Transcript: LPERR03G06650.1
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- LPERR03G06650.1 1779 592aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D9VQU6 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - LPERR03G06650.2 1776 591aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D9VQU7 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GGG AAG AAG CAG CAC AGC AAG GAC CGG ATG TTC ATC ACG CGG ACG GAG TGG GCG ACG 60
1 ATGGGGAAGAAGCAGCACAGCAAGGACCGGATGTTCATCACGCGGACGGAGTGGGCGACG 60
1 -M--G--K--K--Q--H--S--K--D--R--M--F--I--T--R--T--E--W--A--T- 20
61 GAG TGG GGC GGC GCC AAG CAG AAG GAG GCC GGC ACG CCC TTC AAG CGC CTT CCC TTC TAC 120
61 GAGTGGGGCGGCGCCAAGCAGAAGGAGGCCGGCACGCCCTTCAAGCGCCTTCCCTTCTAC 120
21 -E--W--G--G--A--K--Q--K--E--A--G--T--P--F--K--R--L--P--F--Y- 40
121 TGC TGC GC G CTT ACA TTT TTA CCA TTT GAG GAT CCG GTG TGC ACA GCA GAT GGA AGC GTC 180
121 TGCTGCGCGCTTACATTTTTACCATTTGAGGATCCGGTGTGCACAGCAGATGGAAGCGTC 180
41 -C--C--A--L--T--F--L--P--F--E--D--P--V--C--T--A--D--G--S--V- 60
181 TTC GAT TTG AT G AGC ATA GTT CCG TAC ATT AAG AAG TTC GGA AAG CAT CCA GTA ACA GGA 240
181 TTCGATTTGATGAGCATAGTTCCGTACATTAAGAAGTTCGGAAAGCATCCAGTAACAGGA 240
61 -F--D--L--M--S--I--V--P--Y--I--K--K--F--G--K--H--P--V--T--G- 80
241 GCA CCC CTC AAG CAG GAA GAT CTA ATG CCT TTA ACA TTC CAC AAG AAC TCG GAC G GG GAG 300
241 GCACCCCTCAAGCAGGAAGATCTAATGCCTTTAACATTCCACAAGAACTCGGACGGGGAG 300
81 -A--P--L--K--Q--E--D--L--M--P--L--T--F--H--K--N--S--D--G--E- 100
301 TTC CAG TGC CCT GTT TTG AAT AAA GTT TTT ACA GAA TTC ACG CAT ATA GTT GCT GTA AAG 360
301 TTCCAGTGCCCTGTTTTGAATAAAGTTTTTACAGAATTCACGCATATAGTTGCTGTAAAG 360
101 -F--Q--C--P--V--L--N--K--V--F--T--E--F--T--H--I--V--A--V--K- 120
361 ACT ACT GGG AAT GTC TTC TGT TAT GAG GCA ATC CAA GAA CTT AAC ATT AAG CCA AAG AAT 420
361 ACTACTGGGAATGTCTTCTGTTATGAGGCAATCCAAGAACTTAACATTAAGCCAAAGAAT 420
121 -T--T--G--N--V--F--C--Y--E--A--I--Q--E--L--N--I--K--P--K--N- 140
421 TGG AGA GAG TTG CTA ACT GAT GAG CCA TTC TCT CGA GAT GAC TTG ATA ACA ATT CAG AAC 480
421 TGGAGAGAGTTGCTAACTGATGAGCCATTCTCTCGAGATGACTTGATAACAATTCAGAAC 480
141 -W--R--E--L--L--T--D--E--P--F--S--R--D--D--L--I--T--I--Q--N- 160
481 CCA AAT GCG GTT GAT AGC AAG ATC TTG GGT GAA TTT GAC CAT GTC AAG AAA GGC CTC AAA 540
481 CCAAATGCGGTTGATAGCAAGATCTTGGGTGAATTTGACCATGTCAAGAAAGGCCTCAAA 540
161 -P--N--A--V--D--S--K--I--L--G--E--F--D--H--V--K--K--G--L--K- 180
