Brassica oleracea (BOL)
Description

XBAT32 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G57740) UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178UH83]

Location
About this transcript

This transcript has 9 exons and is annotated with 37 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene Bo2g029110 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-Bo2g029110.11518505aa
 
Protein coding
A0A0D3ALD7 -Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Other
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Markup
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     1 ATGAGGTTTCTGAGCCTCGTCGGAAACTCATTCGGTTGCTCCGCGTCCGGCGAGCGATTA     60
     1 ATGAGGTTTCTGAGCCTCGTCGGAAACTCATTCGGTTGCTCCGCGTCCGGCGAGCGATTA     60
     1 -M--R--F--L--S--L--V--G--N--S--F--G--C--S--A--S--G--E--R--L-     20

                                                                          
    61 GTATCAGCCGCCAGAGACGGCGATCTACAAGAAGCCAAAGCCCTCCTTGATTACAACCCG    120
    61 GTATCAGCCGCCAGAGACGGCGATCTACAAGAAGCCAAAGCCCTCCTTGATTACAACCCG    120
    21 -V--S--A--A--R--D--G--D--L--Q--E--A--K--A--L--L--D--Y--N--P-     40

                                                                          
   121 AGACTCGCTCGCTATTCCACTTTCGGCGTTCGTAACTCTCCTCTCCATTACTCCGCCGCT    180
   121 AGACTCGCTCGCTATTCCACTTTCGGCGTTCGTAACTCTCCTCTCCATTACTCCGCCGCT    180
    41 -R--L--A--R--Y--S--T--F--G--V--R--N--S--P--L--H--Y--S--A--A-     60

                                                                          
   181 CAAGGCCACCACGAGATAGTTTCTTTGTTGGTGGAGTCAGGAGTTGATATCAATCTCCGG    240
   181 CAAGGCCACCACGAGATAGTTTCTTTGTTGGTGGAGTCAGGAGTTGATATCAATCTCCGG    240
    61 -Q--G--H--H--E--I--V--S--L--L--V--E--S--G--V--D--I--N--L--R-     80

                                                                          
   241 AACTATCGTGGACAGACGGCTTTGATGCAAGCTTGTCAACATGGTCATTGGGAGGTTGTC    300
   241 AACTATCGTGGACAGACGGCTTTGATGCAAGCTTGTCAACATGGTCATTGGGAGGTTGTC    300
    81 -N--Y--R--G--Q--T--A--L--M--Q--A--C--Q--H--G--H--W--E--V--V-    100

                                                                          
   301 TTGATTCTCATCCTCTTTGGTGCTAATATTCACAGATCAGATTACCTTAACGGTGGTACT    360
   301 TTGATTCTCATCCTCTTTGGTGCTAATATTCACAGATCAGATTACCTTAACGGTGGTACT    360
   101 -L--I--L--I--L--F--G--A--N--I--H--R--S--D--Y--L--N--G--G--T-    120

                                                                          
   361 GCTCTGCATCTGGCGGCTCTAAATGGTCACCCTCGGTGTATCAGGATCTTGCTTTCCGAG    420
   361 GCTCTGCATCTGGCGGCTCTAAATGGTCACCCTCGGTGTATCAGGATCTTGCTTTCCGAG    420
   121 -A--L--H--L--A--A--L--N--G--H--P--R--C--I--R--I--L--L--S--E-    140

                                                                          
   421 TATATACCAAGTGTCCCTAACTGCTGGAGCCTCTTGAAGAATAGTAAATCCTCTGTTTCT    480
   421 TATATACCAAGTGTCCCTAACTGCTGGAGCCTCTTGAAGAATAGTAAATCCTCTGTTTCT    480
   141 -Y--I--P--S--V--P--N--C--W--S--L--L--K--N--S--K--S--S--V--S-    160

                                                                          
   481 GGATTTGATCCAAGTGTTATTCAAGAAGTGATAAACAGAGCAGCAGATGGAGGAATCACA    540
   481 GGATTTGATCCAAGTGTTATTCAAGAAGTGATAAACAGAGCAGCAGATGGAGGAATCACA    540
   161 -G--F--D--P--S--V--I--Q--E--V--I--N--R--A--A--D--G--G--I--T-    180

                                                                          
   541 CCTCTTCATGTAGCGGCTCTGAACGGACACGTAGAGACGGTGCAGTTACTCTTGGATTTG    600
   541 CCTCTTCATGTAGCGGCTCTGAACGGACACGTAGAGACGGTGCAGTTACTCTTGGATTTG    600
   181 -P--L--H--V--A--A--L--N--G--H--V--E--T--V--Q--L--L--L--D--L-    200

                                                                          
   601 GGAGCTTCACTTACTCAGGTTACTGTGGAAGACGGAACCACAATAGATCTCATAGGTGCT    660
   601 GGAGCTTCACTTACTCAGGTTACTGTGGAAGACGGAACCACAATAGATCTCATAGGTGCT    660
   201 -G--A--S--L--T--Q--V--T--V--E--D--G--T--T--I--D--L--I--G--A-    220

                                                                          
   661 GGGAGTACTCCTCTCCATTATGCTTCATGTGGCGGAAACACCCAGTGTTGCCAGCTTTTG    720
   661 GGGAGTACTCCTCTCCATTATGCTTCATGTGGCGGAAACACCCAGTGTTGCCAGCTTTTG    720
   221 -G--S--T--P--L--H--Y--A--S--C--G--G--N--T--Q--C--C--Q--L--L-    240

                                                                          
   721 ATCGATAAGGGTGCCTCTTTAGCTGCCATTAACTCTAACGGATGGACGCCATTGATGGTT    780
   721 ATCGATAAGGGTGCCTCTTTAGCTGCCATTAACTCTAACGGATGGACGCCATTGATGGTT    780
   241 -I--D--K--G--A--S--L--A--A--I--N--S--N--G--W--T--P--L--M--V-    260

