Transcript: Bo3g001260.1
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Description
ENTH/VHS/GAT family protein [Source:TAIR;Acc:AT5G01760](projected from arabidopsis_thaliana,AT5G01760)
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- Bo3g001260.1 1692 563aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3AZ91 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG ACG ATG AGG CCC TCT TCT TCG TCT TCT GCT TGC TCT GCT TCT CCT TCG TTA ACG CTG 60
1 ATGACGATGAGGCCCTCTTCTTCGTCTTCTGCTTGCTCTGCTTCTCCTTCGTTAACGCTG 60
1 -M--T--M--R--P--S--S--S--S--S--A--C--S--A--S--P--S--L--T--L- 20
61 TCG TCG CTG TCA GTG GCG GTC GAT AAG GCC ACG AGC GAG CTT CTC CTC ACT CCT GAT TGG 120
61 TCGTCGCTGTCAGTGGCGGTCGATAAGGCCACGAGCGAGCTTCTCCTCACTCCTGATTGG 120
21 -S--S--L--S--V--A--V--D--K--A--T--S--E--L--L--L--T--P--D--W- 40
121 ACC ATC ATC ATC GCT ATC TGC GAT TCC CTC AAT TCT AAT CGC GG T CAC TGC AAA GAT GCG 180
121 ACCATCATCATCGCTATCTGCGATTCCCTCAATTCTAATCGCGGTCACTGCAAAGATGCG 180
41 -T--I--I--I--A--I--C--D--S--L--N--S--N--R--G--H--C--K--D--A- 60
181 ATC AAA GCG GTC AAG AGA AGA TTG CAG CAC AAG AGC TCT AAA GTG CAG CTA CTC ACT CTA 240
181 ATCAAAGCGGTCAAGAGAAGATTGCAGCACAAGAGCTCTAAAGTGCAGCTACTCACTCTA 240
61 -I--K--A--V--K--R--R--L--Q--H--K--S--S--K--V--Q--L--L--T--L- 80
241 ACG C TG TTG GAA GCA ATG CTG AAA AAC TGT GGG GAG TTT GTG CAT TCT CAT ATC GCT GAG 300
241 ACGCTGTTGGAAGCAATGCTGAAAAACTGTGGGGAGTTTGTGCATTCTCATATCGCTGAG 300
81 -T--L--L--E--A--M--L--K--N--C--G--E--F--V--H--S--H--I--A--E- 100
301 AAG CAT GTG CTT GAA GAT ATG GTT AAA ATT ATT GTG AGG AAG AAG G GT GAT TTT GAA GTA 360
301 AAGCATGTGCTTGAAGATATGGTTAAAATTATTGTGAGGAAGAAGGGTGATTTTGAAGTA 360
101 -K--H--V--L--E--D--M--V--K--I--I--V--R--K--K--G--D--F--E--V- 120
361 AGG AAC AAA ATC TTG ATA TTG TTG GAC ACT TGG AAT GAA GCA TTC AGT GCT CGC AAA TAC 420
361 AGGAACAAAATCTTGATATTGTTGGACACTTGGAATGAAGCATTCAGTGCTCGCAAATAC 420
121 -R--N--K--I--L--I--L--L--D--T--W--N--E--A--F--S--A--R--K--Y- 140
421 CCT CAT TAC AAC TGG GCT TAC CGA GAG CTA ATC C GG TCT GGT GTG AAA TTC CCA CAA CGT 480
421 CCTCATTACAACTGGGCTTACCGAGAGCTAATCCGGTCTGGTGTGAAATTCCCACAACGT 480
141 -P--H--Y--N--W--A--Y--R--E--L--I--R--S--G--V--K--F--P--Q--R- 160
481 TCA AAA GAA GCA CCC CTA ATG CTC GAA CCT TCG TCA CAG TCT TCT TCC TCT TCT TCC ATG 540
