Description
AMSH-like ubiquitin thioesterase 1 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT1G48790) UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8VYB5]
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- KGN64127 2106 499aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0A0LTN8 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ACGAATTGCGTTTTTCTATTCTACTCCGCCAAGCCTGACGCCCGAATCCACCATTGAAGA 60
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............................................................
61 GCCCACAAGTCTTTGCTGTGAAGCTTACTGGTCGGAGTAACGATCTAGGTTTTCAGATCA 120
............................................................
............................................................
121 CGGAAAATGGTTGTATCAATTTCGGAAGGGAAGCGAAGGTGAGAGACAACAGTTCTCTTC 180
............................................................
............................................................
181 AGAGGGTATCAGA ATG AGA CCT TCT TCG GAT AGA ATC AAC ATC GCC GCC AGT ACC CGG CG 240
.............ATGAGACCTTCTTCGGATAGAATCAACATCGCCGCCAGTACCCGGCG 47
.............-M--R--P--S--S--D--R--I--N--I--A--A--S--T--R--R 16
241 G GTC GTT GTT GAC AAT CGA TTT CCT CTT CGT TAT TAC TAT CGT GTC GCC GAT AAT GTT TT 300
48 GGTCGTTGTTGACAATCGATTTCCTCTTCGTTATTACTATCGTGTCGCCGATAATGTTTT 107
16 --V--V--V--D--N--R--F--P--L--R--Y--Y--Y--R--V--A--D--N--V--L 36
301 G AAA CAG GCT GAC ATC TTT CGA GCA GAG AAG AAC ATA ATC GAT CTT TAT GTC ATG TTA AT 360
108 GAAACAGGCTGACATCTTTCGAGCAGAGAAGAACATAATCGATCTTTATGTCATGTTAAT 167
36 --K--Q--A--D--I--F--R--A--E--K--N--I--I--D--L--Y--V--M--L--M 56
361 G AGA TTT TCA AG T TTG GTC ACT GAG ACG ATA CCT CGT CAT TTG GAG TAT GGG ACA ACT CC 420
168 GAGATTTTCAAGTTTGGTCACTGAGACGATACCTCGTCATTTGGAGTATGGGACAACTCC 227
56 --R--F--S--S--L--V--T--E--T--I--P--R--H--L--E--Y--G--T--T--P 76
421 A AAA TTC CAA AAA AAT CAT TTT AGA AAG A AG CTA TTA GAT GCT TTG AGC GAG CTT GAA GA 480
228 AAAATTCCAAAAAAATCATTTTAGAAAGAAGCTATTAGATGCTTTGAGCGAGCTTGAAGA 287
76 --K--F--Q--K--N--H--F--R--K--K--L--L--D--A--L--S--E--L--E--E 96
481 G TTG AAG CCA GCA GTG CAA AGA AAG GTG GAT GAA ATA AAT GGG AAA CAA AAA TAT CAA GT 540
288 GTTGAAGCCAGCAGTGCAAAGAAAGGTGGATGAAATAAATGGGAAACAAAAATATCAAGT 347
96 --L--K--P--A--V--Q--R--K--V--D--E--I--N--G--K--Q--K--Y--Q--V 116
541 T AAC GGG CGG GGT AAT CAG CAA CAA AAT GGT TCA TTG GAA TGG CAT TCT GGT GGA AAG CA 600
348 TAACGGGCGGGGTAATCAGCAACAAAATGGTTCATTGGAATGGCATTCTGGTGGAAAGCA 407
116 --N--G--R--G--N--Q--Q--Q--N--G--S--L--E--W--H--S--G--G--K--Q 136
601 A TAT CTT CCT AAT AAT GGC ATG GCT AAG GCT GGT AGA TCA CCT GCT CGA GAA ATT GCT CG 660
