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Arabidopsis thaliana (TAIR10)
Description

ARM repeat protein interacting with ABF2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832053]

Location
About this transcript

This transcript has 19 exons, is annotated with 31 domains and features, is associated with 293 variant alleles and maps to 51 oligo probes.

Gene

This transcript is a product of gene AT5G19330 Show transcript tableHide transcript table

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  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • RefSeq
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
ARIA-201AT5G19330.12752710aa
 
Protein coding
A0A178UCM4 B9DHT4 -Ensembl Canonical
ARIA-202AT5G19330.21969636aa
 
Protein coding
F4K132 --
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ACCCCTGATCTCTTTTGTGCCTGAGATTGATTTCAAAACGCTGCTTCTTCTTCTTCTCTG     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 ATCTCTCCTCTTCTTCGGATCGTCTTTTACTTTGTGAACGATGGACCAACAACCGGAGAG    120
       ........................................ATGGACCAACAACCGGAGAG     20
       ........................................-M--D--Q--Q--P--E--R      7

                                                                          
   121 GCGAGAAGGCCGGAGTTTTCCGGAGCGTAAAGGACAGAAGCGGAAGCTAGAGGAAGGAGC    180
    21 GCGAGAAGGCCGGAGTTTTCCGGAGCGTAAAGGACAGAAGCGGAAGCTAGAGGAAGGAGC     80
     7 --R--E--G--R--S--F--P--E--R--K--G--Q--K--R--K--L--E--E--G--A     27

                                                                          
   181 CGCCGCCGTAGAAGATCGAGAGATCTCTGCCGTCAGCACCGACGGAGGCCAAGCGCTTCT    240
    81 CGCCGCCGTAGAAGATCGAGAGATCTCTGCCGTCAGCACCGACGGAGGCCAAGCGCTTCT    140
    27 --A--A--V--E--D--R--E--I--S--A--V--S--T--D--G--G--Q--A--L--L     47

                                                                          
   241 TAGCGAGGTTGCTGCTCAAGTCTCGGTACTAAACTCTGCCTTCTCTTGGCAAGAGTCCGA    300
   141 TAGCGAGGTTGCTGCTCAAGTCTCGGTACTAAACTCTGCCTTCTCTTGGCAAGAGTCCGA    200
    47 --S--E--V--A--A--Q--V--S--V--L--N--S--A--F--S--W--Q--E--S--D     67

                                                                          
   301 TCGCGCTGCTGCCAAGCGAGCCACTCAAGTTCTGGCTGAGCTAGCCAAAAACGAGGATTT    360
   201 TCGCGCTGCTGCCAAGCGAGCCACTCAAGTTCTGGCTGAGCTAGCCAAAAACGAGGATTT    260
    67 --R--A--A--A--K--R--A--T--Q--V--L--A--E--L--A--K--N--E--D--L     87

                                                                          
   361 AGTGAACGTGATTGTCGACGGAGGTGCTGTTCCAGCTCTTATGACGCATCTACAGGCGCC    420
   261 AGTGAACGTGATTGTCGACGGAGGTGCTGTTCCAGCTCTTATGACGCATCTACAGGCGCC    320
    87 --V--N--V--I--V--D--G--G--A--V--P--A--L--M--T--H--L--Q--A--P    107

                                                                          
   421 ACCATACAACGACGGGGACTTGGCTGAGAAGCCGTACGAACACGAAGTTGAGAAGGGAAG    480
   321 ACCATACAACGACGGGGACTTGGCTGAGAAGCCGTACGAACACGAAGTTGAGAAGGGAAG    380
   107 --P--Y--N--D--G--D--L--A--E--K--P--Y--E--H--E--V--E--K--G--S    127

                                                                          
   481 CGCTTTTGCGCTTGGTCTTCTTGCTATTAAGCCAGAGTATCAGAAACTGATAGTAGACAA    540
   381 CGCTTTTGCGCTTGGTCTTCTTGCTATTAAGCCAGAGTATCAGAAACTGATAGTAGACAA    440
   127 --A--F--A--L--G--L--L--A--I--K--P--E--Y--Q--K--L--I--V--D--K    147

                                                                          
   541 AGGTGCCTTACCTCATTTAGTGAATTTGTTGAAGAGAAACAAAGATGGTTCTAGCTCTCG    600
   441 AGGTGCCTTACCTCATTTAGTGAATTTGTTGAAGAGAAACAAAGATGGTTCTAGCTCTCG    500
   147 --G--A--L--P--H--L--V--N--L--L--K--R--N--K--D--G--S--S--S--R    167