541 CTT GAA GAT GAA G A G TTG CAA CGG ATG AAG GAT GAT CCA ACC TAC AAC ATA AAT ATT TCT 600
541 CTTGAAGATGAAGAGTTGCAACGGATGAAGGATGATCCAACCTACAACATAAATATTTCT 600
181 -L--E--D--E--E--L--Q--R--M--K--D--D--P--T--Y--N--I--N--I--S- 200
601 GGT GAT CTT AAG CAA ATG ATT AAG GAA CTT GGA ACT GAA AAG GGA AAG CTA GCC TTT TTG 660
601 GGTGATCTTAAGCAAATGATTAAGGAACTTGGAACTGAAAAGGGAAAGCTAGCCTTTTTG 660
201 -G--D--L--K--Q--M--I--K--E--L--G--T--E--K--G--K--L--A--F--L- 220
661 CAT GGT GGG GGA GGG CAG AAA GCT CAA AAG GAA AGA GCC GCT GCA CTT GCT GCT ATA TTA 720
661 CATGGTGGGGGAGGGCAGAAAGCTCAAAAGGAAAGAGCCGCTGCACTTGCTGCTATATTA 720
221 -H--G--G--G--G--Q--K--A--Q--K--E--R--A--A--A--L--A--A--I--L- 240
721 GCG AAG AAG GAG AAG GAT GAC TCA GAA TCT AGC AAA GAA CCT AAA CCT CAT CAA ACT TTC 780
721 GCGAAGAAGGAGAAGGATGACTCAGAATCTAGCAAAGAACCTAAACCTCATCAAACTTTC 780
241 -A--K--K--E--K--D--D--S--E--S--S--K--E--P--K--P--H--Q--T--F- 260
781 AGT ATT GTA GAT GCT GCT TCT GCT TCT GTT CAT GGC AGA AGC GCA GCC GCA GCA AAG GCT 840
781 AGTATTGTAGATGCTGCTTCTGCTTCTGTTCATGGCAGAAGCGCAGCCGCAGCAAAGGCT 840
261 -S--I--V--D--A--A--S--A--S--V--H--G--R--S--A--A--A--A--K--A- 280
841 ACT ACT GCT GAG AAA ACA GCT GCC AGA ATC GCA ATG CAC ATG GCA GGA GAT CGA GCT CCT 900
841 ACTACTGCTGAGAAAACAGCTGCCAGAATCGCAATGCACATGGCAGGAGATCGAGCTCCT 900
281 -T--T--A--E--K--T--A--A--R--I--A--M--H--M--A--G--D--R--A--P- 300
901 GTG AAT GCT AAA CTG GTT AAA AGC CGT TAC ACC ACG GGA GCA GCT TCA CGT TCT TTC ACA 960
901 GTGAATGCTAAACTGGTTAAAAGCCGTTACACCACGGGAGCAGCTTCACGTTCTTTCACA 960
301 -V--N--A--K--L--V--K--S--R--Y--T--T--G--A--A--S--R--S--F--T- 320
961 TCA ACT GCC TAC GAT CCT GTC ACC AAA AAT GAA TTT GAG TAT GTT AAG GTT GAA AAG AAC 1020
961 TCAACTGCCTACGATCCTGTCACCAAAAATGAATTTGAGTATGTTAAGGTTGAAAAGAAC 1020
321 -S--T--A--Y--D--P--V--T--K--N--E--F--E--Y--V--K--V--E--K--N- 340
1021 CCA AAA AAG AAG GGA TAT GTT CAG TTG CAT ACC ACC CAC GGT GAT TTG AAT TTG GAG CTT 1080
1021 CCAAAAAAGAAGGGATATGTTCAGTTGCATACCACCCACGGTGATTTGAATTTGGAGCTT 1080
341 -P--K--K--K--G--Y--V--Q--L--H--T--T--H--G--D--L--N--L--E--L- 360
1081 CAT TGT GAT ATA ACA CCA CGG ACA TGT GAA AAT TTT CTA ACA CAT TGT GAA AAT GGC TAC 1140
1081 CATTGTGATATAACACCACGGACATGTGAAAATTTTCTAACACATTGTGAAAATGGCTAC 1140
361 -H--C--D--I--T--P--R--T--C--E--N--F--L--T--H--C--E--N--G--Y- 380
1141 TAT AAT GGT CTT ATC TTC CAT CGT AGT ATC AA A AAT TTC ATG ATT CAA GGA GGT GAT CCA 1200
1141 TATAATGGTCTTATCTTCCATCGTAGTATCAAAAATTTCATGATTCAAGGAGGTGATCCA 1200
