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Brassica rapa (Brapa_1.0)
Description

AT2G35160 (E=1e-166) SUVH5, SGD9 | SUVH5 (SU(VAR)3-9 HOMOLOG 5); histone methyltransferase

Location
About this transcript

This transcript has 1 exon and is annotated with 18 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene Bra005362 Show transcript tableHide transcript table

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  • UniProt
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-Bra005362.11230409aa
 
Protein coding
M4CMC4 Ensembl Canonical
Variants
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Markup
  • loaded
                                                                          
     1 ATGAGAGACGCCAACAAGGAGCTGCTCGCCGTGAGTATAGTAGCCTCTGGTGGCTACGAC     60
     1 ATGAGAGACGCCAACAAGGAGCTGCTCGCCGTGAGTATAGTAGCCTCTGGTGGCTACGAC     60
     1 -M--R--D--A--N--K--E--L--L--A--V--S--I--V--A--S--G--G--Y--D-     20

                                                                          
    61 GACGACCTTTGTAACTCCGACGTGTTGATCTACACAGGCCAAGGAGGGAACCTATCTAAA    120
    61 GACGACCTTTGTAACTCCGACGTGTTGATCTACACAGGCCAAGGAGGGAACCTATCTAAA    120
    21 -D--D--L--C--N--S--D--V--L--I--Y--T--G--Q--G--G--N--L--S--K-     40

                                                                          
   121 AAGTTTCAACAGGGGAACATAACCAACGAACCTAAAGACCAGCAGCTCTTGAGAGGAAAC    180
   121 AAGTTTCAACAGGGGAACATAACCAACGAACCTAAAGACCAGCAGCTCTTGAGAGGAAAC    180
    41 -K--F--Q--Q--G--N--I--T--N--E--P--K--D--Q--Q--L--L--R--G--N-     60

                                                                          
   181 CTCGCGTTGGCGAACAGTATAGACAAACAGAACCCTGTGAGGGTCATAAGAGGCAACAAG    240
   181 CTCGCGTTGGCGAACAGTATAGACAAACAGAACCCTGTGAGGGTCATAAGAGGCAACAAG    240
    61 -L--A--L--A--N--S--I--D--K--Q--N--P--V--R--V--I--R--G--N--K-     80

                                                                          
   241 AAGACACCATCTTCTGATAATAACACCAAAAACTACGTCTACGATGGGTTGTATCTGGTT    300
   241 AAGACACCATCTTCTGATAATAACACCAAAAACTACGTCTACGATGGGTTGTATCTGGTT    300
    81 -K--T--P--S--S--D--N--N--T--K--N--Y--V--Y--D--G--L--Y--L--V-    100

                                                                          
   301 GAAGAGTTTTGGAAAGAAGTGGGATCTTATGGTAAGCTTGTTTTTAAGTTCAGGCTGCGG    360
   301 GAAGAGTTTTGGAAAGAAGTGGGATCTTATGGTAAGCTTGTTTTTAAGTTCAGGCTGCGG    360
   101 -E--E--F--W--K--E--V--G--S--Y--G--K--L--V--F--K--F--R--L--R-    120

                                                                          
   361 CGTATCGCCGGGCAGCCTGAACTTACTTGGAAAGTGGTTAAGAAAGCAAAATCATCAAAG    420
   361 CGTATCGCCGGGCAGCCTGAACTTACTTGGAAAGTGGTTAAGAAAGCAAAATCATCAAAG    420
   121 -R--I--A--G--Q--P--E--L--T--W--K--V--V--K--K--A--K--S--S--K-    140

                                                                          
   421 GCTCGCGACGGTCTCTGCTGCGAAGATATCTCTGGAGGGAAAGAGAGGTTGCCTATATGC    480
   421 GCTCGCGACGGTCTCTGCTGCGAAGATATCTCTGGAGGGAAAGAGAGGTTGCCTATATGC    480
   141 -A--R--D--G--L--C--C--E--D--I--S--G--G--K--E--R--L--P--I--C-    160

                                                                          
   481 GCTGTTAACGAGATAGACGATGAGAAACCTCCTGTGTTTGACTACACTGTTAACATGATA    540
   481 GCTGTTAACGAGATAGACGATGAGAAACCTCCTGTGTTTGACTACACTGTTAACATGATA    540
   161 -A--V--N--E--I--D--D--E--K--P--P--V--F--D--Y--T--V--N--M--I-    180

                                                                          
   541 TATCCGGATTGGTGCCAGCCGATTCCTCCGAAAGGTTGCGGCTGCACGAAGGGCTGCAAA    600
   541 TATCCGGATTGGTGCCAGCCGATTCCTCCGAAAGGTTGCGGCTGCACGAAGGGCTGCAAA    600
   181 -Y--P--D--W--C--Q--P--I--P--P--K--G--C--G--C--T--K--G--C--K-    200

