Brassica rapa (Brapa_1.0)
Description

AT2G15580 (E=7e-089) | zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein

Location
About this transcript

This transcript has 3 exons and is annotated with 9 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene Bra015225 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-Bra015225.1585194aa
 
Protein coding
M4DFF2 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
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Markup
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     1 ATGGCTGGTATGCTTCCAGGAGTTGAGTGCGCGAGGAGGCGGCGCTTTCACGGCGGTGCT     60
     1 ATGGCTGGTATGCTTCCAGGAGTTGAGTGCGCGAGGAGGCGGCGCTTTCACGGCGGTGCT     60
     1 -M--A--G--M--L--P--G--V--E--C--A--R--R--R--R--F--H--G--G--A-     20

                                                                          
    61 CCACCGATTGACTTATCCAACACGGCTTCTGTGGCGGCAGCAACGGGACACGTATGGACT    120
    61 CCACCGATTGACTTATCCAACACGGCTTCTGTGGCGGCAGCAACGGGACACGTATGGACT    120
    21 -P--P--I--D--L--S--N--T--A--S--V--A--A--A--T--G--H--V--W--T-     40

                                                                          
   121 CGCCGACCATCCTTCTCTCTCTACACTACCAATCACGAGAGTCACCAAGCCTATGTCTCC    180
   121 CGCCGACCATCCTTCTCTCTCTACACTACCAATCACGAGAGTCACCAAGCCTATGTCTCC    180
    41 -R--R--P--S--F--S--L--Y--T--T--N--H--E--S--H--Q--A--Y--V--S-     60

                                                                          
   181 TTCTCGGAGAGAAATGTTAGGAACAAATCTTACGGTGTTGATAACGACGAGAAGCTCGTA    240
   181 TTCTCGGAGAGAAATGTTAGGAACAAATCTTACGGTGTTGATAACGACGAGAAGCTCGTA    240
    61 -F--S--E--R--N--V--R--N--K--S--Y--G--V--D--N--D--E--K--L--V-     80

                                                                          
   241 GGAGCAGCCAAAGAGGCGAAAGATAGATTGGACGAGCGGCTGAGAAACCCGCGAAGAAGG    300
   241 GGAGCAGCCAAAGAGGCGAAAGATAGATTGGACGAGCGGCTGAGAAACCCGCGAAGAAGG    300
    81 -G--A--A--K--E--A--K--D--R--L--D--E--R--L--R--N--P--R--R--R-    100

                                                                          
   301 CAAAATGGCAAAGACAAAGTGAATAAATTGGAGCAAGGGAAAATTAAATCTCTCATGGAT    360
   301 CAAAATGGCAAAGACAAAGTGAATAAATTGGAGCAAGGGAAAATTAAATCTCTCATGGAT    360
   101 -Q--N--G--K--D--K--V--N--K--L--E--Q--G--K--I--K--S--L--M--D-    120

                                                                          
   361 TTACCGACAGAGGTAGTTGGGTTGAAGAAGAGCCGGGGAAGGCTTGTCAAATGGTTCGGG    420
   361 TTACCGACAGAGGTAGTTGGGTTGAAGAAGAGCCGGGGAAGGCTTGTCAAATGGTTCGGG    420
   121 -L--P--T--E--V--V--G--L--K--K--S--R--G--R--L--V--K--W--F--G-    140

                                                                          
   421 TGGCGAGTAAGGCACCAACAAGAGTGTGCTATATGTCTTGACCAGTTCAAGACGGGTGAG    480
   421 TGGCGAGTAAGGCACCAACAAGAGTGTGCTATATGTCTTGACCAGTTCAAGACGGGTGAG    480
   141 -W--R--V--R--H--Q--Q--E--C--A--I--C--L--D--Q--F--K--T--G--E-    160

                                                                          
   481 ACATTGGTCCACCTACCATGCACCCATAAGTTTCACTCTATATGCTTATTGCCTTGGCTA    540
   481 ACATTGGTCCACCTACCATGCACCCATAAGTTTCACTCTATATGCTTATTGCCTTGGCTA    540
   161 -T--L--V--H--L--P--C--T--H--K--F--H--S--I--C--L--L--P--W--L-    180

                                                                          
   541 GATACCAACGCGTATTGCCCTTATTGTAGAATGGACATTTATTAA                   585
   541 GATACCAACGCGTATTGCCCTTATTGTAGAATGGACATTTATTAA                   585
   181 -D--T--N--A--Y--C--P--Y--C--R--M--D--I--Y--*-                   194