Brassica oleracea (BOL)
Description

RING/U-box superfamily protein [Source:TAIR;Acc:AT3G55530](projected from arabidopsis_thaliana,AT3G55530)

Location
About this transcript

This transcript has 8 exons and is annotated with 21 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene Bo8g090000 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-Bo8g090000.1834277aa
 
Protein coding
A0A0D3DTE7 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
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Other
  • UTR
Markup
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     1 ATGAGTTTCGTTTTCAGGGGAAGTGGGGGAGATTTAGAGAGCGGATTCTCAGGTTTCATA     60
     1 ATGAGTTTCGTTTTCAGGGGAAGTGGGGGAGATTTAGAGAGCGGATTCTCAGGTTTCATA     60
     1 -M--S--F--V--F--R--G--S--G--G--D--L--E--S--G--F--S--G--F--I-     20

                                                                          
    61 CCCGAGAGACGCGCTATGCGTGTCCATGGAGCTCGACCTGTTAACTCTAATTCTCTCGCT    120
    61 CCCGAGAGACGCGCTATGCGTGTCCATGGAGCTCGACCTGTTAACTCTAATTCTCTCGCT    120
    21 -P--E--R--R--A--M--R--V--H--G--A--R--P--V--N--S--N--S--L--A-     40

                                                                          
   121 TTTCTTGTCACCGTTCTTTTGCTGTTTATGATTCTCAATTCGCATCAGATGCCTCCTAAT    180
   121 TTTCTTGTCACCGTTCTTTTGCTGTTTATGATTCTCAATTCGCATCAGATGCCTCCTAAT    180
    41 -F--L--V--T--V--L--L--L--F--M--I--L--N--S--H--Q--M--P--P--N-     60

                                                                          
   181 TTCCTGCTCTGGCTTGTGCTTGGGGTGTTTTTGATGGCGACGACTCTTAGGATGTATGCG    240
   181 TTCCTGCTCTGGCTTGTGCTTGGGGTGTTTTTGATGGCGACGACTCTTAGGATGTATGCG    240
    61 -F--L--L--W--L--V--L--G--V--F--L--M--A--T--T--L--R--M--Y--A-     80

                                                                          
   241 ACTTGCCAGCAACTTCAAGCTCAAGCTCAGGCTCATGTTGCAGCAGCTAGTGGGCTCTTT    300
   241 ACTTGCCAGCAACTTCAAGCTCAAGCTCAGGCTCATGTTGCAGCAGCTAGTGGGCTCTTT    300
    81 -T--C--Q--Q--L--Q--A--Q--A--Q--A--H--V--A--A--A--S--G--L--F-    100

                                                                          
   301 AGTCACACTGAGCTGAGGCTGCATGTGCCTCCCTCCATTGCTCTTGCGACGAGAGGGCGT    360
   301 AGTCACACTGAGCTGAGGCTGCATGTGCCTCCCTCCATTGCTCTTGCGACGAGAGGGCGT    360
   101 -S--H--T--E--L--R--L--H--V--P--P--S--I--A--L--A--T--R--G--R-    120

                                                                          
   361 CTTCAAGGACTTAGGCTCCAGCTGGCTCTTCTTGATCGGGAGTTTGATGACTTAGATTAT    420
   361 CTTCAAGGACTTAGGCTCCAGCTGGCTCTTCTTGATCGGGAGTTTGATGACTTAGATTAT    420
   121 -L--Q--G--L--R--L--Q--L--A--L--L--D--R--E--F--D--D--L--D--Y-    140

                                                                          
   421 GAAACTCTAAGAGCACTAGATTCTGATAATGTCCCTACAAATTCTATGAGCGAGGAAGAG    480
   421 GAAACTCTAAGAGCACTAGATTCTGATAATGTCCCTACAAATTCTATGAGCGAGGAAGAG    480
   141 -E--T--L--R--A--L--D--S--D--N--V--P--T--N--S--M--S--E--E--E-    160

                                                                          
   481 ATAAATGCACTTCCAGTACACAAGTACAAAGTGTTGGATCCTGAAAATGGTTCCTCTTTG    540
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   161 -I--N--A--L--P--V--H--K--Y--K--V--L--D--P--E--N--G--S--S--L-    180

                                                                          
   541 ACAAAGCAGGCATCAACATCAACCTCATCTTCAGCGGAGAAGAATCAAGTTTCTGTAAGT    600
   541 ACAAAGCAGGCATCAACATCAACCTCATCTTCAGCGGAGAAGAATCAAGTTTCTGTAAGT    600
   181 -T--K--Q--A--S--T--S--T--S--S--S--A--E--K--N--Q--V--S--V--S-    200

                                                                          
   601 GTGAGTAAAAAAGGAACAGAAGACGAGCTCACTTGTAGTGTTTGCCTCGAACAAGTTACC    660
   601 GTGAGTAAAAAAGGAACAGAAGACGAGCTCACTTGTAGTGTTTGCCTCGAACAAGTTACC    660
   201 -V--S--K--K--G--T--E--D--E--L--T--C--S--V--C--L--E--Q--V--T-    220

                                                                          
   661 GTAGGGGAAGTTGTTCGCACCCTACCTTGCTTGCATCAGTTTCATGCAGACTGTATCGAT    720
   661 GTAGGGGAAGTTGTTCGCACCCTACCTTGCTTGCATCAGTTTCATGCAGACTGTATCGAT    720
   221 -V--G--E--V--V--R--T--L--P--C--L--H--Q--F--H--A--D--C--I--D-    240

                                                                          
   721 CCGTGGCTTAGACAGCAAGGAACATGTCCTGTTTGTAAGTTTAAGGCTCATTCAGGATGG    780
   721 CCGTGGCTTAGACAGCAAGGAACATGTCCTGTTTGTAAGTTTAAGGCTCATTCAGGATGG    780
   241 -P--W--L--R--Q--Q--G--T--C--P--V--C--K--F--K--A--H--S--G--W-    260

                                                                          
   781 CAAGAACAAGACGACGGGACAGATGATGATGATGAAGCCTCCGTCATGGTTTGA          834
   781 CAAGAACAAGACGACGGGACAGATGATGATGATGAAGCCTCCGTCATGGTTTGA          834
   261 -Q--E--Q--D--D--G--T--D--D--D--D--E--A--S--V--M--V--*-          277