                                                                          
   601 AGCTGTGAATAGTGTTATCAGAAGAGCGGCTGATGCCATCACCAATCTTGCTCATGAGAA    660
   501 AGCTGTGAATAGTGTTATCAGAAGAGCGGCTGATGCCATCACCAATCTTGCTCATGAGAA    560
   167 --A--V--N--S--V--I--R--R--A--A--D--A--I--T--N--L--A--H--E--N    187

                                                                          
   661 CAGCAGTATCAAGACCCGTGTTAGGGTAGAAGGCGGTATTCCACCTCTCGTGGAGTTGCT    720
   561 CAGCAGTATCAAGACCCGTGTTAGGGTAGAAGGCGGTATTCCACCTCTCGTGGAGTTGCT    620
   187 --S--S--I--K--T--R--V--R--V--E--G--G--I--P--P--L--V--E--L--L    207

                                                                          
   721 TGAATTTTCTGATTCAAAGGTCCAGAGAGCAGCAGCAGGGGCATTGAGAACCCTTGCATT    780
   621 TGAATTTTCTGATTCAAAGGTCCAGAGAGCAGCAGCAGGGGCATTGAGAACCCTTGCATT    680
   207 --E--F--S--D--S--K--V--Q--R--A--A--A--G--A--L--R--T--L--A--F    227

                                                                          
   781 TAAAAATGATGATAACAAGAATCAGATAGTTGAATGCAATGCTCTTCCCACACTTATTCT    840
   681 TAAAAATGATGATAACAAGAATCAGATAGTTGAATGCAATGCTCTTCCCACACTTATTCT    740
   227 --K--N--D--D--N--K--N--Q--I--V--E--C--N--A--L--P--T--L--I--L    247

                                                                          
   841 AATGCTAGGATCAGAGGATGCTGCTATACATTATGAAGCGGTTGGAGTTATAGGCAATCT    900
   741 AATGCTAGGATCAGAGGATGCTGCTATACATTATGAAGCGGTTGGAGTTATAGGCAATCT    800
   247 --M--L--G--S--E--D--A--A--I--H--Y--E--A--V--G--V--I--G--N--L    267

                                                                          
   901 AGTACACTCGTCTCCACACATTAAAAAAGAGGTTCTTACTGCCGGGGCGTTGCAACCTGT    960
   801 AGTACACTCGTCTCCACACATTAAAAAAGAGGTTCTTACTGCCGGGGCGTTGCAACCTGT    860
   267 --V--H--S--S--P--H--I--K--K--E--V--L--T--A--G--A--L--Q--P--V    287

                                                                          
   961 CATTGGTCTTCTTAGCTCCTGTTGCCCTGAGAGTCAAAGAGAGGCGGCTTTATTACTTGG   1020
   861 CATTGGTCTTCTTAGCTCCTGTTGCCCTGAGAGTCAAAGAGAGGCGGCTTTATTACTTGG    920
   287 --I--G--L--L--S--S--C--C--P--E--S--Q--R--E--A--A--L--L--L--G    307

                                                                          
  1021 GCAGTTTGCCTCAACTGATTCTGATTGTAAGGTGCACATTGTGCAAAGGGGTGCTGTCCG   1080
   921 GCAGTTTGCCTCAACTGATTCTGATTGTAAGGTGCACATTGTGCAAAGGGGTGCTGTCCG    980
   307 --Q--F--A--S--T--D--S--D--C--K--V--H--I--V--Q--R--G--A--V--R    327

                                                                          
  1081 TCCTTTAATTGAGATGCTTCAGTCCCCGGATGTCCAGTTGAAGGAAATGTCGGCCTTTGC   1140
   981 TCCTTTAATTGAGATGCTTCAGTCCCCGGATGTCCAGTTGAAGGAAATGTCGGCCTTTGC   1040
   327 --P--L--I--E--M--L--Q--S--P--D--V--Q--L--K--E--M--S--A--F--A    347

                                                                          
  1141 ACTGGGTAGATTGGCACAGGATGCCCACAATCAAGCTGGTATTGCCCATAGTGGTGGTTT   1200
  1041 ACTGGGTAGATTGGCACAGGATGCCCACAATCAAGCTGGTATTGCCCATAGTGGTGGTTT   1100
   347 --L--G--R--L--A--Q--D--A--H--N--Q--A--G--I--A--H--S--G--G--L    367

