Transcript: Bo8g080650.1
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Description
RING-type E3 ubiquitin transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A0D3DS57 ]
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- Bo8g080650.1 1308 435aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3DS57 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GAT CAA GAG ATA GAG ATT CCT ACT TTC TTT CTA TGT CCG ATC TCT CTA GAT ATC ATG 60
1 ATGGATCAAGAGATAGAGATTCCTACTTTCTTTCTATGTCCGATCTCTCTAGATATCATG 60
1 -M--D--Q--E--I--E--I--P--T--F--F--L--C--P--I--S--L--D--I--M- 20
61 AAG GAC CCG GTG ATA GTT TCC ACC GGA ATA ACC TAC GAC AGA GAC AGC ATC GAG AAG TGG 120
61 AAGGACCCGGTGATAGTTTCCACCGGAATAACCTACGACAGAGACAGCATCGAGAAGTGG 120
21 -K--D--P--V--I--V--S--T--G--I--T--Y--D--R--D--S--I--E--K--W- 40
121 CTC TTC ACC GGT AAG AAA AAC ACA TGT CCG GTC ACA AAA CAA GTT ATA ACC GAA ACT GAT 180
121 CTCTTCACCGGTAAGAAAAACACATGTCCGGTCACAAAACAAGTTATAACCGAAACTGAT 180
41 -L--F--T--G--K--K--N--T--C--P--V--T--K--Q--V--I--T--E--T--D- 60
181 CTC ACA CCA AAC CAT ACT CTA CGC CGT TTA ATC CAA TCT TGG TGT ACT CTC AAC GCA TCC 240
181 CTCACACCAAACCATACTCTACGCCGTTTAATCCAATCTTGGTGTACTCTCAACGCATCC 240
61 -L--T--P--N--H--T--L--R--R--L--I--Q--S--W--C--T--L--N--A--S- 80
241 CAC GGC ATC GAG AGG ATC CCA ACC CCA AAA CCT CCT ATC TCT AAA TCC GAG ATC GAA AAG 300
241 CACGGCATCGAGAGGATCCCAACCCCAAAACCTCCTATCTCTAAATCCGAGATCGAAAAG 300
81 -H--G--I--E--R--I--P--T--P--K--P--P--I--S--K--S--E--I--E--K- 100
301 CTC ATC AAA GAT TCA TCA TCT TCA CAT CAA AAC CAA GTC AAA TGC CTC AAA AGA CTT CGT 360
301 CTCATCAAAGATTCATCATCTTCACATCAAAACCAAGTCAAATGCCTCAAAAGACTTCGT 360
101 -L--I--K--D--S--S--S--S--H--Q--N--Q--V--K--C--L--K--R--L--R- 120
361 CAA ATA GTG TCC GAG AAT ACA ACG AAC AAG CGG TGC TTA GAA GCT GCA AAT GTT CCA GAG 420
361 CAAATAGTGTCCGAGAATACAACGAACAAGCGGTGCTTAGAAGCTGCAAATGTTCCAGAG 420
121 -Q--I--V--S--E--N--T--T--N--K--R--C--L--E--A--A--N--V--P--E- 140
421 TTC TTG GCC AAG ATC GTC AGC AAC TCG GTA GAT AGT TAC AAC TCT CCT TCT CCT TCA CTT 480
421 TTCTTGGCCAAGATCGTCAGCAACTCGGTAGATAGTTACAACTCTCCTTCTCCTTCACTT 480
141 -F--L--A--K--I--V--S--N--S--V--D--S--Y--N--S--P--S--P--S--L- 160
481 TCT TCG TCG AAT CTC AAC GAT CTT TGT CAG TCA AAC ATG CTA GAG AAT CGG TTT GAT TCT 540
481 TCTTCGTCGAATCTCAACGATCTTTGTCAGTCAAACATGCTAGAGAATCGGTTTGATTCT 540
161 -S--S--S--N--L--N--D--L--C--Q--S--N--M--L--E--N--R--F--D--S- 180
541 TCT AGG AGC TTA ATG GAC GAA GCT TTA AGC TTG CTC TAT CAT CTC GAC ACA TCG GAG ACG 600
541 TCTAGGAGCTTAATGGACGAAGCTTTAAGCTTGCTCTATCATCTCGACACATCGGAGACG 600
181 -S--R--S--L--M--D--E--A--L--S--L--L--Y--H--L--D--T--S--E--T- 200
601 GCC CGG AAG AGT CTT TTA AAC AAC AAG AAG GGA ACA AAT CTT GTG AAA ACG TTG ACT AAG 660
