Transcript: Bra013593.1
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Description
AT4G22150 (E=1e-139) PUX3 | PUX3; protein binding
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- Bra013593.1 909 302aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M4DAT3 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG TCT TCA AAG GAC AAG AAA CCG TCG AAG CCC TCT GGT GGT CGG ACC AGT GGT ATC CGT 60
1 ATGTCTTCAAAGGACAAGAAACCGTCGAAGCCCTCTGGTGGTCGGACCAGTGGTATCCGT 60
1 -M--S--S--K--D--K--K--P--S--K--P--S--G--G--R--T--S--G--I--R- 20
61 ACA CTC TCC GAT CTG AAC CGA AGA TCA GGA CCG GAC TCC GAC AGT GAC TCC GAT GGA CCT 120
61 ACACTCTCCGATCTGAACCGAAGATCAGGACCGGACTCCGACAGTGACTCCGATGGACCT 120
21 -T--L--S--D--L--N--R--R--S--G--P--D--S--D--S--D--S--D--G--P- 40
121 CAA GAG TAC TAC ACC GGC GGA GAG AAA AG T GGT ATG CTA GTT CAG GAT CCT ACA AAA GAA 180
121 CAAGAGTACTACACCGGCGGAGAGAAAAGTGGTATGCTAGTTCAGGATCCTACAAAAGAA 180
41 -Q--E--Y--Y--T--G--G--E--K--S--G--M--L--V--Q--D--P--T--K--E- 60
181 CCG AAA CAC GAT GAT GTT GAT GAG ATA TTC AAC CAA GCA AGG CAA CTA GGA GCG GTG GAA 240
181 CCGAAACACGATGATGTTGATGAGATATTCAACCAAGCAAGGCAACTAGGAGCGGTGGAA 240
61 -P--K--H--D--D--V--D--E--I--F--N--Q--A--R--Q--L--G--A--V--E- 80
241 GGA CCT CTT GAG CGT CCT TCG AGT TCC AGA AGC TTC ACT GGA ACA GGG AGA TTG CTT TCA 300
241 GGACCTCTTGAGCGTCCTTCGAGTTCCAGAAGCTTCACTGGAACAGGGAGATTGCTTTCA 300
81 -G--P--L--E--R--P--S--S--S--R--S--F--T--G--T--G--R--L--L--S- 100
301 GGA GAA AGT GTG CCG ACA GCT CTT CAA CAG CCC GAG CCT GTG ATT CAC AAC ATC GTT TTC 360
301 GGAGAAAGTGTGCCGACAGCTCTTCAACAGCCCGAGCCTGTGATTCACAACATCGTTTTC 360
101 -G--E--S--V--P--T--A--L--Q--Q--P--E--P--V--I--H--N--I--V--F- 120
361 TGG TCT AAT GGA TTC ACT GTT GAT GAT GGA CCT TTG AGG AAG TTG GAT GAT CCA GAG AAC 420
361 TGGTCTAATGGATTCACTGTTGATGATGGACCTTTGAGGAAGTTGGATGATCCAGAGAAC 420
121 -W--S--N--G--F--T--V--D--D--G--P--L--R--K--L--D--D--P--E--N- 140
421 GCG CCT TTT CTC GAC A GC ATA CGA AAG TCT GAG TGT CCG AAA GAG CTT GAG CCT GCT GAT 480
421 GCGCCTTTTCTCGACAGCATACGAAAGTCTGAGTGTCCGAAAGAGCTTGAGCCTGCTGAT 480
141 -A--P--F--L--D--S--I--R--K--S--E--C--P--K--E--L--E--P--A--D- 160
481 AAA AGA GCT CCC GTA CAT GTT AAT CTT ATG AGA AGA GAC GAG AAA TGC CCC G AA CGT GAG 540
481 AAAAGAGCTCCCGTACATGTTAATCTTATGAGAAGAGACGAGAAATGCCCCGAACGTGAG 540
161 -K--R--A--P--V--H--V--N--L--M--R--R--D--E--K--C--P--E--R--E- 180
541 AAA CCT AAG GTT GCA TTT CAA GGA GTG GGA AGG ACT CTA GGC GGT GCT AGC TCA TCA ACC 600
541 AAACCTAAGGTTGCATTTCAAGGAGTGGGAAGGACTCTAGGCGGTGCTAGCTCATCAACC 600
181 -K--P--K--V--A--F--Q--G--V--G--R--T--L--G--G--A--S--S--S--T- 200
601 CCT CCA AAC CTA AGC AAT CCA ACC GAT CTA GCA GCG GTT CCA TCG CCG TCA CAG AGT CTT 660
601 CCTCCAAACCTAAGCAATCCAACCGATCTAGCAGCGGTTCCATCGCCGTCACAGAGTCTT 660
201 -P--P--N--L--S--N--P--T--D--L--A--A--V--P--S--P--S--Q--S--L- 220
661 GTA GTA GAT GAA ACT CTT CCA TCC ACA TCT ATC CAG CTT AGA CTC GCT GAC GGG ACA CGC 720
661 GTAGTAGATGAAACTCTTCCATCCACATCTATCCAGCTTAGACTCGCTGACGGGACACGC 720
221 -V--V--D--E--T--L--P--S--T--S--I--Q--L--R--L--A--D--G--T--R- 240
721 ATG GTG GCT AAG TTC AAC AAT CAT CAC ACG GTC AAT GAC ATT CGA GCT TTC ATT GAC TTT 780
721 ATGGTGGCTAAGTTCAACAATCATCACACGGTCAATGACATTCGAGCTTTCATTGACTTT 780
241 -M--V--A--K--F--N--N--H--H--T--V--N--D--I--R--A--F--I--D--F- 260
781 TCT CGA CCT GGG AAC CCA ATC AAC TAC AGC CTT CAG GTC ATG GGG TTC CCA CCA AAG CTG 840
781 TCTCGACCTGGGAACCCAATCAACTACAGCCTTCAGGTCATGGGGTTCCCACCAAAGCTG 840
261 -S--R--P--G--N--P--I--N--Y--S--L--Q--V--M--G--F--P--P--K--L- 280
841 CTT ACT GAT CCT TTT CAG ACC ATT GAT CAA GCC GGT CTA GCA AAC TCT GTA GTC ATT CAG 900
841 CTTACTGATCCTTTTCAGACCATTGATCAAGCCGGTCTAGCAAACTCTGTAGTCATTCAG 900
281 -L--T--D--P--F--Q--T--I--D--Q--A--G--L--A--N--S--V--V--I--Q- 300
901 AAA TTC TAG 909
901 AAATTCTAG 909
301 -K--F--*- 302
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