Leersia perrieri (Lperr_V1.4) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 2: 15,996,530-16,001,606 reverse strand.
This transcript has 8 exons and is annotated with 26 domains and features.
This transcript is a product of gene LPERR02G18320 Show transcript tableHide transcript table
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1 ATGTCCGGCCGGAGCTCGCCGATGTACGAAGGGTTCGCGCCGCGTTCTGACGGCGAGTGG 60 1 ATGTCCGGCCGGAGCTCGCCGATGTACGAAGGGTTCGCGCCGCGTTCTGACGGCGAGTGG 60 1 -M--S--G--R--S--S--P--M--Y--E--G--F--A--P--R--S--D--G--E--W- 20 61 GACGTTGTCCTCAAGGTCAAATATGGTGAAACTCTTAAGAGGTTCAATGGGTATGTGCAG 120 61 GACGTTGTCCTCAAGGTCAAATATGGTGAAACTCTTAAGAGGTTCAATGGGTATGTGCAG 120 21 -D--V--V--L--K--V--K--Y--G--E--T--L--K--R--F--N--G--Y--V--Q- 40 121 GGATCACGTTTCAGTCTTAACTTATCTGCTCTCAGGTCCAAGATTGCATTTGCTTTTAAG 180 121 GGATCACGTTTCAGTCTTAACTTATCTGCTCTCAGGTCCAAGATTGCATTTGCTTTTAAG 180 41 -G--S--R--F--S--L--N--L--S--A--L--R--S--K--I--A--F--A--F--K- 60 181 TTTGGTCCTGATATCAACTTCATTCTGACATACACTGATGAGGATGGAGATATTGTCATG 240 181 TTTGGTCCTGATATCAACTTCATTCTGACATACACTGATGAGGATGGAGATATTGTCATG 240 61 -F--G--P--D--I--N--F--I--L--T--Y--T--D--E--D--G--D--I--V--M- 80 241 CTGGATGATGATGATGATTTGCATGATGCTGCTATTCATCAGAAACTGAATCCTCTCAGG 300 241 CTGGATGATGATGATGATTTGCATGATGCTGCTATTCATCAGAAACTGAATCCTCTCAGG 300 81 -L--D--D--D--D--D--L--H--D--A--A--I--H--Q--K--L--N--P--L--R- 100 301 ATTAATGTTCAGTTAAACAGCAGCCTCACCACAGCTTCACAGACCAAGCAACAGGATTCA 360 301 ATTAATGTTCAGTTAAACAGCAGCCTCACCACAGCTTCACAGACCAAGCAACAGGATTCA 360 101 -I--N--V--Q--L--N--S--S--L--T--T--A--S--Q--T--K--Q--Q--D--S- 120 361 GATAATACACCTCTGAGACCCACCACCATTCAAGACCCATTAGCTCAACTTAAATCAGTT 420 361 GATAATACACCTCTGAGACCCACCACCATTCAAGACCCATTAGCTCAACTTAAATCAGTT 420 121 -D--N--T--P--L--R--P--T--T--I--Q--D--P--L--A--Q--L--K--S--V- 140 421 ATTGATGAGCTTTTGAAGCCCTTGTCTAATCCGTTGAGATCCACCGTGCATGAAGATACA 480 421 ATTGATGAGCTTTTGAAGCCCTTGTCTAATCCGTTGAGATCCACCGTGCATGAAGATACA 480 141 -I--D--E--L--L--K--P--L--S--N--P--L--R--S--T--V--H--E--D--T- 160 481 CAGGCTCAGATAAAATCAGCTATTGATGATGCTATGAAGTCCATCCCGGAGCCGATTCCT 540 481 CAGGCTCAGATAAAATCAGCTATTGATGATGCTATGAAGTCCATCCCGGAGCCGATTCCT 540 161 -Q--A--Q--I--K--S--A--I--D--D--A--M--K--S--I--P--E--P--I--P- 180 541 GATGCACTTGCGAAGCTGTCTCATGAAGTACTTGGAGCGGCACCACCGCAATTGGCTGAG 600 541 GATGCACTTGCGAAGCTGTCTCATGAAGTACTTGGAGCGGCACCACCGCAATTGGCTGAG 600 181 -D--A--L--A--K--L--S--H--E--V--L--G--A--A--P--P--Q--L--A--E- 200 601 CTAATGAAACCTTTTGTTCAACTGGTCACACCGAGCAACAAGAATCCCTCTAATGGTTGT 660 601 CTAATGAAACCTTTTGTTCAACTGGTCACACCGAGCAACAAGAATCCCTCTAATGGTTGT 660 201 -L--M--K--P--F--V--Q--L--V--T--P--S--N--K--N--P--S--N--G--C- 220 661 GGTAATGGTTCCTGCAGCTTCTCAAGTGGTTTGCCCCAAACACAGGTTGATTCCAAAGCT 720 661 GGTAATGGTTCCTGCAGCTTCTCAAGTGGTTTGCCCCAAACACAGGTTGATTCCAAAGCT 720 221 -G--N--G--S--C--S--F--S--S--G--L--P--Q--T--Q--V--D--S--K--A- 240 721 AATGTTGAGCCCAAAATTGACACAAGTTTGGGGCCACGACCCTTGGGCACACAGAACTCT 780 721 AATGTTGAGCCCAAAATTGACACAAGTTTGGGGCCACGACCCTTGGGCACACAGAACTCT 780 241 -N--V--E--P--K--I--D--T--S--L--G--P--R--P--L--G--T--Q--N--S- 260 781 GAACCTAGAGCTCCTCCGATTCCACCTCGGAATGATATTTGGCCTCAGCTACCAGAGCGT 840 781 GAACCTAGAGCTCCTCCGATTCCACCTCGGAATGATATTTGGCCTCAGCTACCAGAGCGT 840 261 -E--P--R--A--P--P--I--P--P--R--N--D--I--W--P--Q--L--P--E--R- 280 841 GGATCAACATTTTACCCCTCTATTTGGCAGTCCGAAGCTGATCCAAAAGCCACCAGTGAT 900 841 GGATCAACATTTTACCCCTCTATTTGGCAGTCCGAAGCTGATCCAAAAGCCACCAGTGAT 900 281 -G--S--T--F--Y--P--S--I--W--Q--S--E--A--D--P--K--A--T--S--D- 300 901 TCCAGATGGTGTCTTCCATCACACAGAGCTGGTCATCCATTCCGACCCCATGCTCCCATG 960 901 TCCAGATGGTGTCTTCCATCACACAGAGCTGGTCATCCATTCCGACCCCATGCTCCCATG 960 301 -S--R--W--C--L--P--S--H--R--A--G--H--P--F--R--P--H--A--P--M- 320 961 ACCCGTGCATCCTTGCAAGTGCCCCCTGCGCCCACAAGCCTAAACTATGGTCCTTCTCCA 1020 961 ACCCGTGCATCCTTGCAAGTGCCCCCTGCGCCCACAAGCCTAAACTATGGTCCTTCTCCA 1020 321 -T--R--A--S--L--Q--V--P--P--A--P--T--S--L--N--Y--G--P--S--P- 340 1021 CATTTTCCTTACCCTGGCCGCCTCTTGTCTTCTGGTCATCTGCATGGAGACCTTGAGAAC 1080 1021 CATTTTCCTTACCCTGGCCGCCTCTTGTCTTCTGGTCATCTGCATGGAGACCTTGAGAAC 1080 341 -H--F--P--Y--P--G--R--L--L--S--S--G--H--L--H--G--D--L--E--N- 360 1081 TCATCAGCACGCACATTCCATAGATGGATTCAGTGTGATGGCTGTGGAGTGCAGCCAATT 1140 1081 TCATCAGCACGCACATTCCATAGATGGATTCAGTGTGATGGCTGTGGAGTGCAGCCAATT 1140 361 -S--S--A--R--T--F--H--R--W--I--Q--C--D--G--C--G--V--Q--P--I- 380 1141 