481 TCAAAAGAAGCACCCCTAATGCTCGAACCTTCGTCACAGTCTTCTTCCTCTTCTTCCATG 540
161 -S--K--E--A--P--L--M--L--E--P--S--S--Q--S--S--S--S--S--S--M- 180
541 AAT TTA ATG TCC ATC GGT TCA TTT AAA AGG CTC GAC GAA GCA ATG GCT ACT GAA ATT GAG 600
541 AATTTAATGTCCATCGGTTCATTTAAAAGGCTCGACGAAGCAATGGCTACTGAAATTGAG 600
181 -N--L--M--S--I--G--S--F--K--R--L--D--E--A--M--A--T--E--I--E- 200
601 AGT CTA AG T TTA TCG AAT CTT GAA TCC ATG AGA ACT GTC ATG GAT CTC ATG AGC GTT ATG 660
601 AGTCTAAGTTTATCGAATCTTGAATCCATGAGAACTGTCATGGATCTCATGAGCGTTATG 660
201 -S--L--S--L--S--N--L--E--S--M--R--T--V--M--D--L--M--S--V--M- 220
661 GTT CAA GCC GTA AAT CCC TCT GAT AAA TCA G CC CTG AAA GAT GAC CTC ATA GTT GAT CTA 720
661 GTTCAAGCCGTAAATCCCTCTGATAAATCAGCCCTGAAAGATGACCTCATAGTTGATCTA 720
221 -V--Q--A--V--N--P--S--D--K--S--A--L--K--D--D--L--I--V--D--L- 240
721 GTA GAG CAG TGC AGA TCT AAT CAG AAG AAA CTA ATC CAG ATG CTC ACC ACA ACT TC G GAC 780
721 GTAGAGCAGTGCAGATCTAATCAGAAGAAACTAATCCAGATGCTCACCACAACTTCGGAC 780
241 -V--E--Q--C--R--S--N--Q--K--K--L--I--Q--M--L--T--T--T--S--D- 260
781 GAG GAT GTT ATG GCG CGT GGC CTC GAG CTG AAT GAC TCA TTG CAG GTA GCT CTC GCC AGA 840
781 GAGGATGTTATGGCGCGTGGCCTCGAGCTGAATGACTCATTGCAGGTAGCTCTCGCCAGA 840
261 -E--D--V--M--A--R--G--L--E--L--N--D--S--L--Q--V--A--L--A--R- 280
841 CAC GAC GCT ATC GCC TCT GGT GTC TCT CTT CCT ATG TTG CAG GCT GCC CCA GAA ACA AGG 900
841 CACGACGCTATCGCCTCTGGTGTCTCTCTTCCTATGTTGCAGGCTGCCCCAGAAACAAGG 900
281 -H--D--A--I--A--S--G--V--S--L--P--M--L--Q--A--A--P--E--T--R- 300
901 GAC TCG ACA AGC TCT GTC CTA ATC AAG ACT AGT GAT GCT GAT GCT GCT GCT CTT GAG TCT 960
901 GACTCGACAAGCTCTGTCCTAATCAAGACTAGTGATGCTGATGCTGCTGCTCTTGAGTCT 960
301 -D--S--T--S--S--V--L--I--K--T--S--D--A--D--A--A--A--L--E--S- 320
961 GAC CCT TCT TCA TCA TCA ACG AGC AGT GAA AGT GAA ACA TAT GAG GAG GGA GAT GAT GTT 1020
961 GACCCTTCTTCATCATCAACGAGCAGTGAAAGTGAAACATATGAGGAGGGAGATGATGTT 1020
321 -D--P--S--S--S--S--T--S--S--E--S--E--T--Y--E--E--G--D--D--V- 340
1021 AAA AAT GAC TTT ATC CAG TTA ACC AAA AG T CAC GCT CTA TTA AAT GCC GAG GAA GAA GAA 1080
1021 AAAAATGACTTTATCCAGTTAACCAAAAGTCACGCTCTATTAAATGCCGAGGAAGAAGAA 1080
341 -K--N--D--F--I--Q--L--T--K--S--H--A--L--L--N--A--E--E--E--E- 360
1081 GAA GAA ACC TTG CTT CTA GGC AAC AAC AAT GAA AAT ACA GCG GAA ACC GAA GCC AAG ACA 1140
1081 GAAGAAACCTTGCTTCTAGGCAACAACAATGAAAATACAGCGGAAACCGAAGCCAAGACA 1140
