Transcript: Bo8g090000.1
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Description
RING/U-box superfamily protein [Source:TAIR;Acc:AT3G55530](projected from arabidopsis_thaliana,AT3G55530)
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- Bo8g090000.1 834 277aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3DTE7 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG AGT TTC GTT TTC AGG GGA AGT GGG GGA GAT TTA GAG AGC GGA TTC TCA GGT TTC ATA 60
1 ATGAGTTTCGTTTTCAGGGGAAGTGGGGGAGATTTAGAGAGCGGATTCTCAGGTTTCATA 60
1 -M--S--F--V--F--R--G--S--G--G--D--L--E--S--G--F--S--G--F--I- 20
61 CCC GAG AGA CGC GCT ATG C GT GTC CAT GGA GCT CGA CCT GTT AAC TCT AAT TCT CTC GCT 120
61 CCCGAGAGACGCGCTATGCGTGTCCATGGAGCTCGACCTGTTAACTCTAATTCTCTCGCT 120
21 -P--E--R--R--A--M--R--V--H--G--A--R--P--V--N--S--N--S--L--A- 40
121 TTT CTT GTC ACC G T T CTT TTG CTG TTT ATG ATT CTC AAT TCG CAT CAG ATG CCT CCT AAT 180
121 TTTCTTGTCACCGTTCTTTTGCTGTTTATGATTCTCAATTCGCATCAGATGCCTCCTAAT 180
41 -F--L--V--T--V--L--L--L--F--M--I--L--N--S--H--Q--M--P--P--N- 60
181 TTC CTG CTC TGG CTT GTG CTT GGG GTG TTT TTG ATG GCG ACG ACT CTT AGG ATG TAT GCG 240
181 TTCCTGCTCTGGCTTGTGCTTGGGGTGTTTTTGATGGCGACGACTCTTAGGATGTATGCG 240
61 -F--L--L--W--L--V--L--G--V--F--L--M--A--T--T--L--R--M--Y--A- 80
241 ACT TGC CAG CAA CTT CAA GCT CAA GCT CAG GCT CAT GTT GCA GCA GCT AGT GGG CTC TTT 300
241 ACTTGCCAGCAACTTCAAGCTCAAGCTCAGGCTCATGTTGCAGCAGCTAGTGGGCTCTTT 300
81 -T--C--Q--Q--L--Q--A--Q--A--Q--A--H--V--A--A--A--S--G--L--F- 100
301 AGT CAC ACT GAG CTG AGG CTG CAT GTG CCT CCC TCC ATT GCT CTT GCG ACG AGA GGG CGT 360
301 AGTCACACTGAGCTGAGGCTGCATGTGCCTCCCTCCATTGCTCTTGCGACGAGAGGGCGT 360
101 -S--H--T--E--L--R--L--H--V--P--P--S--I--A--L--A--T--R--G--R- 120
361 CTT CAA GGA CTT AGG CTC CAG CTG GCT CTT CTT GAT CGG GAG TTT GAT GAC TTA G A T TAT 420
361 CTTCAAGGACTTAGGCTCCAGCTGGCTCTTCTTGATCGGGAGTTTGATGACTTAGATTAT 420
121 -L--Q--G--L--R--L--Q--L--A--L--L--D--R--E--F--D--D--L--D--Y- 140
421 GAA ACT CTA AGA GCA CTA GAT TCT GAT AAT GTC CCT ACA AAT TCT ATG AGC GAG GAA GAG 480
421 GAAACTCTAAGAGCACTAGATTCTGATAATGTCCCTACAAATTCTATGAGCGAGGAAGAG 480
141 -E--T--L--R--A--L--D--S--D--N--V--P--T--N--S--M--S--E--E--E- 160
481 ATA AAT GCA CTT CCA GTA CAC AAG TAC AAA GTG TTG GAT CCT GAA AA T GGT TCC TCT TTG 540
481 ATAAATGCACTTCCAGTACACAAGTACAAAGTGTTGGATCCTGAAAATGGTTCCTCTTTG 540
161 -I--N--A--L--P--V--H--K--Y--K--V--L--D--P--E--N--G--S--S--L- 180
541 ACA AAG CAG GCA TCA ACA TCA ACC TCA TCT TCA GCG GAG AAG AAT CAA GTT TCT GTA AGT 600
541 ACAAAGCAGGCATCAACATCAACCTCATCTTCAGCGGAGAAGAATCAAGTTTCTGTAAGT 600
181 -T--K--Q--A--S--T--S--T--S--S--S--A--E--K--N--Q--V--S--V--S- 200
601 GTG AGT AAA AAA GGA ACA GAA GAC GAG CTC ACT TGT AGT GTT TGC CTC GAA CAA GTT ACC 660
601 GTGAGTAAAAAAGGAACAGAAGACGAGCTCACTTGTAGTGTTTGCCTCGAACAAGTTACC 660
201 -V--S--K--K--G--T--E--D--E--L--T--C--S--V--C--L--E--Q--V--T- 220
661 GTA GGG GAA GTT GTT CGC ACC CTA CCT TGC TTG CAT CAG TTT CAT GCA GAC TGT ATC GAT 720
661 GTAGGGGAAGTTGTTCGCACCCTACCTTGCTTGCATCAGTTTCATGCAGACTGTATCGAT 720
221 -V--G--E--V--V--R--T--L--P--C--L--H--Q--F--H--A--D--C--I--D- 240
721 CCG TGG CTT AGA CAG CAA GGA ACA TGT CCT GTT TGT AAG TTT AAG GCT CAT TCA GGA TGG 780
721 CCGTGGCTTAGACAGCAAGGAACATGTCCTGTTTGTAAGTTTAAGGCTCATTCAGGATGG 780
241 -P--W--L--R--Q--Q--G--T--C--P--V--C--K--F--K--A--H--S--G--W- 260
781 CAA GAA CAA GAC GAC GGG ACA GAT GAT GAT GAT GAA GCC TCC GTC ATG GTT TGA 834
781 CAAGAACAAGACGACGGGACAGATGATGATGATGAAGCCTCCGTCATGGTTTGA 834
261 -Q--E--Q--D--D--G--T--D--D--D--D--E--A--S--V--M--V--*- 277
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