Transcript: Bo2g120780.1
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- Bo2g120780.1 2292 763aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3ATW9 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TT CTC GAC GGT CAT TTT TAT CTA GGC CCG GTT AAA CCA ACT ATT AGC CCG GCC CAT CAA 60
1 ATTCTCGACGGTCATTTTTATCTAGGCCCGGTTAAACCAACTATTAGCCCGGCCCATCAA 60
1 -I--L--D--G--H--F--Y--L--G--P--V--K--P--T--I--S--P--A--H--Q- 20
61 GAG GAG AAT CAG AAT AAA GGA GTG GGG ATA TCA ACA GTC GTC ATC AGG AAC AGA AAG TCT 120
61 GAGGAGAATCAGAATAAAGGAGTGGGGATATCAACAGTCGTCATCAGGAACAGAAAGTCT 120
21 -E--E--N--Q--N--K--G--V--G--I--S--T--V--V--I--R--N--R--K--S- 40
121 GAG AGT CCA AGA TTT AGC AGT ACG AGC AAG TGG AGA AGC ACC TGT CGT ACA GTC CTC GCG 180
121 GAGAGTCCAAGATTTAGCAGTACGAGCAAGTGGAGAAGCACCTGTCGTACAGTCCTCGCG 180
41 -E--S--P--R--F--S--S--T--S--K--W--R--S--T--C--R--T--V--L--A- 60
181 TGT TCT CAC GCG CCG ACT CAA TAC TCT GCT GCC GAC GCC GAC ATT GGC TCT CCG GCG TTG 240
181 TGTTCTCACGCGCCGACTCAATACTCTGCTGCCGACGCCGACATTGGCTCTCCGGCGTTG 240
61 -C--S--H--A--P--T--Q--Y--S--A--A--D--A--D--I--G--S--P--A--L- 80
241 TCG TTG GAT TTC GTA GGC CAC GAT TCT ACA GCT ACG CAG TCA AAA CCC CTT GAC TCC TTT 300
241 TCGTTGGATTTCGTAGGCCACGATTCTACAGCTACGCAGTCAAAACCCCTTGACTCCTTT 300
81 -S--L--D--F--V--G--H--D--S--T--A--T--Q--S--K--P--L--D--S--F- 100
301 GAG CTT TCA TTA AAC CCT AAC CCT CAC CAC TCT TTG A GC TTT GTT AGC ATA AAA ACC ATG 360
301 GAGCTTTCATTAAACCCTAACCCTCACCACTCTTTGAGCTTTGTTAGCATAAAAACCATG 360
101 -E--L--S--L--N--P--N--P--H--H--S--L--S--F--V--S--I--K--T--M- 120
361 GCA CCA AAT ACG CAT GTC AAA AGA GCG TTC AAA GCT ATG AAT GAT CTT GGA ATA ACG GAT 420
361 GCACCAAATACGCATGTCAAAAGAGCGTTCAAAGCTATGAATGATCTTGGAATAACGGAT 420
121 -A--P--N--T--H--V--K--R--A--F--K--A--M--N--D--L--G--I--T--D- 140
421 GCG CAA GTG AAG CCG GTC TTG AAG AAC CTT CTC ACC CTT TAC GAC AAA AAC TGG GAG TTG 480
421 GCGCAAGTGAAGCCGGTCTTGAAGAACCTTCTCACCCTTTACGACAAAAACTGGGAGTTG 480
141 -A--Q--V--K--P--V--L--K--N--L--L--T--L--Y--D--K--N--W--E--L- 160
481 ATA GCC GAG GAC AAC TAC AGG GCT CTC GCT GAT GCT ATC TTC GAT AGC CAA GAG TCT CAG 540
481 ATAGCCGAGGACAACTACAGGGCTCTCGCTGATGCTATCTTCGATAGCCAAGAGTCTCAG 540
161 -I--A--E--D--N--Y--R--A--L--A--D--A--I--F--D--S--Q--E--S--Q- 180
