGGCGGCGCCC 480 ............................................................ ............................................................ 481 CCGCGCCTAGCAGGAGGAGCCGGTGATGTCGCCCGCCGTGCAGCCGCCGCCGTCGTCCCC 540 .........................ATGTCGCCCGCCGTGCAGCCGCCGCCGTCGTCCCC 35 .........................-M--S--P--A--V--Q--P--P--P--S--S--P 12 541 GCCCCCACCGCCGCGGCGGCCCCGCTCGGGGCCTCCACCCGGGCTGAAGAATCTAGGCAA 600 36 GCCCCCACCGCCGCGGCGGCCCCGCTCGGGGCCTCCACCCGGGCTGAAGAATCTAGGCAA 95 12 --P--P--P--P--R--R--P--R--S--G--P--P--P--G--L--K--N--L--G--N 32 601 TACCTGCTACCTCAACAGCGTGCTGCAGTGCCTCGCGTCGACCCCTCCCCTCGCTACCTT 660 96 TACCTGCTACCTCAACAGCGTGCTGCAGTGCCTCGCGTCGACCCCTCCCCTCGCTACCTT 155 32 --T--C--Y--L--N--S--V--L--Q--C--L--A--S--T--P--P--L--A--T--F 52 661 CTGCCTCTCGCTCCGGCACTCCAATCTGTGCAAGAGGGTGTTGCCGAACAAGGAGAAGGA 720 156 CTGCCTCTCGCTCCGGCACTCCAATCTGTGCAAGAGGGTGTTGCCGAACAAGGAGAAGGA 215 52 --C--L--S--L--R--H--S--N--L--C--K--R--V--L--P--N--K--E--K--E 72 721 GTGTGCGTTCTGTGTGTTCGAACGGCAGATCTGGCGTCTGCTTCGGACAGAAGCAGGGGC 780 216 GTGTGCGTTCTGTGTGTTCGAACGGCAGATCTGGCGTCTGCTTCGGACAGAAGCAGGGGC 275 72 --C--A--F--C--V--F--E--R--Q--I--W--R--L--L--R--T--E--A--G--A 92 781 GCTAGACTCGCCGGGGAAGATCATACGCTGCCTGCCGCTCTTTGCCGAGAACTTCCGGTG 840 276 GCTAGACTCGCCGGGGAAGATCATACGCTGCCTGCCGCTCTTTGCCGAGAACTTCCGGTG 335 92 --L--D--S--P--G--K--I--I--R--C--L--P--L--F--A--E--N--F--R--W 112 841 GGGGCGCCAGGAGGACGCGCACGAGTTCCTCCGCTATGTTATAGACGCTTGCCACACGGC 900 336 GGGGCGCCAGGAGGACGCGCACGAGTTCCTCCGCTATGTTATAGACGCTTGCCACACGGC 395 112 --G--R--Q--E--D--A--H--E--F--L--R--Y--V--I--D--A--C--H--T--A 132 901 TGGTCTCCGCATGCGCAAGCGGCTCCATGCGGCAAACGCCAATGGAGATGTTGGCGAGGA 960 396 TGGTCTCCGCATGCGCAAGCGGCTCCATGCGGCAAACGCCAATGGAGATGTTGGCGAGGA 455 132 --G--L--R--M--R--K--R--L--H--A--A--N--A--N--G--D--V--G--E--E 152 961 GGAGGGCCGGCCATGTATGGTGATGAAGGAGACGTTTGGTGGCGCGCTGCTAAGCCAAGT 1020 456 GGAGGGCCGGCCATGTATGGTGATGAAGGAGACGTTTGGTGGCGCGCTGCTAAGCCAAGT 515 152 --E--G--R--P--C--M--V--M--K--E--T--F--G--G--A--L--L--S--Q--V 172 1021 GAAGTGCATCAGCTGCAAGGGAGAGTCAAACAAGACCGACGAAATAATGGATATCAGCCT 1080 516 GAAGTGCATCAGCTGCAAGGGAGAGTCAAACAAGACCGACGAAATAATGGATATCAGCCT 575 172 --K--C--I--S--C--K--G--E--S--N--K--T--D--E--I--M--D--I--S--L 192 1081 TGATCTGCCCGGAAGCAATTCCGTTGCTGATGCGCTTGCCCGTTATTTTCAGCCTGAGAT 1140 576 TGATCTGCCCGGAAGCAATTCCGTTGCTGATGCGCTTGCCCGTTATTTTCAGCCTGAGAT 635 192 --D--L--P--G--S--N--S--V--A--D--A--L--A--R--Y--F--Q--P--E--I 212 1141 