Transcript: AT5G54200.1 AT5G54200-201
.
Description
Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835508 ]
Show/hide columns (1 hidden)
AT5G54200-201 AT5G54200.1 3139 825aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A654GAU1 Q9FK21 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
CCTCCTTCCTCTCTCTGGAGTCTGGACATTAAACACTAAAACAGTTTATTTCTATTTTTC ............................................................ ............................................................ TCTTTCCTCTCTCCATTAATCTCCGATCTGACTCCTCTCTTACTCAACCTCCATTGGCGA ............................................................ ............................................................ ACTTCGTTTTTGATTCTCGTAATCCCTAATTCCTCTTCTCGAACCTCTCACAGTCAAAAA ............................................................ ............................................................ TTTCTCCAACCAAAGACTGTAGCAGAGAGAGACAAAGTCATTTTCAGATGATAATACTTT ............................................................ ............................................................ TGCTTCAGTC ATG ATG AAG ATG ATG ATG ATG AAT CGA AGA CGA AGC AAC GTC GTT AGA TT ..........ATGATGAAGATGATGATGATGAATCGAAGACGAAGCAACGTCGTTAGATT ..........-M--M--K--M--M--M--M--N--R--R--R--S--N--V--V--R--F T GAA GCT AAG AAA GAA GAC AAA GTA GAA GAA GAA GAT AAC AAT GAC GAT TGT TTC TAT GA TGAAGCTAAGAAAGAAGACAAAGTAGAAGAAGAAGATAACAATGACGATTGTTTCTATGA --E--A--K--K--E--D--K--V--E--E--E--D--N--N--D--D--C--F--Y--E G TCT CTA GAT CGT GTA CTA TCG TCT TGC TCT TGT TCA ACT TCA AAC TCT GAT TAC GAC TC GTCTCTAGATCGTGTACTATCGTCTTGCTCTTGTTCAACTTCAAACTCTGATTACGACTC --S--L--D--R--V--L--S--S--C--S--C--S--T--S--N--S--D--Y--D--S T GAC CCG AAT GTT TCC GAT TCG ATC CAC GAT CCG ACT CCG TTT CCT GTT CCT ATG TTT AC TGACCCGAATGTTTCCGATTCGATCCACGATCCGACTCCGTTTCCTGTTCCTATGTTTAC --D--P--N--V--S--D--S--I--H--D--P--T--P--F--P--V--P--M--F--T C TCT GGG TTC GAG CTG TGG AAA TCT GAG CCT GAA TCT GTG TCG GAG AGA CGA ATC AGG TT CTCTGGGTTCGAGCTGTGGAAATCTGAGCCTGAATCTGTGTCGGAGAGACGAATCAGGTT --S--G--F--E--L--W--K--S--E--P--E--S--V--S--E--R--R--I--R--L A TTG CGT GGT TTG GGA CTT AGT AAT GAG CCG GAT CTA CCT CCG GCG AGT CAG TTA CGT TC ATTGCGTGGTTTGGGACTTAGTAATGAGCCGGATCTACCTCCGGCGAGTCAGTTACGTTC --L--R--G--L--G--L--S--N--E--P--D--L--P--P--A--S--Q--L--R--S T AGA AGT CGG AGA AAC AGT TCT CAT TTC TCT AGA TCG GTT CCT TCT GAT GTT TTG ACT TC TAGAAGTCGGAGAAACAGTTCTCATTTCTCTAGATCGGTTCCTTCTGATGTTTTGACTTC --R--S--R--R--N--S--S--H--F--S--R--S--V--P--S--D--V--L--T--S G AAT CAT CAT GGT AAA TGT GTG TTG AGA TCA GAT GTA TCA GGT ACT GAC AAT GTC GAT CG GAATCATCATGGTAAATGTGTGTTGAGATCAGATGTATCAGGTACTGACAATGTCGATCG --N--H--H--G--K--C--V--L--R--S--D--V--S--G--T--D--N--V--D--R A GAG TAT ACT GGA TCT CGT ATG CGA AAC GAT GGT GTT GAT TTT ATA AGC