Transcript: Bo2g029110.1
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Description
XBAT32 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G57740) UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178UH83]
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- Bo2g029110.1 1518 505aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0D3ALD7 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG AGG TTT CTG AGC CTC GTC GGA AAC TCA TTC GGT TGC TCC GCG TCC GGC GAG CGA TTA 60
1 ATGAGGTTTCTGAGCCTCGTCGGAAACTCATTCGGTTGCTCCGCGTCCGGCGAGCGATTA 60
1 -M--R--F--L--S--L--V--G--N--S--F--G--C--S--A--S--G--E--R--L- 20
61 GTA TCA GCC GCC AGA GAC GGC GAT CTA CAA GAA GCC AAA GCC CTC CTT GAT TAC AAC CCG 120
61 GTATCAGCCGCCAGAGACGGCGATCTACAAGAAGCCAAAGCCCTCCTTGATTACAACCCG 120
21 -V--S--A--A--R--D--G--D--L--Q--E--A--K--A--L--L--D--Y--N--P- 40
121 AGA CTC GCT CGC TAT TCC ACT TTC GGC GTT CGT AAC TCT CCT CTC CAT TAC TCC GCC GCT 180
121 AGACTCGCTCGCTATTCCACTTTCGGCGTTCGTAACTCTCCTCTCCATTACTCCGCCGCT 180
41 -R--L--A--R--Y--S--T--F--G--V--R--N--S--P--L--H--Y--S--A--A- 60
181 CAA GGC CAC CAC GAG ATA GTT TCT TTG TTG GTG GAG TCA GGA GTT GAT ATC AAT CTC CGG 240
181 CAAGGCCACCACGAGATAGTTTCTTTGTTGGTGGAGTCAGGAGTTGATATCAATCTCCGG 240
61 -Q--G--H--H--E--I--V--S--L--L--V--E--S--G--V--D--I--N--L--R- 80
241 AAC TAT CGT GGA CAG ACG GCT TTG ATG CAA GCT TGT CAA CAT GGT CAT TGG GAG GTT GTC 300
241 AACTATCGTGGACAGACGGCTTTGATGCAAGCTTGTCAACATGGTCATTGGGAGGTTGTC 300
81 -N--Y--R--G--Q--T--A--L--M--Q--A--C--Q--H--G--H--W--E--V--V- 100
301 TTG ATT CTC ATC CTC TTT GGT GCT AAT A TT CAC AGA TCA GAT TAC CTT AAC GGT GGT ACT 360
301 TTGATTCTCATCCTCTTTGGTGCTAATATTCACAGATCAGATTACCTTAACGGTGGTACT 360
101 -L--I--L--I--L--F--G--A--N--I--H--R--S--D--Y--L--N--G--G--T- 120
361 GCT CTG CAT CTG GCG GCT CTA AAT GGT CAC CCT CGG TGT ATC AGG ATC TTG CTT TCC GAG 420
361 GCTCTGCATCTGGCGGCTCTAAATGGTCACCCTCGGTGTATCAGGATCTTGCTTTCCGAG 420
121 -A--L--H--L--A--A--L--N--G--H--P--R--C--I--R--I--L--L--S--E- 140
421 TAT ATA CCA AGT GTC CCT AAC TGC TGG AGC CTC TTG AAG AAT AGT AAA TCC TCT GTT TCT 480
421 TATATACCAAGTGTCCCTAACTGCTGGAGCCTCTTGAAGAATAGTAAATCCTCTGTTTCT 480
141 -Y--I--P--S--V--P--N--C--W--S--L--L--K--N--S--K--S--S--V--S- 160
481 GGA TTT GAT CCA AG T GTT ATT CAA GAA GTG ATA AAC AGA GCA GCA GAT GGA GGA ATC ACA 540
481 GGATTTGATCCAAGTGTTATTCAAGAAGTGATAAACAGAGCAGCAGATGGAGGAATCACA 540
161 -G--F--D--P--S--V--I--Q--E--V--I--N--R--A--A--D--G--G--I--T- 180
541 CCT CTT CAT GTA GCG GCT CTG AAC GGA CAC GTA GAG ACG GTG CAG TTA CTC TTG GAT TTG 600
541 CCTCTTCATGTAGCGGCTCTGAACGGACACGTAGAGACGGTGCAGTTACTCTTGGATTTG 600
181 -P--L--H--V--A--A--L--N--G--H--V--E--T--V--Q--L--L--L--D--L- 200
601 GGA GCT TCA CTT ACT CAG GTT ACT GTG GAA GAC GGA ACC ACA ATA GAT CTC ATA GGT GCT 660
601 GGAGCTTCACTTACTCAGGTTACTGTGGAAGACGGAACCACAATAGATCTCATAGGTGCT 660
201 -G--A--S--L--T--Q--V--T--V--E--D--G--T--T--I--D--L--I--G--A- 220
661 GGG AGT ACT CCT CTC CAT TAT GCT TCA TGT GGC GGA AAC ACC CAG TGT TGC CAG CTT TTG 720
661 GGGAGTACTCCTCTCCATTATGCTTCATGTGGCGGAAACACCCAGTGTTGCCAGCTTTTG 720
221 -G--S--T--P--L--H--Y--A--S--C--G--G--N--T--Q--C--C--Q--L--L- 240
