Transcript: AT5G19330.1 ARIA-201
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Description
ARM repeat protein interacting with ABF2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832053 ]
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ARIA-201 AT5G19330.1 2752 710aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A178UCM4 B9DHT4 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, ARIA-202 AT5G19330.2 1969 636aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
F4K132 - -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A CCCCTGATCTCTTTTGTGCCTGAGATTGATTTCAAAACGCTGCTTCTTCTTCTTCTCTG 60
............................................................
............................................................
61 ATCTCTCCTCTTCTTCGGATCGTCTTTTACTTTGTGAACG ATG GAC CAA CAA CCG GAG AG 120
........................................ATGGACCAACAACCGGAGAG 20
........................................-M--D--Q--Q--P--E--R 7
121 G CGA GAA GGC CGG AGT TTT CCG GAG CGT AAA GGA CAG AAG CGG AAG CTA GAG GAA GGA GC 180
21 GCGAGAAGGCCGGAGTTTTCCGGAGCGTAAAGGACAGAAGCGGAAGCTAGAGGAAGGAGC 80
7 --R--E--G--R--S--F--P--E--R--K--G--Q--K--R--K--L--E--E--G--A 27
181 C GCC GCC GTA GAA GAT CGA GAG ATC TCT GCC GTC AGC ACC GAC GGA GGC CAA GCG CTT CT 240
81 CGCCGCCGTAGAAGATCGAGAGATCTCTGCCGTCAGCACCGACGGAGGCCAAGCGCTTCT 140
27 --A--A--V--E--D--R--E--I--S--A--V--S--T--D--G--G--Q--A--L--L 47
241 T AGC GAG GTT GCT GCT CAA GTC TCG GTA CTA AAC TCT GCC TTC TCT TGG CAA GAG TCC GA 300
141 TAGCGAGGTTGCTGCTCAAGTCTCGGTACTAAACTCTGCCTTCTCTTGGCAAGAGTCCGA 200
47 --S--E--V--A--A--Q--V--S--V--L--N--S--A--F--S--W--Q--E--S--D 67
301 T CGC GCT GCT GCC AAG CGA GCC ACT CAA GTT CTG GCT GAG CTA GCC AAA AAC G AG GAT TT 360
201 TCGCGCTGCTGCCAAGCGAGCCACTCAAGTTCTGGCTGAGCTAGCCAAAAACGAGGATTT 260
67 --R--A--A--A--K--R--A--T--Q--V--L--A--E--L--A--K--N--E--D--L 87
361 A GTG AAC GTG ATT GTC GAC GGA GGT GCT GTT CCA GCT CTT ATG ACG CAT CTA CAG GCG CC 420
261 AGTGAACGTGATTGTCGACGGAGGTGCTGTTCCAGCTCTTATGACGCATCTACAGGCGCC 320
87 --V--N--V--I--V--D--G--G--A--V--P--A--L--M--T--H--L--Q--A--P 107
421 A CCA TAC AAC GAC GGG GAC TTG GCT GAG AAG CCG TAC GAA CAC GAA GTT GAG AAG GGA AG 480
321 ACCATACAACGACGGGGACTTGGCTGAGAAGCCGTACGAACACGAAGTTGAGAAGGGAAG 380
107 --P--Y--N--D--G--D--L--A--E--K--P--Y--E--H--E--V--E--K--G--S 127
481 C GCT TTT GCG CTT GGT CTT CTT GCT ATT AAG C CA GAG TAT CAG AAA CTG ATA GTA GAC AA 540
381 CGCTTTTGCGCTTGGTCTTCTTGCTATTAAGCCAGAGTATCAGAAACTGATAGTAGACAA 440
127 --A--F--A--L--G--L--L--A--I--K--P--E--Y--Q--K--L--I--V--D--K 147
541 A GGT GCC TTA CCT CAT TTA GTG AAT TTG TTG AAG AGA AAC AAA GAT GGT TCT AGC TCT CG 600
441 AGGTGCCTTACCTCATTTAGTGAATTTGTTGAAGAGAAACAAAGATGGTTCTAGCTCTCG 500
