Transcript: Bra019958.1
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Description
AT1G10170 (E=0.0) ATNFXL1 | ATNFXL1 (ARABIDOPSIS THALIANA NF-X-LIKE 1); protein binding / transcription factor/ zinc ion binding
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- Bra019958.1 3474 1157aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M4DTW5 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
A TG TTT GGA AGT TAC CAA TTT CTA CAA TCT GAA TAT ATA TTT CTC ATT TGG TTG TAT AGA ATGTTTGGAAGTTACCAATTTCTACAATCTGAATATATATTTCTCATTTGGTTGTATAGA -M--F--G--S--Y--Q--F--L--Q--S--E--Y--I--F--L--I--W--L--Y--R- AGC ACT TTA GTG ACG ACG TGT GAA GGA TCT GGT TCT GTA TTT GTG GAG TCA GAG AAG AAC AGCACTTTAGTGACGACGTGTGAAGGATCTGGTTCTGTATTTGTGGAGTCAGAGAAGAAC -S--T--L--V--T--T--C--E--G--S--G--S--V--F--V--E--S--E--K--N- ATG AGC TCT CAA GTC AGG AGA GAT AGG CGT CAT CAG AGT TCT CAG CAA ACT TGG GTT CCT ATGAGCTCTCAAGTCAGGAGAGATAGGCGTCATCAGAGTTCTCAGCAAACTTGGGTTCCT -M--S--S--Q--V--R--R--D--R--R--H--Q--S--S--Q--Q--T--W--V--P- AGA GGT GCT TCT ACC TCC GTG GCG GTT GTA AAT GAG CCT TCA CAT CCT CCT GCT AAT AAT AGAGGTGCTTCTACCTCCGTGGCGGTTGTAAATGAGCCTTCACATCCTCCTGCTAATAAT -R--G--A--S--T--S--V--A--V--V--N--E--P--S--H--P--P--A--N--N- ACA GCC GGA GTT TCT GAA AGT CTT GTC GCT GGT GCT GCA TCA CGT CCT GTT TAT CCA CAA ACAGCCGGAGTTTCTGAAAGTCTTGTCGCTGGTGCTGCATCACGTCCTGTTTATCCACAA 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TGC CAT TCA GGT GAT TGC CCT CCT TGT CTTCCTTGTGGATTACATACTTGCAACGAGGTGTGCCATTCAGGTGATTGCCCTCCTTGT -L--P--C--G--L--H--T--C--N--E--V--C--H--S--G--D--C--P--P--C- TTA GTG CAA GTC AAC CAG AAA TGC CGG TGT GGG TCG ACA TCC AGG ACT GTG GAA TGC TAC TTAGTGCAAGTCAACCAGAAATGCCGGTGTGGGTCGACATCCAGGACTGTGGAATGCTAC -L--V--Q--V--N--Q--K--C--R--C--G--S--T--S--R--T--V--E--C--Y- ATA ACA ACT TCT TCA GAG ACG GAT AAG TTT GTG TGT TCT AAA CCA TGT GGG CGT AAG AAG ATAACAACTTCTTCAGAGACGGATAAGTTTGTGTGTTCTAAACCATGTGGGCGTAAGAAG -I--T--T--S--S--E--T--D--K--F--V--C--S--K--P--C--G--R--K--K- AAC TGT GGG AGA CAT AGA TGT AGT GAG CGT TGC TGC CCT CTC TTG AAC GCG AAG AAG AAT AACTGTGGGAGACATAGATGTAGTGAGCGTTGCTGCCCTCTCTTGAACGCGAAGAAGAAT -N--C--G--R--H--R--C--S--E--R--C--C--P--L--L--N--A--K--K--N- GAT CTA TCC GGT AAT TGG GAC GAA CAC GTA TGC CAA TTA CCT TGT GGG AAG AAG CTA AGG GATCTATCCGGTAATTGGGACGAACACGTATGCCAATTACCTTGTGGGAAGAAGCTAAGG -D--L--S--G--N--W--D--E--H--V--C--Q--L--P--C--G--K--K--L--R- TGC GGG CAG CAT TCC TGT GAA TCT TTG TGC CAT AGT GGC CAT TGC CCT CCT TGC CTC GAG TGCGGGCAGCATTCCTGTGAATCTTTGTGCCATAGTGGCCATTGCCCTCCTTGCCTCGAG -C--G--Q--H--S--C--E--S--L--C--H--S--G--H--C--P--P--C--L--E- ATG ATA TTC ACT GAT CTA ACA TGT GCG TGT GGA AAT ACT TCG ATT CCT CCA CCA CTA CCA ATGATATTCACTGATCTAACATGTGCGTGTGGAAATACTTCGATTCCTCCACCACTACCA -M--I--F--T--D--L--T--C--A--C--G--N--T--S--I--P--P--P--L--P- TGC GGG ACG CCT GTT CCT AGC TGC CAG CTT CCG TGC TCC ATT CCT CAG CCT TGT GGC CAT TGCGGGACGCCTGTTCCTAGCTGCCAGCTTCCGTGCTCCATTCCTCAGCCTTGTGGCCAT -C--G--T--P--V--P--S--C--Q--L--P--C--S--I--P--Q--P--C--G--H- TCT GCT ACG CAT GGA TGC CAT TTT GGA GAT TGC CCT CCT TGT TCT GCC CCA GTG GAA AAG TCTGCTACGCATGGATGCCATTTTGGAGATTGCCCTCCTTGTTCTGCCCCAGTGGAAAAG -S--A--T--H--G--C--H--F--G--D--C--P--P--C--S--A--P--V--E--K- AAA TGC GTT GGT GGT CAC GTG GTT CTG AGA AAC ATA CCT TGT GGG CTG AAA GAC ATC AGA AAATGCGTTGGTGGTCACGTGGTTCTGAGAAACATACCTTGTGGGCTGAAAGACATCAGA -K--C--V--G--G--H--V--V--L--R--N--I--P--C--G--L--K--D--I--R- TGT AAC AAG ATT TGT GGA AAG ACG AGG CGT TGT GGT ATG CAT GCT TGT GCC AGA ACT TGT TGTAACAAGATTTGTGGAAAGACGAGGCGTTGTGGTATGCATGCTTGTGCCAGAACTTGT -C--N--K--I--C--G--K--T--R--R--C--G--M--H--A--C--A--R--T--C- CAC CCG GAG GCA TGT GAC ACT TAC AGT GAA TCT GAA GCA GGA CTG CGT GTT ACA TGT GGA CACCCGGAGGCATGTGACACTTACAGTGAATCTGAAGCAGGACTGCGTGTTACATGTGGA -H--P--E--A--C--D--T--Y--S--E--S--E--A--G--L--R--V--T--C--G- CAG ACT TGT AGT GCT CCT AGA AGA GAT TGC AGG CAT ACT TGT GCA GCT CTC TGC CAT CCT CAGACTTGTAGTGCTCCTAGAAGAGATTGCAGGCATACTTGTGCAGCTCTCTGCCATCCT -Q--T--C--S--A--P--R--R--D--C--R--H--T--C--A--A--L--C--H--P- TCG CAG CCT TGC CCT GAC TCA AGA TGT GAA TTT CCA GTA ACA ATT ACA TGT TCG TGT GGT TCGCAGCCTTGCCCTGACTCAAGATGTGAATTTCCAGTAACAATTACATGTTCGTGTGGT -S--Q--P--C--P--D--S--R--C--E--F--P--V--T--I--T--C--S--C--G- CGC ATA ACC GCT ACT GTC CCT TGC GAT GCG GGA GGA GGA AGT ACC AGC AAT CTT AGT GTT CGCATAACCGCTACTGTCCCTTGCGATGCGGGAGGAGGAAGTACCAGCAATCTTAGTGTT -R--I--T--A--T--V--P--C--D--A--G--G--G--S--T--S--N--L--S--V- GAT TCT ATC TAT GAA GCC TCT GTT TTG CAG AAG CTT CCA ACC ACG CTT CAG CCT GCT GAG GATTCTATCTATGAAGCCTCTGTTTTGCAGAAGCTTCCAACCACGCTTCAGCCTGCTGAG -D--S--I--Y--E--A--S--V--L--Q--K--L--P--T--T--L--Q--P--A--E- TCG AGC GGA AAC AGA ATC CCC CTC GGG CAG CGA AAG CTT TCG TGT GAT GAT GAG TGT GCT TCGAGCGGAAACAGAATCCCCCTCGGGCAGCGAAAGCTTTCGTGTGATGATGAGTGTGCT -S--S--G--N--R--I--P--L--G--Q--R--K--L--S--C--D--D--E--C--A- AAG CAG GAG CGT AAG CGG GTT CTT CAA GAC GCG TTT GAT ATC ACT CCC CCA AAT CTG GAC AAGCAGGAGCGTAAGCGGGTTCTTCAAGACGCGTTTGATATCACTCCCCCAAATCTGGAC -K--Q--E--R--K--R--V--L--Q--D--A--F--D--I--T--P--P--N--L--D- TCT TTA CAT TTC AGC GAG AAT GCT GCT ATG ACA GAG ATT ATT TCG GAC ATC TAC AGG CGT TCTTTACATTTCAGCGAGAATGCTGCTATGACAGAGATTATTTCGGACATCTACAGGCGT -S--L--H--F--S--E--N--A--A--M--T--E--I--I--S--D--I--Y--R--R- GAT CCG AAG TGG GTA CTG GCT GTT GAA GAG CGC TTC AAG TTC TTG GTA CTT GGG AAA GCC GATCCGAAGTGGGTACTGGCTGTTGAAGAGCGCTTCAAGTTCTTGGTACTTGGGAAAGCC 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