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Cucumis sativus (ASM407v2)
Description

AMSH-like ubiquitin thioesterase 1 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT1G48790) UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8VYB5]

Location
About this transcript

This transcript has 14 exons and is annotated with 12 domains and features.

Gene
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  • Name
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-KGN641272106499aa
 
Protein coding
A0A0A0LTN8 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
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Other
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Markup
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     1 ACGAATTGCGTTTTTCTATTCTACTCCGCCAAGCCTGACGCCCGAATCCACCATTGAAGA     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 GCCCACAAGTCTTTGCTGTGAAGCTTACTGGTCGGAGTAACGATCTAGGTTTTCAGATCA    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 CGGAAAATGGTTGTATCAATTTCGGAAGGGAAGCGAAGGTGAGAGACAACAGTTCTCTTC    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 AGAGGGTATCAGAATGAGACCTTCTTCGGATAGAATCAACATCGCCGCCAGTACCCGGCG    240
       .............ATGAGACCTTCTTCGGATAGAATCAACATCGCCGCCAGTACCCGGCG     47
       .............-M--R--P--S--S--D--R--I--N--I--A--A--S--T--R--R     16

                                                                          
   241 GGTCGTTGTTGACAATCGATTTCCTCTTCGTTATTACTATCGTGTCGCCGATAATGTTTT    300
    48 GGTCGTTGTTGACAATCGATTTCCTCTTCGTTATTACTATCGTGTCGCCGATAATGTTTT    107
    16 --V--V--V--D--N--R--F--P--L--R--Y--Y--Y--R--V--A--D--N--V--L     36

                                                                          
   301 GAAACAGGCTGACATCTTTCGAGCAGAGAAGAACATAATCGATCTTTATGTCATGTTAAT    360
   108 GAAACAGGCTGACATCTTTCGAGCAGAGAAGAACATAATCGATCTTTATGTCATGTTAAT    167
    36 --K--Q--A--D--I--F--R--A--E--K--N--I--I--D--L--Y--V--M--L--M     56

                                                                          
   361 GAGATTTTCAAGTTTGGTCACTGAGACGATACCTCGTCATTTGGAGTATGGGACAACTCC    420
   168 GAGATTTTCAAGTTTGGTCACTGAGACGATACCTCGTCATTTGGAGTATGGGACAACTCC    227
    56 --R--F--S--S--L--V--T--E--T--I--P--R--H--L--E--Y--G--T--T--P     76

                                                                          
   421 AAAATTCCAAAAAAATCATTTTAGAAAGAAGCTATTAGATGCTTTGAGCGAGCTTGAAGA    480
   228 AAAATTCCAAAAAAATCATTTTAGAAAGAAGCTATTAGATGCTTTGAGCGAGCTTGAAGA    287
    76 --K--F--Q--K--N--H--F--R--K--K--L--L--D--A--L--S--E--L--E--E     96

                                                                          
   481 GTTGAAGCCAGCAGTGCAAAGAAAGGTGGATGAAATAAATGGGAAACAAAAATATCAAGT    540
   288 GTTGAAGCCAGCAGTGCAAAGAAAGGTGGATGAAATAAATGGGAAACAAAAATATCAAGT    347
    96 --L--K--P--A--V--Q--R--K--V--D--E--I--N--G--K--Q--K--Y--Q--V    116

                                                                          
   541 TAACGGGCGGGGTAATCAGCAACAAAATGGTTCATTGGAATGGCATTCTGGTGGAAAGCA    600
   348 TAACGGGCGGGGTAATCAGCAACAAAATGGTTCATTGGAATGGCATTCTGGTGGAAAGCA    407
   116 --N--G--R--G--N--Q--Q--Q--N--G--S--L--E--W--H--S--G--G--K--Q    136

                                                                          
   601 ATATCTTCCTAATAATGGCATGGCTAAGGCTGGTAGATCACCTGCTCGAGAAATTGCTCG    660
   408 ATATCTTCCTAATAATGGCATGGCTAAGGCTGGTAGATCACCTGCTCGAGAAATTGCTCG    467
   136 --Y--L--P--N--N--G--M--A--K--A--G--R--S--P--A--R--E--I--A--R    156