AAA GAG CCA AT AGAGTATACTGGATCTCGTATGCGAAACGATGGTGTTGATTTTATAAGCAAAGAGCCAAT --E--Y--T--G--S--R--M--R--N--D--G--V--D--F--I--S--K--E--P--M G GAA AGA TCT CTT AGG GAC ATT GTA GAG AAA GAG AAT GGT AGA GAT GTT GTT TTA GAG GA GGAAAGATCTCTTAGGGACATTGTAGAGAAAGAGAATGGTAGAGATGTTGTTTTAGAGGA --E--R--S--L--R--D--I--V--E--K--E--N--G--R--D--V--V--L--E--E G CAA ATG TGT ACT ATT AGG AAT TTA GAT ACT GGG AGA GAG TTT GTG GTG AAT GAA GTT CG GCAAATGTGTACTATTAGGAATTTAGATACTGGGAGAGAGTTTGTGGTGAATGAAGTTCG --Q--M--C--T--I--R--N--L--D--T--G--R--E--F--V--V--N--E--V--R A GAA GAT GGG ATG TTG GAG AGG TTG AAG GAA GTA GGT ACT GAT CGG CAA TTG ACT CTG GA AGAAGATGGGATGTTGGAGAGGTTGAAGGAAGTAGGTACTGATCGGCAATTGACTCTGGA --E--D--G--M--L--E--R--L--K--E--V--G--T--D--R--Q--L--T--L--E G GAG TTT GAG ATT TGT GTT GGT ACG TCA CCG ATT GTG CTT GAG TTG ATG AGG AGG CAA AA GGAGTTTGAGATTTGTGTTGGTACGTCACCGATTGTGCTTGAGTTGATGAGGAGGCAAAA --E--F--E--I--C--V--G--T--S--P--I--V--L--E--L--M--R--R--Q--N T GTT GAA GAT GTT TGT AAA GAC TCT GTG GAT TTG GAT ACT AAT GTT AGT GGA AGC AGG GT TGTTGAAGATGTTTGTAAAGACTCTGTGGATTTGGATACTAATGTTAGTGGAAGCAGGGT --V--E--D--V--C--K--D--S--V--D--L--D--T--N--V--S--G--S--R--V G ACT AAA CAT AGA AGG AGA GGG AGT TGG TTA AAG AGT ATT AAG AAT GTT GCT AGT AGT GT GACTAAACATAGAAGGAGAGGGAGTTGGTTAAAGAGTATTAAGAATGTTGCTAGTAGTGT --T--K--H--R--R--R--G--S--W--L--K--S--I--K--N--V--A--S--S--V G ACT GGG TAT AAA GAG CGA CGG AGC ACC GAT GAT AGG GAT TCA CCG TCT GAG AGA GGT GG GACTGGGTATAAAGAGCGACGGAGCACCGATGATAGGGATTCACCGTCTGAGAGAGGTGG --T--G--Y--K--E--R--R--S--T--D--D--R--D--S--P--S--E--R--G--G T CAG AGG TTT AGC TCT GCA ACT GAT GAT AGT CGA GAT ATG TCT TTT CAT GAC CCT GAG AG TCAGAGGTTTAGCTCTGCAACTGATGATAGTCGAGATATGTCTTTTCATGACCCTGAGAG --Q--R--F--S--S--A--T--D--D--S--R--D--M--S--F--H--D--P--E--R A GTT AAG GTT AGG CAG TAT GGG AAG TCG TGT AAA GAG CTT ACT GCA CTT TTC AAG AGT CA AGTTAAGGTTAGGCAGTATGGGAAGTCGTGTAAAGAGCTTACTGCACTTTTCAAGAGTCA --V--K--V--R--Q--Y--G--K--S--C--K--E--L--T--A--L--F--K--S--Q A GAG ATT CAA GCT CAT AAA GGA TCG ATA TGG AGT ATT AAG TTT AGT TTG GAT GGG AGG TA AGAGATTCAAGCTCATAAAGGATCGATATGGAGTATTAAGTTTAGTTTGGATGGGAGGTA --E--I--Q--A--H--K--G--S--I--W--S--I--K--F--S--L--D--G--R--Y T CTT GCT AGT GCT GGT GAG GAT TGT GTT ATT CAG ATT TGG AAG GTT GTT GAG TCA GAA AG TCTTGCTAGTGCTGGTGAGGATTGTGTTATTCAGATTTGGAAGGTTGTTGAGTCAGAAAG --L--A--S--A--G--E--D--C--V--I--Q--I--W--K--V--V--E--S--E--R A AAA GGG GAA CTC TTG TCG ATG GAT AAA CAA GAA GAT GGA AGT ATA AAT TTG TTT CTT TT AAAAGGGGAACTCTTGTCGATGGATAAACAAGAAGATGGAAGTATAAATTTGTTTCTTTT --K--G--E--L--L--S--M--D--K--Q--E--D--G--S--I--N--L--F--L--L A GCA AAT GGA TCA CCC GAA CCC GTT TCA ATG TCT CCA AAG AGA AGA GGA AGA ACA TCT TT AGCAAATGGATCACCCGAACCCGTTTCAATGTCTCCAAAGAGAAGAGGAAGAACATCTTT --A--N--G--S--P--E--P--V--S--M--S--P--K--R--R--G--R--T--S--F T AGC CGA AAA TCA GTG AGC TTG GAC AAT GTT CTT GTT CCA GAG GCA GTC TTT GGT CTT TC TAGCCGAAAATCAGTGAGCTTGGACAATGTTCTTGTTCCAGAGGCAGTCTTTGGTCTTTC --S--R--K--S--V--S--L--D--N--V--L--V--P--E--A--V--F--G--L--S A GAG AAA CCC GTG TGT TCA TTT GTA GGG CAT TTG GAT GAC GTA CTT GAT CTT TCG TGG TC AGAGAAACCCGTGTGTTCATTTGTAGGGCATTTGGATGACGTACTTGATCTTTCGTGGTC --E--K--P--V--C--S--F--V--G--H--L--D--D--V--L--D--L--S--W--S A AAA TCT CAG C AC CTG CTT TCC TCT TCC ATG GAT AAG ACT GTT CGT CTA TGG GAC TTA TC AAAATCTCAGCACCTGCTTTCCTCTTCCATGGATAAGACTGTTCGTCTATGGGACTTATC --K--S--Q--H--L--L--S--S--S--M--D--K--T--V--R--L--W--D--L--S T AGC AAG ACA TGT TTG AAA GTC TTC TCA CAT AGT GAC TAC G T G ACT TGC ATC CAG TTT AA TAGCAAGACATGTTTGAAAGTCTTCTCACATAGTGACTACGTGACTTGCATCCAGTTTAA --S--K--T--C--L--K--V--F--S--H--S--D--Y--V--T--C--I--Q--F--N T CCC GTG GAT GAC AAT TAC TTC ATC AGC GGA TCA TTG GAT GCA AAA GTT CGG ATA TGG AG TCCCGTGGATGACAATTACTTCATCAGCGGATCATTGGATGCAAAAGTTCGGATATGGAG --P--V--D--D--N--Y--F--I--S--G--S--L--D--A--K--V--R--I--W--S T ATT CCT GAT CAT CAA GTT GTT GAT TGG AAT GAT CTT CAT GAG ATG GTC ACA GCT GCT TG TATTCCTGATCATCAAGTTGTTGATTGGAATGATCTTCATGAGATGGTCACAGCTGCTTG --I--P--D--H--Q--V--V--D--W--N--D--L--H--E--M--V--T--A--A--C C TAC ACA CCG GAT GGA CAG G GT GCA TTG GTT GGT TCA TAC AAA GGA ACA TGC TGC TTA TA CTACACACCGGATGGACAGGGTGCATTGGTTGGTTCATACAAAGGAACATGCTGCTTATA --Y--T--P--D--G--Q--G--A--L--V--G--S--Y--K--G--T--C--C--L--Y C AAC ACA CAT G A T AAC AAA CTG CAG CAG AGA CGC GAA ATC AAT CTG AAG AAC AGG AAA AA CAACACACATGATAACAAACTGCAGCAGAGACGCGAAATCAATCTGAAGAACAGGAAAAA --N--T--H--D--N--K--L--Q--Q--R--R--E--I--N--L--K--N--R--K--K G AAA ACC CAT CAC AAG AAA ATC ACT GGT TTT CAG TTT GTG GCA GGA AGT TCA TCG GAA GT GAAAACCCATCACAAGAAAATCACTGGTTTTCAGTTTGTGGCAGGAAGTTCATCGGAAGT --K--T--H--H--K--K--I--T--G--F--Q--F--V--A--G--S--S--S--E--V T CTC GTC ACA TCT GCA GAT TCA CGT ACG CGT GTT GTT GAT GGT GTT GAC CTT GTT CAC AA TCTCGTCACATCTGCAGATTCACGTACGCGTGTTGTTGATGGTGTTGACCTTGTTCACAA --L--V--T--S--A--D--S--R--T--R--V--V--D--G--V--D--L--V--H--K G TTT AAA G GA TTT CGC AAC ACG AAT AGC CAA ATC TCG GCT TCA CTT ACA TCA AAC GGG AA GTTTAAAGGATTTCGCAACACGAATAGCCAAATCTCGGCTTCACTTACATCAAACGGGAA --F--K--G--F--R--N--T--N--S--Q--I--S--A--S--L--T--S--N--G--K A TTC CTA GTA TCA GCA AGC GAA GAC TCT AAT GTG TAT GTA TGG AAC TAC GAC TCA GAC TC ATTCCTAGTATCAGCAAGCGAAGACTCTAATGTGTATGTATGGAACTACGACTCAGACTC --F--L--V--S--A--S--E--D--S--N--V--Y--V--W--N--Y--D--S--D--S T CGA GCA GGA AGA AGC AAA CGT GTC ACA GTC ACA AAC TCA TAC GAA AAC TTT TAT TGT CG TCGAGCAGGAAGAAGCAAACGTGTCACAGTCACAAACTCATACGAAAACTTTTATTGTCG --R--A--G--R--S--K--R--V--T--V--T--N--S--Y--E--N--F--Y--C--R T GAC GTC TCT GTG GCT