ATTGGAGGGTGCGAACAAGTATAGCTGCGAAAGCAACCATATGCATTCGTCACAGTGGTA 1200 636 ATTGGAGGGTGCGAACAAGTATAGCTGCGAAAGCAACCATATGCATTCGTCACAGTGGTA 695 212 --L--E--G--A--N--K--Y--S--C--E--S--N--H--M--H--S--S--Q--W--Y 232 1201 CACTGACTTTTCACAAAGGGAAAAGTGCAAGAAGCTTACTTCTGCACGAAAGCAAATGTT 1260 696 CACTGACTTTTCACAAAGGGAAAAGTGCAAGAAGCTTACTTCTGCACGAAAGCAAATGTT 755 232 --T--D--F--S--Q--R--E--K--C--K--K--L--T--S--A--R--K--Q--M--F 252 1261 TATACTCAAAGCACCTAAGGTGCTTGTCATACAACTCAAGAGGTTTGAGGGAATAAATGG 1320 756 TATACTCAAAGCACCTAAGGTGCTTGTCATACAACTCAAGAGGTTTGAGGGAATAAATGG 815 252 --I--L--K--A--P--K--V--L--V--I--Q--L--K--R--F--E--G--I--N--G 272 1321 TGGAAAGATCAACAGGAGCATTGAATTTAAGGAGGCTCTCTTTCTTTCTGACTACATGTA 1380 816 TGGAAAGATCAACAGGAGCATTGAATTTAAGGAGGCTCTCTTTCTTTCTGACTACATGTA 875 272 --G--K--I--N--R--S--I--E--F--K--E--A--L--F--L--S--D--Y--M--Y 292 1381 TAATAAAAACCAGGATTCACTGCCAGTATATAATCTTTTTGGCAGTATTGTTCACTCAGG 1440 876 TAATAAAAACCAGGATTCACTGCCAGTATATAATCTTTTTGGCAGTATTGTTCACTCAGG 935 292 --N--K--N--Q--D--S--L--P--V--Y--N--L--F--G--S--I--V--H--S--G 312 1441 GTTCTCTCCAGATTCTGGTCACTACTATGCATATGTTAAGGATGCGGTTGGTCGCTGGTA 1500 936 GTTCTCTCCAGATTCTGGTCACTACTATGCATATGTTAAGGATGCGGTTGGTCGCTGGTA 995 312 --F--S--P--D--S--G--H--Y--Y--A--Y--V--K--D--A--V--G--R--W--Y 332 1501 TTGTTGTAATGATTCCCATATATCCCCCTCAAGCTCTCAGGATGTTCTATCTGAGAAGGT 1560 996 TTGTTGTAATGATTCCCATATATCCCCCTCAAGCTCTCAGGATGTTCTATCTGAGAAGGT 1055 332 --C--C--N--D--S--H--I--S--P--S--S--S--Q--D--V--L--S--E--K--V 352 1561 CTATATCCTATTCTATATTCTGAGTACCAAAACTCAAAAGCCTGGTACAAATGGTTACTC 1620 1056 CTATATCCTATTCTATATTCTGAGTACCAAAACTCAAAAGCCTGGTACAAATGGTTACTC 1115 352 --Y--I--L--F--Y--I--L--S--T--K--T--Q--K--P--G--T--N--G--Y--S 372 1621 TTCTAGTGCAGCTAAATCTTCCAACAGCAATGGAAATGGCATATCAAATGCTACGTCTAA 1680 1116 TTCTAGTGCAGCTAAATCTTCCAACAGCAATGGAAATGGCATATCAAATGCTACGTCTAA 1175 372 --S--S--A--A--K--S--S--N--S--N--G--N--G--I--S--N--A--T--S--N 392 1681 TGATCCCCTGAAAACACCACTAGTAAAACAGAATGGATTATGTTCTACTAAAGGTATTGC 1740 1176 TGATCCCCTGAAAACACCACTAGTAAAACAGAATGGATTATGTTCTACTAAAGGTATTGC 1235 392 --D--P--L--K--T--P--L--V--K--Q--N--G--L--C--S--T--K--G--I--A 412 1741 ACCGCCATCTGTGAAGAATGGCAAGATTGCACCAGGTCTGCATATCAAACCAATCCACTT 1800 1236 ACCGCCATCTGTGAAGAATGGCAAGATTGCACCAGGTCTGCATATCAAACCAATCCACTT 1295 412 --P--P--S--V--K--N--G--K--I--A--P--G--L--H--I--K--P--I--H--L 432 1801 AAAGAATAATGGAACAGAGAAAGTTACATCAAATGGCAAGGCAAACAACGTTCTGGGAAA 1860 1296 AAAGAATAATGGAACAGAGAAAGTTACATCAAATGGCAAGGCAAACAACGTTCTGGGAAA 1355 432 --K--N--N--G--T--E--K--V--T--S--N--G--K--A--N--N--V--L--G--N 452 1861 TAAGCTAGAAGTTAATGAGGGTTTAACACTGCCATCAATTGATGGACATGAGTCTGGAAA 1920 1356 TAAGCTAGAAGTTAATGAGGGTTTAACACTGCCATCAATTGATGGACATGAGTCTGGAAA 1415 452 --K--L--E--V--N--E--G--L--T--L--P--S--I--D--G--H--E--S--G--K 472 1921 ATCTGCAGAACCCAGTAAAATTAATGCTAACGGTAGTATTTCATGCAATAAGATGGATGC 1980 1416 ATCTGCAGAACCCAGTAAAATTAATGCTAACGGTAGTATTTCATGCAATAAGATGGATGC 1475 472 --S--A--E--P--S--K--I--N--A--N--G--S--I--S--C--N--K--M--D--A 492 1981 CAATTCAAAGAGTATGTTACACAGTGTGAATGGAAATGGAAATTCAATTCACTTCACCGA 2040 1476 CAATTCAAAGAGTATGTTACACAGTGTGAATGGAAATGGAAATTCAATTCACTTCACCGA 1535 492 --N--S--K--S--M--L--H--S--V--N--G--N--G--N--S--I--H--F--T--D 512 2041 TCTTCAAGAGACCACTGATGCTAAGTCTACATATGCTGAGCAGTATTCTGAGAAGTCATC 2100 1536 TCTTCAAGAGACCACTGATGCTAAGTCTACATATGCTGAGCAGTATTCTGAGAAGTCATC 1595 512 --L--Q--E--T--T--D--A--K--S--T--Y--A--E--Q--Y--S--E--K--S--S 532 2101 GATTGCCAGTTTGGAGAATTCTAAAAGTACTGTTTCACACCATGAAGTCTCTGTAGACAT 2160 1596 GATTGCCAGTTTGGAGAATTCTAAAAGTACTGTTTCACACCATGAAGTCTCTGTAGACAT 1655 532 --I--A--S--L--E--N--S--K--S--T--V--S--H--H--E--V--S--V--D--I 552 2161 AGTAAAGGATGTGGTTTCTTCAGGTAAGGACAGTGCTTCGTTCAAGCATCGTCGTGAAGA 2220 1656 AGTAAAGGATGTGGTTTCTTCAGGTAAGGACAGTGCTTCGTTCAAGCATCGTCGTGAAGA 1715 552 --V--K--D--V--V--S--S--G--K--D--S--A--S--F--K--H--R--R--E--E 572 2221 AGGGGAGTTTAAGGAAATGCTTGGTAAATCAGCATCTTCAGAGCTTCGCTTGTCTGGTTG 2280 1716 AGGGGAGTTTAAGGAAATGCTTGGTAAATCAGCATCTTCAGAGCTTCGCTTGTCTGGTTG 1775 572 --G--E--F--K--E--M--L--G--K--S--A--S--S--E--L--R--L--S--G--W 592 2281 GGTGGATGACGTCTACAATTTCATGCGCACTACAAAGAGACAGCGTGTGCAAACTATGGG 2340 1776 GGTGGATGACGTCTACAATTTCATGCGCACTACAAAGAGACAGCGTGTGCAAACTATGGG 1835 592 --V--D--D--V--Y--N--F--M--R--T--T--K--R--Q--R--V--Q--T--M--G 612 2341 CATGCCTCAAGATAGTGACACAATGAGAAAGGAGCTAGTAAGTGAAGCTGGAAAAATATT 2400 1836 CATGCCTCAAGATAGTGACACAATGAGAAAGGAGCTAGTAAGTGAAGCTGGAAAAATATT 1895 612 --M--P--Q--D--S--D--T--M--R--K--E--L--V--S--E--A--G--K--I--F 632 2401 TAGGGCAAAAATTCCAGAGCCGCTGAGGGAACATCTGATTCAAGACCTGCGGTCGTACTT 2460 1896 TAGGGCAAAAATTCCAGAGCCGCTGAGGGAACATCTGATTCAAGACCTGCGGTCGTACTT 1955 632 --R--A--K--I--P--E--P--L--R--E--H--L--I--Q--D--L--R--S--Y--F 652 2461 TGTGGACAATTTTTGATTGGGAGCATAAATTTTGTGCAGAAGTTCATCAAAGACAGAGAA 2520 1956 TGTGGACAATTTTTGA............................................ 1971 652 --V--D--N--F--*-............................................ 