Brassica rapa (Brapa_1.0)
Description

AT4G22150 (E=1e-139) PUX3 | PUX3; protein binding

Location
About this transcript

This transcript has 4 exons and is annotated with 18 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene Bra013593 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-Bra013593.1909302aa
 
Protein coding
M4DAT3 -Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
  • UTR
Markup
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     1 ATGTCTTCAAAGGACAAGAAACCGTCGAAGCCCTCTGGTGGTCGGACCAGTGGTATCCGT     60
     1 ATGTCTTCAAAGGACAAGAAACCGTCGAAGCCCTCTGGTGGTCGGACCAGTGGTATCCGT     60
     1 -M--S--S--K--D--K--K--P--S--K--P--S--G--G--R--T--S--G--I--R-     20

                                                                          
    61 ACACTCTCCGATCTGAACCGAAGATCAGGACCGGACTCCGACAGTGACTCCGATGGACCT    120
    61 ACACTCTCCGATCTGAACCGAAGATCAGGACCGGACTCCGACAGTGACTCCGATGGACCT    120
    21 -T--L--S--D--L--N--R--R--S--G--P--D--S--D--S--D--S--D--G--P-     40

                                                                          
   121 CAAGAGTACTACACCGGCGGAGAGAAAAGTGGTATGCTAGTTCAGGATCCTACAAAAGAA    180
   121 CAAGAGTACTACACCGGCGGAGAGAAAAGTGGTATGCTAGTTCAGGATCCTACAAAAGAA    180
    41 -Q--E--Y--Y--T--G--G--E--K--S--G--M--L--V--Q--D--P--T--K--E-     60

                                                                          
   181 CCGAAACACGATGATGTTGATGAGATATTCAACCAAGCAAGGCAACTAGGAGCGGTGGAA    240
   181 CCGAAACACGATGATGTTGATGAGATATTCAACCAAGCAAGGCAACTAGGAGCGGTGGAA    240
    61 -P--K--H--D--D--V--D--E--I--F--N--Q--A--R--Q--L--G--A--V--E-     80

                                                                          
   241 GGACCTCTTGAGCGTCCTTCGAGTTCCAGAAGCTTCACTGGAACAGGGAGATTGCTTTCA    300
   241 GGACCTCTTGAGCGTCCTTCGAGTTCCAGAAGCTTCACTGGAACAGGGAGATTGCTTTCA    300
    81 -G--P--L--E--R--P--S--S--S--R--S--F--T--G--T--G--R--L--L--S-    100

                                                                          
   301 GGAGAAAGTGTGCCGACAGCTCTTCAACAGCCCGAGCCTGTGATTCACAACATCGTTTTC    360
   301 GGAGAAAGTGTGCCGACAGCTCTTCAACAGCCCGAGCCTGTGATTCACAACATCGTTTTC    360
   101 -G--E--S--V--P--T--A--L--Q--Q--P--E--P--V--I--H--N--I--V--F-    120

                                                                          
   361 TGGTCTAATGGATTCACTGTTGATGATGGACCTTTGAGGAAGTTGGATGATCCAGAGAAC    420
   361 TGGTCTAATGGATTCACTGTTGATGATGGACCTTTGAGGAAGTTGGATGATCCAGAGAAC    420
   121 -W--S--N--G--F--T--V--D--D--G--P--L--R--K--L--D--D--P--E--N-    140

                                                                          
   421 GCGCCTTTTCTCGACAGCATACGAAAGTCTGAGTGTCCGAAAGAGCTTGAGCCTGCTGAT    480
   421 GCGCCTTTTCTCGACAGCATACGAAAGTCTGAGTGTCCGAAAGAGCTTGAGCCTGCTGAT    480
   141 -A--P--F--L--D--S--I--R--K--S--E--C--P--K--E--L--E--P--A--D-    160

                                                                          
   481 AAAAGAGCTCCCGTACATGTTAATCTTATGAGAAGAGACGAGAAATGCCCCGAACGTGAG    540
   481 AAAAGAGCTCCCGTACATGTTAATCTTATGAGAAGAGACGAGAAATGCCCCGAACGTGAG    540
   161 -K--R--A--P--V--H--V--N--L--M--R--R--D--E--K--C--P--E--R--E-    180

                                                                          
   541 AAACCTAAGGTTGCATTTCAAGGAGTGGGAAGGACTCTAGGCGGTGCTAGCTCATCAACC    600
   541 AAACCTAAGGTTGCATTTCAAGGAGTGGGAAGGACTCTAGGCGGTGCTAGCTCATCAACC    600
   181 -K--P--K--V--A--F--Q--G--V--G--R--T--L--G--G--A--S--S--S--T-    200

                                                                          
   601 CCTCCAAACCTAAGCAATCCAACCGATCTAGCAGCGGTTCCATCGCCGTCACAGAGTCTT    660
   601 CCTCCAAACCTAAGCAATCCAACCGATCTAGCAGCGGTTCCATCGCCGTCACAGAGTCTT    660
   201 -P--P--N--L--S--N--P--T--D--L--A--A--V--P--S--P--S--Q--S--L-    220

                                                                          
   661 GTAGTAGATGAAACTCTTCCATCCACATCTATCCAGCTTAGACTCGCTGACGGGACACGC    720
   661 GTAGTAGATGAAACTCTTCCATCCACATCTATCCAGCTTAGACTCGCTGACGGGACACGC    720
   221 -V--V--D--E--T--L--P--S--T--S--I--Q--L--R--L--A--D--G--T--R-    240

                                                                          
   721 ATGGTGGCTAAGTTCAACAATCATCACACGGTCAATGACATTCGAGCTTTCATTGACTTT    780
   721 ATGGTGGCTAAGTTCAACAATCATCACACGGTCAATGACATTCGAGCTTTCATTGACTTT    780
   241 -M--V--A--K--F--N--N--H--H--T--V--N--D--I--R--A--F--I--D--F-    260

                                                                          
   781 TCTCGACCTGGGAACCCAATCAACTACAGCCTTCAGGTCATGGGGTTCCCACCAAAGCTG    840
   781 TCTCGACCTGGGAACCCAATCAACTACAGCCTTCAGGTCATGGGGTTCCCACCAAAGCTG    840
   261 -S--R--P--G--N--P--I--N--Y--S--L--Q--V--M--G--F--P--P--K--L-    280

                                                                          
   841 CTTACTGATCCTTTTCAGACCATTGATCAAGCCGGTCTAGCAAACTCTGTAGTCATTCAG    900
   841 CTTACTGATCCTTTTCAGACCATTGATCAAGCCGGTCTAGCAAACTCTGTAGTCATTCAG    900
   281 -L--T--D--P--F--Q--T--I--D--Q--A--G--L--A--N--S--V--V--I--Q-    300

                                                                          
   901 AAATTCTAG                                                       909
   901 AAATTCTAG                                                       909
   301 -K--F--*-                                                       302