Transcript: Bo2g093430.1
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- Bo2g093430.1 1128 375aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3ARG5 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GGT AAT AAG CTA GTG GGA AGG AGG AGG CAA GCG GTG GAA GAA AAG TAT ACA AAG CCA 60
1 ATGGGTAATAAGCTAGTGGGAAGGAGGAGGCAAGCGGTGGAAGAAAAGTATACAAAGCCA 60
1 -M--G--N--K--L--V--G--R--R--R--Q--A--V--E--E--K--Y--T--K--P- 20
61 CAA GGT TTG TAT GTG AAC AAC GAT GTC GAC ATT AAA AAG CTT AGG AAA CTG ATT CTA GAG 120
61 CAAGGTTTGTATGTGAACAACGATGTCGACATTAAAAAGCTTAGGAAACTGATTCTAGAG 120
21 -Q--G--L--Y--V--N--N--D--V--D--I--K--K--L--R--K--L--I--L--E- 40
121 TCT AAG CTT GCT CCT TGC TAC CCT GGA GAT GAT GAA AGC TGT CAT GAA CTC GAA GAA TGC 180
121 TCTAAGCTTGCTCCTTGCTACCCTGGAGATGATGAAAGCTGTCATGAACTCGAAGAATGC 180
41 -S--K--L--A--P--C--Y--P--G--D--D--E--S--C--H--E--L--E--E--C- 60
181 CCC ATT TGC TTT CTG T AC TAT CCT AGC CTC AAT AGA TCA AGA TGT TGC ATG AAA AGC ATT 240
181 CCCATTTGCTTTCTGTACTATCCTAGCCTCAATAGATCAAGATGTTGCATGAAAAGCATT 240
61 -P--I--C--F--L--Y--Y--P--S--L--N--R--S--R--C--C--M--K--S--I- 80
241 TGT ACA G AG TGC TTT TTG CAA ATG AAG AAT CCT AAT TTA GCT CGG CCT ACT CA G TGC CCC 300
241 TGTACAGAGTGCTTTTTGCAAATGAAGAATCCTAATTTAGCTCGGCCTACTCAGTGCCCC 300
81 -C--T--E--C--F--L--Q--M--K--N--P--N--L--A--R--P--T--Q--C--P- 100
301 TTT TGT AAA ACA CCC AAC TAT GCT GTT GAG TAC CGT GGA GTA AAG AGC AAG GAG GAG AAG 360
301 TTTTGTAAAACACCCAACTATGCTGTTGAGTACCGTGGAGTAAAGAGCAAGGAGGAGAAG 360
101 -F--C--K--T--P--N--Y--A--V--E--Y--R--G--V--K--S--K--E--E--K- 120
361 GGC ATT GAG CAA GTT GAG GAG CAA CGA GTT ATA GAA GCC AAA ATA AGG ATG AGG CAG AAA 420
361 GGCATTGAGCAAGTTGAGGAGCAACGAGTTATAGAAGCCAAAATAAGGATGAGGCAGAAA 420
121 -G--I--E--Q--V--E--E--Q--R--V--I--E--A--K--I--R--M--R--Q--K- 140
421 GAA ATG CAG GAT GAT GAA GAG AAA ATG CAG AAA CGT TTG GAA TCA TGT TCC TCT AGC ACA 480
421 GAAATGCAGGATGATGAAGAGAAAATGCAGAAACGTTTGGAATCATGTTCCTCTAGCACA 480
141 -E--M--Q--D--D--E--E--K--M--Q--K--R--L--E--S--C--S--S--S--T- 160
481 AGC GCA ATG GCT GGT GAA GTT GAA TAT GGT TCA GCT TCA G C T ATG TCT TAT AAT TCT CCT 540
481 AGCGCAATGGCTGGTGAAGTTGAATATGGTTCAGCTTCAGCTATGTCTTATAATTCTCCT 540
161 -S--A--M--A--G--E--V--E--Y--G--S--A--S--A--M--S--Y--N--S--P- 180
