Leersia perrieri (Lperr_V1.4)
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This transcript has 12 exons and is annotated with 26 domains and features.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-LPERR03G06650.11779592aa
 
Protein coding
A0A0D9VQU6 Ensembl Canonical
-LPERR03G06650.21776591aa
 
Protein coding
A0A0D9VQU7 -
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
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Other
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     1 ATGGGGAAGAAGCAGCACAGCAAGGACCGGATGTTCATCACGCGGACGGAGTGGGCGACG     60
     1 ATGGGGAAGAAGCAGCACAGCAAGGACCGGATGTTCATCACGCGGACGGAGTGGGCGACG     60
     1 -M--G--K--K--Q--H--S--K--D--R--M--F--I--T--R--T--E--W--A--T-     20

                                                                          
    61 GAGTGGGGCGGCGCCAAGCAGAAGGAGGCCGGCACGCCCTTCAAGCGCCTTCCCTTCTAC    120
    61 GAGTGGGGCGGCGCCAAGCAGAAGGAGGCCGGCACGCCCTTCAAGCGCCTTCCCTTCTAC    120
    21 -E--W--G--G--A--K--Q--K--E--A--G--T--P--F--K--R--L--P--F--Y-     40

                                                                          
   121 TGCTGCGCGCTTACATTTTTACCATTTGAGGATCCGGTGTGCACAGCAGATGGAAGCGTC    180
   121 TGCTGCGCGCTTACATTTTTACCATTTGAGGATCCGGTGTGCACAGCAGATGGAAGCGTC    180
    41 -C--C--A--L--T--F--L--P--F--E--D--P--V--C--T--A--D--G--S--V-     60

                                                                          
   181 TTCGATTTGATGAGCATAGTTCCGTACATTAAGAAGTTCGGAAAGCATCCAGTAACAGGA    240
   181 TTCGATTTGATGAGCATAGTTCCGTACATTAAGAAGTTCGGAAAGCATCCAGTAACAGGA    240
    61 -F--D--L--M--S--I--V--P--Y--I--K--K--F--G--K--H--P--V--T--G-     80

                                                                          
   241 GCACCCCTCAAGCAGGAAGATCTAATGCCTTTAACATTCCACAAGAACTCGGACGGGGAG    300
   241 GCACCCCTCAAGCAGGAAGATCTAATGCCTTTAACATTCCACAAGAACTCGGACGGGGAG    300
    81 -A--P--L--K--Q--E--D--L--M--P--L--T--F--H--K--N--S--D--G--E-    100

                                                                          
   301 TTCCAGTGCCCTGTTTTGAATAAAGTTTTTACAGAATTCACGCATATAGTTGCTGTAAAG    360
   301 TTCCAGTGCCCTGTTTTGAATAAAGTTTTTACAGAATTCACGCATATAGTTGCTGTAAAG    360
   101 -F--Q--C--P--V--L--N--K--V--F--T--E--F--T--H--I--V--A--V--K-    120

                                                                          
   361 ACTACTGGGAATGTCTTCTGTTATGAGGCAATCCAAGAACTTAACATTAAGCCAAAGAAT    420
   361 ACTACTGGGAATGTCTTCTGTTATGAGGCAATCCAAGAACTTAACATTAAGCCAAAGAAT    420
   121 -T--T--G--N--V--F--C--Y--E--A--I--Q--E--L--N--I--K--P--K--N-    140

                                                                          
   421 TGGAGAGAGTTGCTAACTGATGAGCCATTCTCTCGAGATGACTTGATAACAATTCAGAAC    480
   421 TGGAGAGAGTTGCTAACTGATGAGCCATTCTCTCGAGATGACTTGATAACAATTCAGAAC    480
   141 -W--R--E--L--L--T--D--E--P--F--S--R--D--D--L--I--T--I--Q--N-    160

                                                                          
   481 CCAAATGCGGTTGATAGCAAGATCTTGGGTGAATTTGACCATGTCAAGAAAGGCCTCAAA    540
   481 CCAAATGCGGTTGATAGCAAGATCTTGGGTGAATTTGACCATGTCAAGAAAGGCCTCAAA    540
   161 -P--N--A--V--D--S--K--I--L--G--E--F--D--H--V--K--K--G--L--K-    180

