Brassica rapa (Brapa_1.0)
Description

AT1G63840 (E=4e-061) | zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein

Location
About this transcript

This transcript has 1 exon and is annotated with 11 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene Bra027782 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-Bra027782.1507168aa
 
Protein coding
A0A3P5YF77 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
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Markup
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     1 ATGGGTTTTCCGGTGGGCTACTCCGAGCTCCTTCTCCCAAGAATCTTCCTTCATTTACTC     60
     1 ATGGGTTTTCCGGTGGGCTACTCCGAGCTCCTTCTCCCAAGAATCTTCCTTCATTTACTC     60
     1 -M--G--F--P--V--G--Y--S--E--L--L--L--P--R--I--F--L--H--L--L-     20

                                                                          
    61 TCTTTCTTAGGTCTGATCCGAAAACTAATCTCCACTATTTTCTGGCTCATTGGTTTACCC    120
    61 TCTTTCTTAGGTCTGATCCGAAAACTAATCTCCACTATTTTCTGGCTCATTGGTTTACCC    120
    21 -S--F--L--G--L--I--R--K--L--I--S--T--I--F--W--L--I--G--L--P-     40

                                                                          
   121 GATTTCCTAGAACCCGAACCGGTTTCATCTTCATGGCCCGAGCCCCCACCAACCTCAAGC    180
   121 GATTTCCTAGAACCCGAACCGGTTTCATCTTCATGGCCCGAGCCCCCACCAACCTCAAGC    180
    41 -D--F--L--E--P--E--P--V--S--S--S--W--P--E--P--P--P--T--S--S-     60

                                                                          
   181 CACCAAGACTCTCACTTGTTTTCAGCAGCGCTTCTAGCTGGAGATATCTTGCCCGTTGTA    240
   181 CACCAAGACTCTCACTTGTTTTCAGCAGCGCTTCTAGCTGGAGATATCTTGCCCGTTGTA    240
    61 -H--Q--D--S--H--L--F--S--A--A--L--L--A--G--D--I--L--P--V--V-     80

                                                                          
   241 AGATTCTCGGATCTAAACCTACCCGAGTCCGAATGTTGTGCAGTGTGTCTCTACGACTTC    300
   241 AGATTCTCGGATCTAAACCTACCCGAGTCCGAATGTTGTGCAGTGTGTCTCTACGACTTC    300
    81 -R--F--S--D--L--N--L--P--E--S--E--C--C--A--V--C--L--Y--D--F-    100

                                                                          
   301 GAGAACCACGATGAGATCCGACGGCTGACGAATTGCAGGCATATATTCCATAAAGGATGT    360
   301 GAGAACCACGATGAGATCCGACGGCTGACGAATTGCAGGCATATATTCCATAAAGGATGT    360
   101 -E--N--H--D--E--I--R--R--L--T--N--C--R--H--I--F--H--K--G--C-    120

                                                                          
   361 TTGGACCGTTGGATGATGGATTATAATCAGATAACATGTCCACTGTGTCGTACACAGTTT    420
   361 TTGGACCGTTGGATGATGGATTATAATCAGATAACATGTCCACTGTGTCGTACACAGTTT    420
   121 -L--D--R--W--M--M--D--Y--N--Q--I--T--C--P--L--C--R--T--Q--F-    140

                                                                          
   421 ATACCTGATGATCTTCAAGTGGCGTTTAATCATAAGCTTTGGGCTGAATCTAGTGAAGTT    480
   421 ATACCTGATGATCTTCAAGTGGCGTTTAATCATAAGCTTTGGGCTGAATCTAGTGAAGTT    480
   141 -I--P--D--D--L--Q--V--A--F--N--H--K--L--W--A--E--S--S--E--V-    160

                                                                          
   481 TCTGAACTTCTTGTTGAATCATTTTAG                                     507
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   161 -S--E--L--L--V--E--S--F--*-                                     168