Brassica rapa (Brapa_1.0)
Description

AT1G60220 (E=3e-212) OTS1, ULP1D | ULP1D (UB-LIKE PROTEASE 1D); SUMO-specific protease/ cysteine-type peptidase

Location
About this transcript

This transcript has 14 exons and is annotated with 15 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene Bra027164 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-Bra027164.11719572aa
 
Protein coding
M4EEF2 -Ensembl Canonical
Codons
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  • Alternating codons
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     1 ATGACGAAGGGGAAGCATGAAGTAGAAAAAGAGTCGGATTCTTCAGACAAGAAAGCTTTT     60
     1 ATGACGAAGGGGAAGCATGAAGTAGAAAAAGAGTCGGATTCTTCAGACAAGAAAGCTTTT     60
     1 -M--T--K--G--K--H--E--V--E--K--E--S--D--S--S--D--K--K--A--F-     20

                                                                          
    61 ACGATTGACTGGAACTCGGTGCTGGAAGACGACGGCGGCGGCGGAAAGGAGCATCAAGTG    120
    61 ACGATTGACTGGAACTCGGTGCTGGAAGACGACGGCGGCGGCGGAAAGGAGCATCAAGTG    120
    21 -T--I--D--W--N--S--V--L--E--D--D--G--G--G--G--K--E--H--Q--V-     40

                                                                          
   121 CCGGAGTTGGTGATTGTCAACACCCAAAATCCTCTCCCCGGCGATCAGATGGACTGCCAC    180
   121 CCGGAGTTGGTGATTGTCAACACCCAAAATCCTCTCCCCGGCGATCAGATGGACTGCCAC    180
    41 -P--E--L--V--I--V--N--T--Q--N--P--L--P--G--D--Q--M--D--C--H-     60

                                                                          
   181 CGAAACCTAACCGATCACGCGCTAGACGAGCAGCTGGAGCGTAACAAATCGCACCTTGTC    240
   181 CGAAACCTAACCGATCACGCGCTAGACGAGCAGCTGGAGCGTAACAAATCGCACCTTGTC    240
    61 -R--N--L--T--D--H--A--L--D--E--Q--L--E--R--N--K--S--H--L--V-     80

                                                                          
   241 AAATTAGGTCCGGGTCTACCCGACAATGGTGAGAAGATCCGTCTCAATATCGCTAGCCTC    300
   241 AAATTAGGTCCGGGTCTACCCGACAATGGTGAGAAGATCCGTCTCAATATCGCTAGCCTC    300
    81 -K--L--G--P--G--L--P--D--N--G--E--K--I--R--L--N--I--A--S--L-    100

                                                                          
   301 GAAGCCGAGAAGCAGCGCCGGGTGTTACATCTCTCCAATATGGATGCGGACAGAAGTTCG    360
   301 GAAGCCGAGAAGCAGCGCCGGGTGTTACATCTCTCCAATATGGATGCGGACAGAAGTTCG    360
   101 -E--A--E--K--Q--R--R--V--L--H--L--S--N--M--D--A--D--R--S--S-    120

                                                                          
   361 AAGCTCATGCATGCGAGTACCTCAGGTTCAGATGTGTTTACGCGAGGGAATGCAGCTTCA    420
   361 AAGCTCATGCATGCGAGTACCTCAGGTTCAGATGTGTTTACGCGAGGGAATGCAGCTTCA    420
   121 -K--L--M--H--A--S--T--S--G--S--D--V--F--T--R--G--N--A--A--S-    140

                                                                          
   421 ACAGAAGCCTCTAGACAAAGTAATACGGAATCAAAAGAAGTCTCACGGTCTACATTTGCT    480
   421 ACAGAAGCCTCTAGACAAAGTAATACGGAATCAAAAGAAGTCTCACGGTCTACATTTGCT    480
   141 -T--E--A--S--R--Q--S--N--T--E--S--K--E--V--S--R--S--T--F--A-    160

                                                                          
   481 GCTGTTTTCAGTAAACCCAAACCGGATAATACTCAGTCAACGAAAGCGTTTTGTAAAGAA    540
   481 GCTGTTTTCAGTAAACCCAAACCGGATAATACTCAGTCAACGAAAGCGTTTTGTAAAGAA    540
   161 -A--V--F--S--K--P--K--P--D--N--T--Q--S--T--K--A--F--C--K--E-    180