GCA CCT TGG CCT GGC AAA ATC AGT AAC AAC CAC ACT AAC AAC AG TGACGTCTCTGTGGCTGCACCTTGGCCTGGCAAAATCAGTAACAACCACACTAACAACAG --D--V--S--V--A--A--P--W--P--G--K--I--S--N--N--H--T--N--N--S C CCC GAA CAG TCA TCC TTC ACA GCC AAT AAT AAC CCT CCG ACA CCT GTC AAC GAT CCA AC CCCCGAACAGTCATCCTTCACAGCCAATAATAACCCTCCGACACCTGTCAACGATCCAAC --P--E--Q--S--S--F--T--A--N--N--N--P--P--T--P--V--N--D--P--T C AAC AAC AAA ACC GTC ACC AAC GGT ATC ATT TCA AGC GCC ACA AAC CGA TAC TTC TTC GA CAACAACAAAACCGTCACCAACGGTATCATTTCAAGCGCCACAAACCGATACTTCTTCGA --N--N--K--T--V--T--N--G--I--I--S--S--A--T--N--R--Y--F--F--D T AGA GTC TCA GCA ACA TGG CCT GAA GAA AAA CTC TTG CTG GCT GCA AAA AAC CGA GCC AG TAGAGTCTCAGCAACATGGCCTGAAGAAAAACTCTTGCTGGCTGCAAAAAACCGAGCCAG --R--V--S--A--T--W--P--E--E--K--L--L--L--A--A--K--N--R--A--R A ACA AGC CCT CGT GTG AGC GTG GAC ATG TCT AAC ATA CAG GTT AAC ACA AAA CCG AGT GC AACAAGCCCTCGTGTGAGCGTGGACATGTCTAACATACAGGTTAACACAAAACCGAGTGC --T--S--P--R--V--S--V--D--M--S--N--I--Q--V--N--T--K--P--S--A C TCG GCG TGG TCT ATG GTG ATT GTG ACT GGC AGT CTA CGA GGC GAA ATC AGA ATA TTT CA CTCGGCGTGGTCTATGGTGATTGTGACTGGCAGTCTACGAGGCGAAATCAGAATATTTCA --S--A--W--S--M--V--I--V--T--G--S--L--R--G--E--I--R--I--F--Q G AAT TTT GGA TTT CCA GTT CGT CTA TGA TGCAAGGAGAAGGTTTTACAATATCAAAATCC GAATTTTGGATTTCCAGTTCGTCTATGA................................ --N--F--G--F--P--V--R--L--*-................................ TAAGGCAAAGTGAAATTTTCCCTTAGTAAAACCATCTCCTGTCAAAAGTGTATAGATTGA ............................................................ ............................................................ GAGAAGGTTTGGTTCATCCACTGACTTCTCTCGTTTTTTTTTTTTACCACGCTTCTTTTA ............................................................ ............................................................ TTTATCTGATTTGTTATCTCTAAAATTCAAATCTCTAGCAAATATATATAATGTTATTTT ............................................................ ............................................................ TAAGAAAGATTCAAATAGGCAGAAAAAGAAACTTCATATACCAATATAGTTTGCTTCGAT ............................................................ ............................................................ GAAAGTCTGTGCTATTCAACTTGAAGTTTGTAGAATTTGTCTCTGATATTATAACTCTTC ............................................................ ............................................................ AAGGAGAGAATATATGGTAAACTTTTGTATACACATTTTGTAATTGTCTTTAGGTTTATC ............................................................ ............................................................ TTTACATGTAAAATAATTG ................... ................... .
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use
![[RSS logo]](/i/rss_icon_16.png "Ensembl blog"){kind=icon}
![[twitter logo]](/i/twitter.png "Follow us on Twitter!")
