Transcript: AT5G67170.2 AT5G67170-202
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Description
SEC-C motif-containing protein / OTU-like cysteine protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836852 ]
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AT5G67170-203 AT5G67170.1 1415 375aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A654GEU0 F4K3M6 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, AT5G67170-201 AT5G67170.3 1320 295aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A1P8BBA2 - - AT5G67170-202 AT5G67170.2 1215 375aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A654GEU0 F4K3M6 - -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 GCGGCGACGAAACCGTCCTCATTGCGCCGCCGCAACTACCCGACAAACAACTAGCTTTCG 60
............................................................
............................................................
61 TATTACTTCCTTGTATCTGATTTGATA ATG GCG AAA ACT AAA CAA CAG AAA TCT AAG CCT 120
...........................ATGGCGAAAACTAAACAACAGAAATCTAAGCCT 33
...........................-M--A--K--T--K--Q--Q--K--S--K--P- 11
121 AAG AAA CAA CCG CAT CAG A AG CAA GGA AAG GAT TGT GAT CTC TCT CAA TTT CGT GCT CAG 180
34 AAGAAACAACCGCATCAGAAGCAAGGAAAGGATTGTGATCTCTCTCAATTTCGTGCTCAG 93
12 -K--K--Q--P--H--Q--K--Q--G--K--D--C--D--L--S--Q--F--R--A--Q- 31
181 CTT GAC GCT TTA GGG CTT AAG ATT ATC CAA GTG ACT GCT GAC GGT AAT TGT TTC TTC AG A 240
94 CTTGACGCTTTAGGGCTTAAGATTATCCAAGTGACTGCTGACGGTAATTGTTTCTTCAGA 153
32 -L--D--A--L--G--L--K--I--I--Q--V--T--A--D--G--N--C--F--F--R- 51
241 GCA ATT GCT GAT CAA TTA GAA GGC AAT GAG GAT GAA CAC AAC AAG TAC CGT AAC ATG ATT 300
154 GCAATTGCTGATCAATTAGAAGGCAATGAGGATGAACACAACAAGTACCGTAACATGATT 213
52 -A--I--A--D--Q--L--E--G--N--E--D--E--H--N--K--Y--R--N--M--I- 71
301 GTA CTT TAT ATA GTG AAA AAT CGT GAA ATG TTC GAG CCT TTT ATC GAA GAT GAT GTT CCT 360
214 GTACTTTATATAGTGAAAAATCGTGAAATGTTCGAGCCTTTTATCGAAGATGATGTTCCT 273
72 -V--L--Y--I--V--K--N--R--E--M--F--E--P--F--I--E--D--D--V--P- 91
361 TTT GAG GAT TAC TGT AAA ACC ATG GAC GAT GAT GGA ACT TGG GCT GGG AAT ATG GAA TTA 420
274 TTTGAGGATTACTGTAAAACCATGGACGATGATGGAACTTGGGCTGGGAATATGGAATTA 333
92 -F--E--D--Y--C--K--T--M--D--D--D--G--T--W--A--G--N--M--E--L- 111
421 CAA GCA GCT TCT CTT GTC ACT CGC AGT AAT ATA TGT ATT CAC AGG AAC ATG TCA CCG CGT 480
334 CAAGCAGCTTCTCTTGTCACTCGCAGTAATATATGTATTCACAGGAACATGTCACCGCGT 393
112 -Q--A--A--S--L--V--T--R--S--N--I--C--I--H--R--N--M--S--P--R- 131
481 TGG TAT ATA CGC AAC TTT GAA GAT ACG CGA ACC CGC ATG ATC CAT CT G TCT TAC CAT GAT 540
394 TGGTATATACGCAACTTTGAAGATACGCGAACCCGCATGATCCATCTGTCTTACCATGAT 453
132 -W--Y--I--R--N--F--E--D--T--R--T--R--M--I--H--L--S--Y--H--D- 151
