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Leersia perrieri (Lperr_V1.4)
Location
About this transcript

This transcript has 8 exons and is annotated with 26 domains and features.

Gene
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  • Name
  • Transcript ID
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-LPERR01G39920.11514503aa
 
Protein coding
A0A0D9VAV6 Ensembl Canonical
-LPERR01G39920.21751467aa
 
Protein coding
A0A0D9VAV7 -
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
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     1 ATGGCGACGGCCGCGGACGCGTCCCCGAAGCCGGCGGCGCCGCGGCTGAACGTGCCGCCG     60
     1 ATGGCGACGGCCGCGGACGCGTCCCCGAAGCCGGCGGCGCCGCGGCTGAACGTGCCGCCG     60
     1 -M--A--T--A--A--D--A--S--P--K--P--A--A--P--R--L--N--V--P--P-     20

                                                                          
    61 TCGATGGCCGGGGGCCTCCGCCTCGACGCCGCCGCCGTGGGCATCTCCCCGTCGCGCCTC    120
    61 TCGATGGCCGGGGGCCTCCGCCTCGACGCCGCCGCCGTGGGCATCTCCCCGTCGCGCCTC    120
    21 -S--M--A--G--G--L--R--L--D--A--A--A--V--G--I--S--P--S--R--L-     40

                                                                          
   121 CACCTCGACGCCCCCAAGACGCTGTCCCCATCCAAGACCACCTACAGCGACCGGTTCATC    180
   121 CACCTCGACGCCCCCAAGACGCTGTCCCCATCCAAGACCACCTACAGCGACCGGTTCATC    180
    41 -H--L--D--A--P--K--T--L--S--P--S--K--T--T--Y--S--D--R--F--I-     60

                                                                          
   181 CCATGCCGCTCCTCCTCCCGCCTCCACAACTTCGCCCTCCTCCAAGACCACCACCGCGCC    240
   181 CCATGCCGCTCCTCCTCCCGCCTCCACAACTTCGCCCTCCTCCAAGACCACCACCGCGCC    240
    61 -P--C--R--S--S--S--R--L--H--N--F--A--L--L--Q--D--H--H--R--A-     80

                                                                          
   241 GGCGACTCCGCCGCCGACGACGCCCCTTACTCCCGCCTCCTCCGCGCCGAGATCTTCGGC    300
   241 GGCGACTCCGCCGCCGACGACGCCCCTTACTCCCGCCTCCTCCGCGCCGAGATCTTCGGC    300
    81 -G--D--S--A--A--D--D--A--P--Y--S--R--L--L--R--A--E--I--F--G-    100

                                                                          
   301 CCGGACTCCCCTTCCCCCGCTCCCTCCTCTCCCAACACGAATCTCTTCCGGTTCAAGACC    360
   301 CCGGACTCCCCTTCCCCCGCTCCCTCCTCTCCCAACACGAATCTCTTCCGGTTCAAGACC    360
   101 -P--D--S--P--S--P--A--P--S--S--P--N--T--N--L--F--R--F--K--T-    120

                                                                          
   361 GACCACCCTTCCCCTAAATCGCCCTTCGCCGCCGCCGTCGCGGCGGCGGGGCAGCACGAC    420
   361 GACCACCCTTCCCCTAAATCGCCCTTCGCCGCCGCCGTCGCGGCGGCGGGGCAGCACGAC    420
   121 -D--H--P--S--P--K--S--P--F--A--A--A--V--A--A--A--G--Q--H--D-    140

                                                                          
   421 TGCACTGCCGGCTCCGGCGAATCTTCCACGCCGCGCAAGCCGCCCAGGAAGGTCCCCAAG    480
   421 TGCACTGCCGGCTCCGGCGAATCTTCCACGCCGCGCAAGCCGCCCAGGAAGGTCCCCAAG    480
   141 -C--T--A--G--S--G--E--S--S--T--P--R--K--P--P--R--K--V--P--K-    160

                                                                          
   481 ACCCCGCACAAGGTGCTGGACGCGCCGTCGCTGCAGGACGACTTCTACCTGAATCTTGTA    540
   481 ACCCCGCACAAGGTGCTGGACGCGCCGTCGCTGCAGGACGACTTCTACCTGAATCTTGTA    540
   161 -T--P--H--K--V--L--D--A--P--S--L--Q--D--D--F--Y--L--N--L--V-    180

                                                                          
   541 GACTGGTCGTCGCAGAACACGCTTGCCGTCGGCCTCGGGAATTGCGTCTACCTCTGGTCG    600
   541 GACTGGTCGTCGCAGAACACGCTTGCCGTCGGCCTCGGGAATTGCGTCTACCTCTGGTCG    600
   181 -D--W--S--S--Q--N--T--L--A--V--G--L--G--N--C--V--Y--L--W--S-    200

                                                                          
   601 GCTTCCAATTGCAAGGTCACCAAGCTCTGCGATTTGGGGCCGCGGGACAGCGTCTGCGCC    660
   601 GCTTCCAATTGCAAGGTCACCAAGCTCTGCGATTTGGGGCCGCGGGACAGCGTCTGCGCC    660
   201 -A--S--N--C--K--V--T--K--L--C--D--L--G--P--R--D--S--V--C--A-    220

                                                                          
   661 GTGCACTGGACGCGGGAAGGCTCCTATCTTGCCATTGGCACCAGCCTTGGAGATGTCCAG    720
   661 GTGCACTGGACGCGGGAAGGCTCCTATCTTGCCATTGGCACCAGCCTTGGAGATGTCCAG    720
   221 -V--H--W--T--R--E--G--S--Y--L--A--I--G--T--S--L--G--D--V--Q-    240

