Arabidopsis thaliana (TAIR10)
Description

SEC-C motif-containing protein / OTU-like cysteine protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836852]

Location
About this transcript

This transcript has 10 exons, is annotated with 20 domains and features, is associated with 84 variant alleles and maps to 37 oligo probes.

Gene

This transcript is a product of gene AT5G67170 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
AT5G67170-203AT5G67170.11415375aa
 
Protein coding
A0A654GEU0 F4K3M6 -Ensembl Canonical
AT5G67170-201AT5G67170.31320295aa
 
Protein coding
A0A1P8BBA2 --
AT5G67170-202AT5G67170.21215375aa
 
Protein coding
A0A654GEU0 F4K3M6 --
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
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Markup
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     1 GCGGCGACGAAACCGTCCTCATTGCGCCGCCGCAACTACCCGACAAACAACTAGCTTTCG     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 TATTACTTCCTTGTATCTGATTTGATAATGGCGAAAACTAAACAACAGAAATCTAAGCCT    120
       ...........................ATGGCGAAAACTAAACAACAGAAATCTAAGCCT     33
       ...........................-M--A--K--T--K--Q--Q--K--S--K--P-     11

                                                                          
   121 AAGAAACAACCGCATCAGAAGCAAGGAAAGGATTGTGATCTCTCTCAATTTCGTGCTCAG    180
    34 AAGAAACAACCGCATCAGAAGCAAGGAAAGGATTGTGATCTCTCTCAATTTCGTGCTCAG     93
    12 -K--K--Q--P--H--Q--K--Q--G--K--D--C--D--L--S--Q--F--R--A--Q-     31

                                                                          
   181 CTTGACGCTTTAGGGCTTAAGATTATCCAAGTGACTGCTGACGGTAATTGTTTCTTCAGA    240
    94 CTTGACGCTTTAGGGCTTAAGATTATCCAAGTGACTGCTGACGGTAATTGTTTCTTCAGA    153
    32 -L--D--A--L--G--L--K--I--I--Q--V--T--A--D--G--N--C--F--F--R-     51

                                                                          
   241 GCAATTGCTGATCAATTAGAAGGCAATGAGGATGAACACAACAAGTACCGTAACATGATT    300
   154 GCAATTGCTGATCAATTAGAAGGCAATGAGGATGAACACAACAAGTACCGTAACATGATT    213
    52 -A--I--A--D--Q--L--E--G--N--E--D--E--H--N--K--Y--R--N--M--I-     71

                                                                          
   301 GTACTTTATATAGTGAAAAATCGTGAAATGTTCGAGCCTTTTATCGAAGATGATGTTCCT    360
   214 GTACTTTATATAGTGAAAAATCGTGAAATGTTCGAGCCTTTTATCGAAGATGATGTTCCT    273
    72 -V--L--Y--I--V--K--N--R--E--M--F--E--P--F--I--E--D--D--V--P-     91

                                                                          
   361 TTTGAGGATTACTGTAAAACCATGGACGATGATGGAACTTGGGCTGGGAATATGGAATTA    420
   274 TTTGAGGATTACTGTAAAACCATGGACGATGATGGAACTTGGGCTGGGAATATGGAATTA    333
    92 -F--E--D--Y--C--K--T--M--D--D--D--G--T--W--A--G--N--M--E--L-    111

                                                                          
   421 CAAGCAGCTTCTCTTGTCACTCGCAGTAATATATGTATTCACAGGAACATGTCACCGCGT    480
   334 CAAGCAGCTTCTCTTGTCACTCGCAGTAATATATGTATTCACAGGAACATGTCACCGCGT    393
   112 -Q--A--A--S--L--V--T--R--S--N--I--C--I--H--R--N--M--S--P--R-    131

                                                                          
   481 TGGTATATACGCAACTTTGAAGATACGCGAACCCGCATGATCCATCTGTCTTACCATGAT    540
   394 TGGTATATACGCAACTTTGAAGATACGCGAACCCGCATGATCCATCTGTCTTACCATGAT    453
   132 -W--Y--I--R--N--F--E--D--T--R--T--R--M--I--H--L--S--Y--H--D-    151

                                                                          
   541 GGGGAACACTACAACAGTGTGCGTTCCAAGGAAGATGCTTGTGGAGGACCAGCCAGGCCT    600
   454 GGGGAACACTACAACAGTGTGCGTTCCAAGGAAGATGCTTGTGGAGGACCAGCCAGGCCT    513
   152 -G--E--H--Y--N--S--V--R--S--K--E--D--A--C--G--G--P--A--R--P-    171

