Transcript: Bra005933.1
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Description
AT5G07350 (E=0.0) | tudor domain-containing protein / nuclease family protein
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- Bra005933.1 2976 991aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M4CNZ5 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GCG TCA GCG ACT GAG AAC CAA TGG CTC AAA GGA AGA GTG AAG GCT GTT ACC TCC GGA 60
1 ATGGCGTCAGCGACTGAGAACCAATGGCTCAAAGGAAGAGTGAAGGCTGTTACCTCCGGA 60
1 -M--A--S--A--T--E--N--Q--W--L--K--G--R--V--K--A--V--T--S--G- 20
61 GAC TGT TTG GTG ATC ACT ACT TTG GTC CAC AAC AGA CCT GGA GCT CCA CCG GAA AAG GCT 120
61 GACTGTTTGGTGATCACTACTTTGGTCCACAACAGACCTGGAGCTCCACCGGAAAAGGCT 120
21 -D--C--L--V--I--T--T--L--V--H--N--R--P--G--A--P--P--E--K--A- 40
121 ATC ACT CTC TCT TGC CTC ATG GCA CCT AAG ATG G CT CGC AGG GGA GGT AAG GAT GAG CCT 180
121 ATCACTCTCTCTTGCCTCATGGCACCTAAGATGGCTCGCAGGGGAGGTAAGGATGAGCCT 180
41 -I--T--L--S--C--L--M--A--P--K--M--A--R--R--G--G--K--D--E--P- 60
181 TTT GCA TGG GAA AGC AAG GAG TTT CTG AGG AAA CTT TGC ATA GGA AAG GAA ATT TCT TTC 240
181 TTTGCATGGGAAAGCAAGGAGTTTCTGAGGAAACTTTGCATAGGAAAGGAAATTTCTTTC 240
61 -F--A--W--E--S--K--E--F--L--R--K--L--C--I--G--K--E--I--S--F- 80
241 AGA GTG GAA TAC AAA GTT GAA GCC CTT GCT GGA AGA GAA TTT GGC TCT GTT TTC CTT GGA 300
241 AGAGTGGAATACAAAGTTGAAGCCCTTGCTGGAAGAGAATTTGGCTCTGTTTTCCTTGGA 300
81 -R--V--E--Y--K--V--E--A--L--A--G--R--E--F--G--S--V--F--L--G- 100
301 ACC CAG AAT GTT GCA AAG CTT GTT GTT CAA AAT GGT TGG GCA AAG GTT AGG GAG CCA GGT 360
301 ACCCAGAATGTTGCAAAGCTTGTTGTTCAAAATGGTTGGGCAAAGGTTAGGGAGCCAGGT 360
101 -T--Q--N--V--A--K--L--V--V--Q--N--G--W--A--K--V--R--E--P--G- 120
361 CAG CAG AAT CAG GGT AAG GTT AGT CCC ACT CAC ATT ACA GAG CTG CTT CAG CTC CAA GAG 420
361 CAGCAGAATCAGGGTAAGGTTAGTCCCACTCACATTACAGAGCTGCTTCAGCTCCAAGAG 420
121 -Q--Q--N--Q--G--K--V--S--P--T--H--I--T--E--L--L--Q--L--Q--E- 140
421 CAG GCT AGT CAA GAA GGA GTT GGT TGC TGG AGC AAG GTT CCT GGT GCT GCT GAG GCA TCT 480
421 CAGGCTAGTCAAGAAGGAGTTGGTTGCTGGAGCAAGGTTCCTGGTGCTGCTGAGGCATCT 480
141 -Q--A--S--Q--E--G--V--G--C--W--S--K--V--P--G--A--A--E--A--S- 160
481 ATC AGA GAC CTC CCT CCT TCT GCC ATT GGA GAC TCT GCA GGC TTT GAC GCC ATG GGG CTG 540
481 ATCAGAGACCTCCCTCCTTCTGCCATTGGAGACTCTGCAGGCTTTGACGCCATGGGGCTG 540
161 -I--R--D--L--P--P--S--A--I--G--D--S--A--G--F--D--A--M--G--L- 180