361 -E--E--T--L--L--L--G--N--N--N--E--N--T--A--E--T--E--A--K--T- 380
1141 GAG TGC AAA GAT CTA GCT CTA TTT GAC ACA GCA ACA AGC AAG TCG GAG CAG GAC ATT ATT 1200
1141 GAGTGCAAAGATCTAGCTCTATTTGACACAGCAACAAGCAAGTCGGAGCAGGACATTATT 1200
381 -E--C--K--D--L--A--L--F--D--T--A--T--S--K--S--E--Q--D--I--I- 400
1201 GAA CTT CTC AGC CTA ACT TTG TCA ACA ACA GCT CTG CCG TCT TCA CAA ACG CAG GCT CCA 1260
1201 GAACTTCTCAGCCTAACTTTGTCAACAACAGCTCTGCCGTCTTCACAAACGCAGGCTCCA 1260
401 -E--L--L--S--L--T--L--S--T--T--A--L--P--S--S--Q--T--Q--A--P- 420
1261 CCA AAC ACA AGG TTT TTG GCT GAT GAT CAT ATT CTT ACG AAC AGC TAC GTA GTC CCA TGG 1320
1261 CCAAACACAAGGTTTTTGGCTGATGATCATATTCTTACGAACAGCTACGTAGTCCCATGG 1320
421 -P--N--T--R--F--L--A--D--D--H--I--L--T--N--S--Y--V--V--P--W- 440
1321 GCA CAA TCT CAG GCA GAA GCT CAA GTC CCC AAA ATG GCA CAG TTT GTT CCA TTG GGA CCT 1380
1321 GCACAATCTCAGGCAGAAGCTCAAGTCCCCAAAATGGCACAGTTTGTTCCATTGGGACCT 1380
441 -A--Q--S--Q--A--E--A--Q--V--P--K--M--A--Q--F--V--P--L--G--P- 460
1381 CAG TTT CAG CAG CAG CAT CAG CAG CAA TTT TCA TAT GGT TAT CCT CAG GCA CAA TGG AAC 1440
1381 CAGTTTCAGCAGCAGCATCAGCAGCAATTTTCATATGGTTATCCTCAGGCACAATGGAAC 1440
461 -Q--F--Q--Q--Q--H--Q--Q--Q--F--S--Y--G--Y--P--Q--A--Q--W--N- 480
1441 GGT GTT CAA GCC AAC AAT TAT AAT GAC ACA ACA CTG TGG GGG CAA GGA GTT AGT GAG AAT 1500
1441 GGTGTTCAAGCCAACAATTATAATGACACAACACTGTGGGGGCAAGGAGTTAGTGAGAAT 1500
481 -G--V--Q--A--N--N--Y--N--D--T--T--L--W--G--Q--G--V--S--E--N- 500
1501 AAG GTA TTT GAG AGA AAC TTG CAA TAC TCA AAC TCC TTT CCA GCT AGA GGA GGG GCG GGG 1560
1501 AAGGTATTTGAGAGAAACTTGCAATACTCAAACTCCTTTCCAGCTAGAGGAGGGGCGGGG 1560
501 -K--V--F--E--R--N--L--Q--Y--S--N--S--F--P--A--R--G--G--A--G- 520
1561 GGA GCA TCA GGT GCA GAG GTG GAG GGG CAG GCT CAG CAG CAG CCC CAG AGG CAG TAT GTT 1620
1561 GGAGCATCAGGTGCAGAGGTGGAGGGGCAGGCTCAGCAGCAGCCCCAGAGGCAGTATGTT 1620
521 -G--A--S--G--A--E--V--E--G--Q--A--Q--Q--Q--P--Q--R--Q--Y--V- 540
1621 CCT CCG TAC AAA TTG TTT GAA GAT CTG AAT GTT TTC TGG AAG GGA GAT GGA GGC GTT AGG 1680
1621 CCTCCGTACAAATTGTTTGAAGATCTGAATGTTTTCTGGAAGGGAGATGGAGGCGTTAGG 1680
541 -P--P--Y--K--L--F--E--D--L--N--V--F--W--K--G--D--G--G--V--R- 560
1681 AGT AGC AAA TGA 1692
1681 AGTAGCAAATGA 1692
561 -S--S--K--*- 563
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