541 ATG GAA GAT GCA GAA ACT GCT TCA TCT CAG AAC ACA TCA GTT AGA CAG CGA GGA AGC AG G 600
541 ATGGAAGATGCAGAAACTGCTTCATCTCAGAACACATCAGTTAGACAGCGAGGAAGCAGG 600
181 -M--E--D--A--E--T--A--S--S--Q--N--T--S--V--R--Q--R--G--S--R- 200
601 GAT GAT GTT GAC CTT GAA GAG TTA ATG GTT ATG GAA GCA ATA TGG CTC TCC ATT CAG GAA 660
601 GATGATGTTGACCTTGAAGAGTTAATGGTTATGGAAGCAATATGGCTCTCCATTCAGGAA 660
201 -D--D--V--D--L--E--E--L--M--V--M--E--A--I--W--L--S--I--Q--E- 220
661 ACA GAT ATG CAG AGA AGT TCA GGT AGT GGA GAA GTG GCA CCT TGT AGT CAG TAT GTA TCA 720
661 ACAGATATGCAGAGAAGTTCAGGTAGTGGAGAAGTGGCACCTTGTAGTCAGTATGTATCA 720
221 -T--D--M--Q--R--S--S--G--S--G--E--V--A--P--C--S--Q--Y--V--S- 240
721 GAA GAA GAA CCA GCA ATG CCG TCT TCA TCG TCT TCT TGT GCA ATC TCT GCA CTT GCT GAA 780
721 GAAGAAGAACCAGCAATGCCGTCTTCATCGTCTTCTTGTGCAATCTCTGCACTTGCTGAA 780
241 -E--E--E--P--A--M--P--S--S--S--S--S--C--A--I--S--A--L--A--E- 260
781 CGC CAG CAA ATG GTT GGT GAA TCC TCC AAT CAC AAT CAC AAC GTC AAC GTT TCC TCA TAC 840
781 CGCCAGCAAATGGTTGGTGAATCCTCCAATCACAATCACAACGTCAACGTTTCCTCATAC 840
261 -R--Q--Q--M--V--G--E--S--S--N--H--N--H--N--V--N--V--S--S--Y- 280
841 ACT ATG CTT CCT GGC AAC TGC GAC AGT TAC TAC GGC ATA GAA CAA GAA GTA GAC GAC ATT 900
841 ACTATGCTTCCTGGCAACTGCGACAGTTACTACGGCATAGAACAAGAAGTAGACGACATT 900
281 -T--M--L--P--G--N--C--D--S--Y--Y--G--I--E--Q--E--V--D--D--I- 300
901 GAC CAT CAC CAT AAT CAT TAC CAT AAC AAC AGT GAA ATG GAA GAA ACA GGG AGC AAC AGC 960
901 GACCATCACCATAATCATTACCATAACAACAGTGAAATGGAAGAAACAGGGAGCAACAGC 960
301 -D--H--H--H--N--H--Y--H--N--N--S--E--M--E--E--T--G--S--N--S- 320
961 TAT GTA AGC TCG TAC ATG AAC GGA GAG ACC TTC CAC AAC TTT CCT CCT CCT CCT ATG GTC 1020
961 TATGTAAGCTCGTACATGAACGGAGAGACCTTCCACAACTTTCCTCCTCCTCCTATGGTC 1020
321 -Y--V--S--S--Y--M--N--G--E--T--F--H--N--F--P--P--P--P--M--V- 340
1021 ATT GTT CCA GAT AGT TTT GAA GAG CAG ATG ATG ATG GCT ATG GCT GTG TCG TTG GCA GAG 1080
1021 ATTGTTCCAGATAGTTTTGAAGAGCAGATGATGATGGCTATGGCTGTGTCGTTGGCAGAG 1080
341 -I--V--P--D--S--F--E--E--Q--M--M--M--A--M--A--V--S--L--A--E- 360
1081 GTT CAT GCC ACG ACC ACA AGT GCA CCA ACT GAA GTT AGT TGG CAA TAA 1128
1081 GTTCATGCCACGACCACAAGTGCACCAACTGAAGTTAGTTGGCAATAA 1128
361 -V--H--A--T--T--T--S--A--P--T--E--V--S--W--Q--*- 375
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