                                                                          
   661 TCAAGGTTCAGGACCTCAACAATTTTCATATTCCAGACCTATTCATATTCCACTCCCGAA    720
   468 TCAAGGTTCAGGACCTCAACAATTTTCATATTCCAGACCTATTCATATTCCACTCCCGAA    527
   156 --Q--G--S--G--P--Q--Q--F--S--Y--S--R--P--I--H--I--P--L--P--K    176

                                                                          
   721 GGAGGAAACATTATCCCGTCATTCTATCTTGGGTCCCAATGGGCTTCGTGGCCAGTGGCA    780
   528 GGAGGAAACATTATCCCGTCATTCTATCTTGGGTCCCAATGGGCTTCGTGGCCAGTGGCA    587
   176 --E--E--T--L--S--R--H--S--I--L--G--P--N--G--L--R--G--Q--W--Q    196

                                                                          
   781 ACCACCTACCATTGATAAAGGGGTCCAATATCCACGTATTTTGGATGTGTCTCCCGTTGA    840
   588 ACCACCTACCATTGATAAAGGGGTCCAATATCCACGTATTTTGGATGTGTCTCCCGTTGA    647
   196 --P--P--T--I--D--K--G--V--Q--Y--P--R--I--L--D--V--S--P--V--D    216

                                                                          
   841 CATTCCAAGCTTACAACAATCAATAGACAAACTTACAATAGAAAAAGATCTTGGAAACTT    900
   648 CATTCCAAGCTTACAACAATCAATAGACAAACTTACAATAGAAAAAGATCTTGGAAACTT    707
   216 --I--P--S--L--Q--Q--S--I--D--K--L--T--I--E--K--D--L--G--N--L    236

                                                                          
   901 GGAAAAAAAAGGATCTGATATAGAATCAATCTGCACCCAGAATAATGATCACGAGAATAA    960
   708 GGAAAAAAAAGGATCTGATATAGAATCAATCTGCACCCAGAATAATGATCACGAGAATAA    767
   236 --E--K--K--G--S--D--I--E--S--I--C--T--Q--N--N--D--H--E--N--N    256

                                                                          
   961 TGCCACGGAAACAGATTCCTTGATCTCGTTTGAAAATGTTGAGATGCCTGCCCCTATTGA   1020
   768 TGCCACGGAAACAGATTCCTTGATCTCGTTTGAAAATGTTGAGATGCCTGCCCCTATTGA    827
   256 --A--T--E--T--D--S--L--I--S--F--E--N--V--E--M--P--A--P--I--E    276

                                                                          
  1021 AATTGTGCGGCAGCCTTCTCCTCCACCTGTACTTGCTGAAGTACAGGATCTGATACCTGC   1080
   828 AATTGTGCGGCAGCCTTCTCCTCCACCTGTACTTGCTGAAGTACAGGATCTGATACCTGC    887
   276 --I--V--R--Q--P--S--P--P--P--V--L--A--E--V--Q--D--L--I--P--A    296

                                                                          
  1081 AGTGTCACCTCAAGTTTCGGAGGTAGAATGTGCAAGAGACACTTCATTGTCGGATGGTTT   1140
   888 AGTGTCACCTCAAGTTTCGGAGGTAGAATGTGCAAGAGACACTTCATTGTCGGATGGTTT    947
   296 --V--S--P--Q--V--S--E--V--E--C--A--R--D--T--S--L--S--D--G--F    316

                                                                          
  1141 TGTTCATCCTGAACCTTCTATGCAGTTGCATATTTCAACCACGATGATGGAGAGTTTCAT   1200
   948 TGTTCATCCTGAACCTTCTATGCAGTTGCATATTTCAACCACGATGATGGAGAGTTTCAT   1007
   316 --V--H--P--E--P--S--M--Q--L--H--I--S--T--T--M--M--E--S--F--M    336

                                                                          
  1201 GAGGCTAGCCAAGTCAAATACTGCCAAGAATTTAGAAACCTGTGGTGTTCTTGCCGGTTC   1260
  1008 GAGGCTAGCCAAGTCAAATACTGCCAAGAATTTAGAAACCTGTGGTGTTCTTGCCGGTTC   1067
   336 --R--L--A--K--S--N--T--A--K--N--L--E--T--C--G--V--L--A--G--S    356

