Transcript: Bra014421.1
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Description
AT3G61790 (E=1e-175) | seven in absentia (SINA) family protein
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- Bra014421.1 963 320aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M4DD53 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GAT TTG GAT AGC ATG GAC TGC ACT TCA ACC ATC GAT GTC ACC GAC GAC GAC GAA GAG 60
1 ATGGATTTGGATAGCATGGACTGCACTTCAACCATCGATGTCACCGACGACGACGAAGAG 60
1 -M--D--L--D--S--M--D--C--T--S--T--I--D--V--T--D--D--D--E--E- 20
61 ATC CAT CAA GAT CGC CAT TCC TAC GCA TCG GTT TCA AAG CAT CAT AGT AAT AAC AGC ACC 120
61 ATCCATCAAGATCGCCATTCCTACGCATCGGTTTCAAAGCATCATAGTAATAACAGCACC 120
21 -I--H--Q--D--R--H--S--Y--A--S--V--S--K--H--H--S--N--N--S--T- 40
121 AAC GCG AAT GCT GCT TCT GGT CTT CTT CCG ACA ACC ACA AGT GTT CAT GAG CTT CTC GAA 180
121 AACGCGAATGCTGCTTCTGGTCTTCTTCCGACAACCACAAGTGTTCATGAGCTTCTCGAA 180
41 -N--A--N--A--A--S--G--L--L--P--T--T--T--S--V--H--E--L--L--E- 60
181 TGT CCT GTC TGC ACC AAT TCT ATG TAC CCT CCT ATT CAT CAG TGT CAA AAC GGA CAT ACT 240
181 TGTCCTGTCTGCACCAATTCTATGTACCCTCCTATTCATCAGTGTCAAAACGGACATACT 240
61 -C--P--V--C--T--N--S--M--Y--P--P--I--H--Q--C--Q--N--G--H--T- 80
241 CTA TGT TCA ACG TGT AAG AAC AGA GTT CAC AAT CGC TGC CCT ACA TGT AGA CAA GAG CTC 300
241 CTATGTTCAACGTGTAAGAACAGAGTTCACAATCGCTGCCCTACATGTAGACAAGAGCTC 300
81 -L--C--S--T--C--K--N--R--V--H--N--R--C--P--T--C--R--Q--E--L- 100
301 GGT GAT ATC CGT TGT TTA GCA CTC GAA AAA GTA GCC GAG TCT CTT GAG CTT CCG TGC AAG 360
301 GGTGATATCCGTTGTTTAGCACTCGAAAAAGTAGCCGAGTCTCTTGAGCTTCCGTGCAAG 360
101 -G--D--I--R--C--L--A--L--E--K--V--A--E--S--L--E--L--P--C--K- 120
361 TAC ATG TCA CTT GGT TGT CCT GAG ATA TTC CCT TAT TAC GGT AAG CCC AAA CAC GAG ACT 420
361 TACATGTCACTTGGTTGTCCTGAGATATTCCCTTATTACGGTAAGCCCAAACACGAGACT 420
121 -Y--M--S--L--G--C--P--E--I--F--P--Y--Y--G--K--P--K--H--E--T- 140
421 GTA TGT GAC TTC AGG CCT TAT AGC TGT CCG TAC GCT GGT TCA GAG TGT TCT GTT ATG GGT 480
421 GTATGTGACTTCAGGCCTTATAGCTGTCCGTACGCTGGTTCAGAGTGTTCTGTTATGGGT 480
141 -V--C--D--F--R--P--Y--S--C--P--Y--A--G--S--E--C--S--V--M--G- 160
481 GAT ATC CCT TTC TTA GTT GCT CAT CTG AGG GAT GAC CAC AAG GTG GAT ATG CAT TCT GGG 540
481 GATATCCCTTTCTTAGTTGCTCATCTGAGGGATGACCACAAGGTGGATATGCATTCTGGG 540
161 -D--I--P--F--L--V--A--H--L--R--D--D--H--K--V--D--M--H--S--G- 180
541 TGT ACT TTC AAC CAT CGT TAT GTC AAG TCT AAT CCT CGT GAA GTC GAA AAT GCT ACA TGG 600
541 TGTACTTTCAACCATCGTTATGTCAAGTCTAATCCTCGTGAAGTCGAAAATGCTACATGG 600
181 -C--T--F--N--H--R--Y--V--K--S--N--P--R--E--V--E--N--A--T--W- 200
601 ATG TTA ACT GTC TTT TAC TGC TTT GGT GAA TAC TTT TGT CTT CAC TTT GAG GCA TTC CAG 660
601 ATGTTAACTGTCTTTTACTGCTTTGGTGAATACTTTTGTCTTCACTTTGAGGCATTCCAG 660
201 -M--L--T--V--F--Y--C--F--G--E--Y--F--C--L--H--F--E--A--F--Q- 220
661 CTC GGA ATG GCT CCA GTC TAC ATG GCG TTT CTA CGT TTC ATG GGG GAT GAG ACT GAA GCT 720
661 CTCGGAATGGCTCCAGTCTACATGGCGTTTCTACGTTTCATGGGGGATGAGACTGAAGCT 720
221 -L--G--M--A--P--V--Y--M--A--F--L--R--F--M--G--D--E--T--E--A- 240
721 CGG AAC TAT AAT TAC AGT TTG GAA GTT GGA GGG TAT GGT CGG AAG CTG ATA TGG GAA GGA 780
721 CGGAACTATAATTACAGTTTGGAAGTTGGAGGGTATGGTCGGAAGCTGATATGGGAAGGA 780
241 -R--N--Y--N--Y--S--L--E--V--G--G--Y--G--R--K--L--I--W--E--G- 260
781 ACA CCG AGA AGC GTG AGA GAC AGT CAC AGG AAA GTT CGA GAT AGT CAT GAT GGA CTA ATC 840
781 ACACCGAGAAGCGTGAGAGACAGTCACAGGAAAGTTCGAGATAGTCATGATGGACTAATC 840
261 -T--P--R--S--V--R--D--S--H--R--K--V--R--D--S--H--D--G--L--I- 280
841 ATA CAG AGG AAC ATG GCT CTC TTC TTT TCG GGT GGA GAT AGG AAA GAG CTG AAA CTG CGG 900
841 ATACAGAGGAACATGGCTCTCTTCTTTTCGGGTGGAGATAGGAAAGAGCTGAAACTGCGG 900
281 -I--Q--R--N--M--A--L--F--F--S--G--G--D--R--K--E--L--K--L--R- 300
901 GTT ACT GGA AGA ATA TGG AAA GAA CAG CAG CAT CTT GGT TTT AAA TGG CGC ATG GCG AGG 960
901 GTTACTGGAAGAATATGGAAAGAACAGCAGCATCTTGGTTTTAAATGGCGCATGGCGAGG 960
301 -V--T--G--R--I--W--K--E--Q--Q--H--L--G--F--K--W--R--M--A--R- 320
961 TAA 963
961 TAA 963
-*- 320
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