                                                                          
   601 GTTGTAATAGAGGCTGATGCTAAAGTTTCAGCAGCATCTAAACAAGCGAAAGCTACAGAG    660
   514 GTTGTAATAGAGGCTGATGCTAAAGTTTCAGCAGCATCTAAACAAGCGAAAGCTACAGAG    573
   172 -V--V--I--E--A--D--A--K--V--S--A--A--S--K--Q--A--K--A--T--E-    191

                                                                          
   661 AGCAAGTCCAAAAATAAAGCTGATAAGTGTCATGTGAATGCTGGAGCTATCAAAGTTGTC    720
   574 AGCAAGTCCAAAAATAAAGCTGATAAGTGTCATGTGAATGCTGGAGCTATCAAAGTTGTC    633
   192 -S--K--S--K--N--K--A--D--K--C--H--V--N--A--G--A--I--K--V--V-    211

                                                                          
   721 ATGTCTGGTAGTTGTTGTGACAATACTGAGAAAGCTGAACAGGTTCTATTACAAGTTAAT    780
   634 ATGTCTGGTAGTTGTTGTGACAATACTGAGAAAGCTGAACAGGTTCTATTACAAGTTAAT    693
   212 -M--S--G--S--C--C--D--N--T--E--K--A--E--Q--V--L--L--Q--V--N-    231

                                                                          
   781 GGTGATGTGGATGCTGCTATAGAATTCCTGATAGCAGACCAAGGAATGGAGTCTTTGACT    840
   694 GGTGATGTGGATGCTGCTATAGAATTCCTGATAGCAGACCAAGGAATGGAGTCTTTGACT    753
   232 -G--D--V--D--A--A--I--E--F--L--I--A--D--Q--G--M--E--S--L--T-    251

                                                                          
   841 GAAAATGATACAGAAACCGCCTCTGCATCAGATACCATCAACCCAAAGCATGCAAGTGAT    900
   754 GAAAATGATACAGAAACCGCCTCTGCATCAGATACCATCAACCCAAAGCATGCAAGTGAT    813
   252 -E--N--D--T--E--T--A--S--A--S--D--T--I--N--P--K--H--A--S--D-    271

                                                                          
   901 AGTCCAATGGAAAACACCGAGCAAGCCAGAGAAGAATTGATAGAGGAGGAATCAGCTAGC    960
   814 AGTCCAATGGAAAACACCGAGCAAGCCAGAGAAGAATTGATAGAGGAGGAATCAGCTAGC    873
   272 -S--P--M--E--N--T--E--Q--A--R--E--E--L--I--E--E--E--S--A--S-    291

                                                                          
   961 GGCAATAACAGTGAAACAGTCCAAGCCAAGTGCACTACACAGACCGATGATAAGAAGATC   1020
   874 GGCAATAACAGTGAAACAGTCCAAGCCAAGTGCACTACACAGACCGATGATAAGAAGATC    933
   292 -G--N--N--S--E--T--V--Q--A--K--C--T--T--Q--T--D--D--K--K--I-    311

                                                                          
  1021 CCAAGGAATAAAACATGTCCATGTGGTTCAAAGAAGAAATACAAGTCCTGCTGTGGAACA   1080
   934 CCAAGGAATAAAACATGTCCATGTGGTTCAAAGAAGAAATACAAGTCCTGCTGTGGAACA    993
   312 -P--R--N--K--T--C--P--C--G--S--K--K--K--Y--K--S--C--C--G--T-    331

                                                                          
  1081 GCAACTGGGAGATCCTCTGTAAAACTGTTAGTGAGCCAAACAATGGAGTCGAAGAAGGGG   1140
   994 GCAACTGGGAGATCCTCTGTAAAACTGTTAGTGAGCCAAACAATGGAGTCGAAGAAGGGG   1053
   332 -A--T--G--R--S--S--V--K--L--L--V--S--Q--T--M--E--S--K--K--G-    351

                                                                          
  1141 AGAAAGAATTTGAGAAGAGGAACATCGAATGAAGTTGAAGCAAATGCACCAGATGTTGGT   1200
  1054 AGAAAGAATTTGAGAAGAGGAACATCGAATGAAGTTGAAGCAAATGCACCAGATGTTGGT   1113
   352 -R--K--N--L--R--R--G--T--S--N--E--V--E--A--N--A--P--D--V--G-    371

                                                                          
  1201 GCTCTTTGTATATAA                                                1215
  1114 GCTCTTTGTATATAA                                                1128
   372 -A--L--C--I--*-                                                 375