Transcript: LPERR05G10760.1
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- LPERR05G10760.1 1080 359aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D9WFN8 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG AGC TCC TCC GCC GCG TCG GCG TCG GAG AAG AAG AAG AAG AAA AAG GCG GCG ACG ACG 60
1 ATGAGCTCCTCCGCCGCGTCGGCGTCGGAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGGCGGCGACGACG 60
1 -M--S--S--S--A--A--S--A--S--E--K--K--K--K--K--K--A--A--T--T- 20
61 GAG GAG GAG GGC GGC GAC GGC GGC GGC GGC GGC TCG TCC TCG TCG TCG GCG TCG CCG CTG 120
61 GAGGAGGAGGGCGGCGACGGCGGCGGCGGCGGCTCGTCCTCGTCGTCGGCGTCGCCGCTG 120
21 -E--E--E--G--G--D--G--G--G--G--G--S--S--S--S--S--A--S--P--L- 40
121 TGG CTG CTT GCG GAC GAC GTG CTG CTC CAG ATC CTG GGG CGG CTG GAG GGC GAC CCA CGC 180
121 TGGCTGCTTGCGGACGACGTGCTGCTCCAGATCCTGGGGCGGCTGGAGGGCGACCCACGC 180
41 -W--L--L--A--D--D--V--L--L--Q--I--L--G--R--L--E--G--D--P--R- 60
181 GAC TGG GCG CGG GCA TCC TGC GCC TCC CCG CGC CTC GCC GCG CTC CTC CGC GGC GCC TGC 240
181 GACTGGGCGCGGGCATCCTGCGCCTCCCCGCGCCTCGCCGCGCTCCTCCGCGGCGCCTGC 240
61 -D--W--A--R--A--S--C--A--S--P--R--L--A--A--L--L--R--G--A--C- 80
241 CTA CCT CCG CGC CTC ACC CGC GCC CTC CCC GCC GAG CTC CTC CCG GCG CCG GCG CCC GAC 300
241 CTACCTCCGCGCCTCACCCGCGCCCTCCCCGCCGAGCTCCTCCCGGCGCCGGCGCCCGAC 300
81 -L--P--P--R--L--T--R--A--L--P--A--E--L--L--P--A--P--A--P--D- 100
301 GGG GCG CCA AGG GCA TGG GCC GCC CTC CAC AAG CTC TCC GTC TGC TGC CCC GGC CTC CTC 360
301 GGGGCGCCAAGGGCATGGGCCGCCCTCCACAAGCTCTCCGTCTGCTGCCCCGGCCTCCTC 360
101 -G--A--P--R--A--W--A--A--L--H--K--L--S--V--C--C--P--G--L--L- 120
361 CGC GCC GGC GTC CTC CTC CAT CCC CCC GAC GAC CTC GGC CTC GAG CTC GAC ATC GGC CCC 420
361 CGCGCCGGCGTCCTCCTCCATCCCCCCGACGACCTCGGCCTCGAGCTCGACATCGGCCCC 420
121 -R--A--G--V--L--L--H--P--P--D--D--L--G--L--E--L--D--I--G--P- 140
421 AAT CTC CCC TCC ATC AAC CAC ACC CAC ATC CCC TCC TCC TCC CCT TCC TCC TCC ACC GCC 480
421 AATCTCCCCTCCATCAACCACACCCACATCCCCTCCTCCTCCCCTTCCTCCTCCACCGCC 480
141 -N--L--P--S--I--N--H--T--H--I--P--S--S--S--P--S--S--S--T--A- 160
481 ACC TCC GCC GCG AAG AGA TCC CTC GAT TCC GAT CCC GAT CCC CAC ACG TGG TCC CTC TAC 540
481 ACCTCCGCCGCGAAGAGATCCCTCGATTCCGATCCCGATCCCCACACGTGGTCCCTCTAC 540