                                                                          
   601 GACTCGAAAAACTGCGGTTGCGTTGCGAAAAACGACGGAGAGTTGCCGTATAACTACGAC    660
   601 GACTCGAAAAACTGCGGTTGCGTTGCGAAAAACGACGGAGAGTTGCCGTATAACTACGAC    660
   201 -D--S--K--N--C--G--C--V--A--K--N--D--G--E--L--P--Y--N--Y--D-    220

                                                                          
   661 GGAGCGATTGTTTTTAGAAAGCCTATGGTCTACGAGTGTGGCCCTCTCTGCAAATGCCCG    720
   661 GGAGCGATTGTTTTTAGAAAGCCTATGGTCTACGAGTGTGGCCCTCTCTGCAAATGCCCG    720
   221 -G--A--I--V--F--R--K--P--M--V--Y--E--C--G--P--L--C--K--C--P-    240

                                                                          
   721 CCTGATTGCTACCTCCGCGTCACGCAGAGAGGGATCAAGATCCAGCTGGAGATCTTCAAG    780
   721 CCTGATTGCTACCTCCGCGTCACGCAGAGAGGGATCAAGATCCAGCTGGAGATCTTCAAG    780
   241 -P--D--C--Y--L--R--V--T--Q--R--G--I--K--I--Q--L--E--I--F--K-    260

                                                                          
   781 ACCGAGTCGAGAGGATGGGGAGTGAGGTCTCTAGAGTCTATTCCTTCGGGGAGCTTCATC    840
   781 ACCGAGTCGAGAGGATGGGGAGTGAGGTCTCTAGAGTCTATTCCTTCGGGGAGCTTCATC    840
   261 -T--E--S--R--G--W--G--V--R--S--L--E--S--I--P--S--G--S--F--I-    280

                                                                          
   841 TGCGAGTACGCAGGGGAGCTTCTACAGGAAAACGAAGCTGATAGGCTTGCGGGTAAAGAC    900
   841 TGCGAGTACGCAGGGGAGCTTCTACAGGAAAACGAAGCTGATAGGCTTGCGGGTAAAGAC    900
   281 -C--E--Y--A--G--E--L--L--Q--E--N--E--A--D--R--L--A--G--K--D-    300

                                                                          
   901 GAGTATCTATTTGACATTGGGACTGATAATGGGAGTAGTAGCTTCTATGAGAGCAGCTTC    960
   901 GAGTATCTATTTGACATTGGGACTGATAATGGGAGTAGTAGCTTCTATGAGAGCAGCTTC    960
   301 -E--Y--L--F--D--I--G--T--D--N--G--S--S--S--F--Y--E--S--S--F-    320

                                                                          
   961 TTTACCATAGACGCTGCGAGGAAAGGGAACGTAGGGAGGTTTATAAACCATAGCTGCTCG   1020
   961 TTTACCATAGACGCTGCGAGGAAAGGGAACGTAGGGAGGTTTATAAACCATAGCTGCTCG   1020
   321 -F--T--I--D--A--A--R--K--G--N--V--G--R--F--I--N--H--S--C--S-    340

                                                                          
  1021 CCGAATCTGTACGCGCAAGATGTTTTGTACCACCATGAGGATATGAGGATCCCTCATGTG   1080
  1021 CCGAATCTGTACGCGCAAGATGTTTTGTACCACCATGAGGATATGAGGATCCCTCATGTG   1080
   341 -P--N--L--Y--A--Q--D--V--L--Y--H--H--E--D--M--R--I--P--H--V-    360

                                                                          
  1081 ATGCTCTTTGCGAAGGACAATATACCTCCGCTTAAGGAACTAACGTACTATTACAACTAT   1140
  1081 ATGCTCTTTGCGAAGGACAATATACCTCCGCTTAAGGAACTAACGTACTATTACAACTAT   1140
   361 -M--L--F--A--K--D--N--I--P--P--L--K--E--L--T--Y--Y--Y--N--Y-    380

                                                                          
  1141 AAGATTGGCCAGGTGTTGGACGCTGATGGTAATGTCAAGGTGAAGAATTGCTATTGTGGT   1200
  1141 AAGATTGGCCAGGTGTTGGACGCTGATGGTAATGTCAAGGTGAAGAATTGCTATTGTGGT   1200
   381 -K--I--G--Q--V--L--D--A--D--G--N--V--K--V--K--N--C--Y--C--G-    400

                                                                          
  1201 TCGGCGAAGTGCAGTGGTAGGCTCTACTGA                                 1230
  1201 TCGGCGAAGTGCAGTGGTAGGCTCTACTGA                                 1230
   401 -S--A--K--C--S--G--R--L--Y--*-                                  409