381 -Y--N--G--L--I--F--H--R--S--I--K--N--F--M--I--Q--G--G--D--P- 400
1201 ACT GGC ACA GGA AGT GGA GGG GAG TCC ATA TGG GGT AAA CCT TTC AAG GAC GAA CTA AAT 1260
1201 ACTGGCACAGGAAGTGGAGGGGAGTCCATATGGGGTAAACCTTTCAAGGACGAACTAAAT 1260
401 -T--G--T--G--S--G--G--E--S--I--W--G--K--P--F--K--D--E--L--N- 420
1261 TCA AAA CTT GTA CAT TCA GGA AGA GGT GTT GTC AGC ATG GCT AAT TCT GGC CCT CAT ACC 1320
1261 TCAAAACTTGTACATTCAGGAAGAGGTGTTGTCAGCATGGCTAATTCTGGCCCTCATACC 1320
421 -S--K--L--V--H--S--G--R--G--V--V--S--M--A--N--S--G--P--H--T- 440
1321 AAT GGG TCC CAG TTT TTC ATC TTG TAT AAG TCT GCA CCA CAT TTG AAT TTC AAG CAT ACA 1380
1321 AATGGGTCCCAGTTTTTCATCTTGTATAAGTCTGCACCACATTTGAATTTCAAGCATACA 1380
441 -N--G--S--Q--F--F--I--L--Y--K--S--A--P--H--L--N--F--K--H--T- 460
1381 GTA TTT GGC ATG GTG GTT GGT GGC TTA ACC ACT CTT TCA GCT ATG GAA AAG GTT CCT GTT 1440
1381 GTATTTGGCATGGTGGTTGGTGGCTTAACCACTCTTTCAGCTATGGAAAAGGTTCCTGTT 1440
461 -V--F--G--M--V--V--G--G--L--T--T--L--S--A--M--E--K--V--P--V- 480
1441 GAT GAT GAT GAC CGG CCA TTG GAG GAA ATA AAG ATA TTA AAA GTA AGT ATA TTT GTG AAC 1500
1441 GATGATGATGACCGGCCATTGGAGGAAATAAAGATATTAAAAGTAAGTATATTTGTGAAC 1500
481 -D--D--D--D--R--P--L--E--E--I--K--I--L--K--V--S--I--F--V--N- 500
1501 CCT TAC ACG GAA CCA GAT GAA GAA GAA GAA GAA AAG GCA AAG GAA GAG GAG AAG AAA AAG 1560
1501 CCTTACACGGAACCAGATGAAGAAGAAGAAGAAAAGGCAAAGGAAGAGGAGAAGAAAAAG 1560
501 -P--Y--T--E--P--D--E--E--E--E--E--K--A--K--E--E--E--K--K--K- 520
1561 GAC GAG GAT TAT G AT AAG GTG GGA TCG TGG TAT AGC AAT CCA GGC ACT GGT GTT GCT GCT 1620
1561 GACGAGGATTATGATAAGGTGGGATCGTGGTATAGCAATCCAGGCACTGGTGTTGCTGCT 1620
521 -D--E--D--Y--D--K--V--G--S--W--Y--S--N--P--G--T--G--V--A--A- 540
1621 TCA ACC AGC TCT GGT GGT GGT GTT GGC AAG TAT CTA AAA GCT CGG ACA GCT AGC TCT GCT 1680
1621 TCAACCAGCTCTGGTGGTGGTGTTGGCAAGTATCTAAAAGCTCGGACAGCTAGCTCTGCT 1680
541 -S--T--S--S--G--G--G--V--G--K--Y--L--K--A--R--T--A--S--S--A- 560
1681 GAT GTG ATT GGA AAT GCC ATC GCT GCT GAT GAT TCA AAA AAG AAA AGA AAA GCG GAT GTG 1740
1681 GATGTGATTGGAAATGCCATCGCTGCTGATGATTCAAAAAAGAAAAGAAAAGCGGATGTG 1740
561 -D--V--I--G--N--A--I--A--A--D--D--S--K--K--K--R--K--A--D--V- 580
1741 TCG AAC GTA GAA TTT AAA GAT TTC TCT GAG TG G TGT TAA 1779
1741 TCGAACGTAGAATTTAAAGATTTCTCTGAGTGGTGTTAA 1779
581 -S--N--V--E--F--K--D--F--S--E--W--C--*- 592
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