Brassica oleracea (BOL)
Description

RING-type E3 ubiquitin transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A0D3DS57]

Location
About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 15 domains and features and maps to 1 oligo probe.

Gene

This transcript is a product of gene Bo8g080650 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-Bo8g080650.11308435aa
 
Protein coding
A0A0D3DS57 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Other
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Markup
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     1 ATGGATCAAGAGATAGAGATTCCTACTTTCTTTCTATGTCCGATCTCTCTAGATATCATG     60
     1 ATGGATCAAGAGATAGAGATTCCTACTTTCTTTCTATGTCCGATCTCTCTAGATATCATG     60
     1 -M--D--Q--E--I--E--I--P--T--F--F--L--C--P--I--S--L--D--I--M-     20

                                                                          
    61 AAGGACCCGGTGATAGTTTCCACCGGAATAACCTACGACAGAGACAGCATCGAGAAGTGG    120
    61 AAGGACCCGGTGATAGTTTCCACCGGAATAACCTACGACAGAGACAGCATCGAGAAGTGG    120
    21 -K--D--P--V--I--V--S--T--G--I--T--Y--D--R--D--S--I--E--K--W-     40

                                                                          
   121 CTCTTCACCGGTAAGAAAAACACATGTCCGGTCACAAAACAAGTTATAACCGAAACTGAT    180
   121 CTCTTCACCGGTAAGAAAAACACATGTCCGGTCACAAAACAAGTTATAACCGAAACTGAT    180
    41 -L--F--T--G--K--K--N--T--C--P--V--T--K--Q--V--I--T--E--T--D-     60

                                                                          
   181 CTCACACCAAACCATACTCTACGCCGTTTAATCCAATCTTGGTGTACTCTCAACGCATCC    240
   181 CTCACACCAAACCATACTCTACGCCGTTTAATCCAATCTTGGTGTACTCTCAACGCATCC    240
    61 -L--T--P--N--H--T--L--R--R--L--I--Q--S--W--C--T--L--N--A--S-     80

                                                                          
   241 CACGGCATCGAGAGGATCCCAACCCCAAAACCTCCTATCTCTAAATCCGAGATCGAAAAG    300
   241 CACGGCATCGAGAGGATCCCAACCCCAAAACCTCCTATCTCTAAATCCGAGATCGAAAAG    300
    81 -H--G--I--E--R--I--P--T--P--K--P--P--I--S--K--S--E--I--E--K-    100

                                                                          
   301 CTCATCAAAGATTCATCATCTTCACATCAAAACCAAGTCAAATGCCTCAAAAGACTTCGT    360
   301 CTCATCAAAGATTCATCATCTTCACATCAAAACCAAGTCAAATGCCTCAAAAGACTTCGT    360
   101 -L--I--K--D--S--S--S--S--H--Q--N--Q--V--K--C--L--K--R--L--R-    120

                                                                          
   361 CAAATAGTGTCCGAGAATACAACGAACAAGCGGTGCTTAGAAGCTGCAAATGTTCCAGAG    420
   361 CAAATAGTGTCCGAGAATACAACGAACAAGCGGTGCTTAGAAGCTGCAAATGTTCCAGAG    420
   121 -Q--I--V--S--E--N--T--T--N--K--R--C--L--E--A--A--N--V--P--E-    140

                                                                          
   421 TTCTTGGCCAAGATCGTCAGCAACTCGGTAGATAGTTACAACTCTCCTTCTCCTTCACTT    480
   421 TTCTTGGCCAAGATCGTCAGCAACTCGGTAGATAGTTACAACTCTCCTTCTCCTTCACTT    480
   141 -F--L--A--K--I--V--S--N--S--V--D--S--Y--N--S--P--S--P--S--L-    160

                                                                          
   481 TCTTCGTCGAATCTCAACGATCTTTGTCAGTCAAACATGCTAGAGAATCGGTTTGATTCT    540
   481 TCTTCGTCGAATCTCAACGATCTTTGTCAGTCAAACATGCTAGAGAATCGGTTTGATTCT    540
   161 -S--S--S--N--L--N--D--L--C--Q--S--N--M--L--E--N--R--F--D--S-    180

                                                                          
   541 TCTAGGAGCTTAATGGACGAAGCTTTAAGCTTGCTCTATCATCTCGACACATCGGAGACG    600
   541 TCTAGGAGCTTAATGGACGAAGCTTTAAGCTTGCTCTATCATCTCGACACATCGGAGACG    600
   181 -S--R--S--L--M--D--E--A--L--S--L--L--Y--H--L--D--T--S--E--T-    200

                                                                          
   601 GCCCGGAAGAGTCTTTTAAACAACAAGAAGGGAACAAATCTTGTGAAAACGTTGACTAAG    660
   601 GCCCGGAAGAGTCTTTTAAACAACAAGAAGGGAACAAATCTTGTGAAAACGTTGACTAAG    660
   201 -A--R--K--S--L--L--N--N--K--K--G--T--N--L--V--K--T--L--T--K-    220

