Transcript: Bo8g109040.1
.
Description
Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT1G11160) TAIR;Acc:AT1G11160]
Show/hide columns (1 hidden)
- Bo8g109040.1 2853 950aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3DY04 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
ATG GCG AAG CGT GGA TAC AAG CTG C AG GAG TTC CTG GCA CAT TCA GCA AAT GTG AAT TGT ATGGCGAAGCGTGGATACAAGCTGCAGGAGTTCCTGGCACATTCAGCAAATGTGAATTGT -M--A--K--R--G--Y--K--L--Q--E--F--L--A--H--S--A--N--V--N--C- CTA AGT ATC GGA AAG AAG ACA TCA CGT CTC CTT CTA ACC GGA GGA GAT GAC TGC AAG GTC CTAAGTATCGGAAAGAAGACATCACGTCTCCTTCTAACCGGAGGAGATGACTGCAAGGTC -L--S--I--G--K--K--T--S--R--L--L--L--T--G--G--D--D--C--K--V- AAC CTC TGG TCA ATC GGC AAA TCT ACC TCT CTA ACG AGT CTT TGT GGA CAT ACA AGC CCT AACCTCTGGTCAATCGGCAAATCTACCTCTCTAACGAGTCTTTGTGGACATACAAGCCCT -N--L--W--S--I--G--K--S--T--S--L--T--S--L--C--G--H--T--S--P- ATT GAC TCA GTA ACT TTC AAC ACA GAA GAA GCT TTG GTC CTC GCT GGA GCT TCT TCT GGT ATTGACTCAGTAACTTTCAACACAGAAGAAGCTTTGGTCCTCGCTGGAGCTTCTTCTGGT -I--D--S--V--T--F--N--T--E--E--A--L--V--L--A--G--A--S--S--G- GTG ATT AAG CTC TGG AAT CTA CAA GAA GCA AAG G T G GTT CGA GGT TTT ACT GGA CAT ATA GTGATTAAGCTCTGGAATCTACAAGAAGCAAAGGTGGTTCGAGGTTTTACTGGACATATA -V--I--K--L--W--N--L--Q--E--A--K--V--V--R--G--F--T--G--H--I- TCA AAC TGT TCT GCT CTT GAG TTT CAT CCG TTT GGT CAA TAC CTT GCG TCC GGA TCT AGT TCAAACTGTTCTGCTCTTGAGTTTCATCCGTTTGGTCAATACCTTGCGTCCGGATCTAGT -S--N--C--S--A--L--E--F--H--P--F--G--Q--Y--L--A--S--G--S--S- GAC GCA AAT CTA AAG ATT TGG GAT ATC AGA AAG AAA GGA TGC ATC CAA ACA TAC AAA GGT GACGCAAATCTAAAGATTTGGGATATCAGAAAGAAAGGATGCATCCAAACATACAAAGGT -D--A--N--L--K--I--W--D--I--R--K--K--G--C--I--Q--T--Y--K--G- CAC ACT CGT GGC ATT AGT ACT GTC AAA TTC ACT CCT GAT GGG CGT TGG TTA GTG TCT GGT CACACTCGTGGCATTAGTACTGTCAAATTCACTCCTGATGGGCGTTGGTTAGTGTCTGGT -H--T--R--G--I--S--T--V--K--F--T--P--D--G--R--W--L--V--S--G- GGA CTT GAC AAC GTT GTA AAG A TT TGG GAT ATA ACT GCT GGA AAG CTA CTG CAT GAG TTT GGACTTGACAACGTTGTAAAGATTTGGGATATAACTGCTGGAAAGCTACTGCATGAGTTT -G--L--D--N--V--V--K--I--W--D--I--T--A--G--K--L--L--H--E--F- AAG TTT CAT GAT GGA CCT ATT CGT TCC CTA GAC TTC CAC CCT CTT GAG TTT CTC CTA GCC AAGTTTCATGATGGACCTATTCGTTCCCTAGACTTCCACCCTCTTGAGTTTCTCCTAGCC -K--F--H--D--G--P--I--R--S--L--D--F--H--P--L--E--F--L--L--A- ACT G GT TCT GCA GAC AGG ACA GTG AAG TTC TGG GAT TTA GAA ACG TTT GAA TTG ATT GGA ACTGGTTCTGCAGACAGGACAGTGAAGTTCTGGGATTTAGAAACGTTTGAATTGATTGGA -T--G--S--A--D--R--T--V--K--F--W--D--L--E--T--F--E--L--I--G- TCT ACT