Transcript: Bra027164.1
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Description
AT1G60220 (E=3e-212) OTS1, ULP1D | ULP1D (UB-LIKE PROTEASE 1D); SUMO-specific protease/ cysteine-type peptidase
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- Bra027164.1 1719 572aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M4EEF2 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG ACG AAG GGG AAG CAT GAA GTA GAA AAA GAG TCG GAT TCT TCA GAC AAG AAA GCT TTT 60
1 ATGACGAAGGGGAAGCATGAAGTAGAAAAAGAGTCGGATTCTTCAGACAAGAAAGCTTTT 60
1 -M--T--K--G--K--H--E--V--E--K--E--S--D--S--S--D--K--K--A--F- 20
61 ACG ATT GAC TGG AAC TCG GTG CTG GAA GAC GAC GGC GGC GGC GGA AAG GAG CAT CAA GTG 120
61 ACGATTGACTGGAACTCGGTGCTGGAAGACGACGGCGGCGGCGGAAAGGAGCATCAAGTG 120
21 -T--I--D--W--N--S--V--L--E--D--D--G--G--G--G--K--E--H--Q--V- 40
121 CCG GAG TTG GTG ATT GTC AAC ACC CAA AAT CCT CTC CCC GGC GAT CAG ATG GAC TGC CAC 180
121 CCGGAGTTGGTGATTGTCAACACCCAAAATCCTCTCCCCGGCGATCAGATGGACTGCCAC 180
41 -P--E--L--V--I--V--N--T--Q--N--P--L--P--G--D--Q--M--D--C--H- 60
181 CGA AAC CTA ACC GAT CAC GCG CTA GAC GAG CAG CTG GAG CGT AAC AAA TCG CAC CTT GTC 240
181 CGAAACCTAACCGATCACGCGCTAGACGAGCAGCTGGAGCGTAACAAATCGCACCTTGTC 240
61 -R--N--L--T--D--H--A--L--D--E--Q--L--E--R--N--K--S--H--L--V- 80
241 AAA TTA GGT CCG GGT CTA CCC GAC AAT GGT GAG AAG ATC CGT CTC AAT ATC GCT AGC CTC 300
241 AAATTAGGTCCGGGTCTACCCGACAATGGTGAGAAGATCCGTCTCAATATCGCTAGCCTC 300
81 -K--L--G--P--G--L--P--D--N--G--E--K--I--R--L--N--I--A--S--L- 100
301 GAA GCC GAG AAG CAG CGC CGG GTG TTA CAT CTC TCC AAT ATG G AT GCG GAC AGA AGT TCG 360
301 GAAGCCGAGAAGCAGCGCCGGGTGTTACATCTCTCCAATATGGATGCGGACAGAAGTTCG 360
101 -E--A--E--K--Q--R--R--V--L--H--L--S--N--M--D--A--D--R--S--S- 120
361 AAG CTC ATG CAT GCG AGT ACC TCA G G T TCA GAT GTG TTT ACG CGA GGG AAT GCA GCT TCA 420
361 AAGCTCATGCATGCGAGTACCTCAGGTTCAGATGTGTTTACGCGAGGGAATGCAGCTTCA 420
121 -K--L--M--H--A--S--T--S--G--S--D--V--F--T--R--G--N--A--A--S- 140
421 ACA GAA GCC TCT AGA CAA AGT AAT ACG GAA TCA AAA GAA GTC TCA CGG TCT ACA TTT GCT 480
421 ACAGAAGCCTCTAGACAAAGTAATACGGAATCAAAAGAAGTCTCACGGTCTACATTTGCT 480
141 -T--E--A--S--R--Q--S--N--T--E--S--K--E--V--S--R--S--T--F--A- 160
481 GCT GTT TTC AGT AAA CCC AAA C CG GAT AAT ACT CAG TCA ACG AAA GCG TTT TGT AAA GAA 540
481 GCTGTTTTCAGTAAACCCAAACCGGATAATACTCAGTCAACGAAAGCGTTTTGTAAAGAA 540