161 -T--S--A--A--K--R--S--L--D--S--D--P--D--P--H--T--W--S--L--Y- 180
541 GAC GAC CTC TAC CTC GAC GCC GCC TAC GAT TCC CCT TCC TCC TCC TCT GAT CCC CCT CCT 600
541 GACGACCTCTACCTCGACGCCGCCTACGATTCCCCTTCCTCCTCCTCTGATCCCCCTCCT 600
181 -D--D--L--Y--L--D--A--A--Y--D--S--P--S--S--S--S--D--P--P--P- 200
601 CCC CCT CCG CCG CAG ATC CAA CCC CCC GCC GCC GAC GAG ACG CCG CCG CCG CCG AGG AGG 660
601 CCCCCTCCGCCGCAGATCCAACCCCCCGCCGCCGACGAGACGCCGCCGCCGCCGAGGAGG 660
201 -P--P--P--P--Q--I--Q--P--P--A--A--D--E--T--P--P--P--P--R--R- 220
661 AGG AGA GAT CGG AGG TGG GTG GGG ACG GTG GGG GCG CAC CTG GCG ACG GGG GCG TGG ACG 720
661 AGGAGAGATCGGAGGTGGGTGGGGACGGTGGGGGCGCACCTGGCGACGGGGGCGTGGACG 720
221 -R--R--D--R--R--W--V--G--T--V--G--A--H--L--A--T--G--A--W--T- 240
721 CTG AGC AGG GAG CAG GGG AAC AAG CTG CTG GCG AGC AGG TTC CGC GGC GAC GCG CTC TAC 780
721 CTGAGCAGGGAGCAGGGGAACAAGCTGCTGGCGAGCAGGTTCCGCGGCGACGCGCTCTAC 780
241 -L--S--R--E--Q--G--N--K--L--L--A--S--R--F--R--G--D--A--L--Y- 260
781 ATC TGC GAC TGG CCG GGA TGC GTG CAC GCG GAG GAG CGG CGC AAG TAC ATG GTG TTC CGC 840
781 ATCTGCGACTGGCCGGGATGCGTGCACGCGGAGGAGCGGCGCAAGTACATGGTGTTCCGC 840
261 -I--C--D--W--P--G--C--V--H--A--E--E--R--R--K--Y--M--V--F--R- 280
841 GGC GTG TTC CGC GAC TTC CCG AGG TCG CAG GTG CGC CGC GCG CTC CGC GAC ACG CGC CAC 900
841 GGCGTGTTCCGCGACTTCCCGAGGTCGCAGGTGCGCCGCGCGCTCCGCGACACGCGCCAC 900
281 -G--V--F--R--D--F--P--R--S--Q--V--R--R--A--L--R--D--T--R--H- 300
901 CCC GCC GTC GCC GTC GAC TGC GCC TTC TGC GGC AGC GCC CGC GCA TGG GAC CTC TAC TCC 960
901 CCCGCCGTCGCCGTCGACTGCGCCTTCTGCGGCAGCGCCCGCGCATGGGACCTCTACTCC 960
301 -P--A--V--A--V--D--C--A--F--C--G--S--A--R--A--W--D--L--Y--S- 320
961 GCC TTC TGC CTC CGC AGC TTC TAC GGC TAC CAC GAC GAC GGC GAG CCC GTT GTC CGC GCA 1020
961 GCCTTCTGCCTCCGCAGCTTCTACGGCTACCACGACGACGGCGAGCCCGTTGTCCGCGCA 1020
321 -A--F--C--L--R--S--F--Y--G--Y--H--D--D--G--E--P--V--V--R--A- 340
1021 TAC GTC TGC GAG AAC GGC CAC GTC GCC GGC GCG TGG ACC GAG CGC CCC CTC TAC TCC TGA 1080
1021 TACGTCTGCGAGAACGGCCACGTCGCCGGCGCGTGGACCGAGCGCCCCCTCTACTCCTGA 1080
341 -Y--V--C--E--N--G--H--V--A--G--A--W--T--E--R--P--L--Y--S--*- 359
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