541 GGG GAA CAC TAC AAC AGT GTG CGT TCC AAG GAA GAT GCT TGT GGA GGA CCA GCC AGG CCT 600
454 GGGGAACACTACAACAGTGTGCGTTCCAAGGAAGATGCTTGTGGAGGACCAGCCAGGCCT 513
152 -G--E--H--Y--N--S--V--R--S--K--E--D--A--C--G--G--P--A--R--P- 171
601 GTT GTA ATA GAG G CT GAT GCT AAA GTT TCA GCA GCA TCT AAA CAA GCG AAA GCT ACA GAG 660
514 GTTGTAATAGAGGCTGATGCTAAAGTTTCAGCAGCATCTAAACAAGCGAAAGCTACAGAG 573
172 -V--V--I--E--A--D--A--K--V--S--A--A--S--K--Q--A--K--A--T--E- 191
661 AGC AAG TCC AAA AAT AAA GCT GAT AAG TGT CAT GTG AAT GCT GGA GCT ATC AAA GTT GTC 720
574 AGCAAGTCCAAAAATAAAGCTGATAAGTGTCATGTGAATGCTGGAGCTATCAAAGTTGTC 633
192 -S--K--S--K--N--K--A--D--K--C--H--V--N--A--G--A--I--K--V--V- 211
721 ATG TCT GGT AGT TGT TGT GAC AAT ACT GAG AAA GCT GAA CAG GTT CTA TTA CAA GTT AAT 780
634 ATGTCTGGTAGTTGTTGTGACAATACTGAGAAAGCTGAACAGGTTCTATTACAAGTTAAT 693
212 -M--S--G--S--C--C--D--N--T--E--K--A--E--Q--V--L--L--Q--V--N- 231
781 GGT GAT GTG GAT GCT GCT ATA GAA TTC CTG ATA GCA GAC CAA GGA ATG GAG TCT TTG ACT 840
694 GGTGATGTGGATGCTGCTATAGAATTCCTGATAGCAGACCAAGGAATGGAGTCTTTGACT 753
232 -G--D--V--D--A--A--I--E--F--L--I--A--D--Q--G--M--E--S--L--T- 251
841 GAA AAT GAT ACA GAA ACC GCC TCT GCA TCA GAT ACC ATC AAC CCA AAG CAT GCA AGT GAT 900
754 GAAAATGATACAGAAACCGCCTCTGCATCAGATACCATCAACCCAAAGCATGCAAGTGAT 813
252 -E--N--D--T--E--T--A--S--A--S--D--T--I--N--P--K--H--A--S--D- 271
901 AGT CCA ATG GAA AAC ACC GAG CAA GCC AGA GAA GAA TTG ATA GAG GAG GAA TCA GCT AGC 960
814 AGTCCAATGGAAAACACCGAGCAAGCCAGAGAAGAATTGATAGAGGAGGAATCAGCTAGC 873
272 -S--P--M--E--N--T--E--Q--A--R--E--E--L--I--E--E--E--S--A--S- 291
961 GGC AAT AAC AGT GAA ACA GTC CAA GCC AAG TGC ACT ACA CAG ACC GAT GAT AAG A AG ATC 1020
874 GGCAATAACAGTGAAACAGTCCAAGCCAAGTGCACTACACAGACCGATGATAAGAAGATC 933
292 -G--N--N--S--E--T--V--Q--A--K--C--T--T--Q--T--D--D--K--K--I- 311
1021 CCA AGG AAT AAA ACA TGT CCA TGT GGT TCA AAG AAG AAA TAC AAG TCC TGC TGT GGA ACA 1080
934 CCAAGGAATAAAACATGTCCATGTGGTTCAAAGAAGAAATACAAGTCCTGCTGTGGAACA 993
312 -P--R--N--K--T--C--P--C--G--S--K--K--K--Y--K--S--C--C--G--T- 331
1081 GCA ACT GGG AGA TCC TCT GTA AAA CTG TTA GT G AGC CAA ACA ATG GAG TCG AAG AAG GGG 1140
994 GCAACTGGGAGATCCTCTGTAAAACTGTTAGTGAGCCAAACAATGGAGTCGAAGAAGGGG 1053
332 -A--T--G--R--S--S--V--K--L--L--V--S--Q--T--M--E--S--K--K--G- 351
1141 AGA AAG AAT TTG AGA AGA GGA ACA TCG AAT GAA GTT GAA GCA AAT GCA CCA GAT GTT GGT 1200
1054 AGAAAGAATTTGAGAAGAGGAACATCGAATGAAGTTGAAGCAAATGCACCAGATGTTGGT 1113
352 -R--K--N--L--R--R--G--T--S--N--E--V--E--A--N--A--P--D--V--G- 371
1201 GCT CTT TGT ATA TAA 1215
1114 GCTCTTTGTATATAA 1128
372 -A--L--C--I--*- 375
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