Transcript: Bra005362.1
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Description
AT2G35160 (E=1e-166) SUVH5, SGD9 | SUVH5 (SU(VAR)3-9 HOMOLOG 5); histone methyltransferase
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- Bra005362.1 1230 409aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M4CMC4 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG AGA GAC GCC AAC AAG GAG CTG CTC GCC GTG AGT ATA GTA GCC TCT GGT GGC TAC GAC 60
1 ATGAGAGACGCCAACAAGGAGCTGCTCGCCGTGAGTATAGTAGCCTCTGGTGGCTACGAC 60
1 -M--R--D--A--N--K--E--L--L--A--V--S--I--V--A--S--G--G--Y--D- 20
61 GAC GAC CTT TGT AAC TCC GAC GTG TTG ATC TAC ACA GGC CAA GGA GGG AAC CTA TCT AAA 120
61 GACGACCTTTGTAACTCCGACGTGTTGATCTACACAGGCCAAGGAGGGAACCTATCTAAA 120
21 -D--D--L--C--N--S--D--V--L--I--Y--T--G--Q--G--G--N--L--S--K- 40
121 AAG TTT CAA CAG GGG AAC ATA ACC AAC GAA CCT AAA GAC CAG CAG CTC TTG AGA GGA AAC 180
121 AAGTTTCAACAGGGGAACATAACCAACGAACCTAAAGACCAGCAGCTCTTGAGAGGAAAC 180
41 -K--F--Q--Q--G--N--I--T--N--E--P--K--D--Q--Q--L--L--R--G--N- 60
181 CTC GCG TTG GCG AAC AGT ATA GAC AAA CAG AAC CCT GTG AGG GTC ATA AGA GGC AAC AAG 240
181 CTCGCGTTGGCGAACAGTATAGACAAACAGAACCCTGTGAGGGTCATAAGAGGCAACAAG 240
61 -L--A--L--A--N--S--I--D--K--Q--N--P--V--R--V--I--R--G--N--K- 80
241 AAG ACA CCA TCT TCT GAT AAT AAC ACC AAA AAC TAC GTC TAC GAT GGG TTG TAT CTG GTT 300
241 AAGACACCATCTTCTGATAATAACACCAAAAACTACGTCTACGATGGGTTGTATCTGGTT 300
81 -K--T--P--S--S--D--N--N--T--K--N--Y--V--Y--D--G--L--Y--L--V- 100
301 GAA GAG TTT TGG AAA GAA GTG GGA TCT TAT GGT AAG CTT GTT TTT AAG TTC AGG CTG CGG 360
301 GAAGAGTTTTGGAAAGAAGTGGGATCTTATGGTAAGCTTGTTTTTAAGTTCAGGCTGCGG 360
101 -E--E--F--W--K--E--V--G--S--Y--G--K--L--V--F--K--F--R--L--R- 120
361 CGT ATC GCC GGG CAG CCT GAA CTT ACT TGG AAA GTG GTT AAG AAA GCA AAA TCA TCA AAG 420
361 CGTATCGCCGGGCAGCCTGAACTTACTTGGAAAGTGGTTAAGAAAGCAAAATCATCAAAG 420
121 -R--I--A--G--Q--P--E--L--T--W--K--V--V--K--K--A--K--S--S--K- 140
421 GCT CGC GAC GGT CTC TGC TGC GAA GAT ATC TCT GGA GGG AAA GAG AGG TTG CCT ATA TGC 480
421 GCTCGCGACGGTCTCTGCTGCGAAGATATCTCTGGAGGGAAAGAGAGGTTGCCTATATGC 480
141 -A--R--D--G--L--C--C--E--D--I--S--G--G--K--E--R--L--P--I--C- 160
481 GCT GTT AAC GAG ATA GAC GAT GAG AAA CCT CCT GTG TTT GAC TAC ACT GTT AAC ATG ATA 540
481 GCTGTTAACGAGATAGACGATGAGAAACCTCCTGTGTTTGACTACACTGTTAACATGATA 540
161 -A--V--N--E--I--D--D--E--K--P--P--V--F--D--Y--T--V--N--M--I- 180
541 TAT CCG GAT TGG TGC CAG CCG ATT CCT CCG AAA GGT TGC GGC TGC ACG AAG GGC TGC AAA 600
541 TATCCGGATTGGTGCCAGCCGATTCCTCCGAAAGGTTGCGGCTGCACGAAGGGCTGCAAA 600