                                                                          
  1201 AGGACCTTTATTGAAGCTTCTCGATTCAAGAAATGGATCATTGCAACACAATGCTGCATT   1260
  1101 AGGACCTTTATTGAAGCTTCTCGATTCAAGAAATGGATCATTGCAACACAATGCTGCATT   1160
   367 --G--P--L--L--K--L--L--D--S--R--N--G--S--L--Q--H--N--A--A--F    387

                                                                          
  1261 TGCTCTTTATGGCCTTGCCGATAATGAGGATAATGTGTCAGATTTTATCAGGGTGGGAGG   1320
  1161 TGCTCTTTATGGCCTTGCCGATAATGAGGATAATGTGTCAGATTTTATCAGGGTGGGAGG   1220
   387 --A--L--Y--G--L--A--D--N--E--D--N--V--S--D--F--I--R--V--G--G    407

                                                                          
  1321 TATCCAAAAGCTACAGGATGGAGAGTTTATTGTTCAAGCAACTAAAGATTGTGTTTCCAA   1380
  1221 TATCCAAAAGCTACAGGATGGAGAGTTTATTGTTCAAGCAACTAAAGATTGTGTTTCCAA   1280
   407 --I--Q--K--L--Q--D--G--E--F--I--V--Q--A--T--K--D--C--V--S--K    427

                                                                          
  1381 AACACTAAAGAGATTGGAGGAGAAGATTCATGGAAGAGTTCTGAGACATCTGTTGTACCT   1440
  1281 AACACTAAAGAGATTGGAGGAGAAGATTCATGGAAGAGTTCTGAGACATCTGTTGTACCT   1340
   427 --T--L--K--R--L--E--E--K--I--H--G--R--V--L--R--H--L--L--Y--L    447

                                                                          
  1441 AATGCGCATTTCAGAGAAGTCTATCCAAAGACGAGTTGCTCTTGCCCTTGCTCATCTCTG   1500
  1341 AATGCGCATTTCAGAGAAGTCTATCCAAAGACGAGTTGCTCTTGCCCTTGCTCATCTCTG   1400
   447 --M--R--I--S--E--K--S--I--Q--R--R--V--A--L--A--L--A--H--L--C    467

                                                                          
  1501 TTCACCCGAGGATCAACGAACCATATTCATAGATGACAACGGGTTGGAGTTGCTACTCGG   1560
  1401 TTCACCCGAGGATCAACGAACCATATTCATAGATGACAACGGGTTGGAGTTGCTACTCGG   1460
   467 --S--P--E--D--Q--R--T--I--F--I--D--D--N--G--L--E--L--L--L--G    487

                                                                          
  1561 TCTTCTTGGTTCTTTAAACACTAAGCAGCAACTTGACGGTGCAGCAGCGTTGTACAAATT   1620
  1461 TCTTCTTGGTTCTTTAAACACTAAGCAGCAACTTGACGGTGCAGCAGCGTTGTACAAATT   1520
   487 --L--L--G--S--L--N--T--K--Q--Q--L--D--G--A--A--A--L--Y--K--L    507

                                                                          
  1621 AGCAAATAAATCTATGGCACTTTCTCCAGTTGATGCTGCTCCTCCTTCTCCAACACAAAG   1680
  1521 AGCAAATAAATCTATGGCACTTTCTCCAGTTGATGCTGCTCCTCCTTCTCCAACACAAAG   1580
   507 --A--N--K--S--M--A--L--S--P--V--D--A--A--P--P--S--P--T--Q--R    527

                                                                          
  1681 GGTTTATCTCGGAGAGCAATATGTAAATAATGCTACGCTGTCTGATGTAACCTTTCTAGT   1740
  1581 GGTTTATCTCGGAGAGCAATATGTAAATAATGCTACGCTGTCTGATGTAACCTTTCTAGT   1640
   527 --V--Y--L--G--E--Q--Y--V--N--N--A--T--L--S--D--V--T--F--L--V    547

                                                                          
  1741 CGAAGGAAGGACATTCTATGCACACAGAATTTGTCTGCTGGCATCCTCAGATGCATTTCG   1800
  1641 CGAAGGAAGGACATTCTATGCACACAGAATTTGTCTGCTGGCATCCTCAGATGCATTTCG   1700
   547 --E--G--R--T--F--Y--A--H--R--I--C--L--L--A--S--S--D--A--F--R    567

