Transcript: Bra016618.1
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Description
AT1G17110 (E=0.0) UBP15 | UBP15 (UBIQUITIN-SPECIFIC PROTEASE 15); ubiquitin-specific protease
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- Bra016618.1 2679 892aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M4DJE0 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
ATG CTC GAA CCA AGG GGA GCG GAC ATA CCT TTA TTG TTC TTG GTT TTG GTT GTG TTT CCT ATGCTCGAACCAAGGGGAGCGGACATACCTTTATTGTTCTTGGTTTTGGTTGTGTTTCCT -M--L--E--P--R--G--A--D--I--P--L--L--F--L--V--L--V--V--F--P- GTG GTA GCT TAC ATA TTA TTA GGT AAA TGG AGT GAT ATT TCT AAA AAG AGA GGG AGG GCT GTGGTAGCTTACATATTATTAGGTAAATGGAGTGATATTTCTAAAAAGAGAGGGAGGGCT -V--V--A--Y--I--L--L--G--K--W--S--D--I--S--K--K--R--G--R--A- AAC TTG CTG GCT CAG ATG GCA GCT GAA GAA GCT TTT AGA GCT GAG ACC GAA GTT AAT GTG AACTTGCTGGCTCAGATGGCAGCTGAAGAAGCTTTTAGAGCTGAGACCGAAGTTAATGTG -N--L--L--A--Q--M--A--A--E--E--A--F--R--A--E--T--E--V--N--V- AAT AGG GGT GTA AGA TTT GAG GCT GCG GCT ACA GAG AAT AGA GGT CTA AGA ACC AAG ACC AATAGGGGTGTAAGATTTGAGGCTGCGGCTACAGAGAATAGAGGTCTAAGAACCAAGACC -N--R--G--V--R--F--E--A--A--A--T--E--N--R--G--L--R--T--K--T- AAG GCC GCC GTT TCT GCT GCG AGT GGT GCT GTA AGA GAT GAT TTT GTG TCT GGT GTG AGT AAGGCCGCCGTTTCTGCTGCGAGTGGTGCTGTAAGAGATGATTTTGTGTCTGGTGTGAGT 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GAT GGA GAA AAT ATG TAT AGA TGC AGC AG G TGC GCT CAGTTTACTAGACCAGAAGATCTCGATGGAGAAAATATGTATAGATGCAGCAGGTGCGCT -Q--F--T--R--P--E--D--L--D--G--E--N--M--Y--R--C--S--R--C--A- GGA TAT GTT AAA GCA AGA AAA GAA TTG AGC ATT CAT GAA GCA CCA AAC ATT CTC ACA ATT GGATATGTTAAAGCAAGAAAAGAATTGAGCATTCATGAAGCACCAAACATTCTCACAATT -G--Y--V--K--A--R--K--E--L--S--I--H--E--A--P--N--I--L--T--I- GTT CTT AAG AGA TTC CAG GAA GGA AGA TAC GGG AAA ATA AAC AAA TGT ATA AGC TTT CCT GTTCTTAAGAGATTCCAGGAAGGAAGATACGGGAAAATAAACAAATGTATAAGCTTTCCT -V--L--K--R--F--Q--E--G--R--Y--G--K--I--N--K--C--I--S--F--P- GAA ATG CTG GAT ATG ATA CCT TTT ATG ACA AGA ACC GGA GAT GTT CCT CCA CTT TAT ATG GAAATGCTGGATATGATACCTTTTATGACAAGAACCGGAGATGTTCCTCCACTTTATATG -E--M--L--D--M--I--P--F--M--T--R--T--G--D--V--P--P--L--Y--M- CTT TAT GCT GTT ATA GTT CAC CTG GAT ACT CTC AAC GCA TCT TTC TCT GGT CAT TAC ATT CTTTATGCTGTTATAGTTCACCTGGATACTCTCAACGCATCTTTCTCTGGTCATTACATT -L--Y--A--V--I--V--H--L--D--T--L--N--A--S--F--S--G--H--Y--I- TCC TAT GTC AAA GAT 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ACC TCA GAA TCA ACC AGG GAC TCT TTC AGC ACC GTG GAC TAC ACA GAT GGG TGC TCATTCACCTCAGAATCAACCAGGGACTCTTTCAGCACCGTGGACTACACAGATGGGTGC -S--F--T--S--E--S--T--R--D--S--F--S--T--V--D--Y--T--D--G--C- AAC GTC TTA GAC TCT TCC TCT CCT TTC TCC ATC TTC AAC AAC TTA CGC CAC AAC GTG GAG AACGTCTTAGACTCTTCCTCTCCTTTCTCCATCTTCAACAACTTACGCCACAACGTGGAG -N--V--L--D--S--S--S--P--F--S--I--F--N--N--L--R--H--N--V--E- CCG TCG CCG CAC AAC ACC GTC GCC TGC AGA ATG TTC TCA GGT ACC AAG TCA GAA ACC CGG CCGTCGCCGCACAACACCGTCGCCTGCAGAATGTTCTCAGGTACCAAGTCAGAAACCCGG -P--S--P--H--N--T--V--A--C--R--M--F--S--G--T--K--S--E--T--R- TAT TTC GTG GAG GAA GAA ACG AAT CAC AAC AAC ACG GTC GTG ATG GAC TCA GCA CCA ACA TATTTCGTGGAGGAAGAAACGAATCACAACAACACGGTCGTGATGGACTCAGCACCAACA -Y--F--V--E--E--E--T--N--H--N--N--T--V--V--M--D--S--A--P--T- TCC CAT GAC TAT TAC CAG CAG AGT ATG TAT GTA AAC TAT GAG ACT AAC CCA GGG TTT AAC TCCCATGACTATTACCAGCAGAGTATGTATGTAAACTATGAGACTAACCCAGGGTTTAAC 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