656 2521 AATGTATCTGTATTTGCCATTTTGTAGAAAGATAATCTTATGGTGGATGTATGTTTCATG 2580 ............................................................ ............................................................ 2581 TGGTTATGTCTGCTCCGGTTCAATGGAATCTTGTTGGTCAACTACCAGTTCCTTGTGCGG 2640 ............................................................ ............................................................ 2641 CTTAATTTTTGAGGCATTTTTGTTAATCAAGATGAGGTTGAGACGTAGAGTGGCCAAATT 2700 ............................................................ ............................................................ 2701 ATATGTAAAGTATTTATCTTCTTTTTGCTGTTGCTCCTGGTTTTATAGGTTTAAACAACA 2760 ............................................................ ............................................................ 2761 CCAACAACCCCCATTCCTTTCTTTCTTTCTTTCCAGAATGTACTGTAGAAGATTATTTTC 2820 ............................................................ ............................................................ 2821 CCCTTCTGTACAATAATAGTTCATAGATTAGTGCATGACTGTATGGGGTTTTGAGCTTTT 2880 ............................................................ ............................................................ 2881 ACTGAAGAAAAACCCGTTCCAAAATTAGGGTGCATTATACAGAACTGCAGGTAAGTTCTG 2940 ............................................................ ............................................................ 2941 AATTTAAATTATCCAAAAGTAACCTGTCATCTGGACAATTAGACTAAAAGTTTCGTGCCA 3000 ............................................................ ............................................................ 3001 TTGAGCTAGGACAAGTGTAACATAGCATGCCATCCAAACAGAAACAGGCCTAATATATAG 3060 ............................................................ ............................................................ 3061 TATATTTTTTTGTGCTCGTTCAGTTTTGAAATTTGTTACATGACATCACAACACCATCCC 3120 ............................................................ ............................................................ 3121 ATACCATTGCTTTGATTCTACTCCGTTAGAACATTTGAATATTTGTGTTGGTCGATGCGT 3180 ............................................................ ............................................................ 3181 GCTGAGGATAAGATAGCATCGAAAATGAAAAGGAAAGTAGAACAAGAACAGAGCAAAAAT 3240 ............................................................ ............................................................ 3241 GTAAAAAGGGGTGGTTCATGTTAGCTTGTCGCTT 3274 .................................. ..................................
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