                                                                          
  1801 TGCAATGTTTGATGGTGGTTACAGAGAAAAAGACGCTAGAGATATTGAGATTCCAAATAT   1860
  1701 TGCAATGTTTGATGGTGGTTACAGAGAAAAAGACGCTAGAGATATTGAGATTCCAAATAT   1760
   567 --A--M--F--D--G--G--Y--R--E--K--D--A--R--D--I--E--I--P--N--I    587

                                                                          
  1861 CAAATGGGAGGTGTTTGAGTTAATGATGAGGTTTATATACACTGGATCTGTCGACATAAC   1920
  1761 CAAATGGGAGGTGTTTGAGTTAATGATGAGGTTTATATACACTGGATCTGTCGACATAAC   1820
   587 --K--W--E--V--F--E--L--M--M--R--F--I--Y--T--G--S--V--D--I--T    607

                                                                          
  1921 AAATGAGATATCAAAAGATCTTCTAAGAGCAGCGGATCAGTATCTCTTGGAGGGCCTGAA   1980
  1821 AAATGAGATATCAAAAGATCTTCTAAGAGCAGCGGATCAGTATCTCTTGGAGGGCCTGAA   1880
   607 --N--E--I--S--K--D--L--L--R--A--A--D--Q--Y--L--L--E--G--L--K    627

                                                                          
  1981 ACGACTCTGTGAATACACAATTGCTCAGGATATTACGTTGGAAAGTATAGGAGACATGTA   2040
  1881 ACGACTCTGTGAATACACAATTGCTCAGGATATTACGTTGGAAAGTATAGGAGACATGTA   1940
   627 --R--L--C--E--Y--T--I--A--Q--D--I--T--L--E--S--I--G--D--M--Y    647

                                                                          
  2041 CGAGCTATCAGAAGCATTCCATGCGATGTCGCTGAGGCAAGCTTGTATCATGTTCATCCT   2100
  1941 CGAGCTATCAGAAGCATTCCATGCGATGTCGCTGAGGCAAGCTTGTATCATGTTCATCCT   2000
   647 --E--L--S--E--A--F--H--A--M--S--L--R--Q--A--C--I--M--F--I--L    667

                                                                          
  2101 GGAGCATTTCGATAAACTGAGTTCAATGCCTTGGCAGAACGAGCTGGTGCAGAGAACAAT   2160
  2001 GGAGCATTTCGATAAACTGAGTTCAATGCCTTGGCAGAACGAGCTGGTGCAGAGAACAAT   2060
   667 --E--H--F--D--K--L--S--S--M--P--W--Q--N--E--L--V--Q--R--T--I    687

                                                                          
  2161 ACCAGAGATAAGAGAGTACTTTTGTAGAGCCCTAACAAAGTCTACTACAAACCTGCAAAG   2220
  2061 ACCAGAGATAAGAGAGTACTTTTGTAGAGCCCTAACAAAGTCTACTACAAACCTGCAAAG   2120
   687 --P--E--I--R--E--Y--F--C--R--A--L--T--K--S--T--T--N--L--Q--S    707

                                                                          
  2221 CTTGAGGTTGTAGAATGCGGAAGAAGAAGACTGCACTTAACTAGAGGTAAGTAGACAAGG   2280
  2121 CTTGAGGTTGTAG...............................................   2133
   707 --L--R--L--*-...............................................    710

                                                                          
  2281 AATTATATAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGATCAAGAGCCGCCATTAGAGGTCTTTATCGTC   2340
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2341 CTGTACTGGGTTGTCTTAGTTATTTGCTGTGCTTTTTGGTTCGTTTTGGTCATTTTGTAT   2400
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2401 TGTATTAATTAATCTCCTCTGATCACAATCGGTCTTGAATGAAATCGCTACCCTTTGTAT   2460
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2461 CCAAAAATACCATTGTGGTATAACTTCCACTATTCAATTCAAAATCCACTCTCCAACTAT   2520
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2521 CCTCTCTGTTGAGAAAAGATACTTTGGGTAGGTTGTGACTAAGCGTAGCTGTAACGATTT   2580
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2581 GATATTGGTAGTGGTGACCAGTGAGTTCATGTCTGAATAATTAAGAGATGATTCAACACA   2640
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2641 GAACATAATATCCCATTTTTGTTTTACAAATAAAGAATCAATCGAAAGTATTACTGATGA   2700
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2701 TTAGAGACTGTAACTTGTAAGTATTTTGTAGCACAAGCCACTGAAAATTACA           2752
       ....................................................               
       ....................................................