                                                                          
   541 CTTGAAGATGAAGAGTTGCAACGGATGAAGGATGATCCAACCTACAACATAAATATTTCT    600
   541 CTTGAAGATGAAGAGTTGCAACGGATGAAGGATGATCCAACCTACAACATAAATATTTCT    600
   181 -L--E--D--E--E--L--Q--R--M--K--D--D--P--T--Y--N--I--N--I--S-    200

                                                                          
   601 GGTGATCTTAAGCAAATGATTAAGGAACTTGGAACTGAAAAGGGAAAGCTAGCCTTTTTG    660
   601 GGTGATCTTAAGCAAATGATTAAGGAACTTGGAACTGAAAAGGGAAAGCTAGCCTTTTTG    660
   201 -G--D--L--K--Q--M--I--K--E--L--G--T--E--K--G--K--L--A--F--L-    220

                                                                          
   661 CATGGTGGGGGAGGGCAGAAAGCTCAAAAGGAAAGAGCCGCTGCACTTGCTGCTATATTA    720
   661 CATGGTGGGGGAGGGCAGAAAGCTCAAAAGGAAAGAGCCGCTGCACTTGCTGCTATATTA    720
   221 -H--G--G--G--G--Q--K--A--Q--K--E--R--A--A--A--L--A--A--I--L-    240

                                                                          
   721 GCGAAGAAGGAGAAGGATGACTCAGAATCTAGCAAAGAACCTAAACCTCATCAAACTTTC    780
   721 GCGAAGAAGGAGAAGGATGACTCAGAATCTAGCAAAGAACCTAAACCTCATCAAACTTTC    780
   241 -A--K--K--E--K--D--D--S--E--S--S--K--E--P--K--P--H--Q--T--F-    260

                                                                          
   781 AGTATTGTAGATGCTGCTTCTGCTTCTGTTCATGGCAGAAGCGCAGCCGCAGCAAAGGCT    840
   781 AGTATTGTAGATGCTGCTTCTGCTTCTGTTCATGGCAGAAGCGCAGCCGCAGCAAAGGCT    840
   261 -S--I--V--D--A--A--S--A--S--V--H--G--R--S--A--A--A--A--K--A-    280

                                                                          
   841 ACTACTGCTGAGAAAACAGCTGCCAGAATCGCAATGCACATGGCAGGAGATCGAGCTCCT    900
   841 ACTACTGCTGAGAAAACAGCTGCCAGAATCGCAATGCACATGGCAGGAGATCGAGCTCCT    900
   281 -T--T--A--E--K--T--A--A--R--I--A--M--H--M--A--G--D--R--A--P-    300

                                                                          
   901 GTGAATGCTAAACTGGTTAAAAGCCGTTACACCACGGGAGCAGCTTCACGTTCTTTCACA    960
   901 GTGAATGCTAAACTGGTTAAAAGCCGTTACACCACGGGAGCAGCTTCACGTTCTTTCACA    960
   301 -V--N--A--K--L--V--K--S--R--Y--T--T--G--A--A--S--R--S--F--T-    320

                                                                          
   961 TCAACTGCCTACGATCCTGTCACCAAAAATGAATTTGAGTATGTTAAGGTTGAAAAGAAC   1020
   961 TCAACTGCCTACGATCCTGTCACCAAAAATGAATTTGAGTATGTTAAGGTTGAAAAGAAC   1020
   321 -S--T--A--Y--D--P--V--T--K--N--E--F--E--Y--V--K--V--E--K--N-    340

                                                                          
  1021 CCAAAAAAGAAGGGATATGTTCAGTTGCATACCACCCACGGTGATTTGAATTTGGAGCTT   1080
  1021 CCAAAAAAGAAGGGATATGTTCAGTTGCATACCACCCACGGTGATTTGAATTTGGAGCTT   1080
   341 -P--K--K--K--G--Y--V--Q--L--H--T--T--H--G--D--L--N--L--E--L-    360

                                                                          
  1081 CATTGTGATATAACACCACGGACATGTGAAAATTTTCTAACACATTGTGAAAATGGCTAC   1140
  1081 CATTGTGATATAACACCACGGACATGTGAAAATTTTCTAACACATTGTGAAAATGGCTAC   1140
   361 -H--C--D--I--T--P--R--T--C--E--N--F--L--T--H--C--E--N--G--Y-    380

                                                                          
  1141 TATAATGGTCTTATCTTCCATCGTAGTATCAAAAATTTCATGATTCAAGGAGGTGATCCA   1200
  1141 TATAATGGTCTTATCTTCCATCGTAGTATCAAAAATTTCATGATTCAAGGAGGTGATCCA   1200
   381 -Y--N--G--L--I--F--H--R--S--I--K--N--F--M--I--Q--G--G--D--P-    400