601 GCCCGGAAGAGTCTTTTAAACAACAAGAAGGGAACAAATCTTGTGAAAACGTTGACTAAG 660
201 -A--R--K--S--L--L--N--N--K--K--G--T--N--L--V--K--T--L--T--K- 220
661 ATT ATG CAA CGG GGG ATC TAC GAG TCA AGA GCC TAT GCG ACT TTT CTT CTC AAG AAG ATT 720
661 ATTATGCAACGGGGGATCTACGAGTCAAGAGCCTATGCGACTTTTCTTCTCAAGAAGATT 720
221 -I--M--Q--R--G--I--Y--E--S--R--A--Y--A--T--F--L--L--K--K--I- 240
721 CTT GAA GTT GCG GAT CCA ATG CAG ATC ATA TTG TTG GAA CGT GAG CTT TTC AAC GAG GTG 780
721 CTTGAAGTTGCGGATCCAATGCAGATCATATTGTTGGAACGTGAGCTTTTCAACGAGGTG 780
241 -L--E--V--A--D--P--M--Q--I--I--L--L--E--R--E--L--F--N--E--V- 260
781 GTT CAG ATC TTG CAT GAC CAG ATC TCT CAC AAG GCA ACG AAA TCA GCA ATG CAG ATC TTG 840
781 GTTCAGATCTTGCATGACCAGATCTCTCACAAGGCAACGAAATCAGCAATGCAGATCTTG 840
261 -V--Q--I--L--H--D--Q--I--S--H--K--A--T--K--S--A--M--Q--I--L- 280
841 GTG ATT ATA TGT CCA TGG GGA AGG AAT AGA CAC AAG GCT GTG GAA GCT GGA GCG ATC TCG 900
841 GTGATTATATGTCCATGGGGAAGGAATAGACACAAGGCTGTGGAAGCTGGAGCGATCTCG 900
281 -V--I--I--C--P--W--G--R--N--R--H--K--A--V--E--A--G--A--I--S- 300
901 ATG ATT ATT GAG CTC TTG ATG GAT GAG ACT TTC TCA TCT GAG AGA AGG ACT TTG GAG ATG 960
901 ATGATTATTGAGCTCTTGATGGATGAGACTTTCTCATCTGAGAGAAGGACTTTGGAGATG 960
301 -M--I--I--E--L--L--M--D--E--T--F--S--S--E--R--R--T--L--E--M- 320
961 GCT ATG GTG GTT CTT GAT ATG TTA TGT CAG TGT GCA GAA GGA AGA GCT GAG TTC TTG AAT 1020
961 GCTATGGTGGTTCTTGATATGTTATGTCAGTGTGCAGAAGGAAGAGCTGAGTTCTTGAAT 1020
321 -A--M--V--V--L--D--M--L--C--Q--C--A--E--G--R--A--E--F--L--N- 340
1021 CAT TGT GCG GCT ATT GCG GTT GTG TCT AAG AAG ATA CTT AGG GTC TCT CAG ATA ACT AGT 1080
1021 CATTGTGCGGCTATTGCGGTTGTGTCTAAGAAGATACTTAGGGTCTCTCAGATAACTAGT 1080
341 -H--C--A--A--I--A--V--V--S--K--K--I--L--R--V--S--Q--I--T--S- 360
1081 GAA AGG GCG GTT AGG GTT TTG CTT TCT ATT GGG AGG TTT TGT GCG ACG CCT TCT CTA TTG 1140
1081 GAAAGGGCGGTTAGGGTTTTGCTTTCTATTGGGAGGTTTTGTGCGACGCCTTCTCTATTG 1140
361 -E--R--A--V--R--V--L--L--S--I--G--R--F--C--A--T--P--S--L--L- 380
1141 CAG GAT ATG TTG CAA CTG GGA GTT GTG GCG AAG ATG TGT CTT GTA CTT CAA GTG AGT TGC 1200
1141 CAGGATATGTTGCAACTGGGAGTTGTGGCGAAGATGTGTCTTGTACTTCAAGTGAGTTGC 1200
381 -Q--D--M--L--Q--L--G--V--V--A--K--M--C--L--V--L--Q--V--S--C- 400
1201 GGG AAC AAG ACT AAA GAA AAG GCT AAA GAA TTG CTT AAG CTT CAC GCT AGG GTT TGG AGG 1260
1201 GGGAACAAGACTAAAGAAAAGGCTAAAGAATTGCTTAAGCTTCACGCTAGGGTTTGGAGG 1260
401 -G--N--K--T--K--E--K--A--K--E--L--L--K--L--H--A--R--V--W--R- 420
1261 GAG TCA CCT TGT GTC CCA AGA AAC TTG TAT GCT TCG TAT CCA GCT TGA 1308
1261 GAGTCACCTTGTGTCCCAAGAAACTTGTATGCTTCGTATCCAGCTTGA 1308
421 -E--S--P--C--V--P--R--N--L--Y--A--S--Y--P--A--*- 435
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