541 TTG GCT GCC AAC AAA GGC AAG CCT ATG GAA GGC ATT GTT GAG CAG GTG CGC GAT GGA AGC 600
541 TTGGCTGCCAACAAAGGCAAGCCTATGGAAGGCATTGTTGAGCAGGTGCGCGATGGAAGC 600
181 -L--A--A--N--K--G--K--P--M--E--G--I--V--E--Q--V--R--D--G--S- 200
601 AGC ATC CGT GTT TAT CTT CTT CCA GAG TTC CAG TTT GTG CAA GTG TTC GTT GCT GGA ATC 660
601 AGCATCCGTGTTTATCTTCTTCCAGAGTTCCAGTTTGTGCAAGTGTTCGTTGCTGGAATC 660
201 -S--I--R--V--Y--L--L--P--E--F--Q--F--V--Q--V--F--V--A--G--I- 220
661 CAG TCT CCA TCA ATG GGA AGA AGA AAC ACA AAT GGA AAC GTT GTT GAG ACG GTT CCA GAT 720
661 CAGTCTCCATCAATGGGAAGAAGAAACACAAATGGAAACGTTGTTGAGACGGTTCCAGAT 720
221 -Q--S--P--S--M--G--R--R--N--T--N--G--N--V--V--E--T--V--P--D- 240
721 GAG TCC AGC GGA GAT GCT TCT GGT GAG TCA TCA AAA GCT CCT CTA ACG TCA GCT CAG AGA 780
721 GAGTCCAGCGGAGATGCTTCTGGTGAGTCATCAAAAGCTCCTCTAACGTCAGCTCAGAGA 780
241 -E--S--S--G--D--A--S--G--E--S--S--K--A--P--L--T--S--A--Q--R- 260
781 CTT GCT GCC TCT GCA GCT GCA TCG TCT GTG GAG GTT TCT GCT GAT CCT TTT GCA GCT GAA 840
781 CTTGCTGCCTCTGCAGCTGCATCGTCTGTGGAGGTTTCTGCTGATCCTTTTGCAGCTGAA 840
261 -L--A--A--S--A--A--A--S--S--V--E--V--S--A--D--P--F--A--A--E- 280
841 GCC AAG TAC TTC ACT GAG CAC CGT GTT CTT AGC AGA GAT GTT CGG ATT GTT CTT GAA GGC 900
841 GCCAAGTACTTCACTGAGCACCGTGTTCTTAGCAGAGATGTTCGGATTGTTCTTGAAGGC 900
281 -A--K--Y--F--T--E--H--R--V--L--S--R--D--V--R--I--V--L--E--G- 300
901 GTT GAC AAG TTC AAC AAT CTG ATT GGT TCA GTT CAT TAC TCT GAT GGG GAA GCA GTT AAA 960
901 GTTGACAAGTTCAACAATCTGATTGGTTCAGTTCATTACTCTGATGGGGAAGCAGTTAAA 960
301 -V--D--K--F--N--N--L--I--G--S--V--H--Y--S--D--G--E--A--V--K- 320
961 GAC TTG GGG CTA GAG CTC GTT GAA AAT GGT CTT GCT AAA TAT GTT GAA TGG AGT GCA AAC 1020
961 GACTTGGGGCTAGAGCTCGTTGAAAATGGTCTTGCTAAATATGTTGAATGGAGTGCAAAC 1020
321 -D--L--G--L--E--L--V--E--N--G--L--A--K--Y--V--E--W--S--A--N- 340
1021 ATG ATG GAG GAG GAA GCC AAG AGA AAG CTG AAA GCT GCT GAG CTA AAA TGC AAA AAA GAT 1080
1021 ATGATGGAGGAGGAAGCCAAGAGAAAGCTGAAAGCTGCTGAGCTAAAATGCAAAAAAGAT 1080
341 -M--M--E--E--E--A--K--R--K--L--K--A--A--E--L--K--C--K--K--D- 360
1081 AAG GTG AAA ATG TGG GCT AAC TAT GTT CCA CCA GCT ACA AAC TCT AAG GCA CTT CAT GAC 1140
1081 AAGGTGAAAATGTGGGCTAACTATGTTCCACCAGCTACAAACTCTAAGGCACTTCATGAC 1140
361 -K--V--K--M--W--A--N--Y--V--P--P--A--T--N--S--K--A--L--H--D- 380
1141 CAG AAC TTT ACC GGA AAG G TA GTG GAG GTG GTG AGT GGG GAC TGT ATT GTA GTT GCT GAT 1200