AGA CCA GAG GCC ACT GGA GTT CGC TCA ATT GCT TTT CAT CCA GAT GGA CAA TCC TCTACTAGACCAGAGGCCACTGGAGTTCGCTCAATTGCTTTTCATCCAGATGGACAATCC -S--T--R--P--E--A--T--G--V--R--S--I--A--F--H--P--D--G--Q--S- CTT TTC TGT GGA TTG GAT GAT GGC TTG AAG GTT TAT TCA TGG GAA CCA GTG ATA TGC CGG CTTTTCTGTGGATTGGATGATGGCTTGAAGGTTTATTCATGGGAACCAGTGATATGCCGG -L--F--C--G--L--D--D--G--L--K--V--Y--S--W--E--P--V--I--C--R- GAT AGT GTT GAT ATG GGA TGG TCA ACC CTT GGT GAC ATG TGC ATC AAC GAA AAC AAG TTC GATAGTGTTGATATGGGATGGTCAACCCTTGGTGACATGTGCATCAACGAAAACAAGTTC -D--S--V--D--M--G--W--S--T--L--G--D--M--C--I--N--E--N--K--F- GTT GGC TGT TCA TAT TAC CGA AAC TCT GTT GGG ATT TGG GTC TCA GAT ATA TCG A AA CTT GTTGGCTGTTCATATTACCGAAACTCTGTTGGGATTTGGGTCTCAGATATATCGAAACTT -V--G--C--S--Y--Y--R--N--S--V--G--I--W--V--S--D--I--S--K--L- GAG CCG TAT GGA GCT GGA TCT GAG GAT GAG AAT GAA TGC ATG GTG AAA AGA TTC AGT GCC GAGCCGTATGGAGCTGGATCTGAGGATGAGAATGAATGCATGGTGAAAAGATTCAGTGCC -E--P--Y--G--A--G--S--E--D--E--N--E--C--M--V--K--R--F--S--A- TTG GAT GAG CAG GCT TCT GAG AGA ATG AAG AGT GGC TCA AGG GGG AGT TCA TCC CCG GAC TTGGATGAGCAGGCTTCTGAGAGAATGAAGAGTGGCTCAAGGGGGAGTTCATCCCCGGAC -L--D--E--Q--A--S--E--R--M--K--S--G--S--R--G--S--S--S--P--D- TAT GAG ACA AAA GAG ATA AAG AAC ATA TAC GTT GAC T C C ATA GGT GGA AAT TTA AAA GCG TATGAGACAAAAGAGATAAAGAACATATACGTTGACTCCATAGGTGGAAATTTAAAAGCG -Y--E--T--K--E--I--K--N--I--Y--V--D--S--I--G--G--N--L--K--A- GCT ATT AGG AAG AGC GAG AAG CAG AAT GCA AAT GAC AAG TCT TCC AGG ACC AGG ATG CAT GCTATTAGGAAGAGCGAGAAGCAGAATGCAAATGACAAGTCTTCCAGGACCAGGATGCAT -A--I--R--K--S--E--K--Q--N--A--N--D--K--S--S--R--T--R--M--H- AGT GTT GTG GAT AGT GAT AGT GGG GAA GAA TCT TCT CAC TCA AGA AGT GAA TCT GTC GCT AGTGTTGTGGATAGTGATAGTGGGGAAGAATCTTCTCACTCAAGAAGTGAATCTGTCGCT -S--V--V--D--S--D--S--G--E--E--S--S--H--S--R--S--E--S--V--A- TCC TCA AAA ACT AGT CCG GGA ATG ATG CTA AGA CCA GCT CAT GTT AGA AAG ACT CTA GCA TCCTCAAAAACTAGTCCGGGAATGATGCTAAGACCAGCTCATGTTAGAAAGACTCTAGCA -S--S--K--T--S--P--G--M--M--L--R--P--A--H--V--R--K--T--L--A- AAG TTT GAA GAA TCA GCG TCT GTT CAT TCT GGA ACT CGG AAG AAA AGC TCA CAG GAT GTT AAGTTTGAAGAATCAGCGTCTGTTCATTCTGGAACTCGGAAGAAAAGCTCACAGGATGTT -K--F--E--E--S--A--S--V--H--S--G--T--R--K--K--S--S--Q--D--V- GAA GAG GAG ACA CAA ACT CGA AAT GCT GAA GAC TCA ACC ATC AAG GGG ATT ATG TAC AAG GAAGAGGAGACACAAACTCGAAATGCTGAAGACTCAACCATCAAGGGGATTATGTACAAG -E--E--E--T--Q--T--R--N--A--E--D--S--T--I--K--G--I--M--Y--K- TTT GAA AAA GCT TTA TCA TCC GAA CCA CCA ACT GAT GAA GCA ACT C GT ATG CTG CAT AAG