181 -Y--P--D--W--C--Q--P--I--P--P--K--G--C--G--C--T--K--G--C--K- 200
601 GAC TCG AAA AAC TGC GGT TGC GTT GCG AAA AAC GAC GGA GAG TTG CCG TAT AAC TAC GAC 660
601 GACTCGAAAAACTGCGGTTGCGTTGCGAAAAACGACGGAGAGTTGCCGTATAACTACGAC 660
201 -D--S--K--N--C--G--C--V--A--K--N--D--G--E--L--P--Y--N--Y--D- 220
661 GGA GCG ATT GTT TTT AGA AAG CCT ATG GTC TAC GAG TGT GGC CCT CTC TGC AAA TGC CCG 720
661 GGAGCGATTGTTTTTAGAAAGCCTATGGTCTACGAGTGTGGCCCTCTCTGCAAATGCCCG 720
221 -G--A--I--V--F--R--K--P--M--V--Y--E--C--G--P--L--C--K--C--P- 240
721 CCT GAT TGC TAC CTC CGC GTC ACG CAG AGA GGG ATC AAG ATC CAG CTG GAG ATC TTC AAG 780
721 CCTGATTGCTACCTCCGCGTCACGCAGAGAGGGATCAAGATCCAGCTGGAGATCTTCAAG 780
241 -P--D--C--Y--L--R--V--T--Q--R--G--I--K--I--Q--L--E--I--F--K- 260
781 ACC GAG TCG AGA GGA TGG GGA GTG AGG TCT CTA GAG TCT ATT CCT TCG GGG AGC TTC ATC 840
781 ACCGAGTCGAGAGGATGGGGAGTGAGGTCTCTAGAGTCTATTCCTTCGGGGAGCTTCATC 840
261 -T--E--S--R--G--W--G--V--R--S--L--E--S--I--P--S--G--S--F--I- 280
841 TGC GAG TAC GCA GGG GAG CTT CTA CAG GAA AAC GAA GCT GAT AGG CTT GCG GGT AAA GAC 900
841 TGCGAGTACGCAGGGGAGCTTCTACAGGAAAACGAAGCTGATAGGCTTGCGGGTAAAGAC 900
281 -C--E--Y--A--G--E--L--L--Q--E--N--E--A--D--R--L--A--G--K--D- 300
901 GAG TAT CTA TTT GAC ATT GGG ACT GAT AAT GGG AGT AGT AGC TTC TAT GAG AGC AGC TTC 960
901 GAGTATCTATTTGACATTGGGACTGATAATGGGAGTAGTAGCTTCTATGAGAGCAGCTTC 960
301 -E--Y--L--F--D--I--G--T--D--N--G--S--S--S--F--Y--E--S--S--F- 320
961 TTT ACC ATA GAC GCT GCG AGG AAA GGG AAC GTA GGG AGG TTT ATA AAC CAT AGC TGC TCG 1020
961 TTTACCATAGACGCTGCGAGGAAAGGGAACGTAGGGAGGTTTATAAACCATAGCTGCTCG 1020
321 -F--T--I--D--A--A--R--K--G--N--V--G--R--F--I--N--H--S--C--S- 340
1021 CCG AAT CTG TAC GCG CAA GAT GTT TTG TAC CAC CAT GAG GAT ATG AGG ATC CCT CAT GTG 1080
1021 CCGAATCTGTACGCGCAAGATGTTTTGTACCACCATGAGGATATGAGGATCCCTCATGTG 1080
341 -P--N--L--Y--A--Q--D--V--L--Y--H--H--E--D--M--R--I--P--H--V- 360
1081 ATG CTC TTT GCG AAG GAC AAT ATA CCT CCG CTT AAG GAA CTA ACG TAC TAT TAC AAC TAT 1140
1081 ATGCTCTTTGCGAAGGACAATATACCTCCGCTTAAGGAACTAACGTACTATTACAACTAT 1140
361 -M--L--F--A--K--D--N--I--P--P--L--K--E--L--T--Y--Y--Y--N--Y- 380
1141 AAG ATT GGC CAG GTG TTG GAC GCT GAT GGT AAT GTC AAG GTG AAG AAT TGC TAT TGT GGT 1200
1141 AAGATTGGCCAGGTGTTGGACGCTGATGGTAATGTCAAGGTGAAGAATTGCTATTGTGGT 1200
381 -K--I--G--Q--V--L--D--A--D--G--N--V--K--V--K--N--C--Y--C--G- 400
1201 TCG GCG AAG TGC AGT GGT AGG CTC TAC TGA 1230
1201 TCGGCGAAGTGCAGTGGTAGGCTCTACTGA 1230
401 -S--A--K--C--S--G--R--L--Y--*- 409
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