                                                                          
   541 CTAGAAGATTTGGGGTGTGCAAGTGTGAAACCCAAGGCGGAGAAAAAGATCGTGACAAGG    600
   541 CTAGAAGATTTGGGGTGTGCAAGTGTGAAACCCAAGGCGGAGAAAAAGATCGTGACAAGG    600
   181 -L--E--D--L--G--C--A--S--V--K--P--K--A--E--K--K--I--V--T--R-    200

                                                                          
   601 CAGAAGAATGAATGGCGGATTTTGTCAAAGGCAGTGGAAGAAAAGCAGACAGGGAATCAC    660
   601 CAGAAGAATGAATGGCGGATTTTGTCAAAGGCAGTGGAAGAAAAGCAGACAGGGAATCAC    660
   201 -Q--K--N--E--W--R--I--L--S--K--A--V--E--E--K--Q--T--G--N--H-    220

                                                                          
   661 AAATCCAAGGGATCTTATGGGAGGAAAAAGTACAAGGAGTCTTGCACTTACTCCCTTCTT    720
   661 AAATCCAAGGGATCTTATGGGAGGAAAAAGTACAAGGAGTCTTGCACTTACTCCCTTCTT    720
   221 -K--S--K--G--S--Y--G--R--K--K--Y--K--E--S--C--T--Y--S--L--L-    240

                                                                          
   721 GATGATGATGATGACGACTCCAATGGACATGAAACTCCTAAGGAGTGGTCTTGGGAAGAG    780
   721 GATGATGATGATGACGACTCCAATGGACATGAAACTCCTAAGGAGTGGTCTTGGGAAGAG    780
   241 -D--D--D--D--D--D--S--N--G--H--E--T--P--K--E--W--S--W--E--E-    260

                                                                          
   781 TATCCATCACAGAGTTCAAAGCGCCGTAAGAAAGCAGATGATTCAGTGATTAACATAGAC    840
   781 TATCCATCACAGAGTTCAAAGCGCCGTAAGAAAGCAGATGATTCAGTGATTAACATAGAC    840
   261 -Y--P--S--Q--S--S--K--R--R--K--K--A--D--D--S--V--I--N--I--D-    280

                                                                          
   841 GAAGAAGAACCTCAGCCTTCAACGGTGGCAGATCAAACAGTTGAACTGCCTGAAGGCTTA    900
   841 GAAGAAGAACCTCAGCCTTCAACGGTGGCAGATCAAACAGTTGAACTGCCTGAAGGCTTA    900
   281 -E--E--E--P--Q--P--S--T--V--A--D--Q--T--V--E--L--P--E--G--L-    300

                                                                          
   901 CAGGAAGATATATGCTACCCATCAAGTGATGATCCACACTTTGTTCAAGTTTGTCTTAAA    960
   901 CAGGAAGATATATGCTACCCATCAAGTGATGATCCACACTTTGTTCAAGTTTGTCTTAAA    960
   301 -Q--E--D--I--C--Y--P--S--S--D--D--P--H--F--V--Q--V--C--L--K-    320

                                                                          
   961 GATCTTGAATGCCTTGCACCTCAAGAATTTCTAAACTCTCCAGTCATGAATTTCTACATC   1020
   961 GATCTTGAATGCCTTGCACCTCAAGAATTTCTAAACTCTCCAGTCATGAATTTCTACATC   1020
   321 -D--L--E--C--L--A--P--Q--E--F--L--N--S--P--V--M--N--F--Y--I-    340

                                                                          
  1021 AGGTTCTTGCAGGAGCAGCAGGTATCTAACTATTGTCACTTCTTTAACACCTATTTCTAC   1080
  1021 AGGTTCTTGCAGGAGCAGCAGGTATCTAACTATTGTCACTTCTTTAACACCTATTTCTAC   1080
   341 -R--F--L--Q--E--Q--Q--V--S--N--Y--C--H--F--F--N--T--Y--F--Y-    360

                                                                          
  1081 AAGAAGCTCAGTGACGCTGTCACAAACAAGGGAAATGACAAGGCTGCCTCTTTTCTGAAG   1140
  1081 AAGAAGCTCAGTGACGCTGTCACAAACAAGGGAAATGACAAGGCTGCCTCTTTTCTGAAG   1140
   361 -K--K--L--S--D--A--V--T--N--K--G--N--D--K--A--A--S--F--L--K-    380

