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Brassica oleracea (BOL)
Location
About this transcript

This transcript has 10 exons, is annotated with 21 domains and features and maps to 1 oligo probe.

Gene

This transcript is a product of gene Bo2g120780 Show transcript tableHide transcript table

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  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
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  • Biotype
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-Bo2g120780.12292763aa
 
Protein coding
A0A0D3ATW9 -Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATTCTCGACGGTCATTTTTATCTAGGCCCGGTTAAACCAACTATTAGCCCGGCCCATCAA     60
     1 ATTCTCGACGGTCATTTTTATCTAGGCCCGGTTAAACCAACTATTAGCCCGGCCCATCAA     60
     1 -I--L--D--G--H--F--Y--L--G--P--V--K--P--T--I--S--P--A--H--Q-     20

                                                                          
    61 GAGGAGAATCAGAATAAAGGAGTGGGGATATCAACAGTCGTCATCAGGAACAGAAAGTCT    120
    61 GAGGAGAATCAGAATAAAGGAGTGGGGATATCAACAGTCGTCATCAGGAACAGAAAGTCT    120
    21 -E--E--N--Q--N--K--G--V--G--I--S--T--V--V--I--R--N--R--K--S-     40

                                                                          
   121 GAGAGTCCAAGATTTAGCAGTACGAGCAAGTGGAGAAGCACCTGTCGTACAGTCCTCGCG    180
   121 GAGAGTCCAAGATTTAGCAGTACGAGCAAGTGGAGAAGCACCTGTCGTACAGTCCTCGCG    180
    41 -E--S--P--R--F--S--S--T--S--K--W--R--S--T--C--R--T--V--L--A-     60

                                                                          
   181 TGTTCTCACGCGCCGACTCAATACTCTGCTGCCGACGCCGACATTGGCTCTCCGGCGTTG    240
   181 TGTTCTCACGCGCCGACTCAATACTCTGCTGCCGACGCCGACATTGGCTCTCCGGCGTTG    240
    61 -C--S--H--A--P--T--Q--Y--S--A--A--D--A--D--I--G--S--P--A--L-     80

                                                                          
   241 TCGTTGGATTTCGTAGGCCACGATTCTACAGCTACGCAGTCAAAACCCCTTGACTCCTTT    300
   241 TCGTTGGATTTCGTAGGCCACGATTCTACAGCTACGCAGTCAAAACCCCTTGACTCCTTT    300
    81 -S--L--D--F--V--G--H--D--S--T--A--T--Q--S--K--P--L--D--S--F-    100

                                                                          
   301 GAGCTTTCATTAAACCCTAACCCTCACCACTCTTTGAGCTTTGTTAGCATAAAAACCATG    360
   301 GAGCTTTCATTAAACCCTAACCCTCACCACTCTTTGAGCTTTGTTAGCATAAAAACCATG    360
   101 -E--L--S--L--N--P--N--P--H--H--S--L--S--F--V--S--I--K--T--M-    120

                                                                          
   361 GCACCAAATACGCATGTCAAAAGAGCGTTCAAAGCTATGAATGATCTTGGAATAACGGAT    420
   361 GCACCAAATACGCATGTCAAAAGAGCGTTCAAAGCTATGAATGATCTTGGAATAACGGAT    420
   121 -A--P--N--T--H--V--K--R--A--F--K--A--M--N--D--L--G--I--T--D-    140

                                                                          
   421 GCGCAAGTGAAGCCGGTCTTGAAGAACCTTCTCACCCTTTACGACAAAAACTGGGAGTTG    480
   421 GCGCAAGTGAAGCCGGTCTTGAAGAACCTTCTCACCCTTTACGACAAAAACTGGGAGTTG    480
   141 -A--Q--V--K--P--V--L--K--N--L--L--T--L--Y--D--K--N--W--E--L-    160

                                                                          
   481 ATAGCCGAGGACAACTACAGGGCTCTCGCTGATGCTATCTTCGATAGCCAAGAGTCTCAG    540
   481 ATAGCCGAGGACAACTACAGGGCTCTCGCTGATGCTATCTTCGATAGCCAAGAGTCTCAG    540
   161 -I--A--E--D--N--Y--R--A--L--A--D--A--I--F--D--S--Q--E--S--Q-    180

                                                                          
   541 ACCACTGAAGAAGTAAAAGGAAAGGAGAAGAAGGGAGATGAAGCTGAAAGCAGCTCTCTC    600
   541 ACCACTGAAGAAGTAAAAGGAAAGGAGAAGAAGGGAGATGAAGCTGAAAGCAGCTCTCTC    600
   181 -T--T--E--E--V--K--G--K--E--K--K--G--D--E--A--E--S--S--S--L-    200

                                                                          
   601 GAGGAAGATGAAGATGAGCTTGAGCCCCCTTTAAAGAGGCTGCGACGCAGAGGTGAAGGA    660
   601 GAGGAAGATGAAGATGAGCTTGAGCCCCCTTTAAAGAGGCTGCGACGCAGAGGTGAAGGA    660
   201 -E--E--D--E--D--E--L--E--P--P--L--K--R--L--R--R--R--G--E--G-    220

                                                                          
   661 GTCTCTGCTTCGGCTTCGAACAATCCCGACTTGGGAAGTCCCAATTTAGAAGAGCACACA    720
   661 GTCTCTGCTTCGGCTTCGAACAATCCCGACTTGGGAAGTCCCAATTTAGAAGAGCACACA    720
   221 -V--S--A--S--A--S--N--N--P--D--L--G--S--P--N--L--E--E--H--T-    240

                                                                          
   721 ACTCATGACGAAGACACTACTATCTCATTACCATTTCATCCTCAGCCAACCGAGAATAAC    780
   721 ACTCATGACGAAGACACTACTATCTCATTACCATTTCATCCTCAGCCAACCGAGAATAAC    780
   241 -T--H--D--E--D--T--T--I--S--L--P--F--H--P--Q--P--T--E--N--N-    260

                                                                          
   781 GCTGATGCTGAAACAAATGGACATGGCGAAACAGTAAATACTGTTCGTGCTGAAGATCCT    840
   781 GCTGATGCTGAAACAAATGGACATGGCGAAACAGTAAATACTGTTCGTGCTGAAGATCCT    840
   261 -A--D--A--E--T--N--G--H--G--E--T--V--N--T--V--R--A--E--D--P-    280

                                                                          
   841 CGTACAAGTACAACTATTGAGAGATACAGTGAGCAGAGGCTGGCTACAACCCTGGAAGAA    900
   841 CGTACAAGTACAACTATTGAGAGATACAGTGAGCAGAGGCTGGCTACAACCCTGGAAGAA    900
   281 -R--T--S--T--T--I--E--R--Y--S--E--Q--R--L--A--T--T--L--E--E-    300

                                                                          
   901 TCTTCGACACTTGAATTAGCTTCTTCTGAGACGGGTGAAGTGAAGATTAATCTGAGTTTT    960
   901 TCTTCGACACTTGAATTAGCTTCTTCTGAGACGGGTGAAGTGAAGATTAATCTGAGTTTT    960
   301 -S--S--T--L--E--L--A--S--S--E--T--G--E--V--K--I--N--L--S--F-    320

                                                                          
   961 GCCCCTGCAACTGGAGGATCCAATCTACGTGTACCCACTATGGAGGAACTGCGAAGAGCA   1020
   961 GCCCCTGCAACTGGAGGATCCAATCTACGTGTACCCACTATGGAGGAACTGCGAAGAGCA   1020
   321 -A--P--A--T--G--G--S--N--L--R--V--P--T--M--E--E--L--R--R--A-    340

                                                                          
  1021 ATGGAGGATAAGTGTCTCCGATCTTACAAAATACTCGACCCTAACTTCTCTGTAGGTCGT   1080
  1021 ATGGAGGATAAGTGTCTCCGATCTTACAAAATACTCGACCCTAACTTCTCTGTAGGTCGT   1080
   341 -M--E--D--K--C--L--R--S--Y--K--I--L--D--P--N--F--S--V--G--R-    360

                                                                          
  1081 TTTATGGGCGACATCGTTAGTTGCTTTCTCGAACTATCAAAAAACGCAGCCAGCCATTCG   1140
  1081 TTTATGGGCGACATCGTTAGTTGCTTTCTCGAACTATCAAAAAACGCAGCCAGCCATTCG   1140
   361 -F--M--G--D--I--V--S--C--F--L--E--L--S--K--N--A--A--S--H--S-    380

                                                                          
  1141 CCAGAAACATTGCCGTTTCTCACCACGAATATTGGTGTGTTGAAGAAACCTGCAGCCAAC   1200
  1141 CCAGAAACATTGCCGTTTCTCACCACGAATATTGGTGTGTTGAAGAAACCTGCAGCCAAC   1200
   381 -P--E--T--L--P--F--L--T--T--N--I--G--V--L--K--K--P--A--A--N-    400

                                                                          
  1201 CAGCCGCCAGAAAACTTGCCGACGAATGTTGAAGAAAAGGGAGAGTCCATGGGTTTAGTA   1260
  1201 CAGCCGCCAGAAAACTTGCCGACGAATGTTGAAGAAAAGGGAGAGTCCATGGGTTTAGTA   1260
   401 -Q--P--P--E--N--L--P--T--N--V--E--E--K--G--E--S--M--G--L--V-    420

                                                                          
  1261 GTAGTTCCAGAGTGCCAGATCTCTGCGGATGATTTTAGATTGATAAGCAGCATTAATGAT   1320
  1261 GTAGTTCCAGAGTGCCAGATCTCTGCGGATGATTTTAGATTGATAAGCAGCATTAATGAT   1320
   421 -V--V--P--E--C--Q--I--S--A--D--D--F--R--L--I--S--S--I--N--D-    440

                                                                          
  1321 GTCACTCTTGGAAAAGAAACTCTTGAGATTCCCTGGGTGAATGAATTCAATAGCAAGGTT   1380
  1321 GTCACTCTTGGAAAAGAAACTCTTGAGATTCCCTGGGTGAATGAATTCAATAGCAAGGTT   1380
   441 -V--T--L--G--K--E--T--L--E--I--P--W--V--N--E--F--N--S--K--V-    460

                                                                          
  1381 CCTCCACCCTTTCGATACATACCCCAAAGCTATGTCTATCTAGATGCTGCAGTGAAGTTT   1440
  1381 CCTCCACCCTTTCGATACATACCCCAAAGCTATGTCTATCTAGATGCTGCAGTGAAGTTT   1440
   461 -P--P--P--F--R--Y--I--P--Q--S--Y--V--Y--L--D--A--A--V--K--F-    480

                                                                          
  1441 TCAGTTGGGAACATCAGGGATGACCAACGCTGCTCCTCTTGTTGTGGAGATTGCTTGGCT   1500
  1441 TCAGTTGGGAACATCAGGGATGACCAACGCTGCTCCTCTTGTTGTGGAGATTGCTTGGCT   1500
   481 -S--V--G--N--I--R--D--D--Q--R--C--S--S--C--C--G--D--C--L--A-    500

                                                                          
  1501 CCTTCAGTGGCATGCAGCTGTGCAACTGCACTTAGTGGCTTCACGTCATACACAAAAGAT   1560
  1501 CCTTCAGTGGCATGCAGCTGTGCAACTGCACTTAGTGGCTTCACGTCATACACAAAAGAT   1560
   501 -P--S--V--A--C--S--C--A--T--A--L--S--G--F--T--S--Y--T--K--D-    520

                                                                          
  1561 GGCCTCCTGCAGAATGATTTCCTGGAAGAGTGTGTTTCTGAGGCACGTGACCCGCAGAAA   1620
  1561 GGCCTCCTGCAGAATGATTTCCTGGAAGAGTGTGTTTCTGAGGCACGTGACCCGCAGAAA   1620
   521 -G--L--L--Q--N--D--F--L--E--E--C--V--S--E--A--R--D--P--Q--K-    540

                                                                          
  1621 CATGTGTTGCAATTTTGCAAAGAATGTCCGTTGGAGAAGGCTAAAAACATAGAGATTCTG   1680
  1621 CATGTGTTGCAATTTTGCAAAGAATGTCCGTTGGAGAAGGCTAAAAACATAGAGATTCTG   1680
   541 -H--V--L--Q--F--C--K--E--C--P--L--E--K--A--K--N--I--E--I--L-    560

                                                                          
  1681 GAATCGTGCAAGGGGCATCTAAAGAGGAAGGCCATTAAAGAATGTTGGATCAATTGTGGC   1740
  1681 GAATCGTGCAAGGGGCATCTAAAGAGGAAGGCCATTAAAGAATGTTGGATCAATTGTGGC   1740
   561 -E--S--C--K--G--H--L--K--R--K--A--I--K--E--C--W--I--N--C--G-    580

                                                                          
  1741 TGTATCAACAAATGTGGCAACCGAGTCGTCCAACATGGCATTCATAACAAGCTGCAGGTG   1800
  1741 TGTATCAACAAATGTGGCAACCGAGTCGTCCAACATGGCATTCATAACAAGCTGCAGGTG   1800
   581 -C--I--N--K--C--G--N--R--V--V--Q--H--G--I--H--N--K--L--Q--V-    600

                                                                          
  1801 TTTTTCACTCCCAATGGGAGAGGTTGGGGACTCAGGACTCTACAAAAGCTGCCTAAAGGA   1860
  1801 TTTTTCACTCCCAATGGGAGAGGTTGGGGACTCAGGACTCTACAAAAGCTGCCTAAAGGA   1860
   601 -F--F--T--P--N--G--R--G--W--G--L--R--T--L--Q--K--L--P--K--G-    620

                                                                          
  1861 GCATTTGTCTGTGAGTTTGCTGGAGAAATATTGACCATTTCGGAGTTGATCAAACGTAGC   1920
  1861 GCATTTGTCTGTGAGTTTGCTGGAGAAATATTGACCATTTCGGAGTTGATCAAACGTAGC   1920
   621 -A--F--V--C--E--F--A--G--E--I--L--T--I--S--E--L--I--K--R--S-    640

                                                                          
  1921 TCTGAGAAGCTTACCTTTCCGGTAATATTGGATGCACACTGGGGTTCTGAAAAAGCTTCA   1980
  1921 TCTGAGAAGCTTACCTTTCCGGTAATATTGGATGCACACTGGGGTTCTGAAAAAGCTTCA   1980
   641 -S--E--K--L--T--F--P--V--I--L--D--A--H--W--G--S--E--K--A--S-    660

                                                                          
  1981 GGTGTCGACAAAGCTCTTTGCCTTGATGGAATGCATTATGGAAATATTTCCAGGTTTATC   2040
  1981 GGTGTCGACAAAGCTCTTTGCCTTGATGGAATGCATTATGGAAATATTTCCAGGTTTATC   2040
   661 -G--V--D--K--A--L--C--L--D--G--M--H--Y--G--N--I--S--R--F--I-    680

                                                                          
  2041 AATCACAGATGCTCAGATGCAAATTTGATTGACATCCCAGTGCATGTGGAGAATATGGAC   2100
  2041 AATCACAGATGCTCAGATGCAAATTTGATTGACATCCCAGTGCATGTGGAGAATATGGAC   2100
   681 -N--H--R--C--S--D--A--N--L--I--D--I--P--V--H--V--E--N--M--D-    700

                                                                          
  2101 TTTAACTACTATCATCTCGCGTTCTTCACAACAAGAGACATCGAGGCTCTGGAAGAACTA   2160
  2101 TTTAACTACTATCATCTCGCGTTCTTCACAACAAGAGACATCGAGGCTCTGGAAGAACTA   2160
   701 -F--N--Y--Y--H--L--A--F--F--T--T--R--D--I--E--A--L--E--E--L-    720

                                                                          
  2161 ACATGGGATTATGGCGTCGAGTTCAACGATCATGTTTATCCCACGCTTCCGTTCCATTGT   2220
  2161 ACATGGGATTATGGCGTCGAGTTCAACGATCATGTTTATCCCACGCTTCCGTTCCATTGT   2220
   721 -T--W--D--Y--G--V--E--F--N--D--H--V--Y--P--T--L--P--F--H--C-    740

                                                                          
  2221 CAATGTGGTAGCGAGTTCTGTCGGAATGTTAAGCGGATAAGCAAAAGCAAGAAGGCAAAG   2280
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   741 -Q--C--G--S--E--F--C--R--N--V--K--R--I--S--K--S--K--K--A--K-    760

                                                                          
  2281 AAGAGAGCGTAA                                                   2292
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   761 -K--R--A--*-                                                    763