                                                                          
   721 ATTTGGGATAGCTCTCGCTGCAAACGGATTAGGAATATGGGAGGACACCAAACACGGACT    780
   721 ATTTGGGATAGCTCTCGCTGCAAACGGATTAGGAATATGGGAGGACACCAAACACGGACT    780
   241 -I--W--D--S--S--R--C--K--R--I--R--N--M--G--G--H--Q--T--R--T-    260

                                                                          
   781 GGTGTATTAGCTTGGAGCTCCCGAATATTGTCCTCAGGTAGCAGGGACAAGAACATATTG    840
   781 GGTGTATTAGCTTGGAGCTCCCGAATATTGTCCTCAGGTAGCAGGGACAAGAACATATTG    840
   261 -G--V--L--A--W--S--S--R--I--L--S--S--G--S--R--D--K--N--I--L-    280

                                                                          
   841 CAGCATGACATCCGTGACCCAAGTGACTACATCAGCAAGTTCTCAGGGCACAGATCAGAG    900
   841 CAGCATGACATCCGTGACCCAAGTGACTACATCAGCAAGTTCTCAGGGCACAGATCAGAG    900
   281 -Q--H--D--I--R--D--P--S--D--Y--I--S--K--F--S--G--H--R--S--E-    300

                                                                          
   901 GTCTGTGGATTGAAATGGTCGCACGATGACCGTGAACTTGCATCGGGCGGAAATGATAAC    960
   901 GTCTGTGGATTGAAATGGTCGCACGATGACCGTGAACTTGCATCGGGCGGAAATGATAAC    960
   301 -V--C--G--L--K--W--S--H--D--D--R--E--L--A--S--G--G--N--D--N-    320

                                                                          
   961 CAGCTGCTAGTATGGAACCAACGTTCACAGCAGCCGGTATTGAGACTAACAGAACATACA   1020
   961 CAGCTGCTAGTATGGAACCAACGTTCACAGCAGCCGGTATTGAGACTAACAGAACATACA   1020
   321 -Q--L--L--V--W--N--Q--R--S--Q--Q--P--V--L--R--L--T--E--H--T-    340

                                                                          
  1021 GCTGCTGTTAAAGCAATATCATGGTCACCACATCAGCAAGGCCTGCTGGCATCTGGTGGT   1080
  1021 GCTGCTGTTAAAGCAATATCATGGTCACCACATCAGCAAGGCCTGCTGGCATCTGGTGGT   1080
   341 -A--A--V--K--A--I--S--W--S--P--H--Q--Q--G--L--L--A--S--G--G-    360

                                                                          
  1081 GGAACTGCTGATAGGTGTATCAGGTTCTGGAATACGGTTTGTAATCTTGCATGGTGTAAA   1140
  1081 GGAACTGCTGATAGGTGTATCAGGTTCTGGAATACGGTTTGTAATCTTGCATGGTGTAAA   1140
   361 -G--T--A--D--R--C--I--R--F--W--N--T--V--C--N--L--A--W--C--K-    380

                                                                          
  1141 AATGTAAATGAGCTTGTGAGCACTCATGGGTATTCTCAAAACCAAATCATGGTGTGGAAA   1200
  1141 AATGTAAATGAGCTTGTGAGCACTCATGGGTATTCTCAAAACCAAATCATGGTGTGGAAA   1200
   381 -N--V--N--E--L--V--S--T--H--G--Y--S--Q--N--Q--I--M--V--W--K-    400

                                                                          
  1201 TACCCATCTATGTCAAAGGTCGCAACTCTAACTGGACACACGCTGCGGGTGCTTTACCTT   1260
  1201 TACCCATCTATGTCAAAGGTCGCAACTCTAACTGGACACACGCTGCGGGTGCTTTACCTT   1260
   401 -Y--P--S--M--S--K--V--A--T--L--T--G--H--T--L--R--V--L--Y--L-    420

                                                                          
  1261 GCAATGTCACCTGATGGACAGACGATAGTAACAGGAGCCGGGGACGAAACCCTCAGATTT   1320
  1261 GCAATGTCACCTGATGGACAGACGATAGTAACAGGAGCCGGGGACGAAACCCTCAGATTT   1320
   421 -A--M--S--P--D--G--Q--T--I--V--T--G--A--G--D--E--T--L--R--F-    440

                                                                          
  1321 TGGAATATTTTTCCTTCAATGAAGACTCAGCTTGAACTGCCATATGTTTGCATCAGGCTC   1380
  1321 TGGAATATTTTTCCTTCAATGAAGACTCAGCTTGAACTGCCATATGTTTGCATCAGGCTC   1380
   441 -W--N--I--F--P--S--M--K--T--Q--L--E--L--P--Y--V--C--I--R--L-    460

                                                                          
  1381 CTGTTCGTGATATTGGGCTATGGTCATTCTCAAGAAGCCACATCCGGTGACCATAATAGG   1440
  1381 CTGTTCGTGATATTGGGCTATGGTCATTCTCAAGAAGCCACATCCGGTGACCATAATAGG   1440
   461 -L--F--V--I--L--G--Y--G--H--S--Q--E--A--T--S--G--D--H--N--R-    480

                                                                          
  1441 AAGCAACGACGATGCATATGTTTGTGTGGAACACAATTTTCTGAATTTGTGCAGTTCTTC   1500
  1441 AAGCAACGACGATGCATATGTTTGTGTGGAACACAATTTTCTGAATTTGTGCAGTTCTTC   1500
   481 -K--Q--R--R--C--I--C--L--C--G--T--Q--F--S--E--F--V--Q--F--F-    500

                                                                          
  1501 AACGATTTGTAAAT                                                 1514
  1501 AACGATTTGTAA..                                                 1512
   501 -N--D--L--*-..                                                  503