                                                                          
   781 GCTCGCTCATGGCACCGGAACTGTCTTGAAGAAGTCCTGAACCCAACCACAGAGCAGCCA    840
   781 GCTCGCTCATGGCACCGGAACTGTCTTGAAGAAGTCCTGAACCCAACCACAGAGCAGCCA    840
   261 -A--R--S--W--H--R--N--C--L--E--E--V--L--N--P--T--T--E--Q--P-    280

                                                                          
   841 CAAAGCCAACTGCCAAAAGTCCCTTCTCCTTTCCTCTGCCTTCCTCTAATGAGCATTGTC    900
   841 CAAAGCCAACTGCCAAAAGTCCCTTCTCCTTTCCTCTGCCTTCCTCTAATGAGCATTGTC    900
   281 -Q--S--Q--L--P--K--V--P--S--P--F--L--C--L--P--L--M--S--I--V-    300

                                                                          
   901 AAGATTGCTCAGGAATGTGGCTGGAGAGGAGATGACTGTCTCACTCCATGCCGTGACCCT    960
   901 AAGATTGCTCAGGAATGTGGCTGGAGAGGAGATGACTGTCTCACTCCATGCCGTGACCCT    960
   301 -K--I--A--Q--E--C--G--W--R--G--D--D--C--L--T--P--C--R--D--P-    320

                                                                          
   961 TGCGCCGTTTGTTTGGAAAGAAAGTGCACCGTAGCAGCAGATGGATGTGGTCATGAGTTC   1020
   961 TGCGCCGTTTGTTTGGAAAGAAAGTGCACCGTAGCAGCAGATGGATGTGGTCATGAGTTC   1020
   321 -C--A--V--C--L--E--R--K--C--T--V--A--A--D--G--C--G--H--E--F-    340

                                                                          
  1021 TGCACTAACTGTGCGTTATACCTAAGCACCACAAACATAACATCGTCAAAGACATCAAAA   1080
  1021 TGCACTAACTGTGCGTTATACCTAAGCACCACAAACATAACATCGTCAAAGACATCAAAA   1080
   341 -C--T--N--C--A--L--Y--L--S--T--T--N--I--T--S--S--K--T--S--K-    360

                                                                          
  1081 GCTACACCAGGCTCAGTCCCATGTCCTCTCTGTCGCTACGGCATTGTCTCTTTCACCAAA   1140
  1081 GCTACACCAGGCTCAGTCCCATGTCCTCTCTGTCGCTACGGCATTGTCTCTTTCACCAAA   1140
   361 -A--T--P--G--S--V--P--C--P--L--C--R--Y--G--I--V--S--F--T--K-    380

                                                                          
  1141 CTCCCCCATACGATACCAACAACAACAGCAACATCATCAAGAACAAGCATCTCCTTGTCC   1200
  1141 CTCCCCCATACGATACCAACAACAACAGCAACATCATCAAGAACAAGCATCTCCTTGTCC   1200
   381 -L--P--H--T--I--P--T--T--T--A--T--S--S--R--T--S--I--S--L--S-    400

                                                                          
  1201 TTCTGCACTTGCTCCTCCTCTGATGTCTTGGATACAGGTGCTCTCCTCACCGACCCTCAC   1260
  1201 TTCTGCACTTGCTCCTCCTCTGATGTCTTGGATACAGGTGCTCTCCTCACCGACCCTCAC   1260
   401 -F--C--T--C--S--S--S--D--V--L--D--T--G--A--L--L--T--D--P--H-    420

                                                                          
  1261 TACAGCTGTAAACCGGTTGTTTCAAGAACCGGTTCACAATCCGTTGGGTCATCGTCCTTT   1320
  1261 TACAGCTGTAAACCGGTTGTTTCAAGAACCGGTTCACAATCCGTTGGGTCATCGTCCTTT   1320
   421 -Y--S--C--K--P--V--V--S--R--T--G--S--Q--S--V--G--S--S--S--F-    440

                                                                          
  1321 CGGTCTCTTAGCTGCCGGTTTCCTCCAAGTCTCTGCCTCGGTGGCTCGGATGTTGTTGAA   1380
  1321 CGGTCTCTTAGCTGCCGGTTTCCTCCAAGTCTCTGCCTCGGTGGCTCGGATGTTGTTGAA   1380
   441 -R--S--L--S--C--R--F--P--P--S--L--C--L--G--G--S--D--V--V--E-    460

                                                                          
  1381 CCGCAAAGCCGGTTAATGAATGGATCATATTCAAGATCCGGTTTAGGGTCCAGGAGATCC   1440
  1381 CCGCAAAGCCGGTTAATGAATGGATCATATTCAAGATCCGGTTTAGGGTCCAGGAGATCC   1440
   461 -P--Q--S--R--L--M--N--G--S--Y--S--R--S--G--L--G--S--R--R--S-    480

                                                                          
  1441 ACGTCGGAGGTTGAAGGGAAACGTTCTTGGTTTTGTGCTCTTAACCATTGTGTTACAACC   1500
  1441 ACGTCGGAGGTTGAAGGGAAACGTTCTTGGTTTTGTGCTCTTAACCATTGTGTTACAACC   1500
   481 -T--S--E--V--E--G--K--R--S--W--F--C--A--L--N--H--C--V--T--T-    500

                                                                          
  1501 GGTGGAAGTCCTTGCTAA                                             1518
  1501 GGTGGAAGTCCTTGCTAA                                             1518
   501 -G--G--S--P--C--*-                                              505