                                                                          
  1201 ACTGGCACAGGAAGTGGAGGGGAGTCCATATGGGGTAAACCTTTCAAGGACGAACTAAAT   1260
  1201 ACTGGCACAGGAAGTGGAGGGGAGTCCATATGGGGTAAACCTTTCAAGGACGAACTAAAT   1260
   401 -T--G--T--G--S--G--G--E--S--I--W--G--K--P--F--K--D--E--L--N-    420

                                                                          
  1261 TCAAAACTTGTACATTCAGGAAGAGGTGTTGTCAGCATGGCTAATTCTGGCCCTCATACC   1320
  1261 TCAAAACTTGTACATTCAGGAAGAGGTGTTGTCAGCATGGCTAATTCTGGCCCTCATACC   1320
   421 -S--K--L--V--H--S--G--R--G--V--V--S--M--A--N--S--G--P--H--T-    440

                                                                          
  1321 AATGGGTCCCAGTTTTTCATCTTGTATAAGTCTGCACCACATTTGAATTTCAAGCATACA   1380
  1321 AATGGGTCCCAGTTTTTCATCTTGTATAAGTCTGCACCACATTTGAATTTCAAGCATACA   1380
   441 -N--G--S--Q--F--F--I--L--Y--K--S--A--P--H--L--N--F--K--H--T-    460

                                                                          
  1381 GTATTTGGCATGGTGGTTGGTGGCTTAACCACTCTTTCAGCTATGGAAAAGGTTCCTGTT   1440
  1381 GTATTTGGCATGGTGGTTGGTGGCTTAACCACTCTTTCAGCTATGGAAAAGGTTCCTGTT   1440
   461 -V--F--G--M--V--V--G--G--L--T--T--L--S--A--M--E--K--V--P--V-    480

                                                                          
  1441 GATGATGATGACCGGCCATTGGAGGAAATAAAGATATTAAAAGTAAGTATATTTGTGAAC   1500
  1441 GATGATGATGACCGGCCATTGGAGGAAATAAAGATATTAAAAGTAAGTATATTTGTGAAC   1500
   481 -D--D--D--D--R--P--L--E--E--I--K--I--L--K--V--S--I--F--V--N-    500

                                                                          
  1501 CCTTACACGGAACCAGATGAAGAAGAAGAAGAAAAGGCAAAGGAAGAGGAGAAGAAAAAG   1560
  1501 CCTTACACGGAACCAGATGAAGAAGAAGAAGAAAAGGCAAAGGAAGAGGAGAAGAAAAAG   1560
   501 -P--Y--T--E--P--D--E--E--E--E--E--K--A--K--E--E--E--K--K--K-    520

                                                                          
  1561 GACGAGGATTATGATAAGGTGGGATCGTGGTATAGCAATCCAGGCACTGGTGTTGCTGCT   1620
  1561 GACGAGGATTATGATAAGGTGGGATCGTGGTATAGCAATCCAGGCACTGGTGTTGCTGCT   1620
   521 -D--E--D--Y--D--K--V--G--S--W--Y--S--N--P--G--T--G--V--A--A-    540

                                                                          
  1621 TCAACCAGCTCTGGTGGTGGTGTTGGCAAGTATCTAAAAGCTCGGACAGCTAGCTCTGCT   1680
  1621 TCAACCAGCTCTGGTGGTGGTGTTGGCAAGTATCTAAAAGCTCGGACAGCTAGCTCTGCT   1680
   541 -S--T--S--S--G--G--G--V--G--K--Y--L--K--A--R--T--A--S--S--A-    560

                                                                          
  1681 GATGTGATTGGAAATGCCATCGCTGCTGATGATTCAAAAAAGAAAAGAAAAGCGGATGTG   1740
  1681 GATGTGATTGGAAATGCCATCGCTGCTGATGATTCAAAAAAGAAAAGAAAAGCGGATGTG   1740
   561 -D--V--I--G--N--A--I--A--A--D--D--S--K--K--K--R--K--A--D--V-    580

                                                                          
  1741 TCGAACGTAGAATTTAAAGATTTCTCTGAGTGGTGTTAA                        1779
  1741 TCGAACGTAGAATTTAAAGATTTCTCTGAGTGGTGTTAA                        1779
   581 -S--N--V--E--F--K--D--F--S--E--W--C--*-                         592