721 ATC GAT AAG GGT GCC TCT TTA GCT GCC ATT AAC TCT AAC GG A TGG ACG CCA TTG ATG GTT 780
721 ATCGATAAGGGTGCCTCTTTAGCTGCCATTAACTCTAACGGATGGACGCCATTGATGGTT 780
241 -I--D--K--G--A--S--L--A--A--I--N--S--N--G--W--T--P--L--M--V- 260
781 GCT CGC TCA TGG CAC CGG AAC TGT CTT GAA GAA GTC CTG AAC CCA ACC ACA GAG CAG CCA 840
781 GCTCGCTCATGGCACCGGAACTGTCTTGAAGAAGTCCTGAACCCAACCACAGAGCAGCCA 840
261 -A--R--S--W--H--R--N--C--L--E--E--V--L--N--P--T--T--E--Q--P- 280
841 CAA AGC CAA CTG CCA AAA GTC CCT TCT CCT TTC CTC TGC CTT CCT CTA ATG AGC ATT GTC 900
841 CAAAGCCAACTGCCAAAAGTCCCTTCTCCTTTCCTCTGCCTTCCTCTAATGAGCATTGTC 900
281 -Q--S--Q--L--P--K--V--P--S--P--F--L--C--L--P--L--M--S--I--V- 300
901 AAG ATT GCT CA G GAA TGT GGC TGG AGA GGA GAT GAC TGT CTC ACT CCA TGC CGT GAC CCT 960
901 AAGATTGCTCAGGAATGTGGCTGGAGAGGAGATGACTGTCTCACTCCATGCCGTGACCCT 960
301 -K--I--A--Q--E--C--G--W--R--G--D--D--C--L--T--P--C--R--D--P- 320
961 TGC GCC GTT TGT TTG GAA AGA AAG TGC ACC GTA GCA GCA GAT G GA TGT GGT CAT GAG TTC 1020
961 TGCGCCGTTTGTTTGGAAAGAAAGTGCACCGTAGCAGCAGATGGATGTGGTCATGAGTTC 1020
321 -C--A--V--C--L--E--R--K--C--T--V--A--A--D--G--C--G--H--E--F- 340
1021 TGC ACT AAC TGT GCG TTA TAC CTA AGC ACC ACA AAC ATA ACA TCG TCA AAG ACA TCA AAA 1080
1021 TGCACTAACTGTGCGTTATACCTAAGCACCACAAACATAACATCGTCAAAGACATCAAAA 1080
341 -C--T--N--C--A--L--Y--L--S--T--T--N--I--T--S--S--K--T--S--K- 360
1081 GCT ACA CCA GGC TCA GTC CCA TGT CCT CTC TGT CGC TAC GGC ATT GTC TCT TTC ACC AAA 1140
1081 GCTACACCAGGCTCAGTCCCATGTCCTCTCTGTCGCTACGGCATTGTCTCTTTCACCAAA 1140
361 -A--T--P--G--S--V--P--C--P--L--C--R--Y--G--I--V--S--F--T--K- 380
1141 CTC CCC CAT ACG ATA CCA ACA ACA ACA GCA ACA TCA TCA AGA ACA AGC ATC TCC TTG TCC 1200
1141 CTCCCCCATACGATACCAACAACAACAGCAACATCATCAAGAACAAGCATCTCCTTGTCC 1200
381 -L--P--H--T--I--P--T--T--T--A--T--S--S--R--T--S--I--S--L--S- 400
1201 TTC TGC ACT TGC TCC TCC TCT GAT GTC TTG GAT ACA GGT GCT CTC CTC ACC GAC CCT CAC 1260
1201 TTCTGCACTTGCTCCTCCTCTGATGTCTTGGATACAGGTGCTCTCCTCACCGACCCTCAC 1260
401 -F--C--T--C--S--S--S--D--V--L--D--T--G--A--L--L--T--D--P--H- 420
1261 TAC AGC TGT AAA CCG GTT GTT TCA AGA ACC GGT TCA CAA TCC GTT GGG TCA TCG TCC TTT 1320
1261 TACAGCTGTAAACCGGTTGTTTCAAGAACCGGTTCACAATCCGTTGGGTCATCGTCCTTT 1320
421 -Y--S--C--K--P--V--V--S--R--T--G--S--Q--S--V--G--S--S--S--F- 440
1321 CGG TCT CTT AGC TGC CGG TTT CCT CCA AGT CTC TGC CTC GGT GGC TCG GAT GTT GTT GAA 1380
1321 CGGTCTCTTAGCTGCCGGTTTCCTCCAAGTCTCTGCCTCGGTGGCTCGGATGTTGTTGAA 1380
441 -R--S--L--S--C--R--F--P--P--S--L--C--L--G--G--S--D--V--V--E- 460
1381 CCG CAA AGC CGG TTA ATG AAT GGA TCA TAT TCA AGA TCC GGT TTA GGG TCC AGG AGA TCC 1440
1381 CCGCAAAGCCGGTTAATGAATGGATCATATTCAAGATCCGGTTTAGGGTCCAGGAGATCC 1440
461 -P--Q--S--R--L--M--N--G--S--Y--S--R--S--G--L--G--S--R--R--S- 480
1441 ACG TCG GAG GTT GAA GGG AAA CGT TCT TGG TTT TGT GCT CTT AAC CAT TGT GTT ACA ACC 1500
1441 ACGTCGGAGGTTGAAGGGAAACGTTCTTGGTTTTGTGCTCTTAACCATTGTGTTACAACC 1500
481 -T--S--E--V--E--G--K--R--S--W--F--C--A--L--N--H--C--V--T--T- 500
1501 GGT GGA AGT CCT TGC TAA 1518
1501 GGTGGAAGTCCTTGCTAA 1518
501 -G--G--S--P--C--*- 505
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