Transcript: Bra029631.1
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Description
AT3G07200 (E=1e-046) | zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
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- Bra029631.1 1131 376aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M4ELG3 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GCA AAC CGT GCG CAT GTT CCA AAG TTT GGG GAC TGG AAC AAC CAA TCT CAA CCA TTC 60
1 ATGGCAAACCGTGCGCATGTTCCAAAGTTTGGGGACTGGAACAACCAATCTCAACCATTC 60
1 -M--A--N--R--A--H--V--P--K--F--G--D--W--N--N--Q--S--Q--P--F- 20
61 ACA GCC GTC TTC GAC AAC GCT AGG ACG AAC AAA CGA GCT GAC TTG TAC GAC TCT CTG GAG 120
61 ACAGCCGTCTTCGACAACGCTAGGACGAACAAACGAGCTGACTTGTACGACTCTCTGGAG 120
21 -T--A--V--F--D--N--A--R--T--N--K--R--A--D--L--Y--D--S--L--E- 40
121 AAC TCT GAC ATC AAA ACT CAA GCA AAG CCT CCT CCA CAA CAA CCT ACT CCT ATA ATT CCA 180
121 AACTCTGACATCAAAACTCAAGCAAAGCCTCCTCCACAACAACCTACTCCTATAATTCCA 180
41 -N--S--D--I--K--T--Q--A--K--P--P--P--Q--Q--P--T--P--I--I--P- 60
181 AAA CCG GCT AGA GCG CCA CCA CCA ACC GAG ACA AAC AAA GTC AGA GCT CCT CCT GCC GAT 240
181 AAACCGGCTAGAGCGCCACCACCAACCGAGACAAACAAAGTCAGAGCTCCTCCTGCCGAT 240
61 -K--P--A--R--A--P--P--P--T--E--T--N--K--V--R--A--P--P--A--D- 80
241 CAG CTC TAC GGA GCT AGA GGC GGA CTA TAC GGA GGT TAT GGA GGT GGA GGC GGA TCC GGA 300
241 CAGCTCTACGGAGCTAGAGGCGGACTATACGGAGGTTATGGAGGTGGAGGCGGATCCGGA 300
81 -Q--L--Y--G--A--R--G--G--L--Y--G--G--Y--G--G--G--G--G--S--G- 100
301 AAC CAA CGG CAG CCG CAG GTT CCT CCT CGT CCA CCA CAG ACA CAG CCT AAA CCC AAT AGA 360
301 AACCAACGGCAGCCGCAGGTTCCTCCTCGTCCACCACAGACACAGCCTAAACCCAATAGA 360
101 -N--Q--R--Q--P--Q--V--P--P--R--P--P--Q--T--Q--P--K--P--N--R- 120
361 GGC GGC AAC AAC GGA AGG GGA GGG ACG ACG ATT CCA CCA TTT CCA GGA TCA GTG GGA TCA 420
361 GGCGGCAACAACGGAAGGGGAGGGACGACGATTCCACCATTTCCAGGATCAGTGGGATCA 420
121 -G--G--N--N--G--R--G--G--T--T--I--P--P--F--P--G--S--V--G--S- 140
421 GGG GAT CAG AAC ATG AGT TAC ACA CAC ATT TTC GAC CAA GTC AAA GAA GAG AGG CGA GAT 480
421 GGGGATCAGAACATGAGTTACACACACATTTTCGACCAAGTCAAAGAAGAGAGGCGAGAT 480
141 -G--D--Q--N--M--S--Y--T--H--I--F--D--Q--V--K--E--E--R--R--D- 160
481 GCC AGA TCC AAC GGT GGA TCA GTA GGT AAC ACT CCA TCT CGC CTT ATC AAC GAT GAT CAA 540
481 GCCAGATCCAACGGTGGATCAGTAGGTAACACTCCATCTCGCCTTATCAACGATGATCAA 540