408 ATATCTTCCTAATAATGGCATGGCTAAGGCTGGTAGATCACCTGCTCGAGAAATTGCTCG 467
136 --Y--L--P--N--N--G--M--A--K--A--G--R--S--P--A--R--E--I--A--R 156
661 T CAA GGT TCA GGA CCT CAA CAA TTT TCA TAT TCC AG A CCT ATT CAT ATT CCA CTC CCG AA 720
468 TCAAGGTTCAGGACCTCAACAATTTTCATATTCCAGACCTATTCATATTCCACTCCCGAA 527
156 --Q--G--S--G--P--Q--Q--F--S--Y--S--R--P--I--H--I--P--L--P--K 176
721 G GAG GAA ACA TTA TCC CGT CAT TCT ATC TTG GGT CCC AAT GGG CTT CGT GGC CAG TGG CA 780
528 GGAGGAAACATTATCCCGTCATTCTATCTTGGGTCCCAATGGGCTTCGTGGCCAGTGGCA 587
176 --E--E--T--L--S--R--H--S--I--L--G--P--N--G--L--R--G--Q--W--Q 196
781 A CCA CCT ACC ATT GAT AAA GGG GTC CAA TAT CCA CGT ATT TTG GAT GTG TCT CCC GTT GA 840
588 ACCACCTACCATTGATAAAGGGGTCCAATATCCACGTATTTTGGATGTGTCTCCCGTTGA 647
196 --P--P--T--I--D--K--G--V--Q--Y--P--R--I--L--D--V--S--P--V--D 216
841 C ATT CCA AG C TTA CAA CAA TCA ATA GAC AAA CTT ACA ATA GAA AAA GAT CTT GGA AAC TT 900
648 CATTCCAAGCTTACAACAATCAATAGACAAACTTACAATAGAAAAAGATCTTGGAAACTT 707
216 --I--P--S--L--Q--Q--S--I--D--K--L--T--I--E--K--D--L--G--N--L 236
901 G GAA AAA AAA GGA TCT GAT ATA GAA TCA ATC TGC ACC CAG AAT AAT GAT CAC GAG AAT AA 960
708 GGAAAAAAAAGGATCTGATATAGAATCAATCTGCACCCAGAATAATGATCACGAGAATAA 767
236 --E--K--K--G--S--D--I--E--S--I--C--T--Q--N--N--D--H--E--N--N 256
961 T GCC ACG GAA ACA GAT TCC TTG ATC TCG TTT GAA AAT GTT GAG ATG CCT GCC CCT ATT GA 1020
768 TGCCACGGAAACAGATTCCTTGATCTCGTTTGAAAATGTTGAGATGCCTGCCCCTATTGA 827
256 --A--T--E--T--D--S--L--I--S--F--E--N--V--E--M--P--A--P--I--E 276
1021 A ATT GTG CGG CAG CCT TCT CCT CCA CCT GTA CTT GCT GAA GTA CAG GAT CTG ATA CCT GC 1080
828 AATTGTGCGGCAGCCTTCTCCTCCACCTGTACTTGCTGAAGTACAGGATCTGATACCTGC 887
276 --I--V--R--Q--P--S--P--P--P--V--L--A--E--V--Q--D--L--I--P--A 296
1081 A GTG TCA CCT CAA GTT TCG GAG GTA GAA TGT GCA AGA GAC ACT TCA TTG TCG GAT GGT TT 1140
888 AGTGTCACCTCAAGTTTCGGAGGTAGAATGTGCAAGAGACACTTCATTGTCGGATGGTTT 947
296 --V--S--P--Q--V--S--E--V--E--C--A--R--D--T--S--L--S--D--G--F 316
1141 T GTT CAT CCT GAA CCT TCT ATG CAG TTG CAT ATT TCA ACC ACG ATG ATG GAG AGT TTC AT 1200
948 TGTTCATCCTGAACCTTCTATGCAGTTGCATATTTCAACCACGATGATGGAGAGTTTCAT 1007
316 --V--H--P--E--P--S--M--Q--L--H--I--S--T--T--M--M--E--S--F--M 336
1201 G AGG CTA GCC AAG TCA AAT ACT GCC AAG AAT TTA GAA ACC TGT GGT GTT CTT GCC GGT TC 1260
1008 GAGGCTAGCCAAGTCAAATACTGCCAAGAATTTAGAAACCTGTGGTGTTCTTGCCGGTTC 1067
336 --R--L--A--K--S--N--T--A--K--N--L--E--T--C--G--V--L--A--G--S 356
1261 A CTT A AA AAC AGA AAA TTT TAC ATC ACT GCA TTA ATT GTA CCA AAG CAG GAG TCA ACA CC 1320
1068 ACTTAAAAACAGAAAATTTTACATCACTGCATTAATTGTACCAAAGCAGGAGTCAACACC 1127