147 --G--A--L--P--H--L--V--N--L--L--K--R--N--K--D--G--S--S--S--R 167
601 A GCT GTG AAT AGT GTT ATC AGA AGA GCG GCT GAT GCC ATC ACC AAT CTT GCT CAT GAG AA 660
501 AGCTGTGAATAGTGTTATCAGAAGAGCGGCTGATGCCATCACCAATCTTGCTCATGAGAA 560
167 --A--V--N--S--V--I--R--R--A--A--D--A--I--T--N--L--A--H--E--N 187
661 C AGC AGT ATC AAG ACC CGT GTT AG G GTA GAA GGC GGT ATT CCA CCT CTC GTG GAG TTG CT 720
561 CAGCAGTATCAAGACCCGTGTTAGGGTAGAAGGCGGTATTCCACCTCTCGTGGAGTTGCT 620
187 --S--S--I--K--T--R--V--R--V--E--G--G--I--P--P--L--V--E--L--L 207
721 T GAA TTT TCT GAT TCA AAG GTC CAG AGA GCA GCA GCA GGG GCA TTG AGA ACC CTT GCA TT 780
621 TGAATTTTCTGATTCAAAGGTCCAGAGAGCAGCAGCAGGGGCATTGAGAACCCTTGCATT 680
207 --E--F--S--D--S--K--V--Q--R--A--A--A--G--A--L--R--T--L--A--F 227
781 T AAA AAT GAT GAT AAC AAG AAT CAG ATA GTT GAA TGC AAT GCT CTT CCC ACA CTT ATT CT 840
681 TAAAAATGATGATAACAAGAATCAGATAGTTGAATGCAATGCTCTTCCCACACTTATTCT 740
227 --K--N--D--D--N--K--N--Q--I--V--E--C--N--A--L--P--T--L--I--L 247
841 A ATG CTA GGA TCA GAG GAT GCT GCT ATA CAT TAT GAA GCG G TT GGA GTT ATA GGC AAT CT 900
741 AATGCTAGGATCAGAGGATGCTGCTATACATTATGAAGCGGTTGGAGTTATAGGCAATCT 800
247 --M--L--G--S--E--D--A--A--I--H--Y--E--A--V--G--V--I--G--N--L 267
901 A GTA CAC TCG TCT CCA CAC ATT AAA AAA GAG GTT CTT ACT GCC GGG GCG TTG CAA CCT GT 960
801 AGTACACTCGTCTCCACACATTAAAAAAGAGGTTCTTACTGCCGGGGCGTTGCAACCTGT 860
267 --V--H--S--S--P--H--I--K--K--E--V--L--T--A--G--A--L--Q--P--V 287
961 C ATT GGT CTT CTT AG C TCC TGT TGC CCT GAG AGT CAA AGA GAG GCG GCT TTA TTA CTT GG 1020
861 CATTGGTCTTCTTAGCTCCTGTTGCCCTGAGAGTCAAAGAGAGGCGGCTTTATTACTTGG 920
287 --I--G--L--L--S--S--C--C--P--E--S--Q--R--E--A--A--L--L--L--G 307
1021 G CAG TTT GCC TCA ACT GAT TCT GAT TGT AAG G TG CAC ATT GTG CAA AGG GGT GCT GTC CG 1080
921 GCAGTTTGCCTCAACTGATTCTGATTGTAAGGTGCACATTGTGCAAAGGGGTGCTGTCCG 980
307 --Q--F--A--S--T--D--S--D--C--K--V--H--I--V--Q--R--G--A--V--R 327
1081 T CCT TTA ATT GAG ATG CTT CAG TCC CCG GAT GTC CAG TTG AAG GAA ATG TCG GCC TTT GC 1140
981 TCCTTTAATTGAGATGCTTCAGTCCCCGGATGTCCAGTTGAAGGAAATGTCGGCCTTTGC 1040
327 --P--L--I--E--M--L--Q--S--P--D--V--Q--L--K--E--M--S--A--F--A 347
1141 A CTG GGT AGA TTG GCA CAG G AT GCC CAC AAT CAA GCT GGT ATT GCC CAT AGT GGT GGT TT 1200
1041 ACTGGGTAGATTGGCACAGGATGCCCACAATCAAGCTGGTATTGCCCATAGTGGTGGTTT 1100
347 --L--G--R--L--A--Q--D--A--H--N--Q--A--G--I--A--H--S--G--G--L 367
1201 A GGA CCT TTA TTG AAG CTT CTC GAT TCA AGA AAT GGA TCA TTG CAA CAC AAT GCT GCA TT 1260
1101 AGGACCTTTATTGAAGCTTCTCGATTCAAGAAATGGATCATTGCAACACAATGCTGCATT 1160
367 --G--P--L--L--K--L--L--D--S--R--N--G--S--L--Q--H--N--A--A--F 387
1261 T GCT CTT TAT GGC CTT GCC GAT AAT GAG G AT AAT GTG TCA GAT TTT ATC AGG GTG GGA GG 1320