161 -A--R--S--N--G--G--S--V--G--N--T--P--S--R--L--I--N--D--D--Q- 180
541 CGG TCA CGT GAT CAA TCT ACT GCT CCA GGC TCC TTC AAG G TG GTT ATG AGT TCA CGG AGT 600
541 CGGTCACGTGATCAATCTACTGCTCCAGGCTCCTTCAAGGTGGTTATGAGTTCACGGAGT 600
181 -R--S--R--D--Q--S--T--A--P--G--S--F--K--V--V--M--S--S--R--S- 200
601 GAG AGG GTA GTT ACC AGA AGC TCA AGG AGG TCA AAC AAT GTG AAT GGG ACA CAA CAA AGT 660
601 GAGAGGGTAGTTACCAGAAGCTCAAGGAGGTCAAACAATGTGAATGGGACACAACAAAGT 660
201 -E--R--V--V--T--R--S--S--R--R--S--N--N--V--N--G--T--Q--Q--S- 220
661 GAA CAA CCA AGA GCT GGA CAA CAA CCT CCG ATT GTG TCT GGT CCA CCG ACA ATC GAT GTT 720
661 GAACAACCAAGAGCTGGACAACAACCTCCGATTGTGTCTGGTCCACCGACAATCGATGTT 720
221 -E--Q--P--R--A--G--Q--Q--P--P--I--V--S--G--P--P--T--I--D--V- 240
721 GAT GCT ATT GAG GAT GAT GAT GAT GTT GTT GAA TCA ACT GCT TCT GCT TTT GAT CGA GCT 780
721 GATGCTATTGAGGATGATGATGATGTTGTTGAATCAACTGCTTCTGCTTTTGATCGAGCT 780
241 -D--A--I--E--D--D--D--D--V--V--E--S--T--A--S--A--F--D--R--A- 260
781 AAA AGA CAC AAG TCC GGA GGC TCA CAG AGA GGA CCC TTA GTA GTT GAT GTA GAG TCA G GT 840
781 AAAAGACACAAGTCCGGAGGCTCACAGAGAGGACCCTTAGTAGTTGATGTAGAGTCAGGT 840
261 -K--R--H--K--S--G--G--S--Q--R--G--P--L--V--V--D--V--E--S--G- 280
841 GGT ACC ACT AGA CTA AGC AAG AAC CGC ACA AAG CGT CAA TCT GAT CAA GCT AAT GTT GAC 900
841 GGTACCACTAGACTAAGCAAGAACCGCACAAAGCGTCAATCTGATCAAGCTAATGTTGAC 900
281 -G--T--T--R--L--S--K--N--R--T--K--R--Q--S--D--Q--A--N--V--D- 300
901 CAT AAC AAT CCG A GG AAG TCC AAG ACC GTA GCT CCT CCT GTA GAG GAA CCA AAG TTC AAC 960
901 CATAACAATCCGAGGAAGTCCAAGACCGTAGCTCCTCCTGTAGAGGAACCAAAGTTCAAC 960
301 -H--N--N--P--R--K--S--K--T--V--A--P--P--V--E--E--P--K--F--N- 320
961 TGC CCA ATT TGC ATG TGT CCA TTC ACT GAG GAA GTC TCA ACA AAG TGT GGT CAT ATC TTC 1020
961 TGCCCAATTTGCATGTGTCCATTCACTGAGGAAGTCTCAACAAAGTGTGGTCATATCTTC 1020
321 -C--P--I--C--M--C--P--F--T--E--E--V--S--T--K--C--G--H--I--F- 340
1021 TGC AAA AAA TGC ATA AAG CTC GCG GTG TCT GTT CAA GCT AAA TGC CCT ACG TGT AGA AAA 1080
1021 TGCAAAAAATGCATAAAGCTCGCGGTGTCTGTTCAAGCTAAATGCCCTACGTGTAGAAAA 1080
341 -C--K--K--C--I--K--L--A--V--S--V--Q--A--K--C--P--T--C--R--K- 360
1081 AGG GTC ATT GCT AAA GAC CTC ATC CGA GTC TTC CTT CCT ACC ACC AGA TGA 1131
1081 AGGGTCATTGCTAAAGACCTCATCCGAGTCTTCCTTCCTACCACCAGATGA 1131
361 -R--V--I--A--K--D--L--I--R--V--F--L--P--T--T--R--*- 376
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