356 --L--K--N--R--K--F--Y--I--T--A--L--I--V--P--K--Q--E--S--T--P 376
1321 A AAT ACT TGT CAG GCA ACA AAT GAA GAA GAG ATA TTT GAC GTG CAG GAT AAG CGG TCT CT 1380
1128 AAATACTTGTCAGGCAACAAATGAAGAAGAGATATTTGACGTGCAGGATAAGCGGTCTCT 1187
376 --N--T--C--Q--A--T--N--E--E--E--I--F--D--V--Q--D--K--R--S--L 396
1381 A TTC CCA CTT GGG TGG ATT CAT ACA CAT CCT ACA CAG TCA TGC TTC ATG TCG TCC GTT GA 1440
1188 ATTCCCACTTGGGTGGATTCATACACATCCTACACAGTCATGCTTCATGTCGTCCGTTGA 1247
396 --F--P--L--G--W--I--H--T--H--P--T--Q--S--C--F--M--S--S--V--D 416
1441 T GTC CAC ACA CAT TAC TCA TAT CAG GTA ATG TTG CCT GAA GCT GTT GCA ATT GTA ATG GC 1500
1248 TGTCCACACACATTACTCATATCAGGTAATGTTGCCTGAAGCTGTTGCAATTGTAATGGC 1307
416 --V--H--T--H--Y--S--Y--Q--V--M--L--P--E--A--V--A--I--V--M--A 436
1501 T CCC AAG GAC AGT GCA AG A ACC CAT GGT ATT TTC CGG TTG ACA ACT CCC GGC GGC ATG TC 1560
1308 TCCCAAGGACAGTGCAAGAACCCATGGTATTTTCCGGTTGACAACTCCCGGCGGCATGTC 1367
436 --P--K--D--S--A--R--T--H--G--I--F--R--L--T--T--P--G--G--M--S 456
1561 A GTG ATT CGG CAA TGC CAA CAA CGT GGC TTT CAC TCA CAT GGT CAG CCT CCT GAT GGC GG 1620
1368 AGTGATTCGGCAATGCCAACAACGTGGCTTTCACTCACATGGTCAGCCTCCTGATGGCGG 1427
456 --V--I--R--Q--C--Q--Q--R--G--F--H--S--H--G--Q--P--P--D--G--G 476
1621 A CCC ATT TAC AAA ACC TGT ACA GAT ATA TAC ATG GAC CCC AAT TTG AAA TTT GAT GTC AT 1680
1428 ACCCATTTACAAAACCTGTACAGATATATACATGGACCCCAATTTGAAATTTGATGTCAT 1487
476 --P--I--Y--K--T--C--T--D--I--Y--M--D--P--N--L--K--F--D--V--I 496
1681 T GAT CTT CGA TGA TCACAACCATTGAATCTCGAACCAGTATTTTTGTGGCATTCAATCAA 1740
1488 TGATCTTCGATGA............................................... 1500
496 --D--L--R--*-............................................... 499
1741 ACACTCCTAATTGTTCGTACAGATCTAAAGTTCCATCAATAGAGGCAAGCTTCTTTAATT 1800
............................................................
............................................................
1801 TTGTTCATACGTACACTTCACCTCCAGTGGCAACGATGTTCAGTCTTCTTTTAGCTTGAG 1860
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1861 CTTTTGCGCACCAAGTAATTTCTCGATACTAAAAGTAAAGAGATCACATTGAAACAAACA 1920
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1921 CGTTAGTAAAGAGATCTCACTAAAACAAACACGTCCAAACGAGTGTTTCTTGTACAAACA 1980
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1981 TGCTTGCATTGTATAAGCAAGGAATTCTATACCTTACAAAATGGCTTCAGGATCCAATAT 2040
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2041 TGAGAAAATTACTCTTGTTAATAGATTACAAATGATGAATGGATGTTTCGGTTTGTTTTG 2100
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2101 ATACGT 2106
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