GTTGGGCCACGATACAAGTCCAAAACAAAAGAAGATTATGATTTGTGTGATGCCTGCTTT 1200 1141 GTTGGGCCACGATACAAGTCCAAAACAAAAGAAGATTATGATTTGTGTGATGCCTGCTTT 1200 381 -V--G--P--R--Y--K--S--K--T--K--E--D--Y--D--L--C--D--A--C--F- 400 1201 CATCGCATGGGCAATGAGGTTGAGTACACCAGAATTGACAAGCCACTCTTACCCCAGAGA 1260 1201 CATCGCATGGGCAATGAGGTTGAGTACACCAGAATTGACAAGCCACTCTTACCCCAGAGA 1260 401 -H--R--M--G--N--E--V--E--Y--T--R--I--D--K--P--L--L--P--Q--R- 420 1261 TTACTGAGAGACCCTTCTTTGTGCCGCAAGATCCATCCACGGTCTGCGATGAAGTCAAAG 1320 1261 TTACTGAGAGACCCTTCTTTGTGCCGCAAGATCCATCCACGGTCTGCGATGAAGTCAAAG 1320 421 -L--L--R--D--P--S--L--C--R--K--I--H--P--R--S--A--M--K--S--K- 440 1321 CGGGAGAAACTTGAAAGTCGCTTTATTTTGGATGTAACTGTTTTGGATGGAACATTGATG 1380 1321 CGGGAGAAACTTGAAAGTCGCTTTATTTTGGATGTAACTGTTTTGGATGGAACATTGATG 1380 441 -R--E--K--L--E--S--R--F--I--L--D--V--T--V--L--D--G--T--L--M- 460 1381 GCACCTTCGACTCCATTTACTAAGATTTGGCGCATGCATAACAATGGGTCTATCATGTGG 1440 1381 GCACCTTCGACTCCATTTACTAAGATTTGGCGCATGCATAACAATGGGTCTATCATGTGG 1440 461 -A--P--S--T--P--F--T--K--I--W--R--M--H--N--N--G--S--I--M--W- 480 1441 CCCTTGGGCACACAGCTTATCTGGGTTGGTGGAGACCAGTTTGCACTGCAGACCTCAGTC 1500 1441 CCCTTGGGCACACAGCTTATCTGGGTTGGTGGAGACCAGTTTGCACTGCAGACCTCAGTC 1500 481 -P--L--G--T--Q--L--I--W--V--G--G--D--Q--F--A--L--Q--T--S--V- 500 1501 CCATTAGAGATTCCAGTGAATGGATTCCCTGTTGATCAGGAGATTGATGTTGCTGTTGAT 1560 1501 CCATTAGAGATTCCAGTGAATGGATTCCCTGTTGATCAGGAGATTGATGTTGCTGTTGAT 1560 501 -P--L--E--I--P--V--N--G--F--P--V--D--Q--E--I--D--V--A--V--D- 520 1561 TTTATGGCACCTGCAAGGCCTGGGAGGTATATATCTTATTGGAGACTCGCATCACCTTCT 1620 1561 TTTATGGCACCTGCAAGGCCTGGGAGGTATATATCTTATTGGAGACTCGCATCACCTTCT 1620 521 -F--M--A--P--A--R--P--G--R--Y--I--S--Y--W--R--L--A--S--P--S- 540 1621 GGCCAGAAATTTGGTCAGCGTGTTTGGGTTCACATCCAGGTGGAAGATCCTTCTTTTGTC 1680 1621 GGCCAGAAATTTGGTCAGCGTGTTTGGGTTCACATCCAGGTGGAAGATCCTTCTTTTGTC 1680 541 -G--Q--K--F--G--Q--R--V--W--V--H--I--Q--V--E--D--P--S--F--V- 560 1681 AGTAACAACAGGACTGCTCCTATAAACTTGAATCTGCCCCCAGAAACCAATAGCACAAAC 1740 1681 AGTAACAACAGGACTGCTCCTATAAACTTGAATCTGCCCCCAGAAACCAATAGCACAAAC 1740 561 -S--N--N--R--T--A--P--I--N--L--N--L--P--P--E--T--N--S--T--N- 580 1741 GCAAGTAACTTGATTGATGTCAATTTCGAGCCTGTGGATCTGGTCTTTGACCAACATGTC 1800 