1141 CAGAACTTTACCGGAAAGGTAGTGGAGGTGGTGAGTGGGGACTGTATTGTAGTTGCTGAT 1200
381 -Q--N--F--T--G--K--V--V--E--V--V--S--G--D--C--I--V--V--A--D- 400
1201 GAT GCT ATC CCA TAT GGG AGC CCA GCA GCA GAG AGA AGG GTT AAT CTT TCG AGT ATC AGA 1260
1201 GATGCTATCCCATATGGGAGCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGTTAATCTTTCGAGTATCAGA 1260
401 -D--A--I--P--Y--G--S--P--A--A--E--R--R--V--N--L--S--S--I--R- 420
1261 TGT CCT AAA ATG GGT AAT CCA CGT AGA GAA GAG AAG CCA GCT CCT TAT GCT CGT GAA GCA 1320
1261 TGTCCTAAAATGGGTAATCCACGTAGAGAAGAGAAGCCAGCTCCTTATGCTCGTGAAGCA 1320
421 -C--P--K--M--G--N--P--R--R--E--E--K--P--A--P--Y--A--R--E--A- 440
1321 AGA GAG TTC TTG AGA CAG AGG CTT ATT GGC AAA CAG G TT ATT GTT CAA ATG GAA TAC TCA 1380
1321 AGAGAGTTCTTGAGACAGAGGCTTATTGGCAAACAGGTTATTGTTCAAATGGAATACTCA 1380
441 -R--E--F--L--R--Q--R--L--I--G--K--Q--V--I--V--Q--M--E--Y--S- 460
1381 AGG AAA GTC ACA CCA GCA GAA GGT GCT GCC CCA ACA GGT GCT GGT GAT AGG ATA ATG GAT 1440
1381 AGGAAAGTCACACCAGCAGAAGGTGCTGCCCCAACAGGTGCTGGTGATAGGATAATGGAT 1440
461 -R--K--V--T--P--A--E--G--A--A--P--T--G--A--G--D--R--I--M--D- 480
1441 TTT GGC TCA GTG TTC ATT CCA TCT CCC GCC AAA GGC GAT ACC CAG GAA GTG GCT GCA TCA 1500
1441 TTTGGCTCAGTGTTCATTCCATCTCCCGCCAAAGGCGATACCCAGGAAGTGGCTGCATCA 1500
481 -F--G--S--V--F--I--P--S--P--A--K--G--D--T--Q--E--V--A--A--S- 500
1501 GCC ATC TCT GGC AGC CAG CCA GCT GGA GTG AAC ATC GCT GAG CTT CTT CTA TCT CGT GGT 1560
1501 GCCATCTCTGGCAGCCAGCCAGCTGGAGTGAACATCGCTGAGCTTCTTCTATCTCGTGGT 1560
501 -A--I--S--G--S--Q--P--A--G--V--N--I--A--E--L--L--L--S--R--G- 520
1561 TTT GGA AAT GTG GTT AGA CAC AGA GAT TTT GAA GAG AGA TCA AAC CAT TAT GAT GCT CTT 1620
1561 TTTGGAAATGTGGTTAGACACAGAGATTTTGAAGAGAGATCAAACCATTATGATGCTCTT 1620
521 -F--G--N--V--V--R--H--R--D--F--E--E--R--S--N--H--Y--D--A--L- 540
1621 CTT GCT GCT GAA TCT CGT GCT CTC TCT GGA AAG AAA GGA ATC CAT TCT GCT AAA GAG TCT 1680
1621 CTTGCTGCTGAATCTCGTGCTCTCTCTGGAAAGAAAGGAATCCATTCTGCTAAAGAGTCT 1680
541 -L--A--A--E--S--R--A--L--S--G--K--K--G--I--H--S--A--K--E--S- 560
1681 CCT GTC ATG CAC ATC ACA GAC CTA ACC GTG GCC GCA GCT AAG AAA GCT AAA GAT TTC TTG 1740
1681 CCTGTCATGCACATCACAGACCTAACCGTGGCCGCAGCTAAGAAAGCTAAAGATTTCTTG 1740
561 -P--V--M--H--I--T--D--L--T--V--A--A--A--K--K--A--K--D--F--L- 580
1741 CCA TCA CTT CAA AGA ATC AGG AGG ATA CCA GCT GTT GTG GAA TAT GTA CTA AGC GGA CAT 1800