161 -A--V--F--S--K--P--K--P--D--N--T--Q--S--T--K--A--F--C--K--E- 180
541 CTA GAA GAT TTG GGG TGT GCA AGT GTG AAA CCC AAG GCG GAG AAA AAG ATC GTG ACA AGG 600
541 CTAGAAGATTTGGGGTGTGCAAGTGTGAAACCCAAGGCGGAGAAAAAGATCGTGACAAGG 600
181 -L--E--D--L--G--C--A--S--V--K--P--K--A--E--K--K--I--V--T--R- 200
601 CAG AAG AAT GAA TGG CGG ATT TTG TCA AAG GCA GTG GAA GAA AAG CAG ACA GGG AAT CAC 660
601 CAGAAGAATGAATGGCGGATTTTGTCAAAGGCAGTGGAAGAAAAGCAGACAGGGAATCAC 660
201 -Q--K--N--E--W--R--I--L--S--K--A--V--E--E--K--Q--T--G--N--H- 220
661 AAA TCC AAG GGA TCT TAT GGG AGG AAA AAG TAC AAG GAG TCT TGC ACT TAC TCC CTT CTT 720
661 AAATCCAAGGGATCTTATGGGAGGAAAAAGTACAAGGAGTCTTGCACTTACTCCCTTCTT 720
221 -K--S--K--G--S--Y--G--R--K--K--Y--K--E--S--C--T--Y--S--L--L- 240
721 GAT GAT GAT GAT GAC GAC TCC AAT GGA CAT GAA ACT CCT AA G GAG TGG TCT TGG GAA GAG 780
721 GATGATGATGATGACGACTCCAATGGACATGAAACTCCTAAGGAGTGGTCTTGGGAAGAG 780
241 -D--D--D--D--D--D--S--N--G--H--E--T--P--K--E--W--S--W--E--E- 260
781 TAT CCA TCA CAG AGT TCA AAG CGC CGT AAG A AA GCA GAT GAT TCA GTG ATT AAC ATA GAC 840
781 TATCCATCACAGAGTTCAAAGCGCCGTAAGAAAGCAGATGATTCAGTGATTAACATAGAC 840
261 -Y--P--S--Q--S--S--K--R--R--K--K--A--D--D--S--V--I--N--I--D- 280
841 GAA GAA GAA CCT CAG CCT TCA ACG GTG GCA GAT CAA ACA GTT GAA CTG CCT GAA GG C TTA 900
841 GAAGAAGAACCTCAGCCTTCAACGGTGGCAGATCAAACAGTTGAACTGCCTGAAGGCTTA 900
281 -E--E--E--P--Q--P--S--T--V--A--D--Q--T--V--E--L--P--E--G--L- 300
901 CAG GAA GAT ATA TGC TAC CCA TCA AG T GAT GAT CCA CAC TTT GTT CAA GTT TGT CTT AAA 960
901 CAGGAAGATATATGCTACCCATCAAGTGATGATCCACACTTTGTTCAAGTTTGTCTTAAA 960
301 -Q--E--D--I--C--Y--P--S--S--D--D--P--H--F--V--Q--V--C--L--K- 320
961 GAT CTT GAA TGC CTT GCA CCT CAA GAA TTT CTA AAC TCT CCA GTC ATG AAT TTC TAC ATC 1020
961 GATCTTGAATGCCTTGCACCTCAAGAATTTCTAAACTCTCCAGTCATGAATTTCTACATC 1020
321 -D--L--E--C--L--A--P--Q--E--F--L--N--S--P--V--M--N--F--Y--I- 340
1021 AG G TTC TTG CAG GAG CAG CAG GTA TCT AAC TAT TGT CAC TTC TTT AAC ACC TAT TTC TAC 1080
1021 AGGTTCTTGCAGGAGCAGCAGGTATCTAACTATTGTCACTTCTTTAACACCTATTTCTAC 1080
341 -R--F--L--Q--E--Q--Q--V--S--N--Y--C--H--F--F--N--T--Y--F--Y- 360
1081 AAG AAG CTC AGT GAC GCT GTC ACA AAC AAG GGA AAT GAC AAG GCT GCC TCT TTT CTG AAG 1140
1081 AAGAAGCTCAGTGACGCTGTCACAAACAAGGGAAATGACAAGGCTGCCTCTTTTCTGAAG 1140
