Transcript: Bra015225.1
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Description
AT2G15580 (E=7e-089) | zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
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- Bra015225.1 585 194aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M4DFF2 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GCT GGT ATG CTT CCA GGA GTT GAG TGC GCG AGG AGG CGG CGC TTT CAC GGC GGT GCT 60
1 ATGGCTGGTATGCTTCCAGGAGTTGAGTGCGCGAGGAGGCGGCGCTTTCACGGCGGTGCT 60
1 -M--A--G--M--L--P--G--V--E--C--A--R--R--R--R--F--H--G--G--A- 20
61 CCA CCG ATT GAC TTA TCC AAC ACG GCT TCT GTG GCG GCA GCA ACG GGA CAC GTA TGG ACT 120
61 CCACCGATTGACTTATCCAACACGGCTTCTGTGGCGGCAGCAACGGGACACGTATGGACT 120
21 -P--P--I--D--L--S--N--T--A--S--V--A--A--A--T--G--H--V--W--T- 40
121 CGC CGA CCA TCC TTC TCT CTC TAC ACT ACC AAT CAC GAG AGT CAC CAA GCC TAT GTC TCC 180
121 CGCCGACCATCCTTCTCTCTCTACACTACCAATCACGAGAGTCACCAAGCCTATGTCTCC 180
41 -R--R--P--S--F--S--L--Y--T--T--N--H--E--S--H--Q--A--Y--V--S- 60
181 TTC TCG G AG AGA AAT GTT AGG AAC AAA TCT TAC GGT GTT GAT AAC GAC GAG AAG CTC GTA 240
181 TTCTCGGAGAGAAATGTTAGGAACAAATCTTACGGTGTTGATAACGACGAGAAGCTCGTA 240
61 -F--S--E--R--N--V--R--N--K--S--Y--G--V--D--N--D--E--K--L--V- 80
241 GGA GCA GCC AAA GAG GCG AAA GAT AGA TTG GAC GAG CGG CTG AGA AAC CCG CGA AGA AG G 300
241 GGAGCAGCCAAAGAGGCGAAAGATAGATTGGACGAGCGGCTGAGAAACCCGCGAAGAAGG 300
81 -G--A--A--K--E--A--K--D--R--L--D--E--R--L--R--N--P--R--R--R- 100
301 CAA AAT GGC AAA GAC AAA GTG AAT AAA TTG GAG CAA GGG AAA ATT AAA TCT CTC ATG GAT 360
301 CAAAATGGCAAAGACAAAGTGAATAAATTGGAGCAAGGGAAAATTAAATCTCTCATGGAT 360
101 -Q--N--G--K--D--K--V--N--K--L--E--Q--G--K--I--K--S--L--M--D- 120
361 TTA CCG ACA GAG GTA GTT GGG TTG AAG AAG AGC CGG GGA AGG CTT GTC AAA TGG TTC GGG 420
361 TTACCGACAGAGGTAGTTGGGTTGAAGAAGAGCCGGGGAAGGCTTGTCAAATGGTTCGGG 420
121 -L--P--T--E--V--V--G--L--K--K--S--R--G--R--L--V--K--W--F--G- 140
421 TGG CGA GTA AGG CAC CAA CAA GAG TGT GCT ATA TGT CTT GAC CAG TTC AAG ACG GGT GAG 480
421 TGGCGAGTAAGGCACCAACAAGAGTGTGCTATATGTCTTGACCAGTTCAAGACGGGTGAG 480
141 -W--R--V--R--H--Q--Q--E--C--A--I--C--L--D--Q--F--K--T--G--E- 160
481 ACA TTG GTC CAC CTA CCA TGC ACC CAT AAG TTT CAC TCT ATA TGC TTA TTG CCT TGG CTA 540
481 ACATTGGTCCACCTACCATGCACCCATAAGTTTCACTCTATATGCTTATTGCCTTGGCTA 540
161 -T--L--V--H--L--P--C--T--H--K--F--H--S--I--C--L--L--P--W--L- 180
541 GAT ACC AAC GCG TAT TGC CCT TAT TGT AGA ATG GAC ATT TAT TAA 585
541 GATACCAACGCGTATTGCCCTTATTGTAGAATGGACATTTATTAA 585
181 -D--T--N--A--Y--C--P--Y--C--R--M--D--I--Y--*- 194
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