TTTGAAAAAGCTTTATCATCCGAACCACCAACTGATGAAGCAACTCGTATGCTGCATAAG -F--E--K--A--L--S--S--E--P--P--T--D--E--A--T--R--M--L--H--K- CCA CCT CGT GTA CAG AGG TCA TCC TAT AAC AAC AAC TAC AAT GAG TCA AGA CGA GCA ATG CCACCTCGTGTACAGAGGTCATCCTATAACAACAACTACAATGAGTCAAGACGAGCAATG -P--P--R--V--Q--R--S--S--Y--N--N--N--Y--N--E--S--R--R--A--M- TCT GTT GAT TCT GGA ACT TTG AAC GAC AGC AAA GGT GGA ATG GAG TAC TCA GGA GAC TTG TCTGTTGATTCTGGAACTTTGAACGACAGCAAAGGTGGAATGGAGTACTCAGGAGACTTG -S--V--D--S--G--T--L--N--D--S--K--G--G--M--E--Y--S--G--D--L- CCG GCA AGT AGA ATC TTA TGC AAC GAG GAT ATA AAT AGC CAG CAC ATT GTC ACC AAA ACT CCGGCAAGTAGAATCTTATGCAACGAGGATATAAATAGCCAGCACATTGTCACCAAAACT -P--A--S--R--I--L--C--N--E--D--I--N--S--Q--H--I--V--T--K--T- GAA AGA GTT GTT TCA CCA GAA AAG CCT GGT GAT GAA CAG ACA A T A AAA GTT GTC TCC GGG GAAAGAGTTGTTTCACCAGAAAAGCCTGGTGATGAACAGACAATAAAAGTTGTCTCCGGG -E--R--V--V--S--P--E--K--P--G--D--E--Q--T--I--K--V--V--S--G- AGG ACA CGC TCG TTG GTG GAG AGG TTT GAG AGA GGA GAA AAA ATT ACT CAT ACC GAA GAA AGGACACGCTCGTTGGTGGAGAGGTTTGAGAGAGGAGAAAAAATTACTCATACCGAAGAA -R--T--R--S--L--V--E--R--F--E--R--G--E--K--I--T--H--T--E--E- GCA GAT AAT ACT AAT GCA GTG GAG CAA GAT ACG CAT AAG ACG TCA AGA CAG ACA GGT GAA GCAGATAATACTAATGCAGTGGAGCAAGATACGCATAAGACGTCAAGACAGACAGGTGAA -A--D--N--T--N--A--V--E--Q--D--T--H--K--T--S--R--Q--T--G--E- ACT CCT GTA GTA GTA TCT ACA CGG CGA GCT AGA AGT ACT CCA GCT CGA GTG ATG CCT ATA ACTCCTGTAGTAGTATCTACACGGCGAGCTAGAAGTACTCCAGCTCGAGTGATGCCTATA -T--P--V--V--V--S--T--R--R--A--R--S--T--P--A--R--V--M--P--I- GTA CTC AAC CGA GAT AGT AAC ATA AAA TCT GAT GAG TCT CCT TCA ACA CAA CCA GCT AGG GTACTCAACCGAGATAGTAACATAAAATCTGATGAGTCTCCTTCAACACAACCAGCTAGG -V--L--N--R--D--S--N--I--K--S--D--E--S--P--S--T--Q--P--A--R- ACT TCT TCA GTT CCA GTG ATA CTC AAC CAG TCT ACC AAT GAT GAG CCT TCT GTA ACA TTA ACTTCTTCAGTTCCAGTGATACTCAACCAGTCTACCAATGATGAGCCTTCTGTAACATTA -T--S--S--V--P--V--I--L--N--Q--S--T--N--D--E--P--S--V--T--L- ACA CAA TCT AGA ACC TCT CCA GCC CGG ACA TTG CCT TTG ACA CTC AAT CAG GCA ACA CAT ACACAATCTAGAACCTCTCCAGCCCGGACATTGCCTTTGACACTCAATCAGGCAACACAT -T--Q--S--R--T--S--P--A--R--T--L--P--L--T--L--N--Q--A--T--H- ATT GTT ATG TCA AGA AGA CCA CGT AGG ACT TCC TCA GCT CGA GTA AGG CCT ATG TCA CTT ATTGTTATGTCAAGAAGACCACGTAGGACTTCCTCAGCTCGAGTAAGGCCTATGTCACTT -I--V--M--S--R--R--P--R--R--T--S--S--A--R--V--R--P--M--S--L- AGT CAG GCA GTG AGA ATG ACA TCC CAT GAG TGT TCT GTA ACA TCA ACG CGT CCA GAT AGG AGTCAGGCAGTGAGAATGACATCCCATGAGTGTTCTGTAACATCAACGCGTCCAGATAGG -S--Q--A--V--R--M--T--S--H--E--C--S--V--T--S--T--R--P--D--R- ACT