361 -K--K--L--S--D--A--V--T--N--K--G--N--D--K--A--A--S--F--L--K- 380
1141 CTC AGG CGG TGG TGG AAG GGT ATT GAT TTA TTC CGT AAG GCA TAT ATA TTT ATA CCA ATA 1200
1141 CTCAGGCGGTGGTGGAAGGGTATTGATTTATTCCGTAAGGCATATATATTTATACCAATA 1200
381 -L--R--R--W--W--K--G--I--D--L--F--R--K--A--Y--I--F--I--P--I- 400
1201 CAT GAG GA T GTC CAT TGG AGC CTT ATA ATA GTT TGC ATT CCT GAC AAG GAA GAT GAA TCC 1260
1201 CATGAGGATGTCCATTGGAGCCTTATAATAGTTTGCATTCCTGACAAGGAAGATGAATCC 1260
401 -H--E--D--V--H--W--S--L--I--I--V--C--I--P--D--K--E--D--E--S- 420
1261 GGA TTG ACC ATA CTT CAC CTT GAT TCA TTA GGA GTT CAT CCG AAA AGA TCA ATT GTT GAG 1320
1261 GGATTGACCATACTTCACCTTGATTCATTAGGAGTTCATCCGAAAAGATCAATTGTTGAG 1320
421 -G--L--T--I--L--H--L--D--S--L--G--V--H--P--K--R--S--I--V--E- 440
1321 AAT GTA AAA AG G TTT CTA AAA GAT GAA TGG AAC TTT TTG AAT CAG GAT GAT GAT TAT TCA 1380
1321 AATGTAAAAAGGTTTCTAAAAGATGAATGGAACTTTTTGAATCAGGATGATGATTATTCA 1380
441 -N--V--K--R--F--L--K--D--E--W--N--F--L--N--Q--D--D--D--Y--S- 460
1381 TCA AAT CTA CCT ATC TCA GAG AAA CTA TGG AGA AAC CTC CCG CGC AGG ATT AAC GAA GCT 1440
1381 TCAAATCTACCTATCTCAGAGAAACTATGGAGAAACCTCCCGCGCAGGATTAACGAAGCT 1440
461 -S--N--L--P--I--S--E--K--L--W--R--N--L--P--R--R--I--N--E--A- 480
1441 GAT ATA AAG GTT CCA CAA CAG AAG AAT GAT TTT GAC TGT GGT CCG TTT GTT CTC TTC TTC 1500
1441 GATATAAAGGTTCCACAACAGAAGAATGATTTTGACTGTGGTCCGTTTGTTCTCTTCTTC 1500
481 -D--I--K--V--P--Q--Q--K--N--D--F--D--C--G--P--F--V--L--F--F- 500
1501 ATC AAG CGG TTC ATT GAA GAG GCT CCT CAA AGG CTG AAA AGG AAA GAC CTT GGA ATG TTC 1560
1501 ATCAAGCGGTTCATTGAAGAGGCTCCTCAAAGGCTGAAAAGGAAAGACCTTGGAATGTTC 1560
501 -I--K--R--F--I--E--E--A--P--Q--R--L--K--R--K--D--L--G--M--F- 520
1561 GAC AAG AAG TGG TTC AAA CCT GAC GAA GCC TCT GCT CTG AGA ACC GAA ATC CGA AAC ACA 1620
1561 GACAAGAAGTGGTTCAAACCTGACGAAGCCTCTGCTCTGAGAACCGAAATCCGAAACACA 1620
521 -D--K--K--W--F--K--P--D--E--A--S--A--L--R--T--E--I--R--N--T- 540
1621 CTC ATC AAT CTT TTC TGT GTC AGT GAC CAG ACT GAT CGC CAC AAC GAC CCA TCT GAT GAC 1680
1621 CTCATCAATCTTTTCTGTGTCAGTGACCAGACTGATCGCCACAACGACCCATCTGATGAC 1680
541 -L--I--N--L--F--C--V--S--D--Q--T--D--R--H--N--D--P--S--D--D- 560
1681 AAT GGA GCA TCC AAG TCA AGA GAT GGC TCA CCG CTC TAA 1719
1681 AATGGAGCATCCAAGTCAAGAGATGGCTCACCGCTCTAA 1719
561 -N--G--A--S--K--S--R--D--G--S--P--L--*- 572
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