                                                                          
  1261 ACTTAAAAACAGAAAATTTTACATCACTGCATTAATTGTACCAAAGCAGGAGTCAACACC   1320
  1068 ACTTAAAAACAGAAAATTTTACATCACTGCATTAATTGTACCAAAGCAGGAGTCAACACC   1127
   356 --L--K--N--R--K--F--Y--I--T--A--L--I--V--P--K--Q--E--S--T--P    376

                                                                          
  1321 AAATACTTGTCAGGCAACAAATGAAGAAGAGATATTTGACGTGCAGGATAAGCGGTCTCT   1380
  1128 AAATACTTGTCAGGCAACAAATGAAGAAGAGATATTTGACGTGCAGGATAAGCGGTCTCT   1187
   376 --N--T--C--Q--A--T--N--E--E--E--I--F--D--V--Q--D--K--R--S--L    396

                                                                          
  1381 ATTCCCACTTGGGTGGATTCATACACATCCTACACAGTCATGCTTCATGTCGTCCGTTGA   1440
  1188 ATTCCCACTTGGGTGGATTCATACACATCCTACACAGTCATGCTTCATGTCGTCCGTTGA   1247
   396 --F--P--L--G--W--I--H--T--H--P--T--Q--S--C--F--M--S--S--V--D    416

                                                                          
  1441 TGTCCACACACATTACTCATATCAGGTAATGTTGCCTGAAGCTGTTGCAATTGTAATGGC   1500
  1248 TGTCCACACACATTACTCATATCAGGTAATGTTGCCTGAAGCTGTTGCAATTGTAATGGC   1307
   416 --V--H--T--H--Y--S--Y--Q--V--M--L--P--E--A--V--A--I--V--M--A    436

                                                                          
  1501 TCCCAAGGACAGTGCAAGAACCCATGGTATTTTCCGGTTGACAACTCCCGGCGGCATGTC   1560
  1308 TCCCAAGGACAGTGCAAGAACCCATGGTATTTTCCGGTTGACAACTCCCGGCGGCATGTC   1367
   436 --P--K--D--S--A--R--T--H--G--I--F--R--L--T--T--P--G--G--M--S    456

                                                                          
  1561 AGTGATTCGGCAATGCCAACAACGTGGCTTTCACTCACATGGTCAGCCTCCTGATGGCGG   1620
  1368 AGTGATTCGGCAATGCCAACAACGTGGCTTTCACTCACATGGTCAGCCTCCTGATGGCGG   1427
   456 --V--I--R--Q--C--Q--Q--R--G--F--H--S--H--G--Q--P--P--D--G--G    476

                                                                          
  1621 ACCCATTTACAAAACCTGTACAGATATATACATGGACCCCAATTTGAAATTTGATGTCAT   1680
  1428 ACCCATTTACAAAACCTGTACAGATATATACATGGACCCCAATTTGAAATTTGATGTCAT   1487
   476 --P--I--Y--K--T--C--T--D--I--Y--M--D--P--N--L--K--F--D--V--I    496

                                                                          
  1681 TGATCTTCGATGATCACAACCATTGAATCTCGAACCAGTATTTTTGTGGCATTCAATCAA   1740
  1488 TGATCTTCGATGA...............................................   1500
   496 --D--L--R--*-...............................................    499

                                                                          
  1741 ACACTCCTAATTGTTCGTACAGATCTAAAGTTCCATCAATAGAGGCAAGCTTCTTTAATT   1800
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1801 TTGTTCATACGTACACTTCACCTCCAGTGGCAACGATGTTCAGTCTTCTTTTAGCTTGAG   1860
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1861 CTTTTGCGCACCAAGTAATTTCTCGATACTAAAAGTAAAGAGATCACATTGAAACAAACA   1920
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1921 CGTTAGTAAAGAGATCTCACTAAAACAAACACGTCCAAACGAGTGTTTCTTGTACAAACA   1980
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1981 TGCTTGCATTGTATAAGCAAGGAATTCTATACCTTACAAAATGGCTTCAGGATCCAATAT   2040
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2041 TGAGAAAATTACTCTTGTTAATAGATTACAAATGATGAATGGATGTTTCGGTTTGTTTTG   2100
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2101 ATACGT                                                         2106
       ......                                                             
       ......