1741 GCAAGTAACTTGATTGATGTCAATTTCGAGCCTGTGGATCTGGTCTTTGACCAACATGTC 1800 581 -A--S--N--L--I--D--V--N--F--E--P--V--D--L--V--F--D--Q--H--V- 600 1801 AACAGCACAAACAAAGAATTACTTGAAAATTTGATACACTGTGAAGTTGACGAACCCAAG 1860 1801 AACAGCACAAACAAAGAATTACTTGAAAATTTGATACACTGTGAAGTTGACGAACCCAAG 1860 601 -N--S--T--N--K--E--L--L--E--N--L--I--H--C--E--V--D--E--P--K- 620 1861 AATCCCGAGCCTGCTCTATTATCTGTGCCCTTTGTTTCTTCCACAGCTTCTCCTCACCCC 1920 1861 AATCCCGAGCCTGCTCTATTATCTGTGCCCTTTGTTTCTTCCACAGCTTCTCCTCACCCC 1920 621 -N--P--E--P--A--L--L--S--V--P--F--V--S--S--T--A--S--P--H--P- 640 1921 GTTGTTGATGTTCCCTCCACTTCAACTGCTGCTGCTTTTGTGCCTGTTGTTGATGTACCT 1980 1921 GTTGTTGATGTTCCCTCCACTTCAACTGCTGCTGCTTTTGTGCCTGTTGTTGATGTACCT 1980 641 -V--V--D--V--P--S--T--S--T--A--A--A--F--V--P--V--V--D--V--P- 660 1981 GCACCTGAACTTGCTATGGCTCCAACTGTTAATGAGCCTGCTGGTAATGCACCTCCGTCT 2040 1981 GCACCTGAACTTGCTATGGCTCCAACTGTTAATGAGCCTGCTGGTAATGCACCTCCGTCT 2040 661 -A--P--E--L--A--M--A--P--T--V--N--E--P--A--G--N--A--P--P--S- 680 2041 GTTGGTGCATCAGCATCTGATCATCATGGTATTGACATTCTCACCGAAGAGAAACTGCTG 2100 2041 GTTGGTGCATCAGCATCTGATCATCATGGTATTGACATTCTCACCGAAGAGAAACTGCTG 2100 681 -V--G--A--S--A--S--D--H--H--G--I--D--I--L--T--E--E--K--L--L- 700 2101 AAGGAACTTGAAGAAATGGGTTTCAGGCAGGTCGATCTGAACAAGGAGATACTCAGGCAG 2160 2101 AAGGAACTTGAAGAAATGGGTTTCAGGCAGGTCGATCTGAACAAGGAGATACTCAGGCAG 2160 701 -K--E--L--E--E--M--G--F--R--Q--V--D--L--N--K--E--I--L--R--Q- 720 2161 AACAAGTACAACCTGGAGCAGTCCGTCGATGATCTCTGTGGTGTTAGCGAATGGGATCCT 2220 2161 AACAAGTACAACCTGGAGCAGTCCGTCGATGATCTCTGTGGTGTTAGCGAATGGGATCCT 2220 721 -N--K--Y--N--L--E--Q--S--V--D--D--L--C--G--V--S--E--W--D--P- 740 2221 CTCCTCGCAGAGCTGCAGGAGATGGGCTTTGAAGACGCGGAGATAAACAAGGAGATGCTC 2280 2221 CTCCTCGCAGAGCTGCAGGAGATGGGCTTTGAAGACGCGGAGATAAACAAGGAGATGCTC 2280 741 -L--L--A--E--L--Q--E--M--G--F--E--D--A--E--I--N--K--E--M--L- 760 2281 GCGAGGAATGGAGGAAGCATCAAGCGAGCTGTGATGGACCTCATCGCTAGGGAGAAGAAG 2340 2281 GCGAGGAATGGAGGAAGCATCAAGCGAGCTGTGATGGACCTCATCGCTAGGGAGAAGAAG 2340 761 -A--R--N--G--G--S--I--K--R--A--V--M--D--L--I--A--R--E--K--K- 780 2341 GACCAGTGA 2349 2341 GACCAGTGA 2349 781 -D--Q--*- 782
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