1741 CCATCACTTCAAAGAATCAGGAGGATACCAGCTGTTGTGGAATATGTACTAAGCGGACAT 1800
581 -P--S--L--Q--R--I--R--R--I--P--A--V--V--E--Y--V--L--S--G--H- 600
1801 AGG TGT AAG CTT TAT ATT CCG AAG CTA ACG TGT AGC ATT GCC TTT GCG TTC TCT GGT GTT 1860
1801 AGGTGTAAGCTTTATATTCCGAAGCTAACGTGTAGCATTGCCTTTGCGTTCTCTGGTGTT 1860
601 -R--C--K--L--Y--I--P--K--L--T--C--S--I--A--F--A--F--S--G--V- 620
1861 AGA TGC CCT GGC CGT GGA GAG CCC TTT TCA GAT GAA GCT ATC TCT GTA ATG AGA CGT AGG 1920
1861 AGATGCCCTGGCCGTGGAGAGCCCTTTTCAGATGAAGCTATCTCTGTAATGAGACGTAGG 1920
621 -R--C--P--G--R--G--E--P--F--S--D--E--A--I--S--V--M--R--R--R- 640
1921 ATC ATG CAG AGA GAT GTT GAG A TT GAA GTT GAG ACG GTG GAT AGA ACC GGT ACA TTC TTG 1980
1921 ATCATGCAGAGAGATGTTGAGATTGAAGTTGAGACGGTGGATAGAACCGGTACATTCTTG 1980
641 -I--M--Q--R--D--V--E--I--E--V--E--T--V--D--R--T--G--T--F--L- 660
1981 GGA TCA ATG TGG GAG TCC AGG ACA AAT GTG GCG ACG GTT CTG CTT GAA GCT GGC TTA GCA 2040
1981 GGATCAATGTGGGAGTCCAGGACAAATGTGGCGACGGTTCTGCTTGAAGCTGGCTTAGCA 2040
661 -G--S--M--W--E--S--R--T--N--V--A--T--V--L--L--E--A--G--L--A- 680
2041 AAA ATG CAG ACA AGC TTT GGT GCA GAC AGG ATT GTT GAA GCA CAT ATA CTT GAA CAA GCA 2100
2041 AAAATGCAGACAAGCTTTGGTGCAGACAGGATTGTTGAAGCACATATACTTGAACAAGCA 2100
681 -K--M--Q--T--S--F--G--A--D--R--I--V--E--A--H--I--L--E--Q--A- 700
2101 GAG AGA TCT GCT AAG AAT CAG AAA CTG AAG GTT TGG GAG AAC TAT GTT GAA GGA CAA GAA 2160
2101 GAGAGATCTGCTAAGAATCAGAAACTGAAGGTTTGGGAGAACTATGTTGAAGGACAAGAA 2160
701 -E--R--S--A--K--N--Q--K--L--K--V--W--E--N--Y--V--E--G--Q--E- 720
2161 GTC TCA AAC GGA AGT ACA ACC GTT GAG ACC AGA CAA AAG GAG ACT TTG AAG GTT GCT GTT 2220
2161 GTCTCAAACGGAAGTACAACCGTTGAGACCAGACAAAAGGAGACTTTGAAGGTTGCTGTT 2220
721 -V--S--N--G--S--T--T--V--E--T--R--Q--K--E--T--L--K--V--A--V- 740
2221 ACT GAA GTA CTT GGA GGT GGT CGG TTC TAT GTT CAA ACG GTT GGA GAT CAG AGA GTA GCT 2280
2221 ACTGAAGTACTTGGAGGTGGTCGGTTCTATGTTCAAACGGTTGGAGATCAGAGAGTAGCT 2280
741 -T--E--V--L--G--G--G--R--F--Y--V--Q--T--V--G--D--Q--R--V--A- 760
2281 TCT ATT CAG AAC CAG CTT GCA TCT TTG AGT CTT AAA GAT GCT CCA ATC ATT GGT TCC TTC 2340
2281 TCTATTCAGAACCAGCTTGCATCTTTGAGTCTTAAAGATGCTCCAATCATTGGTTCCTTC 2340
761 -S--I--Q--N--Q--L--A--S--L--S--L--K--D--A--P--I--I--G--S--F- 780
2341 AAC CCT AAG AGA GGT GAC ATT GTC CTT GCA CAG TTT AGC CTT GAC AAC TCC TGG AAC CGT 2400
2341 AACCCTAAGAGAGGTGACATTGTCCTTGCACAGTTTAGCCTTGACAACTCCTGGAACCGT 2400