                                                                          
   661 ATTATGCAACGGGGGATCTACGAGTCAAGAGCCTATGCGACTTTTCTTCTCAAGAAGATT    720
   661 ATTATGCAACGGGGGATCTACGAGTCAAGAGCCTATGCGACTTTTCTTCTCAAGAAGATT    720
   221 -I--M--Q--R--G--I--Y--E--S--R--A--Y--A--T--F--L--L--K--K--I-    240

                                                                          
   721 CTTGAAGTTGCGGATCCAATGCAGATCATATTGTTGGAACGTGAGCTTTTCAACGAGGTG    780
   721 CTTGAAGTTGCGGATCCAATGCAGATCATATTGTTGGAACGTGAGCTTTTCAACGAGGTG    780
   241 -L--E--V--A--D--P--M--Q--I--I--L--L--E--R--E--L--F--N--E--V-    260

                                                                          
   781 GTTCAGATCTTGCATGACCAGATCTCTCACAAGGCAACGAAATCAGCAATGCAGATCTTG    840
   781 GTTCAGATCTTGCATGACCAGATCTCTCACAAGGCAACGAAATCAGCAATGCAGATCTTG    840
   261 -V--Q--I--L--H--D--Q--I--S--H--K--A--T--K--S--A--M--Q--I--L-    280

                                                                          
   841 GTGATTATATGTCCATGGGGAAGGAATAGACACAAGGCTGTGGAAGCTGGAGCGATCTCG    900
   841 GTGATTATATGTCCATGGGGAAGGAATAGACACAAGGCTGTGGAAGCTGGAGCGATCTCG    900
   281 -V--I--I--C--P--W--G--R--N--R--H--K--A--V--E--A--G--A--I--S-    300

                                                                          
   901 ATGATTATTGAGCTCTTGATGGATGAGACTTTCTCATCTGAGAGAAGGACTTTGGAGATG    960
   901 ATGATTATTGAGCTCTTGATGGATGAGACTTTCTCATCTGAGAGAAGGACTTTGGAGATG    960
   301 -M--I--I--E--L--L--M--D--E--T--F--S--S--E--R--R--T--L--E--M-    320

                                                                          
   961 GCTATGGTGGTTCTTGATATGTTATGTCAGTGTGCAGAAGGAAGAGCTGAGTTCTTGAAT   1020
   961 GCTATGGTGGTTCTTGATATGTTATGTCAGTGTGCAGAAGGAAGAGCTGAGTTCTTGAAT   1020
   321 -A--M--V--V--L--D--M--L--C--Q--C--A--E--G--R--A--E--F--L--N-    340

                                                                          
  1021 CATTGTGCGGCTATTGCGGTTGTGTCTAAGAAGATACTTAGGGTCTCTCAGATAACTAGT   1080
  1021 CATTGTGCGGCTATTGCGGTTGTGTCTAAGAAGATACTTAGGGTCTCTCAGATAACTAGT   1080
   341 -H--C--A--A--I--A--V--V--S--K--K--I--L--R--V--S--Q--I--T--S-    360

                                                                          
  1081 GAAAGGGCGGTTAGGGTTTTGCTTTCTATTGGGAGGTTTTGTGCGACGCCTTCTCTATTG   1140
  1081 GAAAGGGCGGTTAGGGTTTTGCTTTCTATTGGGAGGTTTTGTGCGACGCCTTCTCTATTG   1140
   361 -E--R--A--V--R--V--L--L--S--I--G--R--F--C--A--T--P--S--L--L-    380

                                                                          
  1141 CAGGATATGTTGCAACTGGGAGTTGTGGCGAAGATGTGTCTTGTACTTCAAGTGAGTTGC   1200
  1141 CAGGATATGTTGCAACTGGGAGTTGTGGCGAAGATGTGTCTTGTACTTCAAGTGAGTTGC   1200
   381 -Q--D--M--L--Q--L--G--V--V--A--K--M--C--L--V--L--Q--V--S--C-    400

                                                                          
  1201 GGGAACAAGACTAAAGAAAAGGCTAAAGAATTGCTTAAGCTTCACGCTAGGGTTTGGAGG   1260
  1201 GGGAACAAGACTAAAGAAAAGGCTAAAGAATTGCTTAAGCTTCACGCTAGGGTTTGGAGG   1260
   401 -G--N--K--T--K--E--K--A--K--E--L--L--K--L--H--A--R--V--W--R-    420

                                                                          
  1261 GAGTCACCTTGTGTCCCAAGAAACTTGTATGCTTCGTATCCAGCTTGA               1308
  1261 GAGTCACCTTGTGTCCCAAGAAACTTGTATGCTTCGTATCCAGCTTGA               1308
   421 -E--S--P--C--V--P--R--N--L--Y--A--S--Y--P--A--*-                435