1161 TGCTCTTTATGGCCTTGCCGATAATGAGGATAATGTGTCAGATTTTATCAGGGTGGGAGG 1220
387 --A--L--Y--G--L--A--D--N--E--D--N--V--S--D--F--I--R--V--G--G 407
1321 T ATC CAA AAG CTA CAG GAT GGA GAG TTT ATT GTT CAA G CA ACT AAA GAT TGT GTT TCC AA 1380
1221 TATCCAAAAGCTACAGGATGGAGAGTTTATTGTTCAAGCAACTAAAGATTGTGTTTCCAA 1280
407 --I--Q--K--L--Q--D--G--E--F--I--V--Q--A--T--K--D--C--V--S--K 427
1381 A ACA CTA AAG AGA TTG GAG GAG AAG ATT CAT GGA AGA GTT CTG AGA CAT CTG TTG TAC CT 1440
1281 AACACTAAAGAGATTGGAGGAGAAGATTCATGGAAGAGTTCTGAGACATCTGTTGTACCT 1340
427 --T--L--K--R--L--E--E--K--I--H--G--R--V--L--R--H--L--L--Y--L 447
1441 A ATG CGC ATT TCA GAG AAG TCT ATC CAA AGA CGA GTT GCT CTT GCC CTT GCT CAT CTC TG 1500
1341 AATGCGCATTTCAGAGAAGTCTATCCAAAGACGAGTTGCTCTTGCCCTTGCTCATCTCTG 1400
447 --M--R--I--S--E--K--S--I--Q--R--R--V--A--L--A--L--A--H--L--C 467
1501 T TCA CCC GAG GAT CAA CGA ACC ATA TTC ATA GAT GAC AAC G G G TTG GAG TTG CTA CTC GG 1560
1401 TTCACCCGAGGATCAACGAACCATATTCATAGATGACAACGGGTTGGAGTTGCTACTCGG 1460
467 --S--P--E--D--Q--R--T--I--F--I--D--D--N--G--L--E--L--L--L--G 487
1561 T CTT CTT GGT TCT TTA AAC ACT AAG CAG CAA CTT GAC GGT GCA GCA GCG TTG TAC AAA TT 1620
1461 TCTTCTTGGTTCTTTAAACACTAAGCAGCAACTTGACGGTGCAGCAGCGTTGTACAAATT 1520
487 --L--L--G--S--L--N--T--K--Q--Q--L--D--G--A--A--A--L--Y--K--L 507
1621 A GCA AAT AAA TCT ATG GCA CTT TCT CCA GTT GAT GCT GCT CCT CCT TCT CCA ACA CAA AG 1680
1521 AGCAAATAAATCTATGGCACTTTCTCCAGTTGATGCTGCTCCTCCTTCTCCAACACAAAG 1580
507 --A--N--K--S--M--A--L--S--P--V--D--A--A--P--P--S--P--T--Q--R 527
1681 G G TT TAT CTC GGA GAG CAA TAT GTA AAT AAT GCT ACG CTG TCT GAT GTA ACC TTT CTA GT 1740
1581 GGTTTATCTCGGAGAGCAATATGTAAATAATGCTACGCTGTCTGATGTAACCTTTCTAGT 1640
527 --V--Y--L--G--E--Q--Y--V--N--N--A--T--L--S--D--V--T--F--L--V 547
1741 C GAA G G A AGG ACA TTC TAT GCA CAC AGA ATT TGT CTG CTG GCA TCC TCA GAT GCA TTT CG 1800
1641 CGAAGGAAGGACATTCTATGCACACAGAATTTGTCTGCTGGCATCCTCAGATGCATTTCG 1700
547 --E--G--R--T--F--Y--A--H--R--I--C--L--L--A--S--S--D--A--F--R 567
1801 T GCA ATG TTT GAT GGT GGT TAC AGA GAA AAA GAC GCT AGA GAT ATT GAG ATT CCA AAT AT 1860
1701 TGCAATGTTTGATGGTGGTTACAGAGAAAAAGACGCTAGAGATATTGAGATTCCAAATAT 1760
567 --A--M--F--D--G--G--Y--R--E--K--D--A--R--D--I--E--I--P--N--I 587
1861 C AAA TGG GAG GTG TTT GAG TTA ATG ATG AG G TTT ATA TAC ACT GGA TCT GTC GAC ATA AC 1920
1761 CAAATGGGAGGTGTTTGAGTTAATGATGAGGTTTATATACACTGGATCTGTCGACATAAC 1820
587 --K--W--E--V--F--E--L--M--M--R--F--I--Y--T--G--S--V--D--I--T 607
1921 A AAT GAG ATA TCA AAA GAT CTT CTA AGA GCA GCG GAT CAG TAT CTC TTG GAG GGC CTG AA 1980
1821 AAATGAGATATCAAAAGATCTTCTAAGAGCAGCGGATCAGTATCTCTTGGAGGGCCTGAA 1880
607 --N--E--I--S--K--D--L--L--R--A--A--D--Q--Y--L--L--E--G--L--K 627
