Brassica rapa (Brapa_1.0)
Description

AT5G05610 (E=6e-108) AL1 | AL1 (ALFIN-LIKE 1); DNA binding / methylated histone residue binding

About this transcript

This transcript has 5 exons and is annotated with 12 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene Bra009121 Show transcript tableHide transcript table

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-Bra009121.1723240aa
 
Protein coding
M4CY24 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGGCTGGCGAGTCCTCTAATCCTGGCACCGTCGAAGAGATCTTCAAGGATTTTAGAGGT     60
     1 ATGGCTGGCGAGTCCTCTAATCCTGGCACCGTCGAAGAGATCTTCAAGGATTTTAGAGGT     60
     1 -M--A--G--E--S--S--N--P--G--T--V--E--E--I--F--K--D--F--R--G-     20

                                                                          
    61 CGTCGCTCTGCTTTTCTTCAAGCTCTCTCCGTAGATGTTGACAAGTTCTACTCTTTATGC    120
    61 CGTCGCTCTGCTTTTCTTCAAGCTCTCTCCGTAGATGTTGACAAGTTCTACTCTTTATGC    120
    21 -R--R--S--A--F--L--Q--A--L--S--V--D--V--D--K--F--Y--S--L--C-     40

                                                                          
   121 AATCCTGAAATGGAGAATCTGTGTTTGTATGGACACCCGAATGGGACGTGGGAAGTGAAT    180
   121 AATCCTGAAATGGAGAATCTGTGTTTGTATGGACACCCGAATGGGACGTGGGAAGTGAAT    180
    41 -N--P--E--M--E--N--L--C--L--Y--G--H--P--N--G--T--W--E--V--N-     60

                                                                          
   181 CTTCCAGCGGAGGAAGTGCCTCCTGAGCTTCCAGAGCCAGCGCTTGGAATCAATTTCGCA    240
   181 CTTCCAGCGGAGGAAGTGCCTCCTGAGCTTCCAGAGCCAGCGCTTGGAATCAATTTCGCA    240
    61 -L--P--A--E--E--V--P--P--E--L--P--E--P--A--L--G--I--N--F--A-     80

                                                                          
   241 AGAGATGGCATGCAGCGTCAAGATTGGCTCTCCTTAGTTGCTGTCCACAGTGATTGTTGG    300
   241 AGAGATGGCATGCAGCGTCAAGATTGGCTCTCCTTAGTTGCTGTCCACAGTGATTGTTGG    300
    81 -R--D--G--M--Q--R--Q--D--W--L--S--L--V--A--V--H--S--D--C--W-    100

                                                                          
   301 TTGCTCTCTGTTTCCTCCTACTTTGGCGCTCGGCTTAGTCGCAATGAGAAGAATCGCCTA    360
   301 TTGCTCTCTGTTTCCTCCTACTTTGGCGCTCGGCTTAGTCGCAATGAGAAGAATCGCCTA    360
   101 -L--L--S--V--S--S--Y--F--G--A--R--L--S--R--N--E--K--N--R--L-    120

                                                                          
   361 TTCAGTCTGATCAACGATCTTCCAACTCTCTTTGAAGTAGTGACCGGTAGGAAGACCATC    420
   361 TTCAGTCTGATCAACGATCTTCCAACTCTCTTTGAAGTAGTGACCGGTAGGAAGACCATC    420
   121 -F--S--L--I--N--D--L--P--T--L--F--E--V--V--T--G--R--K--T--I-    140

                                                                          
   421 AAAGATAAACCAAGCATGGATCATGAGAGCAAATACCAAAACGGCTTAAAGAGATCAATT    480
   421 AAAGATAAACCAAGCATGGATCATGAGAGCAAATACCAAAACGGCTTAAAGAGATCAATT    480
   141 -K--D--K--P--S--M--D--H--E--S--K--Y--Q--N--G--L--K--R--S--I-    160

                                                                          
   481 GAAGGAGAGATGAAGATCACAAGGAAGTTAATGGAAGAGAGCTGCGAAGACGAAGAAGAC    540
   481 GAAGGAGAGATGAAGATCACAAGGAAGTTAATGGAAGAGAGCTGCGAAGACGAAGAAGAC    540
   161 -E--G--E--M--K--I--T--R--K--L--M--E--E--S--C--E--D--E--E--D-    180

                                                                          
   541 GAGCATGGAGATACACTATGTGGAAGCTGTGGAGGACACTACCTAAACGTCGAGTTCTGG    600
   541 GAGCATGGAGATACACTATGTGGAAGCTGTGGAGGACACTACCTAAACGTCGAGTTCTGG    600
   181 -E--H--G--D--T--L--C--G--S--C--G--G--H--Y--L--N--V--E--F--W-    200

                                                                          
   601 ATATGTTGTGATGTATGTGAACGTTGGTACCATGGAAAGTGTGTGAAGATAACACCAGCC    660
   601 ATATGTTGTGATGTATGTGAACGTTGGTACCATGGAAAGTGTGTGAAGATAACACCAGCC    660
   201 -I--C--C--D--V--C--E--R--W--Y--H--G--K--C--V--K--I--T--P--A-    220

                                                                          
   661 AAAGCAGAGAGCATGAAGCAGTACAAATGCCCTTCTTGCTGCACTAAGAAAGGAAGACAG    720
   661 AAAGCAGAGAGCATGAAGCAGTACAAATGCCCTTCTTGCTGCACTAAGAAAGGAAGACAG    720
   221 -K--A--E--S--M--K--Q--Y--K--C--P--S--C--C--T--K--K--G--R--Q-    240

                                                                          
   721 TGA                                                             723
   721 TGA                                                             723
       -*-                                                             240