                                                                          
  1141 CTCAGGCGGTGGTGGAAGGGTATTGATTTATTCCGTAAGGCATATATATTTATACCAATA   1200
  1141 CTCAGGCGGTGGTGGAAGGGTATTGATTTATTCCGTAAGGCATATATATTTATACCAATA   1200
   381 -L--R--R--W--W--K--G--I--D--L--F--R--K--A--Y--I--F--I--P--I-    400

                                                                          
  1201 CATGAGGATGTCCATTGGAGCCTTATAATAGTTTGCATTCCTGACAAGGAAGATGAATCC   1260
  1201 CATGAGGATGTCCATTGGAGCCTTATAATAGTTTGCATTCCTGACAAGGAAGATGAATCC   1260
   401 -H--E--D--V--H--W--S--L--I--I--V--C--I--P--D--K--E--D--E--S-    420

                                                                          
  1261 GGATTGACCATACTTCACCTTGATTCATTAGGAGTTCATCCGAAAAGATCAATTGTTGAG   1320
  1261 GGATTGACCATACTTCACCTTGATTCATTAGGAGTTCATCCGAAAAGATCAATTGTTGAG   1320
   421 -G--L--T--I--L--H--L--D--S--L--G--V--H--P--K--R--S--I--V--E-    440

                                                                          
  1321 AATGTAAAAAGGTTTCTAAAAGATGAATGGAACTTTTTGAATCAGGATGATGATTATTCA   1380
  1321 AATGTAAAAAGGTTTCTAAAAGATGAATGGAACTTTTTGAATCAGGATGATGATTATTCA   1380
   441 -N--V--K--R--F--L--K--D--E--W--N--F--L--N--Q--D--D--D--Y--S-    460

                                                                          
  1381 TCAAATCTACCTATCTCAGAGAAACTATGGAGAAACCTCCCGCGCAGGATTAACGAAGCT   1440
  1381 TCAAATCTACCTATCTCAGAGAAACTATGGAGAAACCTCCCGCGCAGGATTAACGAAGCT   1440
   461 -S--N--L--P--I--S--E--K--L--W--R--N--L--P--R--R--I--N--E--A-    480

                                                                          
  1441 GATATAAAGGTTCCACAACAGAAGAATGATTTTGACTGTGGTCCGTTTGTTCTCTTCTTC   1500
  1441 GATATAAAGGTTCCACAACAGAAGAATGATTTTGACTGTGGTCCGTTTGTTCTCTTCTTC   1500
   481 -D--I--K--V--P--Q--Q--K--N--D--F--D--C--G--P--F--V--L--F--F-    500

                                                                          
  1501 ATCAAGCGGTTCATTGAAGAGGCTCCTCAAAGGCTGAAAAGGAAAGACCTTGGAATGTTC   1560
  1501 ATCAAGCGGTTCATTGAAGAGGCTCCTCAAAGGCTGAAAAGGAAAGACCTTGGAATGTTC   1560
   501 -I--K--R--F--I--E--E--A--P--Q--R--L--K--R--K--D--L--G--M--F-    520

                                                                          
  1561 GACAAGAAGTGGTTCAAACCTGACGAAGCCTCTGCTCTGAGAACCGAAATCCGAAACACA   1620
  1561 GACAAGAAGTGGTTCAAACCTGACGAAGCCTCTGCTCTGAGAACCGAAATCCGAAACACA   1620
   521 -D--K--K--W--F--K--P--D--E--A--S--A--L--R--T--E--I--R--N--T-    540

                                                                          
  1621 CTCATCAATCTTTTCTGTGTCAGTGACCAGACTGATCGCCACAACGACCCATCTGATGAC   1680
  1621 CTCATCAATCTTTTCTGTGTCAGTGACCAGACTGATCGCCACAACGACCCATCTGATGAC   1680
   541 -L--I--N--L--F--C--V--S--D--Q--T--D--R--H--N--D--P--S--D--D-    560

                                                                          
  1681 AATGGAGCATCCAAGTCAAGAGATGGCTCACCGCTCTAA                        1719
  1681 AATGGAGCATCCAAGTCAAGAGATGGCTCACCGCTCTAA                        1719
   561 -N--G--A--S--K--S--R--D--G--S--P--L--*-                         572