TCT CCT CCC CGT GTA ATG CCC ACA AAA CTC AAT CAA ACT GAT GAT ATG GCA TCG GAT ACTTCTCCTCCCCGTGTAATGCCCACAAAACTCAATCAAACTGATGATATGGCATCGGAT -T--S--P--P--R--V--M--P--T--K--L--N--Q--T--D--D--M--A--S--D- ACA TCT CAT ATC ACA TCC AGG CGC CGA ACT AGT CCA ACT CAG ATG CTA GCT ACA CCC ACT ACATCTCATATCACATCCAGGCGCCGAACTAGTCCAACTCAGATGCTAGCTACACCCACT -T--S--H--I--T--S--R--R--R--T--S--P--T--Q--M--L--A--T--P--T- GAG ATT GAT AAT CTG GTT GAT ATG GCT CAG GAT GAG ACA CAT GTA TCG TCA CAA ACT GAT GAGATTGATAATCTGGTTGATATGGCTCAGGATGAGACACATGTATCGTCACAAACTGAT -E--I--D--N--L--V--D--M--A--Q--D--E--T--H--V--S--S--Q--T--D- AGT GAC ATC ACT GAG AAT CTA ATG CAA ACT CAT GAG GAG TTC TTA AGC ACT CTT CAA TCT AGTGACATCACTGAGAATCTAATGCAAACTCATGAGGAGTTCTTAAGCACTCTTCAATCT -S--D--I--T--E--N--L--M--Q--T--H--E--E--F--L--S--T--L--Q--S- AGA TTG ACA AAG TTA CAA A TT GTT AGG CAT TTT TGG GAA CGT AGT GAT GTT AAA GGG GCA AGATTGACAAAGTTACAAATTGTTAGGCATTTTTGGGAACGTAGTGATGTTAAAGGGGCA -R--L--T--K--L--Q--I--V--R--H--F--W--E--R--S--D--V--K--G--A- ATA GGG GCT TTG AGA AAG TTG ACA GAT CAG TCT GTT CAA GCA GAT GTG ATC AGT ATT CTA ATAGGGGCTTTGAGAAAGTTGACAGATCAGTCTGTTCAAGCAGATGTGATCAGTATTCTA -I--G--A--L--R--K--L--T--D--Q--S--V--Q--A--D--V--I--S--I--L- ACA GAC AAG ATA GAG ATT CTT ACA TTG GAT ATG TTC TCT CAA TTG GTC CCT GTC CTT ACA ACAGACAAGATAGAGATTCTTACATTGGATATGTTCTCTCAATTGGTCCCTGTCCTTACA -T--D--K--I--E--I--L--T--L--D--M--F--S--Q--L--V--P--V--L--T- AGC TTA TTG GGT AGC AGG ACA GAA AG G CCT GTT AAT GTG TCC TTG GAC ATG CTC TTG AAG AGCTTATTGGGTAGCAGGACAGAAAGGCCTGTTAATGTGTCCTTGGACATGCTCTTGAAG -S--L--L--G--S--R--T--E--R--P--V--N--V--S--L--D--M--L--L--K- CTT GTA GCA GTG TTC GGT ACA GTT ATA CGG TCA ACT GTC TCA GCT CCA AGG ATA GTC GGC CTTGTAGCAGTGTTCGGTACAGTTATACGGTCAACTGTCTCAGCTCCAAGGATAGTCGGC -L--V--A--V--F--G--T--V--I--R--S--T--V--S--A--P--R--I--V--G- GTT GAT CTT CAT GCG GAT GAA AG G ATA CAA ATC TGC CAA GTT TGT TCT GCG GGA CTG CAC GTTGATCTTCATGCGGATGAAAGGATACAAATCTGCCAAGTTTGTTCTGCGGGACTGCAC -V--D--L--H--A--D--E--R--I--Q--I--C--Q--V--C--S--A--G--L--H- AAG ATT CAA AGG ATT CTT CCA ATT CTC GCA AG A AGA GGC GGT CTA ATA ACA AGA AAG GCT AAGATTCAAAGGATTCTTCCAATTCTCGCAAGAAGAGGCGGTCTAATAACAAGAAAGGCT -K--I--Q--R--I--L--P--I--L--A--R--R--G--G--L--I--T--R--K--A- CAA GAA CTA AAC CTT GTT CTT CAA CAA ACA TAG CAAGAACTAAACCTTGTTCTTCAACAAACATAG -Q--E--L--N--L--V--L--Q--Q--T--*- .
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use
![[RSS logo]](/i/rss_icon_16.png "Ensembl blog"){kind=icon}
![[twitter logo]](/i/twitter.png "Follow us on Twitter!")