1981 A CGA CTC TGT GAA TAC ACA ATT GCT CAG GAT ATT ACG TTG GAA AGT ATA GGA GAC ATG TA 2040
1881 ACGACTCTGTGAATACACAATTGCTCAGGATATTACGTTGGAAAGTATAGGAGACATGTA 1940
627 --R--L--C--E--Y--T--I--A--Q--D--I--T--L--E--S--I--G--D--M--Y 647
2041 C GAG CTA TCA GAA GCA TTC CAT GCG ATG TCG CTG AGG CAA GCT TGT ATC ATG TTC ATC CT 2100
1941 CGAGCTATCAGAAGCATTCCATGCGATGTCGCTGAGGCAAGCTTGTATCATGTTCATCCT 2000
647 --E--L--S--E--A--F--H--A--M--S--L--R--Q--A--C--I--M--F--I--L 667
2101 G GAG CAT TTC GAT AAA CTG AGT TCA ATG CCT TG G CAG AAC GAG CTG GTG CAG AGA ACA AT 2160
2001 GGAGCATTTCGATAAACTGAGTTCAATGCCTTGGCAGAACGAGCTGGTGCAGAGAACAAT 2060
667 --E--H--F--D--K--L--S--S--M--P--W--Q--N--E--L--V--Q--R--T--I 687
2161 A CCA GAG ATA AGA GAG TAC TTT TGT AGA GCC CTA ACA AAG TCT ACT ACA AAC CTG CAA AG 2220
2061 ACCAGAGATAAGAGAGTACTTTTGTAGAGCCCTAACAAAGTCTACTACAAACCTGCAAAG 2120
687 --P--E--I--R--E--Y--F--C--R--A--L--T--K--S--T--T--N--L--Q--S 707
2221 C TTG AGG TTG TAG AATGCGGAAGAAGAAGACTGCACTTAACTAGAGGTAAGTAGACAAGG 2280
2121 CTTGAGGTTGTAG............................................... 2133
707 --L--R--L--*-............................................... 710
2281 AATTATATAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGATCAAGAGCCGCCATTAGAGGTCTTTATCGTC 2340
............................................................
............................................................
2341 CTGTACTGGGTTGTCTTAGTTATTTGCTGTGCTTTTTGGTTCGTTTTGGTCATTTTGTAT 2400
............................................................
............................................................
2401 TGTATTAATTAATCTCCTCTGATCACAATCGGTCTTGAATGAAATCGCTACCCTTTGTAT 2460
............................................................
............................................................
2461 CCAAAAATACCATTGTGGTATAACTTCCACTATTCAATTCAAAATCCACTCTCCAACTAT 2520
............................................................
............................................................
2521 CCTCTCTGTTGAGAAAAGATACTTTGGGTAGGTTGTGACTAAGCGTAGCTGTAACGATTT 2580
............................................................
............................................................
2581 GATATTGGTAGTGGTGACCAGTGAGTTCATGTCTGAATAATTAAGAGATGATTCAACACA 2640
............................................................
............................................................
2641 GAACATAATATCCCATTTTTGTTTTACAAATAAAGAATCAATCGAAAGTATTACTGATGA 2700
............................................................
............................................................
2701 TTAGAGACTGTAACTTGTAAGTATTTTGTAGCACAAGCCACTGAAAATTACA 2752
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