Transcript: Bra020107.1
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Description
AT5G20510 (E=2e-095) AL5 | AL5 (ALFIN-LIKE 5); DNA binding / methylated histone residue binding
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- Bra020107.1 765 254aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M4DUB4 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GAA GGA GGA GGA GGT GCC CGC TAC AAC CCT CGA ACT GTT GAA GAA GTC TTC CGA GAT 60
1 ATGGAAGGAGGAGGAGGTGCCCGCTACAACCCTCGAACTGTTGAAGAAGTCTTCCGAGAT 60
1 -M--E--G--G--G--G--A--R--Y--N--P--R--T--V--E--E--V--F--R--D- 20
61 TTC AAG GGC CGT CGT GCT GGC ATC CTC CGT GCT CTC ACC ACC G AT GTG AAA GAG TTT TTC 120
61 TTCAAGGGCCGTCGTGCTGGCATCCTCCGTGCTCTCACCACCGATGTGAAAGAGTTTTTC 120
21 -F--K--G--R--R--A--G--I--L--R--A--L--T--T--D--V--K--E--F--F- 40
121 CAG CAA TGC AAT CCT G A G AAG GAC AAC CTT TGC TTG TAT GGA TTC CCG AAT GAA GTG TGG 180
121 CAGCAATGCAATCCTGAGAAGGACAACCTTTGCTTGTATGGATTCCCGAATGAAGTGTGG 180
41 -Q--Q--C--N--P--E--K--D--N--L--C--L--Y--G--F--P--N--E--V--W- 60
181 GAA GTT AAC TTA CCA GCT GAA GAA GTG CCT CCT GAG CTC CCT GAG CCT GCG CTC GGC ATC 240
181 GAAGTTAACTTACCAGCTGAAGAAGTGCCTCCTGAGCTCCCTGAGCCTGCGCTCGGCATC 240
61 -E--V--N--L--P--A--E--E--V--P--P--E--L--P--E--P--A--L--G--I- 80
241 AAC TTT GCT AGA GAT GGA ATG CAG GAA AAA GAG TGG ATT TCT CTT GTT GCT GTC CAC AGT 300
241 AACTTTGCTAGAGATGGAATGCAGGAAAAAGAGTGGATTTCTCTTGTTGCTGTCCACAGT 300
81 -N--F--A--R--D--G--M--Q--E--K--E--W--I--S--L--V--A--V--H--S- 100
301 GAT GCC TGG TTG CTT TCT GTC TCC TTT TAC TTC GGT TCA AGA TTT GGT TTC GAT AAA GCT 360
301 GATGCCTGGTTGCTTTCTGTCTCCTTTTACTTCGGTTCAAGATTTGGTTTCGATAAAGCT 360
101 -D--A--W--L--L--S--V--S--F--Y--F--G--S--R--F--G--F--D--K--A- 120
361 GAC AG G AAG CGC TTG TTT AAC ATG ATA AAC GAG GTT CCT ACT GTA TTT GAA GTT GTA ACT 420
361 GACAGGAAGCGCTTGTTTAACATGATAAACGAGGTTCCTACTGTATTTGAAGTTGTAACT 420
121 -D--R--K--R--L--F--N--M--I--N--E--V--P--T--V--F--E--V--V--T- 140
421 GGA AGT GCG AAG AAA CAA ACA GAG GAA CAG CCT TCT TCA GTA AAC AGA AAT GGC AAC AGA 480
421 GGAAGTGCGAAGAAACAAACAGAGGAACAGCCTTCTTCAGTAAACAGAAATGGCAACAGA 480
141 -G--S--A--K--K--Q--T--E--E--Q--P--S--S--V--N--R--N--G--N--R- 160
481 TCC AAG TCT AAT TCA AAA GTG A GA GAT TTA GAA GTC AAA AGC TCA AGG ACA ATA GAG GTC 540
481 TCCAAGTCTAATTCAAAAGTGAGAGATTTAGAAGTCAAAAGCTCAAGGACAATAGAGGTC 540
161 -S--K--S--N--S--K--V--R--D--L--E--V--K--S--S--R--T--I--E--V- 180
541 AAC GAC GAG GAG GAA GGA GTA GAG GAA GAG GAA GAG GAT GAA GAG GAA CAC GGT GAG ACC 600
541 AACGACGAGGAGGAAGGAGTAGAGGAAGAGGAAGAGGATGAAGAGGAACACGGTGAGACC 600
181 -N--D--E--E--E--G--V--E--E--E--E--E--D--E--E--E--H--G--E--T- 200
601 CTA TGT GGA GCT TGT GGA GAT AAC TAT GCA TCT GAT TTC TGG ATT TGC TGC GAC ATG TGC 660
601 CTATGTGGAGCTTGTGGAGATAACTATGCATCTGATTTCTGGATTTGCTGCGACATGTGC 660
201 -L--C--G--A--C--G--D--N--Y--A--S--D--F--W--I--C--C--D--M--C- 220
661 GAG AAA TGG TTT CAT GGG AAG TGT GTG AAG ATC ACT CCA GCT AGA GCG GAG CAT ATC AAG 720
661 GAGAAATGGTTTCATGGGAAGTGTGTGAAGATCACTCCAGCTAGAGCGGAGCATATCAAG 720
221 -E--K--W--F--H--G--K--C--V--K--I--T--P--A--R--A--E--H--I--K- 240
721 CAA TAC AAG TGC CCT TCT TGC AGC AAC AAA AGA GCT CGT CCC TAA 765
721 CAATACAAGTGCCCTTCTTGCAGCAACAAAAGAGCTCGTCCCTAA 765
241 -Q--Y--K--C--P--S--C--S--N--K--R--A--R--P--*- 254
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