781 -N--P--K--R--G--D--I--V--L--A--Q--F--S--L--D--N--S--W--N--R- 800
2401 GCA ATG ATT GTG AGT GCA CCT CGT GCA GCT GTT GAG TCT CCA GAT GAG AAG TTT GAA GTG 2460
2401 GCAATGATTGTGAGTGCACCTCGTGCAGCTGTTGAGTCTCCAGATGAGAAGTTTGAAGTG 2460
801 -A--M--I--V--S--A--P--R--A--A--V--E--S--P--D--E--K--F--E--V- 820
2461 TTC TAC ATC GAT TAT GGA AAC CAA GAG GTA GTC CCT TAC AGC GCA ATC CGA CCA GTG GAC 2520
2461 TTCTACATCGATTATGGAAACCAAGAGGTAGTCCCTTACAGCGCAATCCGACCAGTGGAC 2520
821 -F--Y--I--D--Y--G--N--Q--E--V--V--P--Y--S--A--I--R--P--V--D- 840
2521 CCT TCG GTG TCC TCA GCG CCA GGG CTT GCT CAG CTC TGC AGG CTT GCT TAC ATT AAG GTT 2580
2521 CCTTCGGTGTCCTCAGCGCCAGGGCTTGCTCAGCTCTGCAGGCTTGCTTACATTAAGGTT 2580
841 -P--S--V--S--S--A--P--G--L--A--Q--L--C--R--L--A--Y--I--K--V- 860
2581 CCA AGC TTG GAA GAA GAC TTT GGT CCT GAA GCT GGA GAG TAT TTG CAT ACA ATA ACT TTG 2640
2581 CCAAGCTTGGAAGAAGACTTTGGTCCTGAAGCTGGAGAGTATTTGCATACAATAACTTTG 2640
861 -P--S--L--E--E--D--F--G--P--E--A--G--E--Y--L--H--T--I--T--L- 880
2641 GGA AGT GGC AAA GAG TTC AAA GCA GTG ATA GAA GAA AGA GAC GCA TCT GGA GGC AAA GTC 2700
2641 GGAAGTGGCAAAGAGTTCAAAGCAGTGATAGAAGAAAGAGACGCATCTGGAGGCAAAGTC 2700
881 -G--S--G--K--E--F--K--A--V--I--E--E--R--D--A--S--G--G--K--V- 900
2701 AAA GGA CAA GGC ACT GGA ACT GAA CTT GTT GTC ACT CTC ATT GCT GTC GAC GAT GAG GTC 2760
2701 AAAGGACAAGGCACTGGAACTGAACTTGTTGTCACTCTCATTGCTGTCGACGATGAGGTC 2760
901 -K--G--Q--G--T--G--T--E--L--V--V--T--L--I--A--V--D--D--E--V- 920
2761 TCG GTT AAT GGT GCA ATG CTT CAG GGA GGA ATA GCG AGG ATG GAG AAA CGT AGG AGG TTT 2820
2761 TCGGTTAATGGTGCAATGCTTCAGGGAGGAATAGCGAGGATGGAGAAACGTAGGAGGTTT 2820
921 -S--V--N--G--A--M--L--Q--G--G--I--A--R--M--E--K--R--R--R--F- 940
2821 GAG CAC AAG GAC AAA AAA GCT GCT CTT GAT GCT TTG GAG AAG TTC CAA GAG GAA GCT CGC 2880
2821 GAGCACAAGGACAAAAAAGCTGCTCTTGATGCTTTGGAGAAGTTCCAAGAGGAAGCTCGC 2880
941 -E--H--K--D--K--K--A--A--L--D--A--L--E--K--F--Q--E--E--A--R- 960
2881 AAG TCT AGG ACT GGA ATA TGG CAG TAC GGT GAC GTC GAA TCA GAT GAT GAG GAC ATT GCT 2940
2881 AAGTCTAGGACTGGAATATGGCAGTACGGTGACGTCGAATCAGATGATGAGGACATTGCT 2940
961 -K--S--R--T--G--I--W--Q--Y--G--D--V--E--S--D--D--E--D--I--A- 980
2941 CCG GCT AAA AAG CCT GCC GGT GGT GGT CGC CGG TAA 2976
2941 CCGGCTAAAAAGCCTGCCGGTGGTGGTCGCCGGTAA 2976
981 -P--A--K--K--P--A--G--G--G--R--R--*- 991
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