Transcript: LPERR01G39920.1
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- LPERR01G39920.1 1514 503aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D9VAV6 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - LPERR01G39920.2 1751 467aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D9VAV7 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GCG ACG GCC GCG GAC GCG TCC CCG AAG CCG GCG GCG CCG CGG CTG AAC GTG CCG CCG 60
1 ATGGCGACGGCCGCGGACGCGTCCCCGAAGCCGGCGGCGCCGCGGCTGAACGTGCCGCCG 60
1 -M--A--T--A--A--D--A--S--P--K--P--A--A--P--R--L--N--V--P--P- 20
61 TCG ATG GCC GGG GGC CTC CGC CTC GAC GCC GCC GCC GTG GGC ATC TCC CCG TCG CGC CTC 120
61 TCGATGGCCGGGGGCCTCCGCCTCGACGCCGCCGCCGTGGGCATCTCCCCGTCGCGCCTC 120
21 -S--M--A--G--G--L--R--L--D--A--A--A--V--G--I--S--P--S--R--L- 40
121 CAC CTC GAC GCC CCC AAG ACG CTG TCC CCA TCC AAG ACC ACC TAC AGC GAC CGG TTC ATC 180
121 CACCTCGACGCCCCCAAGACGCTGTCCCCATCCAAGACCACCTACAGCGACCGGTTCATC 180
41 -H--L--D--A--P--K--T--L--S--P--S--K--T--T--Y--S--D--R--F--I- 60
181 CCA TGC CGC TCC TCC TCC CGC CTC CAC AAC TTC GCC CTC CTC CAA GAC CAC CAC CGC GCC 240
181 CCATGCCGCTCCTCCTCCCGCCTCCACAACTTCGCCCTCCTCCAAGACCACCACCGCGCC 240
61 -P--C--R--S--S--S--R--L--H--N--F--A--L--L--Q--D--H--H--R--A- 80
241 GGC GAC TCC GCC GCC GAC GAC GCC CCT TAC TCC CGC CTC CTC CGC GCC GAG ATC TTC GGC 300
241 GGCGACTCCGCCGCCGACGACGCCCCTTACTCCCGCCTCCTCCGCGCCGAGATCTTCGGC 300
81 -G--D--S--A--A--D--D--A--P--Y--S--R--L--L--R--A--E--I--F--G- 100
301 CCG GAC TCC CCT TCC CCC GCT CCC TCC TCT CCC AAC ACG AAT CTC TTC CGG TTC AAG ACC 360
301 CCGGACTCCCCTTCCCCCGCTCCCTCCTCTCCCAACACGAATCTCTTCCGGTTCAAGACC 360
101 -P--D--S--P--S--P--A--P--S--S--P--N--T--N--L--F--R--F--K--T- 120
361 GAC CAC CCT TCC CCT AAA TCG CCC TTC GCC GCC GCC GTC GCG GCG GCG GGG CAG CAC GAC 420
361 GACCACCCTTCCCCTAAATCGCCCTTCGCCGCCGCCGTCGCGGCGGCGGGGCAGCACGAC 420
121 -D--H--P--S--P--K--S--P--F--A--A--A--V--A--A--A--G--Q--H--D- 140
421 TGC ACT GCC GGC TCC GGC GAA TCT TCC ACG CCG CGC AAG CCG CCC AGG AAG GTC CCC AAG 480
421 TGCACTGCCGGCTCCGGCGAATCTTCCACGCCGCGCAAGCCGCCCAGGAAGGTCCCCAAG 480
141 -C--T--A--G--S--G--E--S--S--T--P--R--K--P--P--R--K--V--P--K- 160
481 ACC CCG CAC AAG GTG CTG GAC GCG CCG TCG CTG CAG GAC GAC TTC TAC CTG AAT CTT GTA 540
481 ACCCCGCACAAGGTGCTGGACGCGCCGTCGCTGCAGGACGACTTCTACCTGAATCTTGTA 540
161 -T--P--H--K--V--L--D--A--P--S--L--Q--D--D--F--Y--L--N--L--V- 180
541 GAC TGG TCG TCG CAG AAC ACG CTT GCC GTC GGC CTC GGG AAT TGC GTC TAC CTC TGG TCG 600
541 GACTGGTCGTCGCAGAACACGCTTGCCGTCGGCCTCGGGAATTGCGTCTACCTCTGGTCG 600
181 -D--W--S--S--Q--N--T--L--A--V--G--L--G--N--C--V--Y--L--W--S- 200
601 GCT TCC AAT TGC AAG GTC ACC AAG CTC TGC GAT TTG GGG CCG CGG GAC AGC GTC TGC GCC 660
601 GCTTCCAATTGCAAGGTCACCAAGCTCTGCGATTTGGGGCCGCGGGACAGCGTCTGCGCC 660
201 -A--S--N--C--K--V--T--K--L--C--D--L--G--P--R--D--S--V--C--A- 220
661 GTG CAC TGG ACG CGG GAA GGC TCC TAT CTT GCC ATT GGC ACC AGC CTT GGA GAT GTC CAG 720
661 GTGCACTGGACGCGGGAAGGCTCCTATCTTGCCATTGGCACCAGCCTTGGAGATGTCCAG 720
221 -V--H--W--T--R--E--G--S--Y--L--A--I--G--T--S--L--G--D--V--Q- 240
721 A TT TGG GAT AGC TCT CGC TGC AAA CGG ATT AGG AAT ATG GGA GGA CAC CAA ACA CGG ACT 780
721 ATTTGGGATAGCTCTCGCTGCAAACGGATTAGGAATATGGGAGGACACCAAACACGGACT 780
241 -I--W--D--S--S--R--C--K--R--I--R--N--M--G--G--H--Q--T--R--T- 260
781 GGT GTA TTA GCT TGG AGC TCC CGA ATA TTG TCC TCA GGT AGC AGG GAC AAG AAC ATA TTG 840
781 GGTGTATTAGCTTGGAGCTCCCGAATATTGTCCTCAGGTAGCAGGGACAAGAACATATTG 840
261 -G--V--L--A--W--S--S--R--I--L--S--S--G--S--R--D--K--N--I--L- 280
841 CAG CAT GAC ATC CGT GAC CCA AGT GAC TAC ATC AGC AAG TTC TCA GGG CAC AGA TCA GAG 900
841 CAGCATGACATCCGTGACCCAAGTGACTACATCAGCAAGTTCTCAGGGCACAGATCAGAG 900
281 -Q--H--D--I--R--D--P--S--D--Y--I--S--K--F--S--G--H--R--S--E- 300
901 GTC TGT GGA TTG AAA TGG TCG CAC GAT GAC CGT GAA CTT GCA TCG GGC GGA AAT GAT AAC 960
901 GTCTGTGGATTGAAATGGTCGCACGATGACCGTGAACTTGCATCGGGCGGAAATGATAAC 960
301 -V--C--G--L--K--W--S--H--D--D--R--E--L--A--S--G--G--N--D--N- 320
961 CAG CTG CTA GTA TGG AAC CAA CGT TCA CAG CAG CCG GTA TTG AGA CTA ACA GAA CAT ACA 1020
961 CAGCTGCTAGTATGGAACCAACGTTCACAGCAGCCGGTATTGAGACTAACAGAACATACA 1020
321 -Q--L--L--V--W--N--Q--R--S--Q--Q--P--V--L--R--L--T--E--H--T- 340
1021 GCT GCT GTT AAA GCA ATA TCA TGG TCA CCA CAT CAG CAA GGC CTG CTG GCA TCT GGT GGT 1080
1021 GCTGCTGTTAAAGCAATATCATGGTCACCACATCAGCAAGGCCTGCTGGCATCTGGTGGT 1080
341 -A--A--V--K--A--I--S--W--S--P--H--Q--Q--G--L--L--A--S--G--G- 360
1081 GGA ACT GCT GAT AGG TGT ATC AGG TTC TGG AAT ACG G TT TGT AAT CTT GCA TGG TGT AAA 1140
1081 GGAACTGCTGATAGGTGTATCAGGTTCTGGAATACGGTTTGTAATCTTGCATGGTGTAAA 1140
361 -G--T--A--D--R--C--I--R--F--W--N--T--V--C--N--L--A--W--C--K- 380
1141 AAT GTA AAT GAG CTT GTG AGC ACT CAT GGG TAT TCT CAA AAC CAA ATC ATG GTG TGG AAA 1200
1141 AATGTAAATGAGCTTGTGAGCACTCATGGGTATTCTCAAAACCAAATCATGGTGTGGAAA 1200
381 -N--V--N--E--L--V--S--T--H--G--Y--S--Q--N--Q--I--M--V--W--K- 400
1201 TAC CCA TCT ATG TCA AAG G TC GCA ACT CTA ACT GGA CAC ACG CTG CGG GTG CTT TAC CTT 1260
1201 TACCCATCTATGTCAAAGGTCGCAACTCTAACTGGACACACGCTGCGGGTGCTTTACCTT 1260
401 -Y--P--S--M--S--K--V--A--T--L--T--G--H--T--L--R--V--L--Y--L- 420
1261 GCA ATG TCA CCT GAT GGA CAG A CG ATA GTA ACA GGA GCC GGG GAC GAA ACC CTC AGA TTT 1320
1261 GCAATGTCACCTGATGGACAGACGATAGTAACAGGAGCCGGGGACGAAACCCTCAGATTT 1320
421 -A--M--S--P--D--G--Q--T--I--V--T--G--A--G--D--E--T--L--R--F- 440
1321 TGG AAT ATT TTT CCT TCA ATG AAG ACT CAG C TT GAA CTG CCA TAT GTT TGC ATC AGG CTC 1380
1321 TGGAATATTTTTCCTTCAATGAAGACTCAGCTTGAACTGCCATATGTTTGCATCAGGCTC 1380
441 -W--N--I--F--P--S--M--K--T--Q--L--E--L--P--Y--V--C--I--R--L- 460
1381 CTG TTC GTG ATA TTG GGC TAT GGT CAT TCT CAA GAA GCC ACA TCC GGT GAC CAT AAT AGG 1440
1381 CTGTTCGTGATATTGGGCTATGGTCATTCTCAAGAAGCCACATCCGGTGACCATAATAGG 1440
461 -L--F--V--I--L--G--Y--G--H--S--Q--E--A--T--S--G--D--H--N--R- 480
1441 AAG CAA CGA CGA TGC ATA TGT TTG TGT GGA ACA CAA TTT TCT GAA TTT GTG CAG TTC TTC 1500
1441 AAGCAACGACGATGCATATGTTTGTGTGGAACACAATTTTCTGAATTTGTGCAGTTCTTC 1500
481 -K--Q--R--R--C--I--C--L--C--G--T--Q--F--S--E--F--V--Q--F--F- 500
1501 AAC GAT TTG TAA AT 1514
1501 AACGATTTGTAA.. 1512
501 -N--D--L--*-.. 503
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