541 ACC ACT GAA GAA GTA AAA GGA AAG GAG AAG AAG GGA GAT GAA GCT GAA AGC AGC T CT CTC 600
541 ACCACTGAAGAAGTAAAAGGAAAGGAGAAGAAGGGAGATGAAGCTGAAAGCAGCTCTCTC 600
181 -T--T--E--E--V--K--G--K--E--K--K--G--D--E--A--E--S--S--S--L- 200
601 GAG GAA GAT GAA GAT GAG CTT GAG CCC CCT TTA AAG AGG CTG CGA CGC AGA GGT GAA GGA 660
601 GAGGAAGATGAAGATGAGCTTGAGCCCCCTTTAAAGAGGCTGCGACGCAGAGGTGAAGGA 660
201 -E--E--D--E--D--E--L--E--P--P--L--K--R--L--R--R--R--G--E--G- 220
661 GTC TCT GCT TCG GCT TCG AAC AAT CCC GAC TTG GGA AGT CCC AAT TTA GAA GAG CAC ACA 720
661 GTCTCTGCTTCGGCTTCGAACAATCCCGACTTGGGAAGTCCCAATTTAGAAGAGCACACA 720
221 -V--S--A--S--A--S--N--N--P--D--L--G--S--P--N--L--E--E--H--T- 240
721 ACT CAT GAC GAA GAC ACT ACT ATC TCA TTA CCA TTT CAT CCT CAG CCA ACC GAG AAT AAC 780
721 ACTCATGACGAAGACACTACTATCTCATTACCATTTCATCCTCAGCCAACCGAGAATAAC 780
241 -T--H--D--E--D--T--T--I--S--L--P--F--H--P--Q--P--T--E--N--N- 260
781 GCT GAT GCT G AA ACA AAT GGA CAT GGC GAA ACA GTA AAT ACT GTT CGT GCT GAA GAT CCT 840
781 GCTGATGCTGAAACAAATGGACATGGCGAAACAGTAAATACTGTTCGTGCTGAAGATCCT 840
261 -A--D--A--E--T--N--G--H--G--E--T--V--N--T--V--R--A--E--D--P- 280
841 CGT ACA AGT ACA ACT ATT GAG AGA TAC AGT GAG CAG AGG CTG GCT ACA ACC CTG GAA GAA 900
841 CGTACAAGTACAACTATTGAGAGATACAGTGAGCAGAGGCTGGCTACAACCCTGGAAGAA 900
281 -R--T--S--T--T--I--E--R--Y--S--E--Q--R--L--A--T--T--L--E--E- 300
901 TCT TCG ACA CTT GAA TTA GCT TCT TCT GAG ACG GGT GAA GTG AAG ATT AAT CTG AGT TTT 960
901 TCTTCGACACTTGAATTAGCTTCTTCTGAGACGGGTGAAGTGAAGATTAATCTGAGTTTT 960
301 -S--S--T--L--E--L--A--S--S--E--T--G--E--V--K--I--N--L--S--F- 320
961 GCC CCT GCA ACT GGA GGA TCC AAT CTA CGT GTA CCC ACT ATG GAG GAA CTG CGA AGA GCA 1020
961 GCCCCTGCAACTGGAGGATCCAATCTACGTGTACCCACTATGGAGGAACTGCGAAGAGCA 1020
321 -A--P--A--T--G--G--S--N--L--R--V--P--T--M--E--E--L--R--R--A- 340
1021 ATG GAG GAT AAG TGT CTC CGA TCT TAC AAA ATA CTC GAC CCT AAC TTC TCT GTA GGT CGT 1080
1021 ATGGAGGATAAGTGTCTCCGATCTTACAAAATACTCGACCCTAACTTCTCTGTAGGTCGT 1080
341 -M--E--D--K--C--L--R--S--Y--K--I--L--D--P--N--F--S--V--G--R- 360
1081 TTT ATG GGC GAC ATC GTT AGT TGC TTT CTC GAA CTA TCA AAA AAC GCA GCC AGC CAT TCG 1140
1081 TTTATGGGCGACATCGTTAGTTGCTTTCTCGAACTATCAAAAAACGCAGCCAGCCATTCG 1140
361 -F--M--G--D--I--V--S--C--F--L--E--L--S--K--N--A--A--S--H--S- 380
1141 CCA GAA ACA TTG CCG TTT CTC ACC ACG AAT ATT GGT GTG TTG AAG AAA CCT GCA GCC AAC 1200
1141 CCAGAAACATTGCCGTTTCTCACCACGAATATTGGTGTGTTGAAGAAACCTGCAGCCAAC 1200
381 -P--E--T--L--P--F--L--T--T--N--I--G--V--L--K--K--P--A--A--N- 400
1201 CAG CCG CCA GAA AAC TTG CCG ACG AAT GTT GAA GAA AAG GGA GAG TCC ATG GGT TTA GTA 1260
1201 CAGCCGCCAGAAAACTTGCCGACGAATGTTGAAGAAAAGGGAGAGTCCATGGGTTTAGTA 1260
401 -Q--P--P--E--N--L--P--T--N--V--E--E--K--G--E--S--M--G--L--V- 420
1261 GTA GTT CCA GAG TGC CAG ATC TCT GCG GAT GAT TTT AGA TTG ATA AGC AGC ATT AAT GAT 1320
1261 GTAGTTCCAGAGTGCCAGATCTCTGCGGATGATTTTAGATTGATAAGCAGCATTAATGAT 1320
421 -V--V--P--E--C--Q--I--S--A--D--D--F--R--L--I--S--S--I--N--D- 440
1321 GTC ACT CTT GGA AAA GAA ACT CTT GAG ATT CCC TGG GTG AAT GAA TTC AAT AGC AAG GTT 1380
1321 GTCACTCTTGGAAAAGAAACTCTTGAGATTCCCTGGGTGAATGAATTCAATAGCAAGGTT 1380
441 -V--T--L--G--K--E--T--L--E--I--P--W--V--N--E--F--N--S--K--V- 460
1381 CCT CCA CCC TTT CGA TAC ATA CCC CAA AGC TAT GTC TAT CTA GAT GCT GCA GTG AAG TTT 1440
1381 CCTCCACCCTTTCGATACATACCCCAAAGCTATGTCTATCTAGATGCTGCAGTGAAGTTT 1440
461 -P--P--P--F--R--Y--I--P--Q--S--Y--V--Y--L--D--A--A--V--K--F- 480
1441 TCA GTT GGG AAC ATC AGG GAT GAC CAA CGC TGC TCC TCT TGT TGT GGA GAT TGC TTG GCT 1500
1441 TCAGTTGGGAACATCAGGGATGACCAACGCTGCTCCTCTTGTTGTGGAGATTGCTTGGCT 1500
481 -S--V--G--N--I--R--D--D--Q--R--C--S--S--C--C--G--D--C--L--A- 500
1501 CCT TCA GTG GCA TGC AGC TGT GCA ACT GCA CTT AGT GGC TTC ACG TCA TAC ACA AAA GAT 1560
1501 CCTTCAGTGGCATGCAGCTGTGCAACTGCACTTAGTGGCTTCACGTCATACACAAAAGAT 1560
501 -P--S--V--A--C--S--C--A--T--A--L--S--G--F--T--S--Y--T--K--D- 520
1561 GGC CTC CTG CAG AAT GAT TTC CTG GAA GAG TGT GTT TCT GAG GCA CGT GAC CCG CAG AAA 1620
1561 GGCCTCCTGCAGAATGATTTCCTGGAAGAGTGTGTTTCTGAGGCACGTGACCCGCAGAAA 1620
521 -G--L--L--Q--N--D--F--L--E--E--C--V--S--E--A--R--D--P--Q--K- 540
1621 CAT GTG TTG CAA TTT TGC AAA GAA TGT CCG TTG GAG AAG GCT AAA AAC ATA GAG ATT CTG 1680
1621 CATGTGTTGCAATTTTGCAAAGAATGTCCGTTGGAGAAGGCTAAAAACATAGAGATTCTG 1680
541 -H--V--L--Q--F--C--K--E--C--P--L--E--K--A--K--N--I--E--I--L- 560
1681 GAA TCG TGC AAG GGG CAT CTA AAG AGG AAG GCC ATT AAA GAA TGT TGG ATC AAT TGT GGC 1740
1681 GAATCGTGCAAGGGGCATCTAAAGAGGAAGGCCATTAAAGAATGTTGGATCAATTGTGGC 1740
561 -E--S--C--K--G--H--L--K--R--K--A--I--K--E--C--W--I--N--C--G- 580
1741 TGT ATC AAC AAA TGT GGC AAC CGA GTC GTC CAA CAT GGC ATT CAT AAC AAG CTG CAG GTG 1800
1741 TGTATCAACAAATGTGGCAACCGAGTCGTCCAACATGGCATTCATAACAAGCTGCAGGTG 1800
581 -C--I--N--K--C--G--N--R--V--V--Q--H--G--I--H--N--K--L--Q--V- 600
1801 TTT TTC ACT CCC AAT GGG AGA GGT TGG GGA CTC AGG ACT CTA CAA AAG CTG CCT AAA GGA 1860
1801 TTTTTCACTCCCAATGGGAGAGGTTGGGGACTCAGGACTCTACAAAAGCTGCCTAAAGGA 1860
601 -F--F--T--P--N--G--R--G--W--G--L--R--T--L--Q--K--L--P--K--G- 620
1861 GCA TTT GTC TGT GAG TTT GCT GGA GAA ATA TTG ACC ATT TCG GAG TTG ATC AAA CGT AGC 1920
1861 GCATTTGTCTGTGAGTTTGCTGGAGAAATATTGACCATTTCGGAGTTGATCAAACGTAGC 1920
621 -A--F--V--C--E--F--A--G--E--I--L--T--I--S--E--L--I--K--R--S- 640
1921 TCT GAG AAG CTT ACC TTT CCG GTA ATA TTG GAT GCA CAC TGG GGT TCT GAA AAA GCT TCA 1980
1921 TCTGAGAAGCTTACCTTTCCGGTAATATTGGATGCACACTGGGGTTCTGAAAAAGCTTCA 1980
641 -S--E--K--L--T--F--P--V--I--L--D--A--H--W--G--S--E--K--A--S- 660
1981 GGT GTC GAC AAA GCT CTT TGC CTT GAT GGA ATG CAT TAT GGA AAT ATT TCC AGG TTT ATC 2040
1981 GGTGTCGACAAAGCTCTTTGCCTTGATGGAATGCATTATGGAAATATTTCCAGGTTTATC 2040
661 -G--V--D--K--A--L--C--L--D--G--M--H--Y--G--N--I--S--R--F--I- 680
2041 AAT CAC AG A TGC TCA GAT GCA AAT TTG ATT GAC ATC CCA GTG CAT GTG GAG AAT ATG GAC 2100
2041 AATCACAGATGCTCAGATGCAAATTTGATTGACATCCCAGTGCATGTGGAGAATATGGAC 2100
681 -N--H--R--C--S--D--A--N--L--I--D--I--P--V--H--V--E--N--M--D- 700
2101 TTT AAC TAC TAT CAT C TC GCG TTC TTC ACA ACA AGA GAC ATC GAG GCT CTG GAA GAA CTA 2160
2101 TTTAACTACTATCATCTCGCGTTCTTCACAACAAGAGACATCGAGGCTCTGGAAGAACTA 2160
701 -F--N--Y--Y--H--L--A--F--F--T--T--R--D--I--E--A--L--E--E--L- 720
2161 ACA TGG GAT TAT GGC GTC GAG TTC AAC GAT CAT GTT TAT CCC ACG CTT CCG TTC CAT TGT 2220
2161 ACATGGGATTATGGCGTCGAGTTCAACGATCATGTTTATCCCACGCTTCCGTTCCATTGT 2220
721 -T--W--D--Y--G--V--E--F--N--D--H--V--Y--P--T--L--P--F--H--C- 740
2221 CAA TGT GGT AGC GAG TTC TGT CGG AAT GTT AAG CGG ATA AGC A AA AGC AAG AAG GCA AAG 2280
2221 CAATGTGGTAGCGAGTTCTGTCGGAATGTTAAGCGGATAAGCAAAAGCAAGAAGGCAAAG 2280
741 -Q--C--G--S--E--F--C--R--N--V--K--R--I--S--K--S--K--K--A--K- 760
2281 AAG AGA GCG TAA 2292
2281 